非侵入性的三维可视化与亚微米分辨率使用同步加速器X射线断层扫描

我们使用的欧洲同步辐射装置（ESRF）的同步辐射X射线断层检查，非侵入性产生了0.7μm的像素分辨率的三维断层数据集。使用量的渲染软件，这使得无病理切片制作的文物在自然状态下的内部结构重建。

Hello.My 名叫 Michelle Ov，来自管材大学 Bats 实验室，在本次演讲中，我想谈谈使用亚微米分辨率的同步加速器 X 射线断层扫描对微 AHR 推杆内部组织的无创三维可视化。我们正在使用的模型系统是轨道螨 Aus Long osis，这是一种体型 800 微米到 1 毫米的微型 COLYER AHR 输出。这是一张从所有实验室培养物中拍摄的照片，您可以在其中看到以藻类为食的动物。

为了研究 Argos 的内部组织，我们使用同步加速器 X 射线辐射在 SRF 和 Grable 处产生断层扫描 VOX 数据。在这里，您可以看到带有大存储环的 ESRF 图片，在右上角，您可以看到 ID 19 的实验大厅，它位于环的外部。对于测量，样品精确指向右侧并使用强力胶安装在塑料针上。实验在 20.5 KEV 下进行，并采取了 1， 500 个投影进行重建。

在这里，您可以看到带有 co freelance CCD 芯片、14 位动态范围和 4 百万像素的相机。图底部所示的模拟器将 X 射线转换为可见光。这是样品架和旋转台的特写。

样品安装在 Goya 仪表头上，以便样品在光束中正确定向。实验装置的详细说明在我们 2007 年发表在 Journal of Microscopy 上的论文中给出。在本演示中，我将重点介绍使用 Fiji Studio Max 软件进行三维可视化的数据分析器。

首先，我将向您展示如何从背景中删除灰度值以提取样本信息。在直方图中，您会看到一个大峰值，它主要属于背景中的灰度值。从直方图中删除此峰后，您可以看到样品从灰色立方体中流出。

接下来，我将向您展示如何使用关键帧器 VG studio 旋转对象。Max 具有一组预定义的摄像机轨迹。在这里，我使用 XY 圆生成围绕垂直 X 的旋转，这是最终的动画。

动物背面的大结构对应于强力胶的表面。现在，我将向您展示如何设置虚拟切割平面，以便能够对样品的内部组织进行三维观察。有三个方向可以设置切割平面 正面 实际 热情.

在这里，我使用正面平面，并在动物中间的某个地方找到一个切割位置，在这个区域内，这个切割平面不必是静态的。同样，使用关键帧器，它可以沿任何轴移动。在这个例子中，我使用预设的剪辑 Z 沿样品的纵轴移动切割平面，这就是最终动画一步一步的样子，你可以看到并跟踪所有内部结构的 3D 组织，P 分辨率只有 0.7 微米。

除了预定义的相机轨迹外，还可以生成用户特定的相机路径。为此，请选择 free camera look at 模式并将相机和虚拟镜头的焦距调整到任何所需的位置。可以逐步定义新的相机位置，以遵循任何复杂程度的单个路径。

左上角的 3D 窗口实时显示所有摄像机设置的效果。最后一个例子将带您跟随整个消化系统穿过动物进行虚拟飞行。在这里，您可以看到 gma、煤矿、盂唇和罗特拉的一些部分。

我们越来越近，进入了动物的嘴里。在这里，您可以看到背面的 PHN。现在我们穿过食道进入心室。

我们的铆接螨虫有两个大 ker。这些是具有消化功能的类似结构。我们进入正确的 seum。

通过它的小开口，您可以看到许多 IDE 单元。这些在消化中起着重要作用，尽管完整的功能和机制尚不完全清楚。回到心室，我们看到一个特殊的结构，即 Isal 瓣膜，我们实际上在一分钟前通过它进入了心室，就在心室和结肠的交界处。

你可以看到一只食物公牛，它被压实并被萎缩膜包围。在食物团后面，你会看到一个粪便调色板。我们现在正在飞速浏览这个 FE 调色板。

之后，我们传递了短的冒号间并进入后冒号。在这里，您可以看到大而有特色的微生物。最后，您可以在此处看到特定动物板的内表面，就像 fe 调色板一样。

我们离开消化系统。现在我们对动物的外部腹侧进行简短的最终观察，并看到动物板、AAL 板和生殖板。