PCR 기술

이 동영상은 DNA 샘플에서 indel 돌연변이를 식별하는 데 있어 디지털 액적 중합효소 연쇄 반응의 역할을 보여줍니다. ddPCR의 높은 정밀도와 감도는 낮은 수준에서도 샘플에 존재하는 희귀 돌연변이를 정확하고 일관되게 검출할 수 있습니다. 게놈의 여러 영역에서 indel 돌연변이를 식별하고 정량화할 수 있으며, 이를 통해 돌연변이의 메커니즘과 이러한 돌연변이의 기능적 결과에 대한 귀중한 통찰력을 얻을 수 있습니다.

이 비디오는 웰을 따라 그래디언트 어닐링 온도를 설정하는 프라이머의 어닐링 온도 최적화를 위한 그래디언트 중합효소 연쇄 반응을 보여줍니다. 다양한 어닐링 온도의 효과는 반응 조건을 최적화하는 데 도움이 되는 증폭된 산물의 수율에 의해 결정됩니다.

이 비디오에서는 두 개의 서로 다른 유전자 마커를 동시에 검출하는 데 유용한 기존 PCR 기술을 변형한 ddPCR(duplex digital PCR) 기술을 보여줍니다. 단일 PCR 반응은 독립적으로 증폭되는 나노리터 크기의 유화 액적으로 분할되며, 액적 분획에서 서로 다른 색상의 형광 증폭 신호를 검출하는 것은 표적 염기서열의 초기 농도를 계산하는 데 사용됩니다.

이 비디오는 실시간 역전사 PCR을 사용하여 바이러스 감염을 감지하는 정량적 방법을 보여줍니다. 역전사 단계는 RNA를 cDNA로 변환한 다음 PCR 주기를 통해 증폭합니다. 샘플에 바이러스 RNA가 존재한다는 것은 PCR에서 얻은 DNA의 증폭 및 해리 곡선을 분석하여 확인합니다.

이 비디오는 체세포 돌연변이를 감지하는 야생형 차단 중합효소 연쇄 반응(WTB-PCR)에 대해 설명합니다. PCR 기반 기술은 고정 핵산(locked nucleic acid, LNA)을 사용하는데, 이는 올리고뉴클레오타이드(oligonucleotide)로서 상보적인 야생형 대립유전자에 결합하고 그 신장을 차단합니다. 차단은 선택적으로 샘플의 야생형 변이체에 대한 저수준 돌연변이 대립유전자의 증폭을 허용합니다.

이 비디오에서는 DNA 정량화를 통해 T7 박테리오파지를 열거하기 위한 정량적 중합효소 연쇄 반응(qPCR)에 대해 설명합니다. PCR 혼합물의 형광 염료는 새로 합성된 DNA 가닥과 결합하여 형광을 방출하며, 이는 측정됩니다.

이 비디오는 단일 튜브 반응에서 올리고뉴클레오타이드로 코팅된 고분자 미세구를 사용하여 단일 가닥 DNA를 증폭하는 기술을 설명합니다. 이 과정을 통해 DNA 염기서열분석 및 마이크로어레이 분석에 추가로 사용할 수 있는 순수한 단일 가닥 DNA가 생성됩니다.

이 동영상은 두 개의 프라이머 세트를 사용하여 두 개의 순차적 PCR 증폭 프로세스로 구성된 기술인 중첩 중합효소 연쇄 반응에 대해 설명합니다. 프라이머의 첫 번째 세트는 두 번째 세트의 상류에서 서열에 어닐링하여 특정 유전자 서열을 선택적으로 증폭할 수 있습니다. 이 PCR은 일반 PCR보다 민감하고 특이도가 높으며 다양한 질병의 검출 기법으로 널리 사용되고 있습니다.

이 비디오에서는 용융 온도 분석을 기반으로 다양한 염기서열 길이의 DNA 단편의 길이 다형성을 결정하는 고해상도 용융 PCR 기술에 대해 설명합니다.

이 동영상은 임상 진단 및 예후를 위한 조기 바이오마커로서 서로 다른 백혈구 집단에서 메틸화된 DNA 영역을 동시에 정량화하기 위한 다중 액적 중합효소 연쇄 반응 기술을 보여줍니다.

이 비디오는 DNA 샘플에서 단일 뉴클레오티드 변이를 검출하기 위한 chip-in-a-tube 형식의 디지털 PCR의 유용성을 보여줍니다. 단일 PCR 반응은 독립적인 PCR 반응으로 작용하는 챔버로 분할되며, 챔버 내 증폭된 표적에서 형광 신호를 검출하는 것은 샘플 내 변이 대립유전자의 빈도를 계산하는 데 사용됩니다.

이 비디오는 희귀 전사체 변이체를 검출하는 데 유용한 디지털 PCR 기술의 변형인 칩 기반 디지털 PCR을 보여줍니다. PCR 반응은 나노유체 칩의 챔버로 분할되며, 각 챔버는 독립적인 반응으로 작용합니다. 증폭된 표적이 있는 챔버에서 형광 신호를 감지하면 샘플에 희귀한 전사체 변이체가 존재함을 확인할 수 있습니다.