利用干细胞衍生脑 Organoids体外培养人脑组织 Zika 病毒感染的模拟研究
September 19th, 2017
本协议描述了一种用于开发人脑的 Zika 病毒感染模型的技术。利用野生或工程化的干细胞系, 研究人员可以利用这种技术来发现可能影响早期脑部感染的各种机制或治疗方法, 并在 Zika 病毒感染的胚胎中产生小头。
该程序的总体目标是使用干细胞衍生的脑类器官在发育中的人脑中模拟寨卡病毒感染。这种方法可以帮助回答生物学领域的关键问题，例如，哪些细胞能够被感染以及哪些蛋白质与感染途径有关。该技术的主要优点是它模拟早期人类感染，可用于高通量检测，并且可以与 CRISPR 等重点遗传技术结合使用。
这种方法可以深入了解寨卡病毒感染的机制。它也可以应用于其他系统，例如药物筛选和病毒假型。使用常规的干细胞维护方法，使培养物达到 50% 至 70% 的汇合度。
使用 10 至 20 倍放大倍率的明场显微镜检查培养物，并确保菌落具有健康的形态，没有可检测的分化。将无异种成分干细胞维持培养基置于热水浴中至 37 摄氏度，并在室温下解冻 2 毫升酶分离试剂和一小瓶 50 微升原液岩石抑制剂。接下来，准备一个超低附件 U 底 96 孔板、一个多通道 p200 移液器和一个 25 毫升试剂储液槽。
接下来，将 45 mL 培养基分装到 50 mL 锥形管中。加入 45 μL 岩石抑制剂，通过研磨混合物充分混合抑制剂，然后加入 2 至 4 个版本。真空吸出含有干细胞的 6 孔板中的两个孔，并向每个孔中快速添加 1 毫升无酶分离试剂，然后将板在 37 摄氏度下孵育 4 分钟。
接下来，真空吸出处理过的孔，并向每个孔中加入 1 毫升酶分离试剂。在 37 摄氏度下孵育 5 分钟后，从培养箱中取出板。轻轻敲击板以打碎任何聚集的细胞。
接下来，在显微镜下检查细胞。如果仍然可以看到大细胞簇，请将板在 37 摄氏度下再孵育 2 分钟。重复该步骤，直到肉眼不再看到群集。
细胞正确解离后，向每个孔中加入 1 毫升无异种成分干细胞维持培养基，以使解离酶失活。将细胞悬液拉入 50 mL 锥形管中，取少量用于细胞计数。离心时，对细胞进行计数并确定达到每毫升悬浮液 60， 000 个细胞所需的重悬体积。
小心去除上清液，并以每毫升 60， 000 个细胞的浓度重悬于含有岩石抑制剂的培养基中。使用 5 毫升移液器，轻轻混合细胞 5 到 10 次，以确保细胞悬液均匀。立即将细胞悬液加入试剂储液槽中，并使用多通道 p200 移液器将 150 μL 转移到超低附件 U 底部 96 孔板的每个孔中。
接下来，将板以 150 x G 离心 1 分钟，然后将板放入 37 摄氏度的培养箱中。48 小时内不要打扰板。从第二天开始，在 50 毫升锥形管中制备 17 毫升含有 17 微升岩石抑制剂储备液的培养基。
在热水浴中将混合物加热至 37 摄氏度。从培养箱中取出类器官板，使用多通道 p200 移液器，从第一行孔的边缘缓慢吸取 75 微升培养基。然后，迅速将其排出回井中，以取出松散的细胞和类器官。
对每一行重复此分散过程。等待 15 秒以确保类器官沉入每个孔的底部，然后使用多通道 p200 移液器从每个孔中缓慢小心地吸出 75 微升培养基，并将其分配到废液储存器中。接下来，将含有岩石抑制剂的培养基转移到试剂储液槽中，将 150 μL 培养基分配到每个类器官孔中，然后在 37 摄氏度下孵育细胞。
将 17 毫升新鲜培养基加热至 37 摄氏度，此时无需任何岩石抑制剂。使用设置为 100 微升的多通道 p200 移液器，重复前面显示的分散过程并等待 15 秒以确保类器官已沉入其孔底部。然后，小心地从每个孔中吸出 125 微升培养基，并替换为 150 微升加热的培养基。
将板放入 37 摄氏度的培养箱中。根据此处所示的配方制备培养基，然后在 500 毫升过滤器中无菌过滤混合溶液。从第 4 天到大约 24 天感染细胞，使用神经诱导培养基每隔一天进行一次定期维护。
过滤后，将 17 毫升神经诱导培养基加热至 37 摄氏度，并将其余部分储存在 4 摄氏度。使用设置为 100 微升的多通道 p200 移液器，分散类器官板的所有孔，如前所述。等待 15 秒以确保类器官已沉入其孔底。
小心地从每个孔中吸出 125 微升培养基，并用 125 微升新鲜神经诱导培养基代替。每隔一天重复一次这种神经诱导壮举，直到类器官准备好接受寨卡病毒感染。将 Earle 的 1x 平衡盐溶液、1x PBS 和神经诱导培养基放入热水浴中至 37 摄氏度。
接下来，在 1x Earle 溶液中稀释已知浓度的寨卡病毒，以达到目标感染复数，通常介于 0.1 和 10 之间。使用 p200 移液器，小心地从每个类器官孔中取出所有培养基。然后，用 200 微升加热的 1x PBS 快速洗涤类器官。
从每个孔中取出培养基时，关键是不要接触类器官或将其吸入移液器中。这可能会对类器官造成无法修复的损害。如果发生这种情况，最好丢弃类器官。
接下来，使用单通道 p200 移液器小心地从每个类器官孔中去除所有剩余液体。然后，向每个孔中快速加入 50 微升 1x Earle 模拟感染溶液或寨卡病毒溶液。确保每个类器官完成后完全浸没，将板放回 37 摄氏度的培养箱中培养两小时。
病毒暴露完成后，用 200 微升 PBS 洗涤类器官的每个孔。让类器官沉降 15 秒，然后使用单通道 p200 移液器去除 PBS。最后，向每个孔中加入 200 μL 新鲜神经诱导培养基，并将板放回培养箱中。
DAPI、磷酸波形蛋白、TBR2 和 MAP2 染色可以组合显示类器官内形成的皮层结构。这些结构包括心室区、脑室下区、中间区和每个玫瑰花结内的皮质板。将类器官培养到第 108 天，可以观察发育的后期阶段。
虽然皮质分层在这种类型的类器官中并不那么突出，但向神经胶质生成的自然转变确实与体内发生非常相似。寨卡病毒感染 3 天后，类器官大小的差异变得明显。这种差异的规模取决于应用于类器官的病毒感染多样性。
类器官大小的这种差异将在接下来的一周内增加，直到受感染的类器官开始分裂。三天后，与模拟井相比，受感染井中的细胞碎片也会增加。在尝试此程序时，遵循安全的实验室做法很重要，因为使用的是活的传染性材料。
在此程序之后，可以执行其他方法，如免疫组织化学或 RNAC，以回答有关神经发育寨卡病毒感染所涉及的生物学的其他问题。
概览
本研究提出了一种利用干细胞衍生类器官模拟寨卡病毒在发育中的人脑内感染的协议。研究人员旨在调查哪些细胞容易受到感染以及感染途径中涉及的蛋白质，从而提供对寨卡病毒感染机制及其与小头畸形之间关系的洞察。
关键研究组成部分
科学领域
- 神经科学
- 病毒学
- 干细胞生物学
背景
- 寨卡病毒可能导致受感染胚胎出现严重的神经系统疾病，如小头畸形。
- 了解感染机制对开发治疗干预至关重要。
- 干细胞衍生的脑类器官是早期人脑发育的有效模型。
- 本研究探索高通量测定和CRISPR等遗传技术的优势。
研究目的
- 模拟寨卡病毒在发育中的人脑内的感染。
- 识别受感染的细胞类型并探索感染途径。
- 开发药物筛选和了解神经影响的平台。
使用的方法
- 该研究采用干细胞衍生的脑类器官作为主要平台。
- 操纵干细胞系以生产用于感染研究的类器官。
- 没有提到多组学工作流程；重点是细胞感染动态。
- 关键步骤包括准备类器官培养、维持生长和引入病毒感染。
- 在整个实验时间表中进行定期的培养基更换，以确保最佳生长条件。
主要结果
- 该协议允许观察类器官中寨卡病毒感染机制。
- 初步评估突出了细胞感染途径和响应机制。
- 获得了细胞分化和对病毒因素脆弱性的洞察。
- 该研究为未来针对寨卡病毒的治疗评估提供了基础洞察。
结论
- 这项研究能够详细探索寨卡病毒对发育中大脑的影响。
- 对感染机制的理解可能为未来的治疗策略提供信息，以对抗病毒对大脑发育的影响。
- 研究的影响延伸到对神经发育疾病模型的更广泛调查。
常见问题
Executive Industry Relevance
Modeling Zika virus infection in human cerebral organoids provides a species-matched system to evaluate neurotropic mechanisms and assess antiviral interventions. This approach supports target validation by identifying susceptible neural progenitor cells and infection pathways relevant to neurodevelopmental risk. The model enables mechanistic de-risking in early discovery by linking viral exposure to phenotypic outcomes such as cell death and microcephaly-like phenotypes.
Strategic Applications in Biopharma R&D
Early Discovery & Target Validation
- Scientific Value: Identifies neural progenitor cells as primary targets of Zika virus infection, supporting hypothesis testing of viral tropism.
- Operational Value: Enables interrogation of infection mechanisms using stem cell-derived systems that reflect human-specific biology.
- Strategic Value: Supports target confidence by clarifying which cell types and proteins are involved in the infection pathway.
Screening & Assay Development
- Scientific Value: Provides a three-dimensional platform for quantifying viral load and cytopathic effects over time.
- Operational Value: Compatible with high-throughput formats and genetic perturbation tools like CRISPR for pathway interrogation.
- Strategic Value: Enables scalable screening of compounds that modulate viral entry, replication, or host response.
Translational & Preclinical Research
- Scientific Value: Models microcephaly-associated phenotypes including organoid size reduction and cellular debris accumulation post-infection.
- Operational Value: Supports longitudinal assessment of infection outcomes from early exposure to later developmental stages.
- Strategic Value: Improves predictive confidence in preclinical models by recapitulating human-specific cortical layering and gliogenesis timing.
Pipeline & Workflow Integration
The cerebral organoid model fits within the discovery continuum from target validation through lead identification to preclinical assessment of neurotropic compounds.
- Discovery Biology: Enables hypothesis testing of which cells are infectable and which proteins mediate viral entry and pathogenesis.
- Screening: Supports assay readiness through standardized organoid generation, maintenance, and infection protocols in ultra-low attachment plates.
- Analytics: Generates quantitative readouts including organoid size, cell death markers, and viral antigen expression for comparative condition analysis.
- Translational Research: Connects early infection events to downstream phenotypes like disrupted cortical structure and gliogenesis, supporting biomarker-aligned evaluation.
- Enterprise Reuse: Establishes a reusable platform for studying other neurotropic viruses or genetic modifiers of viral susceptibility.
Operational & Enterprise Impact
- Scientific Value: Predictive confidence in target validation through direct observation of virus-host interactions in a human-relevant system.
- Operational Value: Standardized differentiation and infection workflows reduce variability and support cross-experiment reproducibility.
- Strategic Value: Informs go/no-go decisions by providing early insight into neurological liability of viral pathogens or therapeutic candidates.
- Portfolio Impact: Enables risk-adjusted prioritization of antiviral compounds based on efficacy in preventing organoid dysplasia and cell loss.
Implementation Considerations
- Requires expertise in stem cell culture, organoid generation, and virology under biosafety-level appropriate conditions.
- Dependent on ultra-low attachment plates, enzymatic dissociation tools, and controlled incubation systems for organoid formation.
- Necessitates standardization of media changes, rock inhibitor use, and neural induction timing across batches.
- Adaptation to other models may require optimization of infection timing and multiplicity based on differential progenitor susceptibility.
- Practical limitations include organoid variability and the need for careful handling to avoid mechanical disruption during medium exchange.
Biopharma FAQs
Chapters in this video
0:05
Title
0:43
Creating Cerebral Organoids from iPSC / hESC 2D Culture (Day 0)
3:30
Cerebral Organoid Maintenance (Day 2)
4:37
Cerebral Organoid Maintenance (Day 3)
5:14
Cerebral Organoid Maintenance (Day 4+)
6:13
Organoid Infection with ZIKV (~Day 24)
7:45
Results: Characterization of ZIKB-infected Organic Degradation
8:47
Conclusion
