Name: 軟寒天コロニー形成アッセイ (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-10-27T15:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 1 s
Description: 学ぶ軟寒天コロニー形成アッセイによる細胞の浮遊非依存的増殖の定量化方法。がん研究における細胞変形と腫瘍抑制タンパク質の効果評価に応用できます。

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この研究は、米国退役軍人省からのメリット賞と、RWへのNIH助成金R01CA1385282522717によって支援されました。

材料および試薬の調製<ol><li>組織培養の各ウェルは、調査されて各細胞株または状態に対して適切に6ウェルプレートを処理したラベル。 </li><li>粉末培地1gを、50mlの最終体積まで脱イオン水に炭酸水素ナトリウム0.2gを溶解することにより2倍の細胞培養培地を準備する。 </li><li>滅菌するために0.2μmのフィルターを介してこのメ​​ディアを渡します。 </li><li>関心のある細胞株の通常の培養に必要な追加コンポーネントを追加します。たとえば、10％FBSおよび1％ペニシリン/ストレプトマイシン溶液を補充したRPMI 1640培地中でCMT 167細胞株を成長させる。湯浴中で37℃に温培地使用前に。 </li><li>あなたが興味のある細胞株の正常な細胞培養の場合と同じように別々の1x細胞培養培地を準備します。 </li><li>脱イオン水100mlに希寒天1gを添加することにより、1％希寒天を準備する。 注：ノーブル寒天単独で攪拌しながら完全に溶解しない。 </li><li>準備する脱イオン水100mlに希寒天0.6gを添加することにより寒天希0.6％。両方の寒天溶液は、長期保存のための閉鎖可能な蓋付きの100mlのガラス瓶中で行うことができる。 </li><li>殺菌するために高貴な寒天の混合物をオートクレーブ。これらの混合物は、事前に作製し、4℃で保存したが、寒天が完全に溶解するまで、実験の際に再加熱されるべきであることができる。 </li><li>千ミリリットルの最終容量に8gのNaCl、0.2gのKCl、1.44グラムHPO 4 2のNa、0.24グラムのKH H 2 Oで2 PO 4（1×PBS中1mg / mlのストック溶液を作製することにより、ニトロブルーテトラゾリウムクロリド溶液を調製）。これは、コロニーを染色するために、実験の終了時に使用される。 </li></ol>寒天の底層の2めっき<ol><li>約1〜2分間、1％高貴寒天およびマイクロ波のボトルのキャップを緩めます。電子レンジで加熱しながら、オーバー沸騰を避けるために密接にソリューションを監視します。断続的に混合しながら、加熱を継続し、寒天を完全に溶解されるまで、溶液は透明である。 注：加熱後にフラスコを処理するために、耐熱手袋を使用してください。そうしないと、火傷や重傷を引き起こす可能性があります。 </li><li>熱い水道水（42℃）で満たされたアイスバケット内で溶融した寒天液と予め温め2xの培養液を置きます。また、お湯でアイスバケット内チューブホルダーに50ミリリットルコニカルチューブを配置します。後続のステップのための細胞培養フードにバケツを転送します。 </li><li>寒天の最下層では、6ウェルプレートのウェルあたり寒天培地の混合液1.5mlを必要とする。 </li><li>混合物の十分な量を確保するために、各6ウェルプレート、12 mLの合計を準備する。 </li><li> 50mlのコニカルチューブに培地を6mlを添加することによって開始し、次いで1％の希寒天溶液を6ml。 </li><li>混合するコニカルチューブを数回転倒。活発なペースで働くこと軟寒天の早すぎる硬化を防ぐことができます。 </li><li> 5ミリリットルの血清学的パイに、混合物の約5.5ミリリットルを策定pette。 </li><li>気泡が各ウェルにこの混合物に、1.5mlの堆積前に、ピペットカラムの上部に上昇することを可能にする。プレートウェルに気泡の付着を避けるために注意してください。 </li><li>プレートをカバーし、寒天混合物を30分間、細胞培養フード内で、室温で固化することを可能にする。 </li></ol> 3.細胞を含む寒天の上層めっき<ol><li>寒天下層が凝固した後、上層の準備を開始する。 </li><li> （トリプシンの1ミリリットル用など培地4mlを加える）培地中で5 15ミリリットルコニカルチューブに：まず、トリプシン処理によって収穫細胞とは、彼らに1を希釈。 </li><li>細胞をカウントし、この時点で最終的な細胞懸濁液を調製し、ウェル当たりに必要な細胞の数を計算する。この数は、細胞型に依存して変化する。 5000細胞/ウェルとしての出発点を使用し、必要に応じて調整します。この細胞数のために、 すなわち 、各welの（6667細胞/ mlの細胞懸濁液を調製うlはこの懸濁液の0.75ミリリットルと1.5ミリリットルの全容積のための寒天の0.75ミリリットルを受け取ります。 5000最後の総細胞数）が2：細胞の濃度はまた、1に希釈される。 </li><li> 6ウェルプレートのウェルあたりに必要な細胞懸濁液の量が再び1.5ミリリットルであろう。 6ウェルプレート当たり12ミリリットル合計追加の細胞懸濁液を準備します。 </li><li>上記のように電子レンジで0.6％寒天溶液を融解し、ステップ3.3からのチューブホルダーおよび最終細胞懸濁液に50mlの円錐チューブに沿ってお湯を含むアイスバケットに入れる。 </li><li>後続のステップのための細胞培養フードに溶融した0.6％の寒天をアイスバケットを転送します。 </li><li> 6ウェルプレートあたり12 mLの総体積を調製1：1の比で0.6％寒天および細胞懸濁液を混合する。 1.5ミリリットルウェルあたり必要とされますが、余分な上記のようになされるべきである。 </li><li>ピペット50mlコニカルチューブに細胞懸濁液を6ml。 </li><li>その後、チューブに0.6％寒天の6ミリリットルを追加します。 注：この混合物の温度でなければならない時期尚早の硬化を回避し、細胞の生存を最大化するために周りに42°Cに保った。 </li><li>ピペットの細胞を分配するためにこの混合物を2〜3倍、迅速に作業し、その後5ミリリットルの血清学的ピペットに、混合物の5.5ミリリットルを策定。 </li><li>気泡が各ウェルにこの混合物を1.5mlの堆積前に、ピペットカラムの上部に上昇することを可能にする。プレートウェルに気泡の付着を避けるために注意してください。 </li><li>セル/寒天混合物を37℃で加湿細胞培養インキュベーター中に配置する前に30分間、細胞培養フード内で、室温で固化することを可能にする。 </li><li>適切なコロニー形成に要する時間は、約21日、典型的には、各細胞株ごとに異なる​​。 </li><li>成長培地の層は乾燥を防ぐために、寒天の上層の上に維持されるべきである。週二回添加した培地100μlのは、この目的のために十分である。 </li></ol> 4.プレートを染色し、コロニー数を計測<ol><li> 200を追加することによって染色細胞_6;ウェル当たりニトロブルーテトラゾリウムクロリド溶液リットル、37℃で一晩プレートをインキュベートする。 </li><li>コロニーを染色すると、撮像装置を使用して、ウェルを撮影し、画像解析ソフトウェアを用いてコロニーを数え。 </li></ol>

<ol><li>Puck, T. T., Marcus, P. I., Cieciura, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clonal+growth+of+mammalian+cells+in+vitro%3B+growth+characteristics+of+colonies+from+single+HeLa+cells+with+and+without+a+feeder+layer%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Med%22%5BJournal%5D)">Clonal growth of mammalian cells in vitro; growth characteristics of colonies from single HeLa cells with and without a feeder layer.</a> J Exp Med. 103, 273-283 (1956).</li>
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<li>Steele, J. G., Rowlatt, C., Sandall, J. K., Franks, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+surface+properties+of+high-+and+low-metastatic+cell+lines+selected+from+a+spontaneous+mouse+lung+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Cancer%22%5BJournal%5D)">Cell surface properties of high- and low-metastatic cell lines selected from a spontaneous mouse lung carcinoma.</a> Int J Cancer. 32, 769-779 (1983).</li>
</ol>

著者らは開示するものは何もない。

シグナル伝達タンパク質の腫瘍抑制機能のインビトロでの確認は困難である。このプロパティを調査するために利用できる最も厳格なアッセイの1つは、軟寒天コロニー形成アッセイである。ここでは、安定的にその親CMT167細胞株と比較して、Wnt7aおよびFZD9を過剰発現するマウス肺癌細胞株を用いて、軟寒天コロニー形成アッセイを例示している。 軟寒天アッセイに関して考慮すべきいくつかの重要なポイントがあります。このアッセイにおいて最も重要なステップは、細胞のプレーティングされる。細胞計数は正確でなければならない、と寒天ソリューションは、熱すぎてはいけません。はコロニーが形成されていない場合は、細胞は熱ストレスによる損傷を受けている可能性があります。この状況では、アッセイは、可能な限り42°Cに近い寒天温度を保つための予防措置を取って、繰り返されるべきである。あるいは、細胞のより多数のメッキすることができる。 軟寒天アッセイにはいくつかの制限があります。一つのそのような制限は、それが完了...

軟寒天コロニー形成アッセイは、広く、インビトロで細胞形質転換を評価するために使用される技術である。歴史的に、別のアッセイは、パックらによって記載され 1956年にクローン原性アッセイは、コロニー1を形成する細胞の能力を評価するために使用した。この技術では、細胞を培養プレート上に分散させ、必要な成長因子を提供するための「フィーダー」細胞または馴化培地の存在下で増殖させた。この技術の制限は、それが唯一のコロニー形成に関する情報を提供したことであった。正常細胞は、アノイキス2と呼ばれるアポトーシス死の特定のタイプに、足場非依存性増殖を防止することができる。しかし、形質転換細胞は、基質に結合することなく成長し、分裂する能力を有する。この概念を活用するために、研究者らは軟寒天コロニー形成アッセイを開発しました。軟寒天コロニー形成アッセイは、以降のspに対応するために、より近年では、改変されているecificニーズ。一変形形態では、ハイスループットコロニー計数を可能にするために、蛍光色素の取り込みを含む。別の変形例は、タンパク質またはDNAのサンプルが必要な場合にコロニーを形成した後の生存細胞の回収を可能にするために特殊な寒天溶液の使用を含む。 従来の軟寒天コロニー形成アッセイにおいて、細胞は、軟寒天の別の層上に載っている細胞培養培地を含む軟寒天混合物の層で増殖される細胞培養培地と混合したが、寒天、より高い濃度で含有する。これは、培養プレートに付着する細胞を防ぎ、まだ目に見えるコロニーを形成する細胞を形質転換することを可能にする。この手法の背後にある理論的根拠は、正常細胞が成長し、分裂することができるように、細胞外マトリックスへの細胞接触に依存することである。逆に、形質転換された細胞は成長し、関係なく周囲の環境の分裂能を有している。したがって、足場非依存性の方法でコロニーを形成することができる細胞は、cた形質転換されるonsideredと発がん性。この方法の全体的な目標は、半定量的かつ厳格な方法で、細胞内でこの機能を測定することである。 Wntシグナル伝達経路は、胚発生に重要な、しばしば腫瘍形成3-6で脱調節されている。 Wntシグナル伝達に関連する複数の経路がある。標準経路は、転写コアクチベータカテニンに対するその効果を通してWntシグナル伝達および下流の遺伝子転写の調節を必要とする。 Wntはまた、例えば、いくつかの非標準的な経路を介して細胞骨格構造7、および小胞体8からのカルシウムの放出を調節するのWnt-カルシウム経路に関与する要素を調節する平面細胞極性経路を、信号。 Wntシグナルリガンドが結合フリッツルド受容体を介してその活性を発揮する。いくつかのWntが肺癌において上方制御されることが示されているが、Wnt7a、非Smalの中でダウンレギュレートされることが示されているプロモーターのメチル化9を介してLの細胞肺癌。 Wnt7aはFZD9を結合し、非標準的経路を介して腫瘍抑制因子として機能します。のWnt-7aおよびFZD-9の回復は、非小細胞肺癌細胞10の成長を阻害する。 Wnt7a / FZD9の効果は、ERK-5、今度は、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ（PPARγ）11,12を作動させるの活性化を介して媒介される。ここでは、Wnt7aおよびFZD9の過剰発現は、マウス肺癌細胞株の足場非依存性増殖の抑制をもたらすことを示している。マウスCMT167細胞はC57BL / lcrfマウス13で肺癌に由来しかつ安定Wnt7AおよびFZD9トランスフェクトした。 Wnt7AとFZD9の過剰発現は、定量的PCR（Q-PCR）によって確認したとWnt7AとFZD9過剰発現の機能は、PPARγの下流の活性化を介して確認された。

<table><tbody><tr><td>がん細胞株</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>10032302</td><td>CMT-167 細胞</td></tr><tr><td>粉末 RPMI 1640 培地</td><td>Gibco</td><td>31800-089</td><td>2倍細胞培養培地の調製に使用。</td></tr><tr><td>液体RPMI 1650培地</td><td>Cellgro</td><td>10-040-CV</td><td>1x細胞培養培地と呼ばれます。</td></tr><tr><td>ウシ胎児血清</td><td>HyClone</td><td>SH30910.03</td><td>細胞培養培地の補填に使用されます。</td></tr><tr><td>ペニシリン/ストレプトマイシン</td><td>CellGro</td><td>30-002-Cl</td><td>細胞培養液に使用。</td></tr><tr><td>Difco Noble Agar</td><td>BD Biosciences</td><td>214230</td><td>1.0%と0.6%の寒天を調製するために使用されます。</td></tr><tr><td>重炭酸ナトリウム</td><td>フィ</td><td>ッシャーBP-328-1</td><td>2倍細胞培養培地に使用されます。</td></tr><tr><td>トリプシン</td><td>Cellgro</td><td>25-050-CL</td><td></td></tr><tr><td>の生殖不能のびん上のフィルター</td><td>フィッシャー09-761-126</td><td></td><td>フィルター2x媒体をsterilするのに使用。</td></tr><tr><td>リポフェクタミン試薬</td><td>Invitrogen</td><td>18324-020</td><td>PPAR-REルシフェラーゼアッセイに使用。</td></tr><tr><td>6ウェルプレート組織培養処理</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>37 &#176;C/5% CO2インキュベーター</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Chemi-Doc Imager</td><td>Bio-Rad</td><td></td><td>コロニーの写真を撮るために使用されます。</td></tr><tr><td>Quantity One ソフトウェア</td><td>バイオ・ラッド</td><td></td><td>細胞コロニーのカウントに使用します。</td></tr><tr><td>15 mlコニカルチューブ</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>50 mlコニカルチューブ</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>250 ml 三角フラスコ</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>電子レンジ</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>5 ml セロジカルピペット</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>ピペットエイド</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>マイクロピペット</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>血球計算盤 カバー付き</td><td></td><td></td><td></td>スリップ</tr><tr><td>ピペットチップ</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>倒立型光学顕微鏡</td><td></td><td></td><td></td></tr>遠心<tr><td>分離機</td><td></td><td></td><td></td></tr>耐<tr><td>熱手袋</td><td></td><td></td><td></td></tr>サ<tr><td>ランラップ</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>アイスバケツ</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

軟寒天コロニー形成アッセイ

The Soft Agar Colony Formation Assay

アンカレッジに依存しない増殖は、形質転換された細胞が固体表面から独立して増殖する能力であり、発がんの特徴です。軟寒天コロニー形成アッセイは、in vitroでこの能力を特徴付けるための確立された方法であり、細胞内の悪性形質転換の最も厳しい試験の1つと考えられています。 このアッセイでは、さまざまな治療条件に応じたこの能力を半定量的に評価することもできます。 ここでは、マウス肺がん細胞株CMT167を用いた軟寒天コロニー形成アッセイを実演し、Wntシグナル伝達経路の2つのメンバーであるWnt7AとFrizzled-9(Fzd-9)の腫瘍抑制効果を実証します。 Wnt7aとFzd-9の同時過剰発現は、CMT167細胞におけるコロニー形成の阻害を引き起こした。 これは、Wnt7aリガンドとそのFrizzled-9受容体の発現が、マウス肺がんモデルにおける腫瘍増殖を抑制するのに十分であることを示しています。

我々の軟寒天コロニー形成アッセイによって示されるようにCMT167細胞におけるWnt7AおよびFZD9の発現は、腫瘍抑制に有効である。予め、我々はWnt7AおよびFZD9 mRNAがCMT167細胞において低レベルで発現されることを示すためにQ-PCRを用いた。 MLE-12細胞は、SV40形質転換マウス肺上皮細胞株（ 図1）と比較した場合CMT167細胞は、内因性Wnt7AおよびFZD9の低いレベルを示した。私たちは、その後Wnt7AとFZD9（CMT LL Wnt7a / FZD9）の両方を発現する安定な細胞株を作成するためにWnt7A（LNCX-Wnt7A）とFZD9（LPCX-FZD9）の人間構築物を発現する2レトロウイルス過剰発現ベクターでCMT167細胞をトランスフェクトした。我々は、この細胞株（ 図2）においてQ-PCRによってWnt7AおよびFZD9の発現を確認した。私たちの前の仕事が示しているように、PPARγはWnt7A / FZD9シグナル伝達の下流エフェクターである。 Wntシグナル伝達経路は多様である。したがって、特定のWntおよびそのFZD受...

軟寒天コロニー形成アッセイは、in vitroで細胞の足場に依存しない増殖を確認するために使用される方法です。このプロトコルの目的は、形質転換細胞の腫瘍形成可能性および形質転換細胞に対するタンパク質の腫瘍抑制効果を検出するための厳密な方法を説明することです。

Anchorage-independent growth is the ability of transformed cells to grow independently of a solid surface, and is a hallmark of carcinogenesis. The soft ...

この手順の全体的な目標は、細胞の足場に依存しない成長を定量化することです。これは、最初に寒天の層を細胞培養プレートに播種し、それを硬化させることによって達成されます。2番目のステップは、前の寒天層の上に寒天中の細胞の混合物をプレートすることです。次に、細胞は数週間にわたってコロニーを形成することが許されます。最後のステップは、可視化と定量のためにコロニーを染色することです。最終的に、軟寒天コロニー形成アッセイは、細胞形質転換の指標としてアンカレッジに依存しない増殖を示すために使用されます。この手法がClonジェニックアッセイなどの他の方法よりも優れている主な利点は、軟寒天コロニー形成アッセイでは、細胞がアンカレッジに依存しない方法でコロニーを形成する必要があることです。処理した組織培養の各ウェルにラベルを付けることから手順を開始します。調査対象の各細胞株または条件に適した6ウェルプレート。次に、1グラムの粉末培地と0.2グラムの重炭酸ナトリウムを脱イオン水に溶解して、2つのXcel培地を調製し、最終容量50ミリリットルにします。この媒体を0.2ミクロンのフィルターに通します。目的の細胞株の通常の培養に必要な追加のコンポーネントを追加します。例えば、10%FBSおよび1%ペニシリンストレプトマイシン溶液を添加したRPMI 1640培地でCMT 1 67細胞株を増殖させます。使用前に温水浴で中温から摂氏37度まで温めてください。次に、Xcel培地を1つ調製します。次に、100ミリリットルの脱イオン水に1グラムの貴貴な寒天を加えて、1%貴貴な寒天を調製します。その後、0.6ミリリットルの脱イオン水に0.6グラムの貴貴な寒天を加えて、0.6%貴貴な寒天を調製します。次に、貴寒天混合物をオートクレーブします。その後、コロニーを染色する目的で、1 つの XPBS で 1 ミリグラム/ミリグラムのニトロ ブルー テトラ発煙硫酸塩ストック溶液を作成します。この手順では、1%貴金属寒天のボトルを電子レンジで加熱しながら約1〜2分間電子レンジで加熱します。沸騰しないように溶液を注意深く監視してください。次に、寒天が完全に溶解して溶液が透明になるまで、断続的に加熱と混合を続けます。その後、溶かした寒天溶液とプレウォーム2x培地を42°Cで満たされた氷のバケツに入れます。水道水。さらに、50ミリリットルの円錐形のチューブをアイスバケツのチューブホルダーに入れ、お湯を入れます。次に、バケツを細胞培養フードに移します。次に、6ミリリットルの培地と6ミリリットルの1%貴金属寒天溶液を50ミリリットルの円錐管に加えます。ピペットを数回上下させて混ぜます。速いペースで作業することで、柔らかい寒天の早期硬化を防ぐことができます。その後、5ミリリットルの血清ピペットで約5.5ミリリットルの混合物を引き出します。気泡がピペットカラムの上部まで上昇するのを待ちます。次に、1.5ミリリットルの混合物を各ウェルに堆積させ、気泡の堆積を防ぎます。プレートを覆い、寒天混合物を室温で細胞培養フード内で30分間固化させます。まず、トリプシンで細胞を採取し、培養液で1〜5個希釈し、培地を15ミリリットルの円錐管にします。細胞を数え、この時点で最終的な細胞懸濁液を調製するためにウェルごとに必要な細胞数を計算します。次に、0.6%寒天溶液を電子レンジで溶かします。お湯の入った氷の入ったバケツに入れ、50ミリリットルの円錐形チューブをチューブホルダーに入れ、最終的なセル懸濁液を入れます。次に、0.6%寒天を溶かしたアイスバケツを細胞培養フードに移し、その後のステップで行います。6ウェルプレート用の総量12ミリリットルの細胞懸濁液を調製するには、まず、6ミリリットルの細胞懸濁液を50ミリリットルのコニカルチューブにピペットします。次に、チューブに6ミリリットルの0.6%寒天を加えます。混合物を摂氏42度に保ち、早期の早期硬化を避け、細胞の生存率を最大化します。その後、混合物をすばやく、2〜3回ピペットで動かして細胞を分散させます。5ミリリットルの血清ピペットで5.5ミリリットルの混合物を引き出し、気泡がピペットカラムの上部に上昇するのを待ちます。次に、それぞれに1.5ミリリットルの混合物を堆積させます。細胞寒天混合物を細胞培養フード内で室温で30分間固化させてから、摂氏37度の加湿細胞培養インキュベーターに入れます。乾燥を防ぐために、週に2回、寒天の上層に100マイクロリットルの成長培地を追加し、適切なコロニー形成のために約21日間待ちます。細胞を染色するには、各ウェルに200マイクロリットルのニトロブルーテトラ発煙硫酸塩溶液を加え、プレートを摂氏37度で一晩インキュベートします。コロニーが染色されたら、イメージャーを使用して井戸の写真を撮り、画像分析ソフトウェアを使用してコロニーをカウントします。ここに示されているのは、CMT 1 67 LNCX LPC X細胞を発現するベクターとCMT 1 67 LLの軟寒天コロニー形成アッセイであり、発現細胞に対して7つまたは縮れた9つが生じました。CMT 1 67 L および CXL PC X 細胞と CMT 1 67 LL を発現するベクターは、7 a f 縮れました。軟質寒天培地形成アッセイでプレーティングした9つの過剰発現細胞、CMT1、67 LLは、7つの縮れた9つの細胞が、その開発後にコロニー形成の顕著な減少を示した。この技術は、がん研究の分野の研究者がin vitroで細胞形質転換を探求する道を開きました。このビデオを見れば、アンカレッジに依存しない細胞増殖について細胞を評価する方法について十分に理解できるはずです。

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Biology

生物学

生殖可能性を評価するためのクローン原性アッセイの適用は50年以上のために設立されました。ここでは、接着細胞とクローン原性アッセイを行うための一般的な手順を示しています。...

クローン原性アッセイ：付着細胞

文化微生物に使用されるメディアや試薬を扱う場合は、無菌操作は、汚染が最小化されていることを確認するために練習する必要があります。メッキの様々な方法が日常的に、分離、伝播または列挙細菌やファージ、実験材料の無菌性を維持する手順を組み込むすべてがために使用されます。...

無菌実験技術：めっき法

このビデオでは、PADI酵素阻害剤とBB-Cl-アミジンがin...

軟寒天コロニー形成アッセイ:癌細胞増殖に対する新規化合物の影響をテストする方法

このビデオでは、肺がん細胞が無限に増殖し、個々のコロニーを形成する能力を決定するのに役立つコロニー形成アッセイについて説明しています。コロニー形成細胞に対する抗がん剤の効果は、コロニー形成細胞の数や大きさの変化を解析することで解析できます。...

コロニー形成アッセイ:コロニー形成肺がん細胞に対する抗がん剤の有効性の評価

出典: Cayron、J.、およびLesterlin、C.ストレス処理下での細菌増殖のマルチスケール分析。 J. Vis. 経験。 (2019年)このビデオでは、プレーティングによる生存率測定とフローサイトメトリーによる細胞サイズとDNA含有量の分析を使用して、細胞分裂阻害抗生物質処理下で 大腸菌...

プレーティングアッセイとフローサイトメトリーを使用した 大腸菌 における抗生物質誘発性フィラメンテーションの評価

出典: Temkin, M. I. ほか微生物間相互作用の調査のための高スループット共培養アッセイ。 J. Vis. Exp.(2019年)このビデオは、共培養中のコリネバクテリウム・プロピンクムとブドウ球菌の微生物相互作用を研究するためのin...

共培養における微生物間相互作用を研究するためのin vitroアッセイ

タンパク質は互いに相互作用し、これらの相互作用が彼らの機能の大部分を決定します。タンパク質相互作用パートナーは、ジヒドロ葉酸レダクターゼタンパク質フラグメント相補アッセイ(DHFR-PCA)に基づく酵母適応度アッセイを使用して、in...

生細胞内のタンパク質断片相補アッセイ（PCA）によるゲノムワイドなタンパク質間相互作用のスクリーニング

ここでは、ペプチジルアルギニンデイミナーゼ(PADI)酵素阻害剤であるBB-Cl-アミジンがin vitroで乳がんの腫瘍形成性に及ぼす影響をテストするための軟寒天コロニー形成アッセイの使用を文書化しています。...

乳癌細胞における腫瘍形成の阻害剤を同定するための軟寒天コロニー形成アッセイの活用

酵母増殖型は、マイクロコロニーに成長する固定化細胞の高度に平行なタイムラプスイメージングを通じて正確に測定される。同時に、ストレス耐性、タンパク質発現、タンパク質の局在化を監視し、統合データセットを生成して、環境と遺伝的の違い、およびイソジェニック細胞間の遺伝子発現不均一性を研究し、成長を調節することができます。...

成長と遺伝子発現の不均一性を測定するマイクロコロニーのハイスループットライブイメージング

この方法は、96ウェルプレートフォーマットを使用してコロニー形成単位(CFU)をプレート化し、ハエホモジネートサンプル全体の ショウジョウバエ...

ショウジョウバエ微生物叢に適用された96ウェルプレートフォーマットでの高速コロニー形成ユニットカウント

好気性メタン酸化細菌の自然生息地に見られるメタン-酸素カウンター勾配を再現する単純なモデル生態系を準備するためのプロトコルが説明されており、空間的に解決されたコンテキストでそれらの生理機能を研究できます。また、アガロースベースのモデルエコシステムで使用するための一般的な生化学的アッセイの改良についても説明します。...

メタン-酸素カウンターグラジエントにおけるメタン栄養生物の培養のためのアガロースベースモデル生態系

学ぶ軟寒天コロニー形成アッセイによる細胞の浮遊非依存的増殖の定量化方法。がん研究における細胞変形と腫瘍抑制タンパク質の効果評価に応用できます。

軟寒天コロニー形成アッセイ

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