2016年5月12日
细胞内细胞器的形态、大小和位置在进化上是保守的,并且似乎直接影响其功能。了解这些过程背后的分子机制已成为现代生物学的重要目标。本文展示了如何通过应用定量技术来促进这些研究。
本方法学的总体目标是展示如何对解剖学性状进行定量分析。文中演示了对影响果蝇幼虫横纹肌细胞核形态、大小及位置的表型进行量化的方法。理解调控细胞内细胞器形态、大小及分布的分子机制,是现代生物学最重要的科学问题之一。
过去,实验组间及组内的形态学差异仅能进行定性分析。本文中,我们提出一种定量分析方法,将果蝇遗传学与形态测量学定量分析相结合,以鉴定控制肌肉内细胞核大小、形状及分布的基因。本实验操作的演示由本实验室的研究生 Leire Ledahawski 协助完成。
按照文本方案解剖并染色幼虫神经肌肉接头后,使用镊子将样品从1.5毫升微量离心管中取出,放置于处理载玻片上。用显微解剖剪刀剪除肌片的头部和尾部,并使组织内表面朝上。接下来,取一支洁净载玻片,每隔一厘米缠绕三条纤维素胶带,制备成加样载玻片。
将盖玻片置于该间隙上方,以免压平样品。然后,在纤维素胶带条之间滴加约 20 µL 封片介质,并用洁净的镊子将介质铺匀。接着去除制片上多余的组织。
将解剖好的幼虫从处理载玻片转移至封片载玻片,并放入封片介质中,保持其内表面朝上。接着,轻轻盖上盖玻片,注意避免产生气泡。然后用透明指甲油密封载玻片,并在成像前至少干燥10分钟。
进行此分析时,使用显示经 DeVAP 抗体、lamin 抗体及核标记物染色的幼虫体壁肌肉的共聚焦图像。然后将共聚焦 Z 轴层扫图像拖放到操作区域中。双击图像可自动在“Surpass”视图中打开,该视图可通过工具栏图标访问。
Surpass 视图包含三个主要工作区面板:视图区域、对象列表和对象属性区域。接下来,单击 3D 视图图标以生成三维渲染的三通道图像。
然后从“对象”工具栏中选择“添加新测量点”,并按照“对象属性”区域中的创建向导进行操作。首先选择“编辑”选项卡,然后在“特定通道”中选择核标记或层蛋白通道,以高亮显示细胞核。接下来,按下 Esc 键将指针设置为“选择”模式,再使用鼠标滚轮调整 3D 光标框的大小,使其包含图像中的特定细胞核。
通过按住 Shift 键并在同一细胞核上单击鼠标左键来添加一个测量点。然后,使用相同的技术在同块肌肉的邻近细胞核上添加第二个点。两点之间将自动绘制一条线,并显示且记录两个细胞核之间的距离,作为一项统计变量。
对给定细胞核周围的所有细胞核重复该步骤。然后,在“统计详细距离数据”下的所有采集测量点中,选择最短距离。在“对象属性”区域,选择“导出统计结果至文件(以制表符分隔)”选项。
这会将数据保存到电子表格中。对于本分析,使用经层粘连蛋白(lamin)和核标记物染色的体壁肌肉的共聚焦图像来观察细胞核。为评估肌核的形态,测量其球形度,该参数将细胞核的表面积与相同体积的球体表面积进行比较。
或者,测量能够区分长球体、扁球体、椭球体和球状体的椭圆率。按照之前所述方法打开图像,然后点击对象工具栏图标“添加新表面”。
在“对象属性”区域出现的创建向导中,选择核标记染色作为显示细胞核的源通道。将阈值选项设为“绝对强度”。通过调整阈值曲线上的数值,确保大多数细胞核呈现平滑且未过载的渲染效果。
同时,避免出现任何细胞核的孔洞或不完整掩膜。接下来,使用滤波工具去除表面渲染中的噪声。在新创建的表面层的“编辑”选项卡下,分割错误渲染的细胞核表面。
另一种选择是合并那些渲染错误的细胞核表面。在“统计”选项卡下可以查看表面渲染后细胞核的椭圆度和球形度数值。请导出该数据以供分析。
对于本实验方案,使用报告体壁肌肉的共聚焦图像,这些肌肉经核标记物以及特异性针对lamin和DeVAP的抗体染色。从主菜单的“Edit”项中打开感兴趣的图像,然后进行3D裁剪。按照前一节所述,使用lamin通道运行表面创建向导。
表面创建完成后,点击“对象属性”区域中的“编辑”,然后选择“掩膜全部”以分离细胞核内部的信号。接着,选择DeVAP信号。在“选择通道”下拉菜单中,点击“设置表面外部体素”选项,并将该值设为零。
这将在“显示调整”窗口中创建一个可用的新蒙版通道。为了可视化细胞核内信号的存在情况,可点击“对象”工具栏中的“添加新裁剪平面”图标来创建一个轮廓平面。随后,通过交互方式调整裁剪平面的角度和位置,以观察信号在细胞核内的分布情况。
人类VAMP相关蛋白B的错义突变与肌萎缩侧索硬化症(ALS)的发病机制有关。利用所述方法,将表达携带导致ALS的V260I突变果蝇同源基因DeVAP的横纹肌与对照组进行比较,对照组表达与之相当水平的野生型DeVAP或更高水平的野生型DeVAP。采用最近邻分析法评估肌纤维上细胞核的分布情况。
与表达突变型DeVAP转基因或过表达野生型蛋白的对照肌肉相比,所关注的突变导致细胞核间平均最短距离显著减小。接下来检测了细胞核的球形度,发现那些减小细胞核间距的转基因同时会增大细胞核体积。
对细胞核进行三维重建和体积渲染结果显示,表达目标突变的肌肉细胞在细胞核内形成聚集。该方法还可拓展用于其他细胞器(如线粒体)相关形态特征的定量分析。细胞核结构、位置和大小的改变与衰老以及多种神经退行性疾病(如帕金森病和肌萎缩侧索硬化症)相关。
阐明导致运动障碍的分子机制可能有助于发现新的药物治疗靶点,从而实现有效的治疗干预。
本研究展示了一种对解剖学特征进行定量分析的方法,重点针对黑腹果蝇幼虫横纹肌中细胞核的形态、大小及分布。通过将黑腹果蝇遗传学与形态测量技术相结合,该研究旨在鉴定影响这些特征的基因。
在果蝇幼虫神经肌肉接头处进行定量表型分析,能够精确探究基因对细胞结构的影响,支持在早期发现阶段进行可靠的靶点验证和机制层面的风险评估。通过超越定性描述,该方法增强了将基因扰动与功能结果相关联的预测信心,为基于风险调整的研发管线决策提供依据。该方法学对其他系统的适用性进一步提升了其在企业级研发流程中的价值。
这种定量形态测量方法贯穿从早期发现到先导物识别及临床前研究的全过程,支持基于假设的目标验证和转化连续性。