-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PL

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pl_PL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Wykorzystanie bibliotek przetwarzania obrazów w celu usprawnienia kwantyfikacji jąder
Wykorzystanie bibliotek przetwarzania obrazów w celu usprawnienia kwantyfikacji jąder
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Using Computer Vision Libraries to Streamline Nuclei Quantification

Wykorzystanie bibliotek przetwarzania obrazów w celu usprawnienia kwantyfikacji jąder

Full Text
685 Views
06:25 min
June 6, 2025

DOI: 10.3791/67945-v

Danielle E. Levitt1, Alexandra L. Khartabil1, Rylea E. Hall1, Matthew R. DiLeo1, Connor J. Mills1, Ashley K. Williams1, Casey R. Appell2, Ronald G. Budnar, Jr.1, Hui-Ying Luk2

1Metabolic Health & Muscle Physiology Laboratory, Department of Kinesiology and Sport Management,Texas Tech University, 2Applied Exercise Physiology Laboratory, Department of Kinesiology and Sport Management,Texas Tech University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a method for automating the quantification of nuclei in images, which aids in normalizing metabolic data in skeletal muscle research. The automated program, validated across varying cell densities, addresses challenges inherent to manual counting, such as bias and variability.

Key Study Components

Research Area

  • Cell biology
  • Metabolic health
  • Heat therapy effects on muscle

Background

  • Manual quantification of nuclei is time-consuming and biased.
  • Automated methods can improve accuracy and efficiency.
  • Understanding the effects of heat therapy on muscle adaptations is crucial for metabolic health.

Methods Used

  • Automated nuclei counting using an open-source program
  • Cell line models for skeletal muscle research
  • Image processing and analysis

Main Results

  • The automated program showed excellent reliability with an intra-class correlation coefficient of 0.993.
  • Quantification accuracy was high across varying cell densities.
  • Problems with clustering nuclei and artifacts were identified for further improvement.

Conclusions

  • The study demonstrates an objective approach to nuclei quantification that enhances experimental normalization.
  • This method is relevant for advancing research in metabolic health and muscle adaptations.

Frequently Asked Questions

What is the significance of nuclei quantification in this study?
Nuclei quantification is essential for normalizing metabolic data in skeletal muscle research.
How does the automated program compare to manual counting?
The automated program significantly reduces observer bias and variability, showing high reliability against manual counts.
What challenges does manual nuclei counting present?
Manual counting is prone to biases and inconsistencies, making it less reliable than automated methods.
What improvements can be made to the automated method?
Further enhancements can focus on better handling of clustered nuclei and image artifacts.
Is the program user-friendly for those with limited technical skills?
Yes, the program is designed to be accessible for scientists with varying levels of coding experience.
What was the primary validation for the automated program?
The program was validated with high intra-class correlation coefficients across all tested cell densities.
How does this research relate to metabolic health?
It aims to uncover mechanisms of heat therapy in improving muscle and mitochondrial health, particularly in pre-diabetic individuals.

Ten artykuł opisuje krok po kroku metody automatyzacji kwantyfikacji jąder na podstawie obrazów za pomocą programu wykonywalnego o otwartym kodzie źródłowym, sprawdzanego w różnych gęstościach komórek. Ten program stanowi alternatywę, która usuwa bariery związane z kosztami, dostępnością dla użytkowników o ograniczonych umiejętnościach technologicznych oraz walidacją specyficzną dla aplikacji, która może ograniczać użyteczność istniejących technologii.

Opracowaliśmy tę metodę, aby znormalizować dane metaboliczne z modeli komórkowych, aby pomóc zidentyfikować mechanizmy, podkreślić adaptacje mięśni szkieletowych wywołane terapią cieplną i ostatecznie poprawić zdrowie metaboliczne u osób ze stanem przedcukrzycowym.

Musimy policzyć jądra do normalizacji eksperymentalnej. Ręczna kwantyfikacja jąder wiąże się z wyzwaniami, takimi jak stronniczość obserwatora, czas i zmienność w natrafianiu na różne próbki lub warunki.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biologia Zeszyt 220

Related Videos

Przepływ pracy dla wysokiej zawartości, indywidualnej kwantyfikacji komórek markerów fluorescencyjnych na podstawie danych z mikroskopu uniwersalnego, wspierany przez oprogramowanie Open Source

09:57

Przepływ pracy dla wysokiej zawartości, indywidualnej kwantyfikacji komórek markerów fluorescencyjnych na podstawie danych z mikroskopu uniwersalnego, wspierany przez oprogramowanie Open Source

Related Videos

13.6K Views

Kwantyfikacja ekspresji białek i kolokalizacji za pomocą multipleksowanego barwienia immunohistochemicznego i obrazowania wielospektralnego

08:40

Kwantyfikacja ekspresji białek i kolokalizacji za pomocą multipleksowanego barwienia immunohistochemicznego i obrazowania wielospektralnego

Related Videos

13.5K Views

Wykorzystanie obrazowania na żywo do śledzenia jąder podczas różnicowania i fuzji mioblastów

09:03

Wykorzystanie obrazowania na żywo do śledzenia jąder podczas różnicowania i fuzji mioblastów

Related Videos

8.7K Views

Mapowanie wyłaniającej się organizacji przestrzennej komórek ssaków za pomocą mikrowzorców i obrazowania ilościowego

09:56

Mapowanie wyłaniającej się organizacji przestrzennej komórek ssaków za pomocą mikrowzorców i obrazowania ilościowego

Related Videos

7.1K Views

Substructure Analyzer: Przyjazny dla użytkownika przepływ pracy do szybkiej eksploracji i dokładnej analizy ciał komórkowych na obrazach mikroskopii fluorescencyjnej

14:28

Substructure Analyzer: Przyjazny dla użytkownika przepływ pracy do szybkiej eksploracji i dokładnej analizy ciał komórkowych na obrazach mikroskopii fluorescencyjnej

Related Videos

8.4K Views

Analiza przesiewowa, różnicowanie i dojrzewanie płodowych i dorosłych komórek macierzystych pochodzących z płodowych i dorosłych komórek macierzystych układu nerwowego

09:36

Analiza przesiewowa, różnicowanie i dojrzewanie płodowych i dorosłych komórek macierzystych pochodzących z płodowych i dorosłych komórek macierzystych układu nerwowego

Related Videos

3.3K Views

Zautomatyzowane obrazowanie i analiza w celu ilościowego oznaczania makropinosomów znakowanych fluorescencyjnie

11:01

Zautomatyzowane obrazowanie i analiza w celu ilościowego oznaczania makropinosomów znakowanych fluorescencyjnie

Related Videos

3.4K Views

Wszechstronne narzędzie do analizy dynamicznych zmian w ciałach jądrowych w różnych typach komórek

06:33

Wszechstronne narzędzie do analizy dynamicznych zmian w ciałach jądrowych w różnych typach komórek

Related Videos

922 Views

SCAnED – otwartoźródłowe makro do segmentacji skóry do półautomatycznego wykrywania komórek i jąder w przegrodach skóry naskórnej i skórnej

06:34

SCAnED – otwartoźródłowe makro do segmentacji skóry do półautomatycznego wykrywania komórek i jąder w przegrodach skóry naskórnej i skórnej

Related Videos

611 Views

Analiza danych z mikroskopii wielowymiarowej z wykorzystaniem Cell-ACDC

06:17

Analiza danych z mikroskopii wielowymiarowej z wykorzystaniem Cell-ACDC

Related Videos

571 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code