Экологическая микробиология

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Почвы обычно содержат конечное количество воды, которое может быть выражено как «содержание влаги в почве». Эта влага существует в поровых пространствах между почвенными агрегатами (межагрегатное поровое пространство) и в почвенных агрегатах (внутриагрегатное поровое пространство) (Рисунок 1). Обычно это поровое пространство занято воздухом и/или водой. Если все поры заняты...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Луиза Икнер Асептическая техника – это фундаментальный навык, широко практикуемый в области микробиологии окружающей среды, который требует баланса осознанности и практики в лаборатории. Правильное использование этого метода снижает вероятность бактериального или грибкового загрязнения реагентов, питательных сред и образцов окружающей среды. Асептический метод также жизненно важен для...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Луиза Икнер Спектр исследований в области микробиологии окружающей среды широк по масштабу и практическому потенциалу. Независимо от того, ведется ли работа в лабораторном масштабе с известными бактериальными изолятами или в полевых условиях со сбором образцов почвы или воды, содержащих неизвестные бактериальные изоляты, способность быстро и визуально различать культивируемые популяции,...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Почва представляет собой тонкий слой на поверхности земли, содержащий биотические и абиотические факторы, способствующие жизни. Абиотическая часть включает в себя неорганические частицы разного размера и формы, которые определяют текстуру почвы. Биотическая часть включает в себя растительные остатки, корни, органические вещества и микроорганизмы. Изобилие и разнообразие...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Грибы являются гетеротрофными эукариотическими организмами, и, за исключением дрожжей, являются аэробными. Они в изобилии присутствуют в поверхностных почвах и играют важную роль в круговороте питательных веществ и разложении органического вещества и органических загрязнителей. Грибы белой гнили (phanerochaete chryosporium), например, (Рисунок 1) известны тем, что разлагают...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Луиза Икнер Традиционные методы анализа микробных сообществ в почвах обычно включают в себя либо посевные анализы с использованием методологии разбавления и нанесения покрытий на селективных и дифференциальных средах, либо прямые подсчетные анализы. Прямой подсчет дает информацию об общем количестве присутствующих бактерий, но не дает информации о количестве или разнообразии популяций,...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — это метод, используемый для обнаружения микроорганизмов, присутствующих в почве, воде и атмосферной среде. Амплифицируя определенные участки ДНК, ПЦР может облегчить обнаружение и идентификацию целевых микроорганизмов вплоть до видового, штаммового и сероварного/патогенного уровня. Этот метод также может быть использован для характеристики...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Гербы - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) включает в себя тот же процесс, что и обычная ПЦР — циклическую температуру для амплификации нуклеиновых кислот. Однако, в то время как обычная ПЦР амплифицирует только дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК), ОТ-ПЦР позволяет амплификацию рибонуклеиновых кислот (РНК) за счет образования комплементарной ДНК (кДНК).

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Количественная полимеразная цепная реакция (кПЦР), также известная как ПЦР в реальном времени, представляет собой широко используемый молекулярный метод для подсчета микроорганизмов в окружающей среде. До появления этого подхода количественная оценка микроорганизмов была в основном ограничена классическими методами, основанными на культурах. Тем не менее, культивирование...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Луиза Икнер Анализ качества воды отслеживает антропогенные воздействия, такие как загрязняющие вещества, питательные вещества, патогены и любые другие компоненты, которые могут повлиять на целостность воды как ресурса. Фекальное загрязнение способствует распространению микробных патогенов, которые угрожают здоровью растений, животных и человека болезнями или болезнями. Растущие...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Луиза Икнер Качество воды, предназначенной для использования в сельскохозяйственных, рекреационных и бытовых условиях, имеет большое значение из-за возможности вспышек заболеваний, передающихся через воду. К микробным агентам, участвующим в таких событиях, относятся паразиты, бактерии и вирусы, которые выделяются в больших количествах с фекалиями инфицированных людей и животных. Передача...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Алекс Вассими Вирусы представляют собой уникальную группу биологических организмов, которые заражают как эукариотические, так и прокариотические организмы. Это облигатные паразиты, которые не имеют метаболической способности, и для того, чтобы размножаться, полагаются на метаболизм хозяина для производства вирусных частей, которые самоорганизуются внутри клеток хозяина. Вирусы...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Демонстрирующие авторы: Брэдли Шмитц и Луиза Икнер Поверхностные почвы представляют собой неоднородную смесь неорганических и органических частиц, которые объединяются вместе, образуя вторичные агрегаты. Внутри и между агрегатами находятся пустоты или поры, которые визуально содержат как воздух, так и воду. Эти условия создают идеальную экосистему для бактерий, поэтому все почвы содержат огромные популяции...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Луиза Икнер Бактерии являются одними из самых распространенных форм жизни на Земле. Они встречаются в каждой экосистеме и жизненно важны для повседневной жизни. Например, бактерии влияют на то, что люди едят, пьют и дышат, и на самом деле в организме человека больше бактериальных клеток, чем клеток млекопитающих. Из-за важности бактерий предпочтительно изучать определенные виды бактерий в...

Источник: Лаборатории доктора Яна Пеппера и доктора Чарльза Герба - Университет Аризоны Автор демонстрации: Брэдли Шмитц Водоросли представляют собой весьма неоднородную группу микроорганизмов, которые имеют одну общую черту, а именно обладание фотосинтетическими пигментами. В окружающей среде водоросли могут вызывать проблемы у владельцев бассейнов, произрастая в воде. Водоросли также могут вызывать проблемы в поверхностных водах, таких как озера и водохранилища, из-за цветения водорослей,...