Name: שיטת האינטראקציה של כרומטין DNA-DNA המקושר ל-RNA (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-30T13:10:00.000+00:00
Duration: 11 min 1 s
Description: למד את שיטת RDD למיפוי אינטראקציות כרומטין המקושרות ל-RNA ספציפי באמצעות ביוטינילציה וליגציית קרבה. השיטה מאפשרת זיהוי ברזולוציה גבוהה של לוקוסים גנומיים וקשרים מרחוק להבנת ארגון הגנום.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Rao, S. S. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+3D+map+of+the+human+genome+at+kilobase+resolution+reveals+principles+of+chromatin+looping%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A 3D map of the human genome at kilobase resolution reveals principles of chromatin looping.</a> Cell. 159 (7), 1665-1680 (2014).</li>
<li>Fullwood, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+oestrogen-receptor-%CE%B1-bound+human+chromatin+interactome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">An oestrogen-receptor-α-bound human chromatin interactome.</a> Nature. 462 (7269), 58-64 (2009).</li>
<li>Li, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((GRID-seq+reveals+the+global+RNA-chromatin+interactome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">GRID-seq reveals the global RNA-chromatin interactome.</a> Nat Biotechnol. 35 (10), 940-950 (2017).</li>
<li>Tian, S. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3D+chromatin+structures+associated+with+ncRNA+roX2+for+hyperactivation+and+coactivation+across+the+entire+X+chromosome%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Adv%22%5BJournal%5D)">3D chromatin structures associated with ncRNA roX2 for hyperactivation and coactivation across the entire X chromosome.</a> Sci Adv. 10 (30), eado5716(2024).</li>
<li>Rinn, J., Guttman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA+and+dynamic+nuclear+organization%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">RNA and dynamic nuclear organization.</a> Science. 345 (6202), 1240-1241 (2014).</li>
<li>Chu, C., Qu, K., Zhong, F. L., Artandi, S. E., Chang, H. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+Maps+of+Long+Noncoding+RNA+Occupancy+Reveal+Principles+of+RNA-Chromatin+Interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Genomic Maps of Long Noncoding RNA Occupancy Reveal Principles of RNA-Chromatin Interactions.</a> Mol Cell. 44 (4), 667-678 (2011).</li>
<li>Simon, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genomic+binding+sites+of+a+noncoding+RNA%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci%22%5BJournal%5D)">The genomic binding sites of a noncoding RNA.</a> Proc Natl Acad Sci. 108 (51), 20497-20502 (2011).</li>
<li>Yan, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+colocalization+of+RNA-DNA+interactions+and+fusion+RNA+pairs%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci%22%5BJournal%5D)">Genome-wide colocalization of RNA-DNA interactions and fusion RNA pairs.</a> Proc Natl Acad Sci. 116 (8), 3328-3337 (2019).</li>
<li>Quinodoz, S. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA+promotes+the+formation+of+spatial+compartments+in+the+nucleus%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">RNA promotes the formation of spatial compartments in the nucleus.</a> Cell. 184 (23), 5775-5790 (2021).</li>
<li>Li, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-read+ChIA-PET+for+base-pair-resolution+mapping+of+haplotype-specific+chromatin+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Long-read ChIA-PET for base-pair-resolution mapping of haplotype-specific chromatin interactions.</a> Nat Protoc. 12 (5), 899-915 (2017).</li>
<li>Fang, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mapping+of+long-range+chromatin+interactions+by+proximity+ligation-assisted+ChIP-seq%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Res%22%5BJournal%5D)">Mapping of long-range chromatin interactions by proximity ligation-assisted ChIP-seq.</a> Cell Res. 26 (12), 1345-1348 (2016).</li>
<li>Mumbach, M. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((HiChIP%3A+efficient+and+sensitive+analysis+of+protein-directed+genome+architecture%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Meth%22%5BJournal%5D)">HiChIP: efficient and sensitive analysis of protein-directed genome architecture.</a> Nat Meth. 13 (11), 919-922 (2016).</li>
<li>Lee, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ChIA-PIPE%3A+A+Fully+Automated+Pipeline+for+Comprehensive+ChIA-PET+Data+Analysis+and+Visualization%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Adv%22%5BJournal%5D)">ChIA-PIPE: A Fully Automated Pipeline for Comprehensive ChIA-PET Data Analysis and Visualization.</a> Sci Adv. 6 (28), eaay2078(2020).</li>
<li>Meller, V. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ordered+Assembly+of+roX+RNAs+into+MSL+Complexes+on+the+Dosage-Compensated+X+Chromosome+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Ordered Assembly of roX RNAs into MSL Complexes on the Dosage-Compensated X Chromosome in Drosophila.</a> Curr Biol. 10 (3), 136-143 (2000).</li>
<li>Egloff, S., Studniarek, C., Kiss, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((7SK+small+nuclear+RNA%2C+a+multifunctional+transcriptional+regulatory+RNA+with+gene-specific+features%5BTitle%5D)+AND+%22Transcription%22%5BJournal%5D)">7SK small nuclear RNA, a multifunctional transcriptional regulatory RNA with gene-specific features.</a> Transcription. 9 (2), 95-101 (2018).</li>
<li>Tian, S. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Landscape+of+the+Epstein-Barr+virus-host+chromatin+interactome+and+gene+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Landscape of the Epstein-Barr virus-host chromatin interactome and gene regulation.</a> EMBO J. 44 (13), 3872-3915 (2025).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0.5 מיליון EDTA</td><td>Invitrogen</td><td>AM9260G</td><td></td></tr><tr><td>1 M מגנזיום אצטט</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>63052-100ML</td><td></td></tr><tr><td>1 מטר טריס-HCl pH 7.0</td><td>Invitrogen</td><td>AM9851</td><td></td></tr><tr><td>1 מטר טריס-HCl pH 8.0</td><td>Invitrogen</td><td>AM9856</td><td></td></tr><tr><td>צינורות בנפח 1.5 מ"ל</td><td>אפנדורף</td><td>30108051</td><td></td></tr><tr><td>10 mM dATP</td><td>Invitrogen</td><td>18252015</td><td></td></tr><tr><td>10% SDS (משקל/נפח)</td><td>Invitrogen</td><td>AM9822</td><td></td></tr><tr><td>10&times; בופר זנב A</td><td>NEB</td><td>B7002S</td><td></td></tr><tr><td>10&times; בופר סופי לתיקון</td><td>NEB</td><td>B6002S</td><td></td></tr><tr><td>10&times; בופר ליגאזות DNA של T4</td><td>NEB</td><td>B0202S</td><td></td></tr><tr><td>10&times; בופר TBE</td><td>Invitrogen</td><td>AM9863</td><td></td></tr><tr><td>מבחנות 14 מ"ל עם תחתית עגולה</td><td>קורנינג</td><td>352057</td><td></td></tr><tr><td>2&times; מיקס מאסטר PCR</td><td>NEB</td><td>M0541</td><td></td></tr><tr><td>20&00; בופר SSC</td><td>Invitrogen</td><td>AM9770</td><td></td></tr><tr><td>200-&mu; צינורות PCR L</td><td>סאנגון ביוטק</td><td>F611541-0010</td><td></td></tr><tr><td>בקבוקי אחסון Square PET בנפח 250 מ"ל</td><td>קורנינג</td><td>431531</td><td></td></tr><tr><td>2-מרקפטואנול (&beta;-ME)</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>M6250-100mL</td><td>! זהירות ו-ME רעיל; תמיד תשתמש בזה במכסה אדים.</td></tr><tr><td>צינורות 2 מ"ל</td><td>אפנדורף</td><td>22431048</td><td></td></tr><tr><td>3 M נתרן אצטט pH 5.5</td><td>Invitrogen</td><td>AM9740</td><td></td></tr><tr><td>5 גברים NaCl&nbsp;</td><td>Invitrogen</td><td>AM9759</td><td></td></tr><tr><td>5 מ' אצטט אשלגן</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>95843-100ML-F</td><td></td></tr><tr><td>בקבוקי אחסון PET Square בנפח 500 מ"ל</td><td>קורנינג</td><td>431532</td><td></td></tr><tr><td>איזון אנליטי</td><td>סארטוריוס</td><td>BP211D</td><td></td></tr><tr><td>מונה סלולרי אוטומטי</td><td>קאונטרסטאר</td><td>IC1000</td><td></td></tr><tr><td>מערכת אלקטרופורזה קפילרית אוטומטית</td><td>ביופטיקה</td><td>C100100</td><td></td></tr><tr><td>גשושי ביוטינילציה</td><td>ג'נוויז</td><td></td><td>עיין ב-טבלה 1</td></tr><tr><td>אבקת חוסם</td><td>Invitrogen</td><td>T2015</td><td></td></tr><tr><td>אוליגוס מקשר גשר</td><td>ג'נוויז</td><td></td><td>עיין ב-טבלה 1</td></tr><tr><td>חממת CO2</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>51033549</td><td></td></tr><tr><td>דימתיל סולפוקסיד (DMSO)</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>D2650-100mL</td><td></td></tr><tr><td>ערכת הכנת ספריית DNA V2 עבור Illumina</td><td>ואזימה</td><td>TD501</td><td></td></tr><tr><td>ערכת טיהור DNA</td><td>זימו</td><td>D4013</td><td></td></tr><tr><td>דולבקו' s פספט מפופר מלח (DPBS) (1&times;)</td><td>גיבקו</td><td>14190250</td><td></td></tr><tr><td>קוקטייל מעכב פרוטאז ללא EDTA</td><td>רוש</td><td>11836170001</td><td></td></tr><tr><td>EGS (אתילן גליקול ביס[succiniMidylsuccinate])</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>21565</td><td></td></tr><tr><td>בופר השטפה</td><td>קיאגן</td><td>19086</td><td></td></tr><tr><td>אלכוהול אתילי, טהור</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>E7023-500mL</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת פורמלדהיד</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>47608-250mL-F</td><td>! אזהרה: פורמלדהיד הוא רעיל; תמיד תשתמש בזה במכסה אדים.</td></tr><tr><td>פורמיד</td><td>Invitrogen</td><td>AM9342</td><td></td></tr><tr><td>מערכת הדמיית ג'ל</td><td>טנון</td><td>3500R</td><td></td></tr><tr><td>גליצין</td><td>Invitrogen</td><td>50046-1 ק"ג</td><td></td></tr><tr><td>גליקוגן עם צבע כחול</td><td>Invitrogen</td><td>AM9516</td><td></td></tr><tr><td>מחסנית רגישות גבוהה</td><td>ביופטיקה</td><td>C105105</td><td></td></tr><tr><td>צינורות נעילת פאזה בצפיפות גבוהה (1.5 מ"ל)</td><td>קיאגן</td><td>129046</td><td></td></tr><tr><td>ערכת בדיקה פלואורומטרית של dsDNA ברגישות גבוהה</td><td>Invitrogen</td><td>Q32851</td><td></td></tr><tr><td>ערכת אינדקס V2 ל-Illumina</td><td>ואזימה</td><td>TD202</td><td></td></tr><tr><td>יודואצטיל-PEG2-ביוטין (IPB)</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>21334</td><td></td></tr><tr><td>אלכוהול איזופרופיל</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>I9030</td><td>! אזהרה: אלכוהול איזופרופיל הוא רעיל; תמיד תשתמש בזה במכסה אדים.</td></tr><tr><td>מחסנית בסיס קילו</td><td>ביופטיקה</td><td>C105106</td><td></td></tr><tr><td>קטע קלנואו (3'&rarr; 5' exo-)&nbsp;</td><td>NEB</td><td>M0212L</td><td></td></tr><tr><td>חרוזים מגנטיים</td><td>בקמן</td><td>A63881</td><td></td></tr><tr><td>מתקן הפרדה מגנטית&nbsp; לצינור 15 מ"ל</td><td>Invitrogen</td><td>12301D</td><td></td></tr><tr><td>מתקן הפרדה מגנטית&nbsp; לצינור בגודל 2 מ"ל</td><td>Invitrogen</td><td>12321D</td><td></td></tr><tr><td>מתקן הפרדה מגנטית לצינור PCR</td><td>NEB</td><td>S1515S</td><td></td></tr><tr><td>חממה מיקרוביולוגית</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>IMH180</td><td></td></tr><tr><td>מיקרוסקופ</td><td>ניקון</td><td>אקליפס TS2</td><td></td></tr><tr><td>מיקסר</td><td>אלמי</td><td>RM-2L</td><td></td></tr><tr><td>N,N-דימתילפורמיד (DMF)</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>227056-100ML</td><td>! זהירות: DMF הוא רעיל; תמיד תשתמש בזה במכסה אדים.</td></tr><tr><td>מיקרוצנטריפוגה לא מקוררת</td><td>אפנדורף</td><td>5405000204</td><td></td></tr><tr><td>מים ללא נוקלאז (לא מטופלים ב-DEPC, 1000 מ"ל)</td><td>Invitrogen</td><td>AM9932</td><td></td></tr><tr><td>מים ללא נוקלאז (לא מטופלים ב-DEPC, 50 מ"ל)</td><td>Invitrogen</td><td>AM9937</td><td></td></tr><tr><td>כמת חומצות גרעין</td><td>Invitrogen</td><td>Q33226</td><td></td></tr><tr><td>מתנער מסלולי</td><td>קריסטל</td><td>SYC-2102</td><td></td></tr><tr><td>פנול: כלורופורם:IAA</td><td>סולרביולוגיה</td><td>P1012-100mL</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת פרוטאנאז K</td><td>Invitrogen</td><td>AM2548</td><td></td></tr><tr><td>צנטריפוגה מקוררת</td><td>אפנדורף</td><td>22628180</td><td></td></tr><tr><td>חממה מקוררת</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>IMP180</td><td></td></tr><tr><td>מיקרוצנטריפוגה מקוררת</td><td>אפנדורף</td><td>5404F1621754</td><td></td></tr><tr><td>מקרר</td><td>הייר</td><td>DW-25L262</td><td></td></tr><tr><td>מעכב RNase</td><td>אמביון</td><td>AM2696</td><td></td></tr><tr><td>צינורות 15 מ"ל ללא RNase</td><td>Invitrogen</td><td>AM12500</td><td></td></tr><tr><td>צינורות 50 מ"ל ללא RNase</td><td>Invitrogen</td><td>AM12502</td><td></td></tr><tr><td>סוניקטור</td><td>סוניקס & חומרים</td><td>VCX130</td><td></td></tr><tr><td>חרוזים מגנטיים מצופים סטרפטווידין C1</td><td>Invitrogen</td><td>65001</td><td></td></tr><tr><td>חרוזים מגנטיים מצופים סטרפטווידין M-280&nbsp;</td><td>Invitrogen</td><td>11205D</td><td></td></tr><tr><td>T4 DNA ליגאז&nbsp;</td><td>NEB</td><td>M0202S</td><td></td></tr><tr><td>פולימראז DNA של T4</td><td>NEB</td><td>M0203S</td><td></td></tr><tr><td>pH של מאגר TE 8.0</td><td>Invitrogen</td><td>AM9849</td><td></td></tr><tr><td>מחזור תרמי</td><td>ביו-ראד</td><td>1851148</td><td></td></tr><tr><td>תרמומיקסר</td><td>אפנדורף</td><td>5382000023</td><td></td></tr><tr><td>טריטון X-100</td><td>אקרוס אורגניקס</td><td>327371000-100 מ"ל</td><td></td></tr><tr><td>מקפיא בטמפרטורה נמוכה במיוחד</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>995</td><td></td></tr><tr><td>מרוכז ואקום</td><td>טומי</td><td>MV-100</td><td></td></tr></tbody></table>

שיטת האינטראקציה של כרומטין dna-dna המקושר ל-rna

RNA-Associated Chromatin DNA-DNA Interaction Method

שיטת האינטראקציה של כרומטין DNA-DNA המקושר ל-RNA

RNA-Associated Chromatin DNA-DNA Interaction Method (RDD) is a targeted strategy for mapping chromatin interactions anchored by a specific RNA. It ...

rna-associated-chromatin-dna-dna-interaction-method

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

שיטת Hi-C מאפשר זיהוי משוחדת, גנום רחב של אינטראקציות הכרומטין (1). Hi-C זוגות קשירת סמיכות וסדר מקבילי מאסיבי. הנתונים וכתוצאה מכך ניתן ללמוד אדריכלות גנומית בקני מידה מרובות: התוצאות הראשוניות זיהו תכונות כגון בשטחים כרומוזום, הפרדה של הכרומטין פתוח, סגור, מבנה הכרומטין בקנה מידה megabase.

Hi-C: שיטה לחקר ארכיטקטורה תלת ממדי של הגנום.

המלכודת קשורה כרומוזום (ACT) assay היא שיטה חדשנית לזיהוי משוחדת ארוכי טווח אינטראקציות-DNA. אפיון האינטראקציות DNA ארוך טווח תאפשר לנו לקבוע את הקשר של האדריכלות גרעינית ביטוי גנים בפיזיולוגיה הן נורמליות במדינות חולה.

כרומוזום מלכודת הידיעות AP עבור זיהוי לטווח ארוך אינטראקציות DNA

ניתוח הכרומטין אינטראקציה ידי מנבא סוף תג הרצף (Chia-PET) היא...

הכרומטין ניתוח אינטראקציה עם מנבא סוף תג הרצף (Chia-PET) עבור מיפוי אינטראקציות הכרומטין הבנת תקנה תמלול

סרטון זה מתאר פרוטוקול לבדיקת משקעים חיסוניים של כרומטין (ChIP), שהיא טכניקה קלאסית להדגמת אינטראקציות חלבון-דנ"א. טכניקה זו משמשת לזיהוי גני מטרה בתאי לוקמיה לימפוציטית כרונית בבני אדם.

בדיקת משקעים חיסוניים של כרומטין: טכניקה לחקר אינטראקציות חלבון-דנ"א בתאים

כאן אנו מתארים פרוטוקול לזיהוי בו זמני של שינויי היסטון ידי רצפי DNA וimmunofluorescence ידי דגי DNA אחרי מיקרוסקופיה וניתוחים (דגי 3D החיסוני DNA) 3D.

Immunofluorescence שילוב ודגי DNA על 3D-השתמרו גרעיני Interphase לחקר שינויים בארגון גרעיני 3D

immunoprecipitation הכרומטין הוא טכניקה רבת עוצמה לזיהוי DNA מחייבת אתרים של חלבוני ארבידופסיס in vivo. הליך זה כולל הכרומטין המקשר בין-ופיצול, immunoprecipitation עם נוגדנים נגד סלקטיבית החלבון של עניין, וניתוח qPCR של DNA הקשור. אנו מתארים assay שבב פשוט מותאם לצמחי ארבידופסיס.

הכרומטין immunoprecipitation Assay עבור זיהוי של אינטראקציות החלבון-דנ&quot;א ארבידופסיס<em&gt; In vivo</em

הפקת מלח רציפים של חלבוני כרומטין מאוגד הוא כלי שימושי לקביעת מאפייני האיגוד של מתחמי חלבון גדולה. שיטה זו יכולה להיות מועסק כדי להעריך את התפקיד של subunits בודדים או קבוצות מחשבים הנמצאות בזיקה הכוללת של חלבון מורכב בכמות גדולה כרומטין.

עקירות מלח רציפים לניתוח של כרומטין בצובר מחייב מאפיינים של כרומטין שינוי מתחמי

פרוטוקול זה מתמקד בהכנת כרומטין מרקמות קפואות והוא מתאים ל- Crosslinking Chromatin Immunoprecipitation (X-ChIP) ואחריו ניתוח PCR כמותי (X-ChIP-qPCR) או גישות ריצוף מהדור הבא (X-ChIP-seq).

מיצוי כרומטין מרקמת כבד כימרית קפואה לניתוח משקעים חיסוניים של כרומטין

האינטראקציה של שיפוץ כרומטין תלוי ATP עם ליגנד DNA מתוארת באמצעות ספקטרוסקופיה CD. ניתן להשתמש בשינויים הקונפורמציה המושרים על מקדם גנים שניתח על ידי הפסגות שנוצרו כדי להבין את מנגנון הרגולציה התמלולית.

ספקטרוסקופיה של תקליטור לחקר אינטראקציות בין DNA לחלבון

מסך DNA, טכניקת הדמיה של מולקולות בודדות בתפוקה גבוהה, מספק פלטפורמה להדמיה בזמן אמת של אינטראקציות חלבון-דנ"א מגוונות. הפרוטוקול הנוכחי משתמש בטכניקת מסך הדנ"א כדי לחקור את התפקיד הביולוגי והמנגנון המולקולרי של Abo1, סכיזוסקרומיצס פומבה ברומודומיין המכיל AAA+ ATPase.

פענוח מנגנון מולקולרי של הרכבת היסטון בטכניקת מסך DNA

אנו מציגים פרוטוקול צביעה וניתוח מיקרוסקופ מיקום כרומטין חד-מולקולי (SMLM) בשלושה צבעים, המאפשר מיפוי שכפול של אאוכרומטין, הטרוכרומטין ו-RNAP II לניתוח מרחבי. פרוטוקול זה מאפשר תיוג רב-צבעוני יעיל בסביבות גרעיניות צפופות, כולל מטרות הקשורות לכרומטין, ומאפשר גילוי סימולטני אמין.

פרוטוקול מיקרוסקופ מיקום מולקולה בודדת רב-תוויות לחקר כרומטין בסביבה גרעינית צפופה

למד את שיטת RDD למיפוי אינטראקציות כרומטין המקושרות ל-RNA ספציפי באמצעות ביוטינילציה וליגציית קרבה. השיטה מאפשרת זיהוי ברזולוציה גבוהה של לוקוסים גנומיים וקשרים מרחוק להבנת ארגון הגנום.

שיטת האינטראקציה של כרומטין DNA-DNA המקושר ל-RNA

גלה סרטונים נוספים