-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PL

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pl_PL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biochemistry
Analiza odcisków palców u nóg tworzenia kompleksu inicjacji translacji na mRNA ssaków
Analiza odcisków palców u nóg tworzenia kompleksu inicjacji translacji na mRNA ssaków
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
Toeprinting Analysis of Translation Initiation Complex Formation on Mammalian mRNAs

Analiza odcisków palców u nóg tworzenia kompleksu inicjacji translacji na mRNA ssaków

Full Text
13,289 Views
10:37 min
May 10, 2018

DOI: 10.3791/57519-v

Joseph A. Ross1, Nehal Thakor1,2,3

1Department of Chemistry and Biochemistry, Alberta RNA Research and Training Institute,University of Lethbridge, 2Department of Neuroscience and the Canadian Centre for Behavioral Neuroscience (CCBN),University of Lethbridge, 3Arnie Charbonneau Cancer Institute,University of Calgary

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This toeprinting analysis aims to measure the formation of translation initiation complexes on mammalian mRNAs. It provides insights into both cap-dependent and IRES-driven translation mechanisms.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Biochemistry
  • Molecular Biology

Background

  • Toeprinting is a technique used to study translation initiation.
  • It allows for the analysis of specific mRNA interactions with ribosomes.
  • The method can be applied to investigate IRES-mediated translation initiation.
  • Understanding these processes is crucial for insights into gene expression regulation.

Purpose of Study

  • To observe the formation of translation initiation complexes on mammalian mRNAs.
  • To explore the mechanisms of IRES-mediated translation initiation.
  • To provide a detailed analysis of translation initiation on specific mRNAs.

Methods Used

  • Transcription reactions are assembled to transcribe RNA from PCR amplified DNA templates.
  • RNase-free DNase is added to remove the DNA template from the RNA reactions.
  • Incubation is performed at 37 degrees Celsius for 30 minutes.
  • Toeprinting analysis is conducted to assess complex formation.

Main Results

  • The method successfully demonstrates the formation of translation initiation complexes.
  • Insights into IRES-mediated translation initiation are obtained.
  • Specific mRNA interactions with ribosomes can be analyzed in detail.
  • The technique provides a robust framework for studying translation initiation.

Conclusions

  • Toeprinting is an effective method for studying translation initiation.
  • The technique enhances understanding of mRNA translation mechanisms.
  • It can be applied to various mRNAs to explore their translation dynamics.

Frequently Asked Questions

What is toeprinting?
Toeprinting is a technique used to analyze the formation of translation initiation complexes on mRNA.
How does toeprinting work?
It involves transcribing RNA from DNA templates and assessing ribosome interactions with the mRNA.
What are IRES elements?
IRES (Internal Ribosome Entry Site) elements allow for translation initiation independent of the 5' cap structure.
What are the advantages of toeprinting?
Toeprinting allows for detailed analysis of specific mRNA interactions with ribosomes.
Can toeprinting be used for different mRNAs?
Yes, toeprinting can be applied to various mRNAs to study their translation initiation mechanisms.

Toeprinting ma na celu zmierzenie zdolności transkrybowanego RNA in vitro do tworzenia kompleksów inicjujących translację z rybosomami w różnych warunkach. Protokół ten opisuje metodę odciskania palca RNA ssaków i może być stosowany do badania translacji zarówno zależnej od czapeczki, jak i sterowanej przez IRES.

Ogólnym celem tej analizy odcisków palców u nóg jest obserwacja tworzenia się kompleksu inicjacji translacji na mRNA ssaków. Metoda ta może pomóc odpowiedzieć na kluczowe pytania w dziedzinie translacji mRNA, takie jak inicjacja translacji za pośrednictwem IRES. Główną zaletą tej techniki jest to, że można przeprowadzić szczegółową analizę tworzenia się kompleksu inicjującego translację na określonym mRNA.

Zbierz reakcje transkrypcyjne w celu transkrypcji RNA z matryc DNA amplifikowanych PCR, kodując XIAP IRES RNA lub jego mutanty. Następnie dodaj dwie jednostki DNazy wolnej od RNaz, aby usunąć matrycę DNA do każdej 20 mikrolitrowej reakcji RNA. Inkubować w temperaturze 37 stopni Celsjusza przez 30 minut.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Słowa kluczowe: analiza odcisków palców u stóp kompleks inicjujący translację mRNA ssaków IRES oczyszczanie RNA lizat retikulocytów królika inhibitor RNazy ATP GMP-PNP DTT spermidyna

Related Videos

Izolacja translujących rybosomów zawierających peptydylo-tRNA do analiz funkcjonalnych i strukturalnych

11:19

Izolacja translujących rybosomów zawierających peptydylo-tRNA do analiz funkcjonalnych i strukturalnych

Related Videos

20.4K Views

Analiza inicjacji translacji w warunkach stresowych za pomocą profilowania polisomów

10:59

Analiza inicjacji translacji w warunkach stresowych za pomocą profilowania polisomów

Related Videos

18.9K Views

In vivo (in vivo) Badanie translatomii ośrodkowego układu nerwowego przez frakcjonowanie polirybosomów

09:13

In vivo (in vivo) Badanie translatomii ośrodkowego układu nerwowego przez frakcjonowanie polirybosomów

Related Videos

12.7K Views

Frakcjonowanie polisomów i analiza translatomiów ssaków w skali całego genomu

10:56

Frakcjonowanie polisomów i analiza translatomiów ssaków w skali całego genomu

Related Videos

70K Views

Immunofluorescencja ilościowa do pomiaru globalnej translacji zlokalizowanej

09:13

Immunofluorescencja ilościowa do pomiaru globalnej translacji zlokalizowanej

Related Videos

10.5K Views

Sztuczne kompleksy elongacyjne polimerazy II RNA do analizy zdarzeń przetwarzania kotranskrypcyjnego RNA

10:59

Sztuczne kompleksy elongacyjne polimerazy II RNA do analizy zdarzeń przetwarzania kotranskrypcyjnego RNA

Related Videos

10.2K Views

Test obrazowania pojedynczych cząsteczek in vitro do analizy kinetyki translacji zależnej od czapeczki

09:52

Test obrazowania pojedynczych cząsteczek in vitro do analizy kinetyki translacji zależnej od czapeczki

Related Videos

3.5K Views

Definiowanie programu translacji mRNA matki podczas dojrzewania in vitro przy użyciu testu reporterowego pojedynczego oocytu

08:00

Definiowanie programu translacji mRNA matki podczas dojrzewania in vitro przy użyciu testu reporterowego pojedynczego oocytu

Related Videos

4.8K Views

Szybkie utrwalanie in vivo i izolacja kompleksów translacyjnych z komórek eukariotycznych

14:29

Szybkie utrwalanie in vivo i izolacja kompleksów translacyjnych z komórek eukariotycznych

Related Videos

4.9K Views

Wychwytywanie powinowactwa do kompleksu białkowego z komórek ssaków poddanych mieleniu w kriomerze

10:37

Wychwytywanie powinowactwa do kompleksu białkowego z komórek ssaków poddanych mieleniu w kriomerze

Related Videos

15.6K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code