Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Alireza Lorzadeh; Rodrigo Lopez Gutierrez; Linda Jackson; Michelle Moksa; Martin Hirst

doi:10.3791/56085

Journal

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Genética

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Geração de imunoprecipitação da cromatina nativa sequenciamento de bibliotecas para análise da densidade nucleossoma

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

JoVE Journal
Genética

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JoVE Journal Genética

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Geração de imunoprecipitação da cromatina nativa sequenciamento de bibliotecas para análise da densidade nucleossoma

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10:05 min

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December 12, 2017

DOI:

10.3791/56085-v

DOI:

10.3791/56085-v

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10:05 min

December 12, 2017

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Alireza Lorzadeh¹, Rodrigo Lopez Gutierrez¹, Linda Jackson¹, Michelle Moksa¹, Martin Hirst^1,2

¹Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, ²Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Transcrição

Summary

Apresentamos uma imunoprecipitação da cromatina nativa modificada sequenciamento (ChIP-seq) metodologia para a geração de conjuntos de dados sequência apropriadas para um quadro analítico de nucleossoma densidade ChIP-seq integrando acessibilidade nuclease micrococcal (MNase) com medidas de modificação de histona.