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Détermination de l’interaction tripartite entre deux monomères d’un facteur de transcription MADS...
Détermination de l’interaction tripartite entre deux monomères d’un facteur de transcription MADS...
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JoVE Journal Biology
Determination of Tripartite Interaction between Two Monomers of a MADS-box Transcription Factor and a Calcium Sensor Protein by BiFC-FRET-FLIM Assay

Détermination de l’interaction tripartite entre deux monomères d’un facteur de transcription MADS-box et d’une protéine de capteur de calcium par essai BiFC-FRET-FLIM

Full Text
4,265 Views
14:34 min
December 25, 2021

DOI: 10.3791/62791-v

Neelima Boora*1, Vibha Verma*1, Ridhi Khurana1, Gautam Gawande1, Sanchi Bhimrajka1, Komal Chaprana1, Meenu Kapoor2, Sanjay Kapoor1

1Interdisciplinary Centre for Plant Genomics, Department of Plant Molecular Biology,University of Delhi South Campus, 2University School of Biotechnology,Guru Gobind Singh Indraprastha University

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a novel method to visualize ternary complex formation between three proteins using bimolecular fluorescence complementation (BiFC) combined with fluorescence resonance energy transfer (FRET) and fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM). The approach allows for the observation of protein-protein interactions within live cells, enhancing our understanding of complex biological processes.

Key Study Components

Research Area

  • Protein-protein interactions
  • Fluorescent imaging technologies
  • Cell biology

Background

  • Understanding protein interactions is crucial for studying various biological functions.
  • This method builds on previous work utilizing BiFC for examining protein complexes.
  • The addition of FLIM provides a more detailed analysis of interactions.

Methods Used

  • BiFC-FRET-FLIM assay for visualizing protein interactions
  • Nicotiana benthamiana as the biological model system
  • Fluorescence lifetime measurements to assess interactions

Main Results

  • Successful demonstration of tripartite interactions between selected proteins.
  • Visualization of reconstituted YFP and its application in FRET analysis.
  • Quantification of interaction through changes in fluorescence lifetime.

Conclusions

  • The study effectively illustrates the use of BiFC-FRET-FLIM for examining complex protein interactions.
  • This method is significant for advancing research in molecular biology and protein signaling pathways.

Frequently Asked Questions

What is the significance of using BiFC with FRET-FLIM?
This combination allows researchers to visualize complex protein interactions and quantify them in vivo, improving our understanding of cell signaling.
Which organism was used in this study?
The study utilized Nicotiana benthamiana, a common model in plant molecular biology.
What are the critical steps in carrying out the method?
Key steps include cloning genes of interest, transforming agrobacteria, and performing agroinfiltration into plant tissues.
How does the method validate the tripartite interactions?
The method validates interactions by measuring the fluorescence lifetime changes of the donor molecule in the presence of acceptors.
What potential applications does this method have?
This method can be applied to study various protein interactions, signaling pathways, and cellular processes in live cells.
How long does it take to prepare plants for the analysis?
Plant preparation takes several weeks, including germination and growth stages before agroinfiltration can occur.
Is this method applicable to organisms other than plants?
While this study focuses on plants, similar techniques can be adapted for use in other model organisms.

Nous présentons ici une méthode pour visualiser la formation de complexes ternaires entre trois partenaires protéiques à l’aide de protéines marquées par fluorescence par le test FRET-FLIM basé sur BiFC. Cette méthode est précieuse pour étudier les complexes d’interaction protéine-protéine in vivo.

L’étude des interactions protéine-protéine permet de comprendre la régulation de nombreux processus biologiques. Ici, nous démontrons une procédure décrite initialement par Y John shoe and co. Workers en 2007, où les auteurs ont utilisé BiFC en combinaison avec FRET pour valider l’interaction tripartite entre trois molécules de protéines.

Cependant, nous avons inclus des mesures de la durée de vie de la fluorescence dans cette procédure pour étayer les mesures FRET. Pour démontrer une interaction tripartite, nous avons choisi une protéine, qui est connue pour homodimériser. En outre, il a également été validé en interne pour interagir avec un capteur de calcium de protéine appelée protéine C dans ce protocole.

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