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Metodi per abilitare la trascrittomica spaziale dei tessuti ossei
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JoVE Journal Developmental Biology
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues

Metodi per abilitare la trascrittomica spaziale dei tessuti ossei

Full Text
4,286 Views
07:43 min
May 3, 2024

DOI: 10.3791/66850-v

Luigi Mancinelli1,2, Karen Elizabeth Schoedel3,4, Kurt Richard Weiss5,6,7, Giuseppe Intini1,2,8,9,10

1Department of Periodontics and Preventive Dentistry,University of Pittsburgh School of Dental Medicine, 2Center for Craniofacial Regeneration,University of Pittsburgh School of Dental Medicine, 3UPMC Presbyterian, 4UPMC Shadyside, 5Musculoskeletal Oncology Laboratory, Department of Orthopaedic Surgery,University of Pittsburgh, 6UPMC Hillman Cancer Center, 7Departments of Anatomic Pathology and General Surgical Oncology,University of Pittsburgh, 8Department of Medicine,University of Pittsburgh School of Medicine, 9University of Pittsburgh UPMC Hillman Cancer Center, 10McGowan Institute for Regenerative Medicine,University of Pittsburgh

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Qui descriviamo un metodo che consente la decalcificazione dei tessuti ossei appena ottenuti e la conservazione di RNA di alta qualità. Viene inoltre illustrato un metodo per il sezionamento di campioni FFPE (Formalin Fixed Paraffin Embedded) di ossa non demineralizzate per ottenere risultati di buona qualità se i tessuti freschi non sono disponibili o non possono essere raccolti.

Il nostro obiettivo è quello di trovare migliori approcci terapeutici per trattare un cancro osseo umano chiamato osteosarcoma. Per fare ciò, vogliamo scoprire i processi biologici responsabili dell'insorgenza di questo tumore e soprattutto dello sviluppo delle sue metastasi, che stanno cancellando la causa della morte del paziente. Utilizzando l'analisi della trascrittomica spaziale su diversi campioni corrispondenti di metastasi primarie della linea dell'osteosarcoma umano, abbiamo individuato in più popolazioni cellulari comuni di pazienti che risiedono all'interno delle aree tumorali e, confrontandole, abbiamo identificato diversi geni chiave che possono rappresentare preziosi bersagli terapeutici per prevenire le metastasi polmonari.

Le analisi trascrittomiche speciali del tessuto cardiaco, come l'osso, sono state molto impegnative a causa dell'incapacità di preservare l'RNA e la morfologia del tessuto di buona qualità, elaborando allo stesso tempo il tessuto cardiaco per il sezionamento. Il nostro protocollo colma questa lacuna, consentendo ai ricercatori di applicare con successo una speciale analisi trascrittomica anche ai tessuti cardiaci.

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Parole chiave: Trascrittomica spaziale tessuto osseo conservazione dell'RNA morfologia tissutale decalcificazione campioni inclusi in paraffina osteosarcoma campioni di banche dei tessuti

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