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A interação física entre dois parceiros proteicos modula os mecanismos biológicos a jusante.
Para detectar interações proteína-proteína usando o ensaio de imunoabsorção enzimática, ELISA, pegue uma placa de imunoensaio de vários poços. Adicione um tampão de revestimento contendo uma das proteínas que interagem - a proteína da isca - e incuba. As proteínas da isca são adsorvidas na superfície do poço por meio de interações hidrofóbicas não específicas.
Descarte a solução gasta e lave a placa com um tampão para remover as proteínas não ligadas. Adicione uma solução de bloqueio e incuba, permitindo que as moléculas do agente bloqueador da solução bloqueiem locais de ligação não específicos na superfície do poço.
Adicione a proteína parceira de interação - a proteína da presa - marcada com resíduos de histidina para facilitar a quantificação. Incubar, permitindo que a proteína da presa se ligue especificamente ao seu parceiro interativo - a isca. Adicione uma solução de anticorpos anti-histidina conjugados com enzimas peroxidase de rábano que se ligam à presa, formando um complexo isca-presa-anticorpo.
Pipetar uma solução contendo o substrato da enzima e o peróxido de hidrogénio e incubar.
A enzima peroxidase de rábano usa peróxido de hidrogênio para a oxidação catalítica de seu substrato - formando um produto de cor azul. Adicione uma solução ácida que desnatura a enzima para interromper a reação, formando um produto de reação amarelo.
Usando um leitor de microplacas, meça a intensidade da cor do produto, que é proporcional à quantidade da proteína da presa ligada e indica uma interação proteína-proteína bem-sucedida.
Para se preparar para o ELISA, dispense 100 microlitros de solução de proteína em cada poço de uma placa de microtitulação Polysorp. Feche as placas com a tampa e armazene a 4 graus Celsius durante a noite para facilitar a imobilização da proteína nos poços da placa de microtitulação. Descarte a solução da placa de microtitulação inclinando-a de cabeça para baixo sobre a pia. Em seguida, lave os poços três vezes com 300 microlitros de PBS por poço.
Bloqueie os poços revestidos por 1 hora em temperatura ambiente com PBS, contendo 2,5 por cento de peso em volume BSA. Após remover a solução de bloqueio, lave os poços três vezes com 300 microlitros de PBST por poço. Agora, adicione 100 microlitros de PH recombinante de 50 nanomolares marcados com His a cada amostra. Nos poços de controle, adicione apenas 100 microlitros de PBS-BSA. Incube a placa por 1 hora em temperatura ambiente.
Após a incubação, descarte a solução proteica e remova as proteínas não ligadas lavando os poços três vezes com 300 microlitros de PBST por poço. Em seguida, adicione 100 microlitros de PBS-BSA, contendo anticorpos anti-His conjugados com peroxidase de rábano.
Após incubação por 1 hora em temperatura ambiente, lave os poços três vezes com 300 microlitros de PBST por poço. Detecte os complexos antígeno-anticorpo adicionando 100 microlitros de reagente de detecção ELISA a cada poço. Em seguida, adicione 50 microlitros de ácido sulfúrico 1 molar por poço para interromper a reação. Meça a densidade óptica dos poços em 450 nanômetros, usando um leitor de microplacas.