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Optimisation de Microdissection Laser-Capture d’isolement de Ganglia entérique de tissu humain fr...
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JoVE Journal Neuroscience
Optimization of Laser-Capture Microdissection for the Isolation of Enteric Ganglia from Fresh-Frozen Human Tissue

Optimisation de Microdissection Laser-Capture d’isolement de Ganglia entérique de tissu humain frais-congelé

Full Text
9,103 Views
08:28 min
June 14, 2018

DOI: 10.3791/57762-v

Aaron A. May-Zhang1, Karen K Deal1, E. Michelle Southard-Smith1

1Vanderbilt University Medical Center

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study outlines a protocol for extracting high-integrity RNA from enteric ganglia isolated from freshly-resected human intestinal tissue using laser capture microdissection (LCM). The method aims to investigate the expression profiles of the enteric nervous system in human intestines, enhancing our understanding of neural functions within the gastrointestinal tract.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Molecular Biology
  • Gastroenterology

Background

  • The enteric nervous system plays a critical role in gastrointestinal function.
  • High-quality RNA is essential for studying gene expression profiles.
  • Laser capture microdissection allows for precise isolation of cellular structures.
  • This technique facilitates detailed molecular analyses from intact tissue.

Purpose of Study

  • To obtain high yields of RNA from human enteric ganglia.
  • To preserve RNA quality while minimizing tissue damage.
  • To assess gene expression profiles in the human enteric nervous system.

Methods Used

  • Laser capture microdissection (LCM) of enteric ganglia from human tissue samples.
  • Freshly-resected intestinal tissue was processed to isolate ganglia.
  • Critical steps included cryosectioning, staining, and dehydration.
  • RNA extraction followed the LCM techniques to achieve high RNA integrity.

Main Results

  • The protocol yielded over 1 nanogram of high-quality RNA for sequencing.
  • RNA integrity numbers indicated excellent RNA quality suitable for RNA-Seq.
  • More than 95% of samples were sufficient for sequencing analyses.

Conclusions

  • This study demonstrates an effective method for isolating RNA from human enteric ganglia.
  • The results enable deeper insights into the molecular mechanisms of the enteric nervous system.
  • This method has implications for research on gastrointestinal disorders and neural function.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of using LCM for RNA extraction?
Laser capture microdissection allows for precise targeting and isolation of specific cell types, minimizing contamination and maximizing RNA quality.
How is the enteric ganglia model implemented in this study?
Enteric ganglia are isolated from freshly-resected human intestinal tissue processed through cryosectioning and LCM to study their gene expression.
What types of data can be obtained using this RNA extraction protocol?
This method enables high-quality RNA for transcriptomic analyses, facilitating the investigation of gene expression dynamics in the enteric nervous system.
How can this method be applied in future research?
The protocol can be adapted to study other tissues or cell types, broadening its applications in neuroscience and molecular biology.
What are some limitations of this approach?
Sample quality, proper handling, and swift processing are crucial to obtaining high integrity RNA; any deviation may affect results.

Le but du présent protocole est d’obtenir des échantillons d’ARN haute intégrité de ganglia entérique isolée du tissu intestinal humain non fixée, fraîchement réséquée à l’aide de microdissection de saisie de laser (LCM). Ce protocole consiste à préparer les échantillons congelés flash de tissu intestinal humain, de cryosectioning, de coloration dans l’éthanol et de déshydratation, LCM et extraction de l’ARN.

Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés sur le système nerveux entérique, telles que le profil d’expression des ganglions entériques dans les intestins des humains adultes. Le principal avantage de cette technique est qu’elle peut être utilisée pour obtenir des rendements élevés d’ARN à partir de ganglions entériques humains tout en préservant au maximum la qualité de l’ARN. Commencez par le tissu intestinal coupé en longueurs de 20 centimètres.

Tout d’abord, coupez le tissu adipeux et conjonctif. Évitez d’entailler la séreuse, ce qui peut entraîner des dommages structurels au plexus myentérique. Ensuite, faites une incision longitudinale sur toute la longueur de l’échantillon paré, de préférence au site d’attache mésentérique.

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Neurosciences numéro 136 microdissection Laser-capture (LCM) tissu intestinal humain intestin ganglia entérique système nerveux entérique extraction de l’ARN Violet de crésyle coloration RNA séquençage (RNA-Seq)

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