تدرس أخذ عينات لعاب للتطبيق السريرية في المستقبل، ملفقة مصاصة مثل الترشيح الفائق (LLUF) مسبار لتناسب في تجويف الفم والإنسان. أظهر تحليل لعاب مباشر من عسر الهضم بواسطة الطيف الكتلي NanoLC-LTQ قدرة تحقيقات LLUF لإزالة البروتينات الكبيرة والبروتينات وفرة عالية، وجعل المنخفضة وفيرة الببتيدات أكثر للكشف.
على الرغم من أن الإنسان قد كشفت بروتيوم اللعاب وpeptidome 1-2 حددت مجورلي هم من تريبسيني يساعد على هضم البروتينات لعاب. تحديد peptidome السكان الأصليين من لعاب الإنسان دون هضم مسبق مع الانزيمات الخارجية يصبح من الضروري، منذ الببتيد الأصلي في لعاب الإنسان توفير قيم المحتملة لتشخيص المرض، وتوقع تطور المرض، ومراقبة فعالية العلاج. الملائمة لأخذ العينات هو خطوة حاسمة لتعزيز التعرف على الإنسان peptidome لعاب السكان الأصليين. قد الأساليب التقليدية لأخذ عينات من لعاب الإنسان التي تنطوي على الطرد المركزي لإزالة الحطام 3-4 يكون أيضا وقتا طويلا لتكون قابلة للتطبيق للاستخدام السريري. وعلاوة على ذلك، قد إزالة الأنقاض عن طريق الطرد المركزي غير قادر على تنظيف معظم مسببات الأمراض المصابة وإزالة البروتينات وفرة العالية التي غالبا ما تعيق تحديد peptidome وفرة منخفضة.
البروتين الأساليب التقليدية أن الحزب الثوري المؤسسيالاستفادة من marily الكهربائي للهلام ثنائي الأبعاد (2-DE) المواد الهلامية في اقتران مع جل في الهضم قادرة على تحديد البروتينات لعاب كثير 5-6. ومع ذلك، فإن هذا النهج عموما ليست حساسة بما فيه الكفاية للكشف عن الببتيدات وفرة منخفضة / البروتينات. السائلة اللوني قياس الطيف الكتلي (LC-MS) البروتيوميات القائم هو البديل الذي يمكن التعرف على البروتينات من دون فصل 2-DE قبل. على الرغم من أن هذا النهج يوفر أعلى حساسية، فإنه يحتاج عموما نموذج مسبق قبل التجزئة (7) وقبل الهضم مع التربسين، مما يجعل من الصعب للاستخدام السريري.
للالتفاف على عائق في مطياف الكتلة بسبب إعداد عينة، قمنا بتطوير تقنية تسمى الترشيح الفائق الشعرية (الجبهة المدنية المتحدة) 8-11 تحقيقات. أظهرت بيانات من مختبرنا أن تحقيقات حزب الجبهة المدنية المتحدة قادرة على التقاط البروتينات في الجسم الحي من مختلف microenvironments في الحيوانات بطريقة ديناميكية ومينيملي 8 –11. ليس هناك حاجة إلى الطرد المركزي منذ يتم إنشاء ضغط سلبي بواسطة حقنة ببساطة سحب أثناء جمع العينات. وقد حددت تحقيقات حزب الجبهة المدنية المتحدة جنبا إلى جنب مع LC-MS بنجاح البروتينات تريبسيني-هضمها 8-11. في هذه الدراسة، ورفع مستواها ونحن على تقنية الترشيح الفائق أخذ العينات عن طريق إنشاء مصاصة مثل الترشيح الفائق (LLUF) التحقيق التي يمكن أن تناسب بسهولة في التجويف الفموي الإنسان. وأظهر تحليل مباشر من قبل LC-MS بدون الهضم التربسين أن لعاب الإنسان محليا تحتوي على العديد من شظايا الببتيد المستمدة من البروتينات المختلفة. أخذ عينات لعاب مع تحقيقات LLUF تجنب الطرد المركزي ولكن على نحو فعال إزالة العديد من البروتينات وفرة كبيرة وعالية. نتائجنا الطيفي الشامل يتضح أن العديد من الببتيدات وفرة منخفضة أصبح اكتشافها بعد تصفية أكبر من البروتينات مع تحقيقات LLUF. وكان الكشف عن انخفاض الببتيد اللعاب وفرة من فصل مستقل عينة متعددة الخطوة مع اللوني. لتطبيق السريرية، وتحقيقات LLUF إدماجيحتمل د مع LC-MS تستخدم في المستقبل لمراقبة تطور المرض من اللعاب.
لقد وجدنا أن وجود العديد من شظايا الببتيد في لعاب الإنسان عسر الهضم. هذه الشظايا الببتيد هي مشتقات من أشكال مختلفة من البرولين الغنية والبروتينات، والأكتين، ألفا الأميليز، ألفا غلوبين 1، بيتا غلوبين، histain 1، الكيراتين 1، الميوسين 7، البوليمرية مستقبلات المناعي، satherin?…
The authors have nothing to disclose.
وأيد هذا العمل من قبل المعاهد الوطنية للصحة منح (R01-AI067395-01، R21-R022754-01، و R21-01-I58002). نشكر جيم نيماير لقراءة نقدية للمخطوطة.
Name of the reagent | Company | Catalog number | Comments |
Polyethersulfone membranes | Pall Corporation | 30 kDa MWCO | |
Teflon fluorinated ethylene propylene tube | Upchurch Scientific | ||
Blue dextran | Sigma | ||
Nano LC system | Eksigent | ||
C18 trap column | Agilent | 5065-9913 | |
LTQ linear ion-trap mass spectrometer | Thermo Fisher | ||
Sorcerer 2 | Sage-N Research | ||
Acetonitrile-0.1% formic acid | J.T. Baker | 9832-03 | LC/MS grade |
Water-0.1% formic acid | J.T. Baker | 9834-03 | LC/MS grade |