Sequential Salt Extractions for the Analysis of Bulk Chromatin Binding Properties of Chromatin Modifying Complexes

Elizabeth G. Porter; Katelyn E. Connelly; Emily C. Dykhuizen

doi:10.3791/55369

바인딩 속성 수정 복합물 Chromatin의 대량 Chromatin의 분석에 대 한 순차적 소금 기사

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Genetics

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Sequential Salt Extractions for the Analysis of Bulk Chromatin Binding Properties of Chromatin Modifying Complexes

바인딩 속성 수정 복합물 Chromatin의 대량 Chromatin의 분석에 대 한 순차적 소금 기사

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07:41 min

October 2, 2017

DOI: 10.3791/55369-v

Elizabeth G. Porter¹, Katelyn E. Connelly¹, Emily C. Dykhuizen¹

¹Department of Medicinal Chemistry and Molecular Pharmacology,Purdue University

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Chromatin 바인딩 단백질의 순차적 소금 추출 큰 단백질 복합물의 바인딩 속성을 결정 하기 위한 유용한 도구입니다. 개별 하위 단위 또는 단백질 복잡 한 대량 chromatin의 전반적인 선호도에 도메인의 역할을 평가 하기 위해이 메서드를 사용할 수 있습니다.

순차 염 추출 절차의 전반적인 목표는 벌크 염색질에 대한 단백질 결합 프로파일을 특성화하고 단백질 또는 그 환경을 조작할 때 결합이 어떻게 변경되는지 평가하는 것입니다. 이 방법은 염색질에 대한 후성유전학적 조절자의 상대적 친화도를 측정하고 유전적, 화학적, 환경적 조작에 따라 이러한 상호 작용이 어떻게 변하는지 평가하는 데 사용할 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 염색질 결합 단백질의 결합 프로파일을 빠르고 저렴하게 평가할 수 있다는 것입니다.

염색질 분야를 처음 접하는 사람들은 종종 염색질 면역침전(ChIP)으로 어려움을 겪습니다. 순차적 염 추출(Sequential Salt Extraction)은 경험이 부족한 과학자들조차도 동일한 질문에 답하기 위해 사용할 수 있는 오래된 기술입니다. 절차를 시작하려면 각 관심 세포주에서 8, 000, 000개의 세포를 수확합니다.

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