May 1st, 2020
在这里,我们提出了一个协议,以测量eIF4E-eIF4G在活细胞中的相互作用,使用户能够评估药物引起的扰动eIF4F复杂动态的筛选格式。
eIF4F 复合物信号转导的调节与参与癌症增殖和存活的 mRNA 亚群的翻译增加有关。在这里,我们描述了一种基于 eIF4E-eIF4G 细胞的蛋白质-蛋白质相互作用测定,使我们能够评估活细胞中 eIF4F 复合物完整性的药物诱导扰动。人们对开发有效靶向蛋白质-蛋白质界面的方式越来越感兴趣。
我们设想我们的 eIF4E-eIF4G PPI 检测将有助于培养这些策略并对其进行验证。该测定将为其提供最佳的主要方案,以引导 eIF4E-eIF4G 抑制剂的优化。正确接种细胞和进行转染转染是该产品最具挑战性的方面,因为它们可能直接反映在 PPI 报告系统的抑制上。
解冻和计数细胞后,用 HEK 293 细胞接种 6 孔板,每孔使用 2 mL 标准生长培养基。第 2 天早上,对于每次计划转染,在含有 125 μL 不含酚红的还原血清培养基的试管中稀释 9 μL 基于脂质体的溶液。当稀释的脂质体在室温下孵育 5 分钟时,为每个转染管将 3 μg 每个质粒稀释在 125 μL 减血清培养基中,制备 DNA 预混液。
向 DNA 预混液 2 中加入 12 μL 增强剂试剂,然后充分混合。立即将此混合物以 1 比 1 的比例添加到每管稀释的脂质体中。在室温下孵育该 DNA 脂质复合物 15 分钟后,将复合物添加到 6 孔板的每个孔中。
将细胞在 37 摄氏度和 5% 二氧化碳中孵育 24 小时。第 3 天早上,用 1 毫升 PBS 冲洗每个孔,并加入 0.3 毫升胰蛋白酶。将板在 37 摄氏度下孵育 5 分钟。
孵育后,向不含酚红的还原血清培养基的每个孔中加入 2 mL 来中和胰蛋白酶。将转染的细胞转移到 15 mL 试管中。接下来,将细胞以 290x G 离心 5 分钟。
吸出培养基,并将细胞沉淀重悬于 2 mL 还原血清培养基中。将转染的 HEK 293 细胞接种在 96 孔不透明板中,密度为每孔 30, 000 个细胞,溶于 90 微升培养基中。为了在同一实验中获得 3 种不同化合物的 3 个技术重复,请接种 60 个孔。
排除边缘的孔。接种转染细胞后,立即向每个孔中加入 10 μL 10% DMSO 化合物溶液。通过将每种感兴趣的化合物溶解在 100% DMSO 中来制备 1 毫摩尔化合物储备溶液。
为了对每个化合物滴定进行 3 次重复,请使用 8 μL 的 1 毫摩尔化合物储备液。将 4 微升 1 毫摩尔原液移液到 4 微升 100% DMSO 中,在每个滴定点,在 96 孔 PCR 板的 8 个孔中对每种储备化合物溶液进行两倍连续稀释。在两次连续稀释的最后一个点后丢弃多余的 4 μL。
向每管中加入 36 μL HPLC 级无菌水,以制备 40 μL 的 10x 化合物连续稀释溶液,溶于 10% DMSO。此外,准备一个控件。HPLC 级无菌水中含 10% DMS 的储备液。
向 96 孔不透明板中的细胞中加入 10 微升 10x 工作溶液,以产生预期的最终浓度,残留 DMSO 浓度为 1%在 37 摄氏度下用 5% 二氧化碳孵育板 3 小时。3 小时后,将 1 体积的底物与 19 体积的稀释试剂混合,开始制备荧光素酶底物试剂。使用多通道移液器立即将 25 μL 底物试剂加入装有细胞的 96 孔板的每个孔中。
在轨道摇床上以 350 RPM 的转速摇动板,在室温下摇动 50 分钟。要评估发光,请将板放在读板器上。将镜像读取器设置为发光,将发射滤镜设置为 455。
使用 6.5 毫米的测量高度,测量时间为 1 秒。为了评估细胞活力,向每个孔中加入 33 μL 活力检测试剂。在室温下放置 15 分钟后,使用读板器评估发光,将读光镜设置为发光,将发射滤光片设置为 600。
使用 6.5 毫米的测量高度和 1 秒的测量时间。使用读板器中的数据来确定每种化合物的 IC 50 值,方法是将数据曲线拟合到手稿中描述的 4 参数拟合曲线方程。用 eIF4E-eIF4G 互补系统转染 HEK 293 细胞,然后退去并用 mTOR 抑制剂处理。
当治疗后 4 小时评估发光时,PP242 和雷帕霉素均产生剂量依赖性信号抑制。PP242 和雷帕霉素均未显著降低细胞活力,表明 eIF4E-eIF4G 互补系统中发光的降低不是由于非特异性细胞死亡,而是由于 EIF4E-4G 相互作用的破坏。在 m7GTP 下拉实验之后,Western blot 分析表明,4EBP1 介导的内源性 eIF4E-eIF4G 相互作用的破坏与测量的 eIF4E-eIF4G 检测信号相关。
PP242 是比雷帕霉素更有效的 4EBP1 总磷酸化抑制剂。两种抑制剂均显示对 mTOR 信号转导正常影响,雷帕霉素对 mTORC1 底物更活跃,而 PP242 同时靶向 mTORC1 和 mTORC2。该产品最关键的方面是在交易当天接种细胞,在不含酚红的培养基中重新接种细胞,评估 eIF4E-eIF4G 互补测定的发光,并在同一平板上运行活力测定。
可以进行二次活力测定以评估任何靶标药物和已知的特异性作用。
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本文介绍了一种在活细胞中测量eIF4E-eIF4G相互作用的协议,便于评估药物诱导的eIF4F复合物动态扰动。该测定旨在支持靶向这种蛋白质-蛋白质相互作用的抑制剂的开发。