Name: Détection rapide et spécifique des infections à Acinetobacter baumannii à l’aide d’un système d’amplification par polymérase recombinase/système à base de Cas12a (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-04-25T13:10:00.000+00:00
Duration: 7 min 59 s
Description: Découvrez une méthode de détection rapide et spécifique d'Acinetobacter baumannii utilisant l'amplification par polymérase recombinase et le système CRISPR-Cas12a. Cette technique offre une sensibilité d'une copie par microlitre.

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<ol><li>Lenie, D., Alexandr, N., Harald, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+increasing+threat+in+hospitals%3A+Multidrug-resistant+Acinetobacter+baumannii%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An increasing threat in hospitals: Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii.</a> Nat Rev Microbiol. 5 (12), 939-951 (2007).</li>
<li>Li, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+of+Acinetobacter+baumannii+and+molecular+epidemiology+of+carbapenem-resistant+A.+baumannii+in+two+comprehensive+hospitals+of+Beijing%2C+China%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid detection of Acinetobacter baumannii and molecular epidemiology of carbapenem-resistant A. baumannii in two comprehensive hospitals of Beijing, China.</a> Front Microbiol. 6, 997(2015).</li>
<li>Wu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+diagnostic+test+that+uses+isothermal+amplification+and+lateral+flow+detection+sdaA+can+detect+tuberculosis+in+60+min%5BTitle%5D)+AND+%22J+Appl+Microbiol%22%5BJournal%5D)">A diagnostic test that uses isothermal amplification and lateral flow detection sdaA can detect tuberculosis in 60 min.</a> J Appl Microbiol. 130 (6), 2102-2110 (2020).</li>
<li>Huang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cas12a-based+fluorescent+microfluidic+system+for+rapid+on-site+human+papillomavirus+diagnostics%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">A cas12a-based fluorescent microfluidic system for rapid on-site human papillomavirus diagnostics.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 107 (20), 6287-6297 (2023).</li>
<li>Piepenburg, O., Williams, C. H., Stemple, D. L., Armes, N. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+detection+using+recombination+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+Biology%22%5BJournal%5D)">DNA detection using recombination proteins.</a> Plos Biology. 4 (7), 1115-1121 (2006).</li>
<li>Abudayyeh, O. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C2c2+is+a+single-component+programmable+RNA-guided+RNA-targeting+CRISPR+effector%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector.</a> Science. 353 (6299), aaf5573(2016).</li>
<li>Chen, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a+target+binding+unleashes+indiscriminate+single-stranded+DNase+activity%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a target binding unleashes indiscriminate single-stranded DNase activity.</a> Science. 360 (6387), eaar6245(2018).</li>
<li>Xiong, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+of+SARS-CoV-2+with+CRISPR-Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">Rapid detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas12a.</a> PLoS Biol. 18 (12), e3000978(2020).</li>
<li>Gootenberg, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nucleic+acid+detection+with+crispr-Cas13a%2FC2C2%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Nucleic acid detection with crispr-Cas13a/C2C2.</a> Science. 356 (6336), 438-442 (2017).</li>
<li>Harrington, L. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Programmed+DNA+destruction+by+miniature+CRISPR-Cas14+enzymes%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Programmed DNA destruction by miniature CRISPR-Cas14 enzymes.</a> Science. 362 (6416), 839-842 (2018).</li>
<li>Li, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a+has+both+cis-+and+trans-cleavage+activities+on+single-stranded+DNA%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Res%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a has both cis- and trans-cleavage activities on single-stranded DNA.</a> Cell Res. 28 (4), 491-493 (2018).</li>
<li>Wang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cas12aVDet%3A+A+CRISPR%2FCas12a-based+platform+for+rapid+and+visual+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Cas12aVDet: A CRISPR/Cas12a-based platform for rapid and visual nucleic acid detection.</a> Anal Chem. 91 (19), 12156-12161 (2019).</li>
<li>Huang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultra-sensitive+and+high-throughput+crispr-p+owered+COVID-19+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Biosens+Bioelectron%22%5BJournal%5D)">Ultra-sensitive and high-throughput crispr-p owered COVID-19 diagnosis.</a> Biosens Bioelectron. 164, 112316(2020).</li>
<li>Zhang, W. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reverse+transcription+recombinase+polymerase+amplification+coupled+with+CRISPR-Cas12a+for+facile+and+highly+sensitive+colorimetric+SARS-CoV-2+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Reverse transcription recombinase polymerase amplification coupled with CRISPR-Cas12a for facile and highly sensitive colorimetric SARS-CoV-2 detection.</a> Anal Chem. 93 (8), 4126-4133 (2021).</li>
<li>Marraffini Luciano, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas+immunity+in+prokaryotes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas immunity in prokaryotes.</a> Nature. 526 (7571), 55-61 (2015).</li>
<li>Mohanraju, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diverse+evolutionary+roots+and+mechanistic+variations+of+the+CRISPR-Cas+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Diverse evolutionary roots and mechanistic variations of the CRISPR-Cas systems.</a> Science. 353 (6299), aad5147(2016).</li>
<li>Makarova, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+updated+evolutionary+classification+of+CRISPR-Cas+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An updated evolutionary classification of CRISPR-Cas systems.</a> Nat Rev Microbiol. 13 (11), 722-736 (2015).</li>
<li>Li, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-assisted+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Discovery%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-assisted nucleic acid detection.</a> Cell Discovery. 4 (1), 20(2018).</li>
<li>Li, L., Li, S., Wu, N., Wu, J., Wang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Holmesv2%3A+A+CRISPR-Cas12b-assisted+platform+for+nucleic+acid+detection+and+DNA+methylation+quantitation%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Synth+Biol%22%5BJournal%5D)">Holmesv2: A CRISPR-Cas12b-assisted platform for nucleic acid detection and DNA methylation quantitation.</a> ACS Synth Biol. 8 (10), 2228-2237 (2019).</li>
<li>Liang, M., Li, Z., Wang, W., Liu, J., Zhang, L. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+CRISPR-Cas12a-derived+biosensing+platform+for+the+highly+sensitive+detection+of+diverse+small+molecules%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Communications%22%5BJournal%5D)">A CRISPR-Cas12a-derived biosensing platform for the highly sensitive detection of diverse small molecules.</a> Nat Communications. 10 (1), 3672(2019).</li>
<li>Aquino-Jarquin, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas14+is+now+part+of+the+artillery+for+gene+editing+and+molecular+diagnostic%5BTitle%5D)+AND+%22Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas14 is now part of the artillery for gene editing and molecular diagnostic.</a> Nanomedicine. 18, 428-431 (2019).</li>
<li>Zetsche, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cpf1+is+a+single+RNA-guided+endonuclease+of+a+class+2+CRISPR-Cas+system%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cpf1 is a single RNA-guided endonuclease of a class 2 CRISPR-Cas system.</a> Cell. 163 (3), 759-771 (2015).</li>
<li>Fonfara, I., Richter, H., Bratovic, M., Le Rhun, A., Charpentier, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+CRISPR-associated+DNA-cleaving+enzyme+Cpf1+also+processes+precursor+CRISPR+RNA%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">The CRISPR-associated DNA-cleaving enzyme Cpf1 also processes precursor CRISPR RNA.</a> Nature. 532 (7600), 517-521 (2016).</li>
<li>Swarts, D. C., John, V. D. O., Jinek, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structural+basis+for+guide+RNA+processing+and+seed-dependent+DNA+targeting+by+CRISPR-Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Structural basis for guide RNA processing and seed-dependent DNA targeting by CRISPR-Cas12a.</a> Mol Cell. 66 (2), 221-233 (2017).</li>
<li>Jiang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cpf1+assisted+genome+editing+of+Corynebacterium+glutamicum%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cpf1 assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum.</a> Nat Commun. 8, 15179(2017).</li>
<li>Yan, M. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-assisted+recombineering+in+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-assisted recombineering in bacteria.</a> Appl Environ Microbiol. 83 (17), e00947-e01017 (2017).</li>
<li>Ashraf, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+multiplex+pcr+assay+for+simultaneous+detection+of+nine+clinically+significant+bacterial+pathogens+associated+with+bovine+mastitis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Probes%22%5BJournal%5D)">A novel multiplex pcr assay for simultaneous detection of nine clinically significant bacterial pathogens associated with bovine mastitis.</a> Mol Cell Probes. 33, 57-64 (2017).</li>
<li>Zhu, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+rapid+on-site+visualization+platform+based+on+RPA+coupled+with+CRISPR-Cas12a+for+the+detection+of+genetically+modified+papaya+%27huanong+no.1%27%5BTitle%5D)+AND+%22Talanta%22%5BJournal%5D)">A rapid on-site visualization platform based on RPA coupled with CRISPR-Cas12a for the detection of genetically modified papaya 'huanong no.1'.</a> Talanta. 277, 126437(2024).</li>
<li>Zheng, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+developments+in+lateral+flow+immunoassay+for+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Analyst%22%5BJournal%5D)">Rapid developments in lateral flow immunoassay for nucleic acid detection.</a> Analyst. 146 (5), 1514-1528 (2021).</li>
<li>Wang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+and+clinical+application+of+a+RPA-LFS+assay+for+detection+of+capsulated+and+non-capsulated+Haemophilus+influenzae%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Establishment and clinical application of a RPA-LFS assay for detection of capsulated and non-capsulated Haemophilus influenzae.</a> Front Cell Infect Microbiol. 12, 878813(2022).</li>
<li>Wang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+sensitive+recombinase+polymerase+amplification+combined+with+lateral+flow+strips+for+detecting+Candida+albicans%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Biochem%22%5BJournal%5D)">Rapid and sensitive recombinase polymerase amplification combined with lateral flow strips for detecting Candida albicans.</a> Anal Biochem. 633, 114428(2021).</li>
<li>Ma, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+efficient+method+for+potential+point-of-care+diagnosis+of+human+papillomavirus+genotypes%3A+Combination+of+isothermal+recombinase+polymerase+amplification+with+lateral+flow+dipstick+and+reverse+dot+blot%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Bioanal+Chem%22%5BJournal%5D)">A simple and efficient method for potential point-of-care diagnosis of human papillomavirus genotypes: Combination of isothermal recombinase polymerase amplification with lateral flow dipstick and reverse dot blot.</a> Anal Bioanal Chem. 411 (28), 7451-7460 (2019).</li>
<li>Sun, Y., Yu, L., Liu, C., Ye, S., Huang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((One-tube+SARS-CoV-2+detection+platform+based+on+RT-RPA+and+CRISPR%2FCas12a%5BTitle%5D)+AND+%22J+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">One-tube SARS-CoV-2 detection platform based on RT-RPA and CRISPR/Cas12a.</a> J Transl Med. 19 (1), 74(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>-20 ° C Congélateur</td><td>Haier</td><td>HYCD-290</td><td>Chine</td></tr><tr><td>Agarose Basic</td><td>BioFroxx</td><td>1110GR100</td><td>Chine</td></tr><tr><td>Tous les oligonucléotides et l’ARNcr ont été synthétisés par la société</td><td>www.comatebio.com</td><td></td><td></td></tr><tr><td>substrat de coupe Cas12a - ADNss - fluorescent de type</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>Substrat de coupe DNA-FAM-BHQ</td><td>China</td></tr><tr><td>Cas12a - ssDNA - papier réactif type</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>DNA-FAM-BIO</td><td>Chine Appareil</td></tr><tr><td>d’électrophorèse</td><td>BIO-RAD</td><td>POWER</td> PAC1000 <td>USA</td></tr><tr><td>Instrument de PCR quantitative par fluorescence</td><td>BIO-RAD</td><td>CFX Connect</td><td>USA</td></tr><tr><td>Système d’imagerie sur gel</td><td>BIO-RAD</td><td>Gel Doc 2000</td><td>USA</td></tr><tr><td>https://ezassay.com/rna</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>https://www.ezassay.com/primer&nbsp;&nbsp ;</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast</tr><tr><td>Bande de papier à flux latéral (Biotin/FAM)</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>HD-FMBO</td><td>Chine</td></tr><tr><td>LbaCas12a (Cpf1) protéine améliorée</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>CAS-12E-001</td><td></td></tr><tr><td>Chine LED Transilluminateur</td><td>LABGIC</td><td>BL-20</td><td>Chine</td></tr><tr><td>Acétate de magnésium, MgOAc</td><td>TwistDx</td><td>TABAS03KIT</td><td>Royaume-Uni</td></tr><tr><td>Microcentrifugeuse</td><td>allsheng</td><td>Mini-6k</td><td>Chine</td></tr><tr><td>Tubes de bandelettes PCR</td><td>Tubes de bandelettes PCR</td><td>PST-0208-FT-C</td><td>Chine</td></tr><tr><td>TGrade Incubateur à bain sec</td><td>Tiangen technologie biochimique&nbsp;</td><td>OSE-DB-01</td><td></td></tr><tr><td>China Tianamp Bacteria DNA Kit</td><td>Tiangen technologie biochimique&nbsp ;</td><td>DP302-02</td><td></td></tr><tr><td>China TIANamp Bacteria DNA Kit&nbsp ;</td><td>TIANGEN BIOTECH&nbsp ; (BEIJING) CO. ; Ltée.</td><td>DP302</td><td>&nbsp ; Chine&nbsp ;</td></tr><tr><td>TransStart&nbsp ; FastPfu&nbsp ; ADN polymérase&nbsp ;</td><td>TransGen Biotech. Co. Ltd.</td><td>AP221</td><td>&nbsp ; Chine&nbsp ;</td></tr><tr><td>TwistAmp Basic Kit</td><td>TwistDX</td><td>TABAS03KIT</td><td>UK</td></tr><tr><td>Universal DNA Purification</td><td>Kit Technologie biochimique Tiangen&nbsp ;</td><td>DP214-03</td><td>Chine</td></tr></tbody></table>

détection rapide et spécifique des infections à acinetobacter baumannii à l’aide d’un système d’amplification par polymérase recombinase/système à base de cas12a

Rapid and Specific Detection of Acinetobacter baumannii Infections Using a Recombinase Polymerase Amplification/Cas12a-based System

Dans cette étude, nous présentons une nouvelle plate-forme de diagnostic portable nommée A. baumannii-DETECTR, qui intègre l’efficacité d’amplification isotherme du système RPA et CRISPR-Cas12a pour une identification rapide et fiable d’A. baumannii sur le terrain. Le schéma du test DETECTR est illustré à la figure 1.
Douze paires d’apprêts ont été conçues à l’aide d’outils de conc...

Détection rapide et spécifique des infections à Acinetobacter baumannii à l’aide d’un système d’amplification par polymérase recombinase/système à base de Cas12a

Acinetobacter baumannii, a gram-negative bacterium, is notorious for causing severe infections with high mortality rates. Rapid and accurate detection of ...

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JoVE Journal

Immunology and Infection

Immunologie et infection

Nous avons récemment rapporté une nouvelle approche pour générer des sondes DNAzyme fluorogènes qui peuvent être appliqués à mettre en place un simple, «mix-and-lire" immunofluorescence pour la détection bactérienne. Ces sondes d'ADN spécifiques catalyser le clivage d'un chromophore de modification d'ADN-ARN substrat chimérique en présence d'un mélange brut extracellulaire (LEC) produite par une bactérie spécifique, traduisant ainsi la détection de bactéries dans la génération du signal de...

Détection des bactéries à l&#39;aide ADNzymes fluorogènes

Fournit un protocole pour développer un test d’amplification de la polymérase recombinase en temps réel afin de quantifier la concentration initiale d’échantillons d’ADN à l’aide d’un thermocycleur ou d’un microscope et d’un réchauffeur de platine. Le développement d’un contrôle positif interne est également décrit. Des scripts sont fournis pour le traitement des données brutes de fluorescence en temps réel.

Développement d&#39;un Quantitative recombinase polymérase L&#39;amplification Assay avec un contrôle positif interne

Ce protocole décrit comment construire un système de chaîne polymérase à flux continu basé sur une puce microfluidique et comment construire un système d’électrophorèse capillaire en laboratoire. Il présente une méthode simple pour l’analyse des acides nucléiques en laboratoire.

Amplification d’Escherichia coli dans une puce microfluidique PCR à flux continu et sa détection à l’aide d’un système d’électrophorèse capillaire

Dans ce travail, une méthode de détection rapide, sensible et portable pour Candidatus Liberibacter asiaticus basée sur l’amplification de la polymérase recombinase combinée à CRISPR-Cas12a a été développée.

Détection de Candidatus liberibacter asiaticus déployable sur le terrain à l’aide de l’amplification de la polymérase recombinase combinée à CRISPR-Cas12a

Nous présentons un protocole qui combine l’amplification de la polymérase recombinase avec un système CRISPR/Cas12a pour la détection de traces de virus à ADN et construisons une microscopie portable pour smartphone avec une classification assistée par l’intelligence artificielle pour la détection des virus à ADN au point de service.

Système de détection de virus à ADN basé sur RPA-CRISPR/Cas12a-SPM et Deep Learning

Nous décrivons une procédure simple pour la complémentation chromosomique à copie unique d’un gène de pompe d’efflux à l’aide d’un système d’expression basé sur mini-Tn7 dans une souche modifiée d’Acinetobacter baumannii déficiente en efflux. Cet outil génétique précis permet une expression génique contrôlée, ce qui est essentiel pour la caractérisation des pompes d’efflux chez les pathogènes multirésistants.

Caractérisation des systèmes d’efflux multimédicamenteux chez Acinetobacter baumannii à l’aide d’une souche bactérienne déficiente en efflux et d’un système d’expression génique à copie unique

Divers agents pathogènes bactériens peuvent provoquer des infections des voies respiratoires et entraîner de graves problèmes de santé s’ils ne sont pas détectés avec précision et traités rapidement. La détection rapide et précise de ces agents pathogènes par amplification isotherme médiée par boucle permet une gestion et un contrôle efficaces des infections des voies respiratoires en milieu clinique.

Détection rapide d’agents pathogènes bactériens à l’origine d’infections des voies respiratoires inférieures grâce à une amplification isotherme médiée par boucle à base de puce microfluidique

Ici, nous présentons la préparation étape par étape de l’amplification isotherme prémélangée et lyophilisée basée sur la recombinase et des réactions basées sur CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats), qui peuvent être utilisées pour la détection de biomarqueurs d’acides nucléiques d’agents pathogènes de maladies infectieuses ou d’autres marqueurs génétiques d’intérêt.

Diagnostics basés sur CRISPR au point d’intervention avec réactifs prémélangés et lyophilisés

Dans ce protocole, un test combiné d’amplification de la recombinase polymérase CRISPR/Cas12a est illustré pour la détection de l’agent pathogène envahissant des plantes, Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4.

Amplification combinée de la recombinase polymérase Essai CRISPR/Cas12a pour la détection de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4

Ici, nous décrivons une procédure simple et rapide pour détecter l’ADN d’agents pathogènes d’abeilles, tels que Lotmaria passim et Nosema ceranae, à l’aide d’une lyse cellulaire prête à l’amplification, d’une amplification par polymérase recombinase et de tests CRISPR/Cas12a.

Détection sur site de l’ADN des parasites trypanosomatidés et de Nosema ceranae par lyse alcaline couplée au système RPA/CRISPR/Cas12a

Découvrez une méthode de détection rapide et spécifique d'Acinetobacter baumannii utilisant l'amplification par polymérase recombinase et le système CRISPR-Cas12a. Cette technique offre une sensibilité d'une copie par microlitre.

Détection rapide et spécifique des infections à Acinetobacter baumannii à l’aide d’un système d’amplification par polymérase recombinase/système à base de Cas12a (Vidéo) | JoVE Journal

Détection rapide et spécifique des infections à Acinetobacter baumannii à l’aide d’un système d’amplification par polymérase recombinase/système à base de Cas12a

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