Name: のカスタマイズアスペルギルスニジェールモルフォロジー (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-03-15T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 51 s
Description: 学ぶタルク微粒子添加によるAspergillus nigerの形態制御法。バイオリアクター培養と画像解析で菌糸状微生物の形態と生産性の相関を明らかにし、産業バイオテクノロジーへの応用可能性を示す。

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

作者は感謝して工科大学ブラウンシュヴァイク、ドイツで &quot;遺伝子から製品への&quot;共同研究センターSFB 578を介してドイツ研究協会（DFG）による財政支援を認める。

1。栽培の原子炉のセットアップおよび開始合計4つのバイオリアクターの栽培が行われています。 <ol><li> Aの栽培に2.2 Lの作業ボリュームで3 L攪拌タンクバイオリアクターを使用して、 ニジェール SKAn1015。 </li><li>反応器に72.6グラムのグルコース一水和物を注ぐと1.9 Lの脱イオン水でそれを埋める。 </li><li>例えば、3バッフル、2つの6枚羽根ディスクタービンインペラ、pH電極、エアフィルター、冷却指、エアフィルター、エアフィルターの無菌サンプリングのための液浸管と排気クーラーガス入口として原子炉装置の設置培地、接種、酸と塩基およびインレットホース。 </li><li> 20分間121℃で反応をオートクレーブ。 </li><li>酸 - 塩基貯蔵（2 M塩酸、2 M水酸化ナトリウム）とそれに対応するポンプを原子炉に接続し、pH制御ユニットと5.0のpH値±0.05を設定します。 </li><li>冷却水システムで原子炉をリンクし、加熱ジャケットを置く原子炉容器の周り。 </li><li>対応する制御ユニットと温度センサーを取り付け、37の温度を設定±0.1℃の温度制御ユニットで。 </li><li>原子炉の上に攪拌モータに合わせて、200 min -1の撹拌速度でサービスにそれを持って来る。 </li><li>滅菌インレットホースの滅菌最小限の成長媒体11トラフ1（250 mL）を追加します。培地調製のためのすべてのコンポーネントが20分間121℃でオートクレーブと一緒に混合した。 3栽培のためのコンポーネントが1グラム/ L（原子炉2）、3グラム/ L（原子炉3）と10グラム/ L（原子炉4）の濃度タルク粉末（3MgO•4SiO 2•H 2 O）が含まれています。使用する前に、50 mM酢酸ナトリウム緩衝液（pH6.5）のマイクロ粒子を再懸濁および滅菌培地に追加します。コントロール培養で（粒子なし）の50 mM酢酸ナトリウム緩衝液（pH6.5）によるマイクロ粒子懸濁液を交換してください。 </li><li>胞子懸濁液（接種）を追加sはウーハーペニヒらに用意しました。ら（2011）11そのトラフ滅菌インレットホース（50 mL）の1その1X10 6 mLの-1に胞子量の濃度。接種は、栽培開始（H = 0 h）をマークします。 </li><li> 1.0 L min -1の速度で通気を開始します。 </li></ol> 2。 24、48、72栽培の時間後に無菌サンプリング<ol><li>小瓶チューブに無菌培養液50mLを取る。 </li><li>バイオマス乾燥重量、β-フラクトフラノシダーゼ活性の測定と顕微鏡分析用のサンプルを使用しています。 </li></ol> 3。 24時間、48時間および72時間後の栽培バイオマス乾燥重量の測定<ol><li>バイオマス試料は、少なくとも二重に取られることです。 </li><li>重量デシケーター中で乾燥後、マイクロスケールのセルロースフィルターと接続された水ジェット真空ポンプをブフナー漏斗にフィルタを配置します。 </li><li>定義されたサンプル量（例えば10 mL）でフィルタリングndはバイオマスから培地化合物を除去するために10 mLの脱イオン水でフィルターを洗浄してください。 </li><li>しわフィルタ一度途中で、ガラスのペトリ皿に入れて体重不変（少なくとも24時間）までコンパートメント乾燥機に入れます。 </li><li>デシケーター中でフィルタを冷却して重量を測定します。 </li><li>使用されるサンプルの体積で割った乾燥バイオマスの有無にかかわらず、フィルタの重量の差としてバイオマス乾燥重量を計算します。 </li></ol> 4。 24時間後GOD / POD-エッセイによるβ-フラクトフラノシダーゼの細胞外酵素活性の測定、48、栽培の72時間一緒に働きながら常に氷上でサンプルを格納します。 <ol><li>フィルタ1.5 mLの培養懸濁液トラフ反応管にフィルターを介して注射器で培養懸濁液を押すことにより、セルロースアセテートフィルター。使用するまで-20℃で反応管を格納します。 </li><li>反応混合物の使用20サンプルμLおよびスクロースからグルコースへの反応を開始するには0.05 Mリン酸緩衝液（pH 5.4）に溶解した1.65 Mショ糖の200μLを追加します。少なくとも複製に反応出キャリー。 </li><li>加熱ブロックで20分間40℃で反応混合物をインキュベートします。加熱ブロックで10分間95℃でインキュベートして反応を停止します。氷の上にそれを格納することによって、反応混合物を冷却し、4℃で10分間13.000グラムで遠心分離によって凝縮水をスピンダウン℃に</li><li> pHとグルコース、ショ糖の温度依存性の切断を考慮して、20μLの脱イオン水の代わりに、20μLのサンプルを使用してブランク値を実施しています。 </li><li>培養液中の残存グルコースを考慮して、各サンプルの負の制御を行う。そのエンドユーザーによる使用20種類のサンプルのμL及びスクロースを追加し、ステップ4.3で説明をインキュベートする前に、10分間95°Cで加熱することによりβ-フラクトフラノシダーゼを失活させた。 </li><li>次のような測定そのサンプルの希釈ured吸着は、キャリブレーション値の範囲内です。 </li><li>三重のすべての酵素アッセイを実施しています。ウェルマイクロタイタープレートに2μL希釈したサンプルを適用します。代わりに2μLのサンプルの10個の異なるノウハウ濃度（1 mMから15 mMまで）で10グルコース溶液2μLを使用して、それぞれがマイクロタイタープレート上に校正用の標準の範囲を適用します。ゼロ点の校正は、2μL脱イオン水の代わりに2μLのサンプルを使用しています。 </li><li>マルチピペットを用いて各ウェルに試薬溶液200μLを追加します。 </li><li>室温で10分間混合物をインキュベートします。 </li><li> 6でマイクロタイタープレートを保存する度測定（最大で数時間）までC。 </li><li> 96ウェルサンライズマイクロプレートリーダーとマゼランのデータ検索ソフトウェアを使用して450nmにおける吸収を測定します。最大5秒まで混合時間を設定します。最大1秒までと残りの期間。 </li><li>スプレッドシートと結果チャートを開き、標準の範囲を使用して検量線を作成する： グラムlucose濃度= 1 X + bの吸収 </li><li>アクティビティを計算します。 活動=（吸収X希釈因子ブランク値）X A + B </li><li>サンプルの活動と適切なネガティブコントロールとの差を計算することによって、β-フラクトフラノシダーゼの活性を把握する。 </li><li>アカウントバイオマス乾燥重量とβ-フラクトフラノシダーゼ活性を11にとることによって次のように使用するための特定の生産性を計算します。 </li></ol> 5。栽培の72時間後に顕微鏡や自動画像解析<ol><li>場所は約3 mLの培養プラスチックペトリ皿中の懸濁液と形態学的構造が分離されるまで、生理食塩水でそれらを希釈してください。 </li><li>内蔵または接続されているカメラを備えて顕微鏡下でペトリ皿を置く。サンプルあたりの形態構造の約100の画像（ 図2）を取得して保存します。各画像に少なくとも一つのオブジェクトが完全に描かれていることに注意を払う。 </li><li>画像処理プログラムImageJは12と同じサンプルのすべての画像を開きます。プロセスツールの&quot;Makeバイナリ&quot;（ 図2）を使用して白黒に画像を変換します。画像のシリーズ全体にコマンドを適用するため、次のようにマクロのコードを使用します。 実行（、、バイナリを作る&quot;） </li><li>再びImageJを使用して処理バイナリイメージを開きます。形状因子フェレの直径、投影面積、周囲長、円形度、アスペクト比、分析ツールの &quot;Set測定&quot;を持つすべてのイメージのための真円度のundの堅牢性を計算します。セリにコマンドを適用するための画像のESは、次のようにマクロのコードを使用します。 ラン（ &quot;8ビット&quot;）; ラン（ &quot;バイナリを作成します&quot;）; 実行（ &quot;SETスケール...&quot;、 &quot;距離= X知られている= 1000ピクセル= 1単位=ミクロングローバル&quot;）; （ &quot;セットの測定...&quot;、 &quot;領域境界形状フェレの上限の表示は=なしの小数= 3をリダイレクトする&quot;を参照）を実行; （ &quot;粒子を分析...&quot;、 &quot;サイズ= 10000無限の真円度= 0.00から1.00のshow =表示をアウトライン&quot;）を実行します。 スケールバーを越えて直線を作成することにより、1000μmのに相関画素数としてXを決定します。 μmの中のスケールバーの長さの直線の画素数を関連付けることができます。 </li><li>スプレッドシートと各画像の形状係数の値を含む結果チャートを開きます。画像ごとに次のように形態の数を計算します。 <img alt="式（1）" src="/files/ftp_upload/4023/4023eq1.jpg" /></li><li>の値と考慮つのサンプルのすべての画像を取って形態番号の標準偏差を意味します計算します。 </lI&gt; <li>特定の生産性モルフォロジー数のグラフィカルな相関のグラフとデータ解析プログラムを使用して、数学的回帰による数学的関係を決定します。 </li></ol> 6。代表的な結果タルク微粒子Aの追加によりニジェール SKAn 1015形態が真のペレット形態から分散した、あるいは菌糸の形態に変更されます。ペレットの形態は、標準的な条件で展示されているのに対し、菌糸形態がタルク微粒子の10グラム/ L（ 図4）と培地の補充によって作成されます。同時にβ-フラクトフラノシダーゼの活性は3倍3から5の周りに増加します。タルク粉末の1または3 g / Lの補充は倍増フラクトフラノシダーゼ活性（ 図4）と、分散した形態につながる。 マイクロ粒子依存形態を包括的にモルによって記述することができる自動画像解析によって決定されるパラメータを使用して計算することができます。phology番号を指定します。完璧なラウンドと滑らかなペレットは顕微鏡画像で完全な円として表示されます。このような粒子のために形態番号が1の値を持ちます。菌糸形態の最小フラグメント0の形態の番号を得、一次元のラインのように簡略化することができます。細長い不規則なペレットまたは塊のようなすべての中間の形態学的形態は、したがって、0と1の間の値を持ちます。かなり大きな粒子はかなり低い形態番号11で、大規模な表面または細長い粒子と高い、真菌の粒子になります。 標準状態で原子炉1の形態は、展示約0.8モルフォロジー番号を入力します。 10グラム/ Lタルク粉末を反応器4の形態は、0.1の周りにMnを備えています。 1と3 g / Lのタルク粉濃度の原子炉2および3の形態の数は、分散したモルフォを実証し、これらの両極端の間にあるでれっと。ミクロ粒子に依存する形態が密接にβ-フラクトフラノシダーゼの生産性と関連しているので、形態の番号と図5と同様の生産性の数学的な相関が得られます。 <img alt="図1" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig1.jpg" /> 図1実験デザインと分析手順の全体的なスキーム。A.ニジェールは、72時間タンクバイオリアクターの攪拌3 Lに（微小粒子の有無にかかわらず）栽培されています。 24時間後、48と72ヘクタールのサンプルは再び、特定の生産性の計算に使用されているバイオマス乾燥重量とβ-フラクトフラノシダーゼの活性の測定のために取られています。 48時間後に菌の形態を顕微鏡で検査され、デジタル画像解析を特徴とする。画像解析の関連するパラメータは、数学的な特定の生産性と相関している形態の番号に結合されています。 <imgALT = &quot;図2&quot; SRC = &quot;/ files/ftp_upload/4023/4023fig2.jpg&quot; /&gt; 図2：Aから形態学的構造の微視的生成された画像の画像処理のステップニジェール 。ステップ1：顕微鏡による画像取得。ステップ2：イメージの改善、必要に応じて。ステップ3：Ima​​geJのでは生成された画像の二値化、白黒（バイナリ）の画像。ステップ4：バイナリイメージによって処理され、不要なオブジェクトがクリアされます。ステップ5：形態素解析は、オープンソースプログラムImageJの &quot;分析粒子&quot;関数を使って行われている。 <img alt="図3" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig3.jpg" /> 図3。 A.別の形態形追加されたマイクロ粒子の濃度に依存するニジェール 。微小粒子の濃度の増加とともにペレットのサイズは正確に小さなコア·シェル型ペレット、小さな群れも自由に分散した菌糸体にまで減少させることができるようにした。としての形態エンジニアリング液内培養におけるマイクロ粒子補給によってpergillusニジェールSKAn1015。微粒子（）は10 mg / L（B）、0.1グラム/ L（C）、0.2グラム/ L（D）、0.3グラム/ L（E）、0.6グラム/ L（F）、1.0グラム/ Lなし（G）、1.5グラム/ L（H）、2.0グラム/ L（I）、2.5グラム/ L（J）、3.0グラム/ L（K）、3.5グラム/ L（L）、4.0グラム/ L（M ）、4.5グラム/ L（N）、5.0グラム/ L（O）、10グラム/ L（P）、15グラム/ L（Q）、20グラム/ L（R）、30グラム/ L（S）と40〜50グラム/ L（T）。画像は、栽培の72時間後に光学顕微鏡で撮影された。 <img alt="図4" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig4.jpg" /> 図4の依存性のフラクトフラノシダーゼ活性のタルク微粒子濃度を1g / L（原子炉2）、3グラム/ L（原子炉3）と10グラム/ L（原子炉4）。原子炉1は、微小粒子を添加したされていません。ここで栽培は、標準的な条件下で実施されています。 <img alt="図5" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig5.jpg" /> 図5の形態の代表的な良好な相関（R 2 = 0.91）番号と特定の生産性。形態番号は、特定の生産性（縦軸）に対して（横軸）にプロットされています。非線形回帰は指数の相関が得られます。

<ol><li>Wucherpfennig, T., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aWucherpfennig%2C+T+%22Advances+in+Applied+Microbiology%22">Advances in Applied Microbiology</a>. 72, Academic Press. 89-136 (2010).</li>
<li>Driouch, H., Hänsch, R., Wucherpfennig, T., Krull, R., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+enzyme+production+by+bio-pellets+of+Aspergillus+niger%3A+Targeted+morphology+engineering+using+titanate+microparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Improved enzyme production by bio-pellets of Aspergillus niger: Targeted morphology engineering using titanate microparticles.</a> Biotechnology and Bioengineering. 109, 462-471 (2012).</li>
<li>Driouch, H., Roth, A., Dersch, P., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimized+bioprocess+for+production+of+fructofuranosidase+by+recombinant+Aspergillus+niger%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+Microbiology+and+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Optimized bioprocess for production of fructofuranosidase by recombinant Aspergillus niger.</a> Applied Microbiology and Biotechnology. 87, 2011-2024 (2010).</li>
<li>Driouch, H., Roth, A., Dersch, P., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Filamentous+fungi+in+good+shape%3A+Microparticles+for+tailor-made+fungal+morphology+and+enhanced+enzyme+production%5BTitle%5D)+AND+%22Bioengineered+Bugs%22%5BJournal%5D)">Filamentous fungi in good shape: Microparticles for tailor-made fungal morphology and enhanced enzyme production.</a> Bioengineered Bugs. 2, 100-104 (2011).</li>
<li>Driouch, H., Sommer, B., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphology+engineering+of+Aspergillus+niger+for+improved+enzyme+production%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Morphology engineering of Aspergillus niger for improved enzyme production.</a> Biotechnology and Bioengineering. 105, 1058-1068 (2010).</li>
<li>Kaup, B. -A., Ehrich, K., Pescheck, M., Schrader, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microparticle-enhanced+cultivation+of+filamentous+microorganisms%3A+Increased+chloroperoxidase+formation+by+Caldariomyces+fumago+as+an+example%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Microparticle-enhanced cultivation of filamentous microorganisms: Increased chloroperoxidase formation by Caldariomyces fumago as an example.</a> Biotechnology and Bioengineering. 99, 491-498 (2008).</li>
<li>Hirayama, M., Sumi, N., Hidaka, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Purification+and+characterization+of+a+fructooligosaccharide-producing+beta-fructofuranosidase+from+Aspergillus+niger+ATCC+20611%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+and+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Purification and characterization of a fructooligosaccharide-producing beta-fructofuranosidase from Aspergillus niger ATCC 20611.</a> Agricultural and Biological Chemistry. 53, 667-673 (2006).</li>
<li>Rajoka, M. I., Yasmeen, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+productivity+of+beta-fructofuranosidase+by+a+derepressed+mutant+of+Aspergillus+niger+form+conventional+and+non-conventional+substrates%5BTitle%5D)+AND+%22World+Journal+of+Microbiology+and+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Improved productivity of beta-fructofuranosidase by a derepressed mutant of Aspergillus niger form conventional and non-conventional substrates.</a> World Journal of Microbiology and Biotechnology. 21, 471-478 (2005).</li>
<li>Zuccaro, A., GÃ¶tze, S., Kneip, S., Dersch, P., Seibel, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tailor-made+fructooligosaccharides+by+a+combination+of+substrate+and+genetic+engineering%5BTitle%5D)+AND+%22ChemBioChem%22%5BJournal%5D)">Tailor-made fructooligosaccharides by a combination of substrate and genetic engineering.</a> ChemBioChem. 9, 143-149 (2008).</li>
<li>Huggett, A. S. G., Nixon, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+glucose+oxidase%2C+peroxidase%2C+and+o-dianisidin+in+determination+of+blood+and+urinary+glucose%5BTitle%5D)+AND+%22The+Lancet%22%5BJournal%5D)">Use of glucose oxidase, peroxidase, and o-dianisidin in determination of blood and urinary glucose.</a> The Lancet. , 270-368 (1957).</li>
<li>Wucherpfenning, T., Hestler, T., Krull, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphology+engineering+-+Osmolality+and+its+effect+on+Aspergillus+niger+morphology+and+productivity%5BTitle%5D)+AND+%22Microb.+Cell+Fact%22%5BJournal%5D)">Morphology engineering - Osmolality and its effect on Aspergillus niger morphology and productivity.</a> Microb. Cell Fact. 10, (2011).</li>
<li>Rasband, W. S. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRasband%2C+WS+%22ImageJ%22">ImageJ</a>. , National Institutes of Health. Bethesda, Maryland, USA. (1997).</li>
<li>Papagianni, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+the+fractal+nature+of+mycelial+aggregation+in+Aspergillus+niger+submerged+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Cell+Factories%22%5BJournal%5D)">Quantification of the fractal nature of mycelial aggregation in Aspergillus niger submerged cultures.</a> Microbial Cell Factories. 5, 5(2006).</li>
</ol>

私は、開示することは何もありません。

菌類の形態の変更は数十年以来、バイオテクノロジーで注目されている。別の研究では、対照的に、pH値、電源入力、温度、培地の栄養素や接種濃度1として選択されたプロセスパラメータを変更しようとしたが、形態のむしろ不正確、不完全なコントロールに苦しんで、高いエネルギーコスト、抑制効果や製品の不安定ましたマイクロ粒子の補充は、粒子サイズと濃度の微調整の変動を介して菌の形態の正確なエンジニアリングを可能にします。これは、最適化のためにとAと生物工学的生産で高い生産形態のオーダーメイド設計のためのミクロ粒子を使用する新たな可能性を開きます。 ニジェールや他の糸状微生物。 デジタル画像解析は、真菌マクロ形態を特徴づけるための簡単​​な再現可能な方法です。しかし、サイズ、形状、表面特性のパラメータの様々な文献に記載されている形態学的構造のTERは、真菌形態の迅速な評価は複雑になります。関連するパラメータの組み合わせとして提示形態番号は、この欠点を回避し、形態学的構造の総合的特性評価のためだけでなく、生産性との直接的な数学の相関だけでなく、使用することができます。これが再び与えられた形態によって生産性の推定をレンダリングするため、プロセスの形態のカスタマイズが可能必要があります。 形態番号を使用して、それは様々なペレットと塊の形態4,5とを区別することが可能です。形態数の更なる発展のためにフラクタル次元の検討は有望と思われる。フラクタル次元は、オブジェクト13のプロパティを充填複雑さと質量の測定を提供し、したがって、菌糸形態の全体的な特徴付けのためにあらかじめ定めています。 CR菌糸生長フォームは以前にはるかに大きいの培養液の粘度2を示すことが示されているため、高い生産菌糸形態のeationは、しかし、特に大規模栽培でのプロセスのパフォーマンスの問題につながる可能性があります。これは、熱伝達や物質移動と高い電源入力を必要とし、1を動作させる栽培を行うとコストが高く停滞し、非混合ゾーンの形成の問題につながります。したがって、真菌の形態と培養液の粘度との関係は、形態を変更するときに考慮する必要がありますし、さらにモデルに組み込まれる。

のカスタマイズアスペルギルスニジェール</emタルク微粒子を添加することによって>モルフォロジー

Customization of Aspergillus niger Morphology Through Addition of Talc Micro Particles

糸状菌A.ニジェールは、食品から医薬品業界への工業的プロセスの広い範囲で広く使われている株である。この糸状菌の中で最も魅力的な、しばしば手に負えない特徴の一つは、その複雑な形態です。それは緻密な球状ペレットから粘性の菌糸体（ 図1）の範囲である。さまざまなプロセスパラメータと成分は菌類の形態1に影響を与えることが知られています。最適な生産性は、特定の形態学的形態と強く相関するので、菌の形態は、多くの工業生産の生産性のボトルネックを表しています。 正確に形態学的形状を制御するために、まっすぐ進むと、エレガントなアプローチでは、増加した酵素の生産2-6貢献培地に無機不溶性微粒子（含水ケイ酸マグネシウム、酸化アルミニウムやチタン、ケイ酸、酸化など）の追加です。 OBVがあるので、マイクロ粒子依存の形態と酵素生産との間のIOUの相関は、それが数学的に生産性と形態学的外観をリンクすることが望ましい。したがって、定量的な正確かつ包括的な形態学的な説明は、対象としています。 そこで、生成し、特徴づけるミクロ粒子に依存する形態学的構造を、おそらく糸状微生物の形態形成の理解に貢献する生産性（図1）真菌の形態を相互に関連付ける方法を提案する。 組換え株のA.ニジェール SKAn1015はタンクリアクターの攪拌3 Lで72時間栽培されています。 g / Lの事前接種に1グラム/ L、3グラム/ Lと10の濃度タルク微粒子の添加により形態学的構造の様々な再現性が生成されます。滅菌した試料は、酵素生産の成長の進捗状況や活動を決定するための24時間、48時間および72時間後に採取されています。ザ形成された製品は、高付加価値酵素β-フラクトフラノシダーゼ、中でもグルコース7-9ショ糖の反応を触媒する食品や製薬業界におけるネオ糖形成のための重要な生体触媒である。したがって、ショ糖を加えた後、グルコースの定量化は、生産β-フラクトフラノシダーゼの量を意味します。グルコースの定量は、96ウェルマイクロタイタープレートでハイスループット分析のために変更されたGOD / POD-アッセイ10によって行われます。 72時間後の菌の形態を顕微鏡で調べ、デジタル画像解析によって特徴付けられる。そうすることで、フェレの直径、投影面積、周囲長、円形度、アスペクト比、真円度のundの堅実さのような真菌のマクロ形態の粒子の形状因子は、オープンソースの画像処理プログラムImageJを用いて計算されています。関連するパラメータは、包括的な特性評価を可能にする無次元形態番号（Mn）が11に結合され真菌の形態。形態番号と生産の密接な相関関係は、数学的回帰で強調表示されます。

正確に生成すると総合的に糸状菌の形態を特徴づけるための方法<em&gt;アスペルギルスニジェール</em&gt;形態学的外観と生産性の数学的な相関を可能にする、説明されています。

糸状菌であるA. nigerは、食品から製薬業界に至るまで、幅広い工業プロセスで広く利用されている菌株です。最も...

本手法では、糸状菌であるAspergillus nigerのマイクロ粒子依存的な形態構造を生成および特性評価し、菌類の形態と生産性の相関関係を明らかにします。比生産性を算出するため、3リットルの撹拌タンク型バイオリアクターを用い、マイクロ粒子の有無がある状態でA. nigerを72時間培養します。規定の時間にサンプルを採取し、バイオマス乾燥重量およびβ-fructosidase活性を測定します。72時間後、顕微鏡を用いて真菌の形態を観察し、デジタル画像解析によって特性を明らかにします。次に、画像解析の関連パラメーターを統合して、比生産性と数学的に相関する形態数（morphology number）を算出します。最終的に、この手法により、Aspergillus nigerの形態を精密に生成し、包括的に特性評価することができ、糸状微生物の形態形成に関する理解を深めることが可能になります。Aspergillus nigerは、数十年にわたりバイオテクノロジーにおける重要な工業的利用菌として活用されてきました。A. nigerおよび近縁種の最も興味深く、かつ制御が困難な特性の一つに、培養条件に応じて緻密な球状ペレットから粘性の高い菌糸体まで変化する複雑な形態学的な特徴があります。本手法の主な利点は、微粒子を添加することで、プロセスのニーズに合わせて真菌の形態を特異的に調整できるようになった点にあります。これまで、このような真菌形態のカスタマイズに関する手法は他に報告されていません。本手法は、糸状微生物の培養に関する重要な疑問を解決するのに役立ちます。産業応用においては、真菌の形態を制御すること、また、生産性の高い形態と低い形態を区別することが極めて重要であるためです。本プロトコールでは、真菌の形態を自在にカスタマイズし、特性評価を行うための手法を提供します。この手法は Aspergillus niger の形態に関する知見を得るのに有用ですが、Penicillium や Streptomyces などの他の糸状微生物にも適用可能です。付属のプロトコールの詳細に従い、滅菌培養用に4台のバイオリアクターを準備してください。マイクロ粒子の添加に基づき、形態の異なるAspergillus nigerを培養します。72時間後、培養液のサンプル50 millilitersをFalconチューブに移します。バイオマス試料は、デシケーターで乾燥させた後、少なくとも2連（デュプリケート）で採取します。マイクロ天秤を用いてセルロースフィルターの重量を測定します。フィルターを、ウォータージェット真空ポンプに接続されたブフナー漏斗にセットします。試料10 mLをろ過し、続いて10 mLの脱イオン水を流してバイオマスから培地成分を除去します。フィルターの中央を一度折り曲げます。それをガラス製のシャーレに入れ、恒量になるまで定温乾燥機で乾燥させます。フィルターをデシケーターに移し、冷却させます。その後、重量を測定します。グルコースオキシダーゼおよびペルオキシダーゼ酵素アッセイにおいて、重量の測定、フィルターの重量差の算出、およびその後のサンプル量による除算により、1リットルあたりのバイオマス乾燥重量を算出します。サンプルは1.5 mLのシリンジパスを用いて氷上で保存します。培養懸濁液をアセテートセルロースフィルターでろ過して反応チューブに入れ、β-フルクトシダーゼアッセイを行います。統計的な堅牢性を確保するため、2つのトリプリケートサンプルを用いて慎重に試験を行います。アッセイを開始するには、テストチューブに20 µLのサンプルを加えます。pHおよび温度に依存するスクロースからグルコースへの分解を制御するため、20 µLのサンプルの代わりに20 µLの脱イオン水を使用してください。また、各サンプルについて、アッセイにより培養液中の残留グルコースのネガティブコントロールを準備します。熱不活化したサンプル 20 µL。スクロースからグルコースへの反応を開始させるため、1.65 M スクロース溶液 200 µL を加える。pH 5.4 のサンプル 20 µL に対し、すべての反応チューブを 40 °C のヒーティングブロックで 20 分間インキュベートする。チューブを氷上で冷却した後、95 °C で 10 分間加熱して反応を停止させる。必要に応じてサンプルを遠心分離し、測定される吸光度が校正値の範囲内に収まるようにアッセイ用にサンプルを希釈します。次に、各反応について、マイクロタイタープレートに2 µLのサンプルを分注します。サンプルの測定はn=3で行ってください。また、1 mMから15 mMの範囲のグルコース標準溶液を10種類調製し、標準曲線を作成します。ゼロ点校正には、2 µLの脱イオン水を使用します。次に、それぞれに200 µLの試薬溶液を加えます。室温で10分間インキュベートします。96ウェルSunriseマイクロプレートリーダーおよびMagellanデータ回収ソフトウェアを用いて、450 nmにおける吸光度を測定します。結果のチャートをスプレッドシートで開き、標準曲線の校正線を作成します。各サンプルの活性を算出します。次に、サンプル活性から適切なネガティブコントロールの値を差し引くことで、β-フルクトシダーゼ活性を算出します。最後に、バイオマス乾燥重量とβ-フルクトシダーゼ活性を考慮して、比生産性を算出します。3 mLの培養懸濁液をプラスチック製ペトリ皿に入れ、生理食塩水で希釈して形態構造を分離させます。顕微鏡写真の質は極めて重要です。後の画像解析のため、希釈ステップでは細心の注意を払ってください。カメラ一体型の顕微鏡の下にペトリ皿を設置します。サンプルあたり形態構造の画像を約100枚撮影して保存し、各画像に少なくとも1つのオブジェクトが完全に収まるようにしてください。異なるリアクターからのサンプルを含む皿についても同様に操作し、その都度新しい画像を撮影します。添加したタルク粉末の量が異なる、異なるリアクターから得られたサンプルの形態的な成長形態の違いに注目してください。次に、画像処理プログラムであるImage Jで、同一サンプルのすべての画像を開きます。プロセスツールを使用して、バイナリ化を行います。一連の画像すべてにコマンドを適用するため、画像を白黒に変換します。次にマクロコードを使用し、スケールバーを含む画像の一枚を開きます。スケールバーに沿って直線を引いて、2000 micronsに相当するピクセル数を決定します。解析ツールを選択し、計測設定を行い、形状因子（shape factors）、フェレット径（ferrets）、直径（diameter）、面積（area）、および周囲長（perimeter）を選択します。マクロコードを使用して一連の画像を処理します。次に、形状因子の結果をまとめたスプレッドシートを開きます。各画像について、1つのサンプルのすべての画像を用いて形態指標（morphology number）を算出します。形態指標の平均値を算出してください。グラフ作成およびデータ解析プログラムを使用して、形態指標と比生産性をプロットします。タルコ微粒子の濃度を段階的に増加させ、数学的回帰を用いて数学的関係を決定します。Niger SKAN 10 15を8個使用します。標準条件下では期待されるペレット形態が示されますが、形態は真のペレット形態から分散形態、あるいは菌糸状の形態へと変化します。興味深いことに、培地に10 g/Lのタルク微粒子を添加することで、菌糸形態が形成されます。同時に、Beto Fructo taseの活性は約3倍に増加します。1 g/Lまたは3 g/Lのタルク粉末を添加すると、自動画像解析で決定されたパラメータに基づき、分散した形態となり、フルクトース活性が2倍になります。微粒子依存的な形態は、形態学的に包括的に記述することが可能です。注記として、滑らかなペレット状の完全な球形粒子は、顕微鏡画像では完全な円として現れます。形態係数の値は、標準条件において1に近づきます。リアクター1における形態は、約0.8の形態係数を示します。10 g/Lのタルク粉末を用いたリアクター4における形態を示します。タルク粉末の形態数は約0.1です。タルク粉末濃度が1 g/Lおよび3 g/Lであるリアクター2および3の形態数は、これらの中間に位置しており、分散した形態を示しています。微粒子に依存した形態はβ-フルクトシル転移酵素の生産性と密接に関連しているため、形態、数、および形成後の生産性の間には良好な数学的相関が認められます。この手法は、バイオテクノロジー分野の研究者が菌類の形態、特に生産性との関係をさらに探求するための道を開きました。特定の形態を持つ菌類の交配型を詳細に作成するこの手順に従うことで、糸状微生物培養における他の重要な側面を探索することが可能です。例えば、菌糸形態は、プレート形態よりも粘性がはるかに高いことが知られています。そのため、目的産物の精製などの問題を通じて、プロセス全体の生産性が損なわれます。本研究で提示する形態数（morphology number）は、培養やプロトコルのモデル構築に役立ち、菌類形態全般への理解を深めることにつながります。

customization-aspergillus-niger-morphology-through-addition-talc

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

免疫学と感染症

性的な交配と組換え後代の単離は、糸状菌のための重要な研究ツールです。...

の性的開発と子嚢胞子放電フザリウムgraminearum種</em

クライオ電子顕微鏡、走査型（SEM）のいずれか、または送信（TEM）は、広く高含水率1を有する生物学的試料または他の材料の特徴付けのために使用される。 SEM /集束イオンビーム（FIB）は、試料中の関心対象の特徴を識別し、クライオTEMへの転送のために薄い電子透過性のラメラを抽出するために使用される。...

集束イオンビームを用いて低温電子顕微鏡標本の準備

&gt;jove_content&lt;走査型電子顕微鏡観察のための生物学的サンプルの処理における問題には、細胞の崩壊、湿った微小環境からのサンプルの処理、および細胞破壊が含まれます。ここでは、花分裂組織、卵分裂組織、真菌(Agaricales)などの困難なサンプルの調製に適した低コストで比較的迅速なプロトコルをまとめ、詳細に説明しています。...

問題のあるプラント、卵菌類、および真菌サンプルのための電子顕微鏡（SEM）プロトコルをスキャン

ここでコウジカビ flavusの生育および抗真菌性蛋白を発現するトウモロコシのアフラトキシン生産を分析するためのプロトコルを提案する. 我々 は、感染とリアルタイムで成熟したカーネルでは菌の拡散を監視 gfp 発現するA.

コウジカビ flavusの生育と遺伝子組換えトウモロコシはフジマメ属液体l. から α-アミラーゼ阻害剤を表現するアフラトキシン生産阻害

ここでは、走査電子顕微鏡(SEM)を用いて繊細な組織サンプルをイメージングするための詳細な処理プロトコルを紹介する。すなわち、ヘキサメチル・ジシラザナ(HMDS)化学乾燥、単純な空気乾燥、および臨界点乾燥の3つの異なる処理方法が、硬質卵殻、初期発達段階における胚、および真菌培養物をそれぞれ調製するために記載されている。...

電子顕微鏡検査用胚、卵殻、真菌培養の処理

このプロトコルは、ゼブラフィッシュ幼虫における アスペルギルス 感染モデルについて説明する。 アスペルギルス...

宿主と病原体の相互作用の解析のためのゼブラフィッシュ幼虫のア スペルギルス 胞子の感染

CRISPR-Cas9ゲノム編集システムは、モデル種や非モデル種で使用されている使いやすいゲノムエディタです。ここでは、非モデルの糸状アスコマイセテ菌の交配遺伝子に早期停止コドンを導入するために使用されたこのシステムのタンパク質ベースのバージョンを提示する。...

CRISPR-Cas9インターメディエートゲノム編集における糸状アスコミセテ ・ハンティエラオマネンシス

透過光顕微鏡技術を用いたラベルフリーのライブイメージングプロトコルを提示し、水没培養物と固体培地の両方で、画像を撮影し、糸状菌 A.ニドゥラン...

ライブ顕微鏡とオープンソースソフトウェアを用いた アスペルギルスニデュラン の成長率の定量分析

このプロトコルは、菌根菌で発芽した植物組織および種子における真菌コロニー形成を研究するために、走査型および透過型電子顕微鏡、光学顕微鏡、共焦点顕微鏡、蛍光顕微鏡などのさまざまな顕微鏡技術を適用して、マイコ従属栄養植物サンプルを収集、固定、および維持するための詳細な手順を提供することを目的としています。...

菌従属栄養植物組織における真菌のコロニー形成と種子の共生発芽を解釈するための顕微鏡技術

ここでは、高吸水性ポリマーベースの独立栄養系でアーバスキュラー菌根菌を接種および観察するためのシンプルで安価な技術について説明します。...

高吸水性ポリマー系独立栄養系におけるアーバスキュラー菌根培養物の接種と観察

このプロトコールは、 Methanocaldococcus jannaschii...

極低温電子顕微鏡のためのサンプル調製の最適化

学ぶタルク微粒子添加によるAspergillus nigerの形態制御法。バイオリアクター培養と画像解析で菌糸状微生物の形態と生産性の相関を明らかにし、産業バイオテクノロジーへの応用可能性を示す。

のカスタマイズアスペルギルスニジェールモルフォロジー

さらに動画を探す