Eine schnelle und Quantitative Methode für Post-translationale Modifikation und Variante aktiviert Mapping von Peptiden mit Genomen

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22. Mai 2018

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Hier stellen wir Ihnen das Proteogenomic-Tool PoGo und Protokolle für den schnellen, quantitativen, Post-translationale Modifikation und Variante aktiviert Zuordnung von Peptiden durch Massenspektrometrie auf Referenz Genomen identifiziert. Dieses Tool ist von nutzen, zu integrieren und Proteogenomic und persönliche Proteomik-Studien mit orthogonalen Genomik Daten zu visualisieren.

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PoGo-Software

Chapters in this video

0:05

Titel

0:51

Mapping von Peptiden unter Verwendung von PoGoGUI

2:36

Visualisierung im Integrative Genomics Viewer

3:57

Mapping von Peptiden aus einer benutzerdefinierten Variantendatenbank auf ein Referenzgenom

4:44

Mapping von Peptiden aus mehreren Dateien unter Verwendung von PoGoGUI

5:48

Erstellung eines Track Hubs aus gemappten Peptiden und Visualisierung eines Track Hubs im UCSC Genome Browser

6:50

Ergebnisse: Mapping von Peptiden auf Genome unter Berücksichtigung von posttranslationalen Modifikationen und Varianten

8:21

Schlussfolgerung

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