Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
JoVE Journal Chemistry
Click here for the English version

Chemistry

עצמי הרכבה של צורות דו-ממדיות מורכבות מחד-גדילי דנ"א אריחים

Published: May 8, 2015 doi: 10.3791/52486
Automatic Translation
1, 2, 2, 2,3
1Tsinghua-Peking Center for Life Sciences, School of Life Sciences, Tsinghua University, 2Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering, Harvard University, 3Department of Systems Biology, Harvard Medical School

Introduction

עבודת הרכבה עצמית קודמת חומצות גרעין 1-25 הובילה לבנייה המוצלחת של מגוון רחב של מבנים מורכבים, לרבות DNA 2 - 5,8,10 - 13,17,23 או RNA 7,22 3,4,7 תקופתי, 22 ו -5 דו ממדים אלגוריתמיים חסימה, סרטים 10,12 וצינורות 4,12,13, גבישי 3D 17, פאונים 11 וסופיים, 2D מעצב 7,8. שיטה יעילה במיוחד היא מלווה בתמיכת אוריגמי DNA, לפיה גדיל פיגום אחת מקופל על ידי רב גדילי מצרך עזר קצרים ליצירת צורה מורכבת 9,14 - 16,18 - 21,25.

לאחרונה דיווחו שיטה לבניית ננו הדיסקרטי עם צורות 2D נקבעו באמצעות אריחים חד-גדילים (SST), והפגינו מבנים עם מורכבות דומה לאוריגמי DNA 26. articl זהדואר הוא עיבוד של העבודה הקודמת שלנו 26 ומתאר מפורט פרוטוקולים להסדרת טמפרטורת פני הים מיעון בנפרד לצורות 2D סופיות מתוחכמות עם ממדים שנקבעו בדיוק (רוחב ואורך) ומורפולוגיות. יתרון מרכזי אחד של שיטת SST הוא המודולריות שלה. כל SST המרכיב של מבנה משמש כיחידת בנייה מודולרית בהרכבה, וקבוצות משנה שונות של טמפרטורת פני הים אלה לייצר צורות שונות. כך, הקמנו פלטפורמה כללית לבניית ננו עם גדלים וצורות שנקבעו מגדילי דנ"א קצרים, סינטטיים.

טמפרטורת פני הים מכילים ארבעה תחומים, כל אחת (איור 1 א) באורך 10 או 11 נוקלאוטידים. טמפרטורת פני הים להיקשר כך שהסלילים המקבילים שלהם ליצור סריג DNA מוחזק ביחד על ידי קשרים מוצלבים. כל מוצלב הוא פוספט בין תחומים 2 ו -3 פוספט נמתח באופן מלאכותי בתרשימים לבהירות חזותית. הצלבות מרווחים שני סיבובי סליל (21 בסיסים) מזה (<1B strong> איור). המלבנים מרוכבים מכונים על ידי ממדיהם במספר הסלילים וסיבובי סליל. לדוגמא, מלבן שרוחבו שישה סלילים ושמונה סליל הופך ארוך הפניה כ6H × מלבן 8T. ניתן להשאיר את טמפרטורת פני ים החוצה, הוסיפו, או מחדש בדרך אחרת כדי ליצור מבנים של צורות וגדלים (איור 1 ג) שרירותיות. לדוגמא, עיצוב מלבני ניתן התגלגל לתוך צינור באורך רצוי ורדיוס (1D איור).

לחלופין, סריג SST המלבני ניתן לראות כבד מולקולרי המורכב מפיקסלים SST, כל ננומטר 3 על ידי 7 ננומטר. במחקר זה, אנו משתמשים בבד מולקולרי של 310 טמפרטורת פני הים פנימית באורך מלא, 24 טמפרטורת פני הים באורך מלא המרכיבות את גבולות ימין ועל השמאל, וטמפרטורת פני ים 28 חצי אורך להרכיב את הגבולות העליונים ותחתונים. יש הבד 24 סלילים כפולים מקושרים על ידי הצלבות וכל סליל מכיל 28 סיבובי סליל (294 בסיסים), ולכן הוא מכונה24H × בד מלבני 28T. 24H × בד 28T יש משקל מולקולרי דומה לזה של מבנה אוריגמי DNA שנוצר מפיגום הפאג M13.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. ה- DNA רצף עיצוב

  1. השתמש בתוכנת UNIQUIMER 27 לתכנן מבנה SST-סופי על ידי ציון מספר הסלילים כפולים, האורכים של סליל העליון ותחתון לכל סליל כפול, ואת התבנית המוצלב ליצור 24H × בד 28T. לאחר הגדרת פרמטרים אלה, הארכיטקטורה הכוללת (הרכב גדיל וההסדר המשלים) מודגמת בצורה גרפית בתכנית.
  2. צור רצפים לגדילים של המבנה שצוין לפגוש ההסדר המשלים ודרישות נוספות (אם בכלל). עיצוב רצפי DNA על ידי מזעור הסימטריה רצף 28 (עבור רוב המבנים).
    1. צור נוקלאוטידים (A, C, G ו- T) באופן אקראי האחד אחד.
    2. נוקלאוטידים התאמה משלימים לאלו שנוצרו בעקבות שלטון בסיס שיוך: לT ולהיפך; C לG ולהיפך.
    3. אל תשתמשו במגזרים חוזרים מעבר לשמונה או תשעה נוקלאוטידים. כאשר נציג כזהאכילת פלחים לצוץ במהלך עיצוב, להשתנות נוקלאוטידים נוצרו לאחרונה עד הדרישה לחזור המגזר זה הנה מרוצה.
    4. אל תשתמשו בארבעה בסיסים, C, G או T ברציפות.
    5. השתמשו נוקלאוטידים מראש שצוין בנקודות ההצמדה חד-גדילים (למשל T ו- G כמו נוקלאוטידים העשרים ואחת ועשרים ושניים, בהתאמה, עבור רוב הגדילים), כדי למנוע החלקת בסיסים סביב נקודות ההצמדה (למשל, אם שני נוקלאוטידים העשרים ואחת ועשרים ושתיים היו T, זה היה אפשרי עבור נוקלאוטיד עשרים ואחת להיקשר לנוקלאוטיד שנוקלאוטיד בעשרים ושתיים אמור להיקשר ל).
  3. לשנות רצפי DNA באופן ידני לתיוג streptavidin, את הפיכתו של מלבנים לתוך צינורות, ההיווצרות של מלבנים וצינורות על פני קני מידה שונות שונים, וכדי למנוע צבירה נגרמת על ידי תחומים נחשפו בSST.
    1. החלף את התחומים נחשפו על הגבול של הבד המולקולרי עם tra פולי-TCTS.
    2. לתיוג streptavidin, לעצב את מגזרי ידית (קטע הנוסף יצורף לגדיל הרכיב שיכול להיקשר לעמית משלים כגון גדיל אנטי-ידית) כך שהם יכולים להכיל גדיל אנטי-ידית עם 3 שינוי ביוטין '.
    3. להמרה של מלבן לתוך צינור, להסיר את השורות העליונה ותחתונים מהמלבן ולהכניס שורה חדשה טמפרטורת פני הים שיש לי השלמה ספציפית לאריחים המתאימים בשני לשורה העליונה והשני לשורה תחתונה.
    4. לתחום גדילים חשוף של צורות שונות, להחליף עם מגזרי פולי-T של אורך נוקלאוטידים 10-11, או לכסות על ידי מגיני קצה, כי הם משלימים לתחום החשוף ולסיים עם מגזרי פולי-T 10-11 נוקליאוטידים ארוכים.

2. הכנת הבד המולקולרי

  1. להשיג גדילי DNA רכיב של רצפים צוינו מומסים במי RNase ללא מoligonucleotiיצרן דה ב 96 צלחות גם תחתונה V עם oligonucleotides מסונתז בקנה מידת 10 ננומול עם desalting הסטנדרטי. צנטריפוגה 96 הצלחות גם עם גדילי דנ"א לבערך 10 שניות ב 600 x גרם.
    1. פיפטה 1 μl מכל אחת מהבארות 362 עם גדילי דנ"א ל24H × מלבן 28T (איור 3 א) בשעה לכל גדיל 100 מיקרומטר (מפרט יצרן) למבחנת 2 מיליליטר. להוסיף 138 μl של H deionized מזוקק 2 O לצינור 2 מיליליטר המבחן כדי להפוך את פתרון מניות של תערובת הגדיל בריכוז של 200 ננומטר לכל גדיל.
  2. הוסף 50 μl של פתרון 200 מניות ננומטר של תערובת גדיל, 10 μl של חיץ 10X חישול (50 מ"מ טריס, pH 7.9, 10 מ"מ EDTA, 250 מ"מ MgCl 2), ו -40 μl של H deionized מזוקק 2 O 0.2 צינור מיליליטר PCR. זה עושה את מדגם 100 μl של הבד המולקולרי במאגר חישול 1X (5 מ"מ טריס, pH 7.9, 1 mM EDTA, 25 מ"מ MgCl 2).
  3. לחשל samplדואר במשך 17 שעות בCycler תרמית קירור מ -90 מעלות צלזיוס עד 25 מעלות צלזיוס. תכנית Cycler התרמית כדלקמן: רמפה למטה מ -90 ° C עד 61 ° C במהירות קבועה של 5 דקות לכל מעלות צלזיוס; רמפה למטה מ 60 מעלות צלזיוס עד 25 מעלות צלזיוס במהירות קבועה של 20 דקות לכל מעלות צלזיוס; דגירה על 4 מעלות צלזיוס עד המדגם ניתן לקחת מCycler התרמית.
  4. הכן 2% agarose ג'ל ילידים.
    1. למדוד 2.4 גרם של agarose לתוך כוס 600 מיליליטר. להוסיף 120 מיליליטר של חיץ 0.5x TBE (44.5 מ"מ טריס-Borate, pH 8.3, 1 mM EDTA) ו -30 מיליליטר מים מזוקקים deionized לכוס.
    2. מיקרוגל במשך 3 דקות (או 40 - 60 שניות יותר לאחר הרתיחה). לחדש את המים איבדו במהלך אידוי על ידי תוספת של 30 מיליליטר של מים, מה שעוזר לשמור על הריכוז של agarose בג'ל על 2%.
    3. מערבולת את התוכן של כוס דקות 1 באמבט מים קר. הוסף 1 מיליליטר של 1.2 מ 'MgCl 2 (לעשות 2 ריכוז 10 מ"מ MgCl בג'ל) וטרום-להכתים את שנינות ג'ל6 μl שעות של צבע SYBR הבטוח (1: 20,000).
    4. יוצקים את פתרון ג'ל לתיבת ג'ל יבש ולהכניס 1.5 מ"מ מסרק ג'ל אלקטרופורזה גם 12 עבה. תן הפתרון לחזק במשך 15 - 30 דקות על אף פלטפורמה.
    5. יוצקים חיץ ריצת ג'ל (44.5 מ"מ טריס-Borate, pH 8.3, 1 mM EDTA, ו -10 מ"מ MgCl 2) בתיבת ג'ל. טען 2-3 μl של סולם ה- DNA 1 KB לתוך באר של agarose ג'ל. לערבב 4 μl של צבע 6X bromophenol הכחול (0.25% bromophenol הכחול, 5 מ"מ טריס, 1 mM EDTA, 10 מ"מ MgCl גליצרול 2 ו -30%) עם 20 μl של המדגם של הבד המולקולרי ולטעון את הפתרון לטוב נוספת של agarose ג'ל.
  5. הפעל את agarose 2% הילידים לשעה 2 ב 100 V באמבט מים קרח (bromophenol הכחול, מוצגת בכחול, פועל מהר יותר מגדילי רכיב כך שהוא יכול לשמש כאינדיקציה שאם זמן ריצת 2 שעות מתאים).
  6. תמונת ג'ל באמצעות סורק ג'ל עם מסנן מתאים לכתם הבטוח SYBR (איור 2
  7. על transilluminator אור כחול, בלו הלהקה הדומיננטית עם ניידות דומה ללהקה של 1,500 זוגות בסיסים של סולם ה- DNA 1 KB באמצעות סכין גילוח נקי חד. מניחים את החתיכה הרצויה ג'ל (ים) בטור ספין ואז לרסק את הג'ל לחתיכות דקות באמצעות העלי microtube. צנטריפוגה ב 438 XG במשך 3 דקות ב 4 מעלות צלזיוס.
  8. למדוד את הריכוז של ה- DNA באמצעות ספקטרופוטומטר אולטרה הסגול ב 260 ננומטר.
    1. השתמש 2 μl של DNase ultrapure מים / RNase ללא מזוקקים כריק כדי לכייל את המכשיר.
    2. השתמש היקף שווה ערך של המדגם שנאסף מעמודת הספין כדי לקבל אומדן של ריכוז ה- DNA. הערך שנמדד הריכוז ("" = ng / μl) שהושג בקליטת UV של 260 ננומטר יסייע לקבוע את הגורם לדילול ולAFM הדמיה TEM.
    3. להמיר את הריכוז שנמדד מ( ng / μl) "" ל "B" ב הבא (ננומטר) = 10 × 6 / (330 &215 #; מספר נוקלאוטידים).
      הערה: המשקל המולקולרי של נוקלאוטיד הוא 330 g / mol. ערך הריכוז טוחנת מחושב יקבע את הגורם לדילול הדמיה AFM וTEM. באשר למקרה של 24H × מלבן 28T, המדידה המשותפת למדגם המטוהר היא סביב 10-60 ng / μl. ככל שמספר נוקלאוטידים למבנה כזה הוא 14616 דא, הריכוז טוחנת הוא כ 2-12 ננומטר. הריכוז הסופי נקבע על ידי תשואת האוסף (~ 20 - 50%) מצנטריפוגה והנפח של להקת ג'ל נכרת החוצה (הגבוה הנפח, יותר לדלל את המדגם המטוהר).

הדמיה 3. מיקרוסקופית כוח אטומי

  1. לקלף נציץ מצורף לדיסק מתכתי דגימה באמצעות סרט דביק כדי לקבל משטח שטוח והכנס את דיסק הדגימה על הבמה ההדמיה.
  2. הוסף 40 μl של חיץ חישול 1X ואחרי 5 μl (2-5 ננומטר) של המדגם המטוהר של 24H × 28Tמלבן אל פני השטח נציץ טרי ביקע. אפשר התערובת להסתפק בכ 2 דקות.
  3. התקן שבב סיליקון ניטריד שלוחה AFM על בעל שלוחה. השתמש קצה C משולש (תדר תהודה, F 0 = 40-75 קילוהרץ; אביב קבוע, K = 0.24 Nm -1) להדמיה.
  4. תמונה לדוגמא במצב הקשה-הנוזל. השתמש בפרמטרים הבאים ההדמיה לסריקה: סריקת גודל של 2 מיקרומטר, 1024 קווים לפתרון, וקצב סריקה של 0.5-1 הרץ (איור 2 ג).
  5. במידת צורך, להוסיף 10 μl או יותר של 10 מ"מ פתרון NiCl 2 להגדיל את כוחו של ה- DNA נציץ מחייבים 29.

לדוגמא הכנה 4. לתיוג streptavidin

  1. ידני לעצב 24H × מלבן 28T כך שגדילי ידית במקומות מסוימים משולבים להיות משלימים לגדילים אנטי-ידית עם שינוי ביוטין, אשר בתורו יכולים להיקשר לstreptavidבאופן ספציפי.
    1. לשנות את הבד המולקולרי על ידי הצמדת קטע 3 '17-נוקלאוטיד שמורכבת מרצף של שני נוקליאוטידים (TT) כspacer וידית 15 נוקליאוטידים (GGAAGGGATGGAGGA) לאריחים 14 בשורה העליונה ו -14 אריחים בתחתית שורה של המלבן (איור 3 א) לתייג את הגבול. רצף זה הוא משלים לגדיל ביוטין '3 שונה נגד ידית (TCCTCCATCCCTTCC ביוטין).
  2. לתיוג פנימי, לצרף את קטע 3 17 נוקליאוטידים '8 אריחים פנימיים ו -6 אריחי גבול של המלבן (איור 4 א).
    1. מערבבים את הגדילים 28 עם ידיות (תיוג גבול) עם שאר גדילי הרכיב של 24H × מלבן 28T (334 גדילים) כדי להפוך את פתרון מניות ננומטר 200. מערבבים את הגדילים 14 עם ידיות (תיוג פנימי) עם שאר גדילי הרכיב של 24H × מלבן 28T (348 גדילים) כדי להשיג פתרון מניות ננומטר 200.
  3. לboתיוג undary, להוסיף 50 μl של פתרון מניות ננומטר 200 של הגדילים, 6 μl של 100 מיקרומטר הגדילים אנטי-ידית ביוטין שונה, 10 μl של חיץ חישול 10X, ו -34 μl מים ללא יונים מזוקקים ל0.1-0.2 מבחנת מיליליטר PCR. הריכוז הסופי של גדיל הרכיב הוא 100 ננומטר והריכוז הסופי של הגדיל שונה ביוטין אנטי-הידית הוא 6,000 ננומטר. שים לב כי 28 מולקולות של אנטי-לטפל לאגד גדיל ביוטין שונה כדי 24H × מלבן 28T כך הגדיל שונה ביוטין לטפל אנטי-הוא בעודף של 100% על מנת להפוך את מחייב חיובי.
  4. לתיוג פנימי, להוסיף 50 μl של פתרון מניות ננומטר 200 של הגדילים, 3 μl של הגדיל הפנימי אנטי לטפל ביוטין שונה ב 100 מיקרומטר, 10 μl של חיץ חישול 10X, 37 μl מים ללא יונים מזוקקים ל0.1 - 0.2 מיליליטר מבחנת PCR. הריכוז הסופי של גדיל הרכיב הוא 100 ננומטר והריכוז הסופי של modifi ביוטין אנטי-הידית אד גדיל הוא 3,000 ננומטר. שים לב כי 14 מולקולות של לאגד גדיל ביוטין אנטי-ידית שונה ל24H × גדיל ביוטין כל כך אנטי-28T להתמודד מלבן שונה היא בעודף של 100% על מנת להפוך את מחייב חיובי.
  5. לחשל שני הדגימות בCycler תרמית במשך 17 שעות באמצעות השלבים מתוארים ב2.3.
  6. הכן 2% agarose ג'ל ילידים כמתואר בצעדים 2.4.
  7. לטהר שתי הדגימות כפי שמתואר בצעדים 2.5.
  8. מדוד את הריכוז של מבני DNA הרצויים כמתואר בצעדים 2.6.

5. במיקרוסקופ כוח אטומי לתיוג streptavidin

  1. תמונה כל דגימה באמצעות AFM כמתואר בשלב 3 (3B דמויות ו4B).
  2. לאחר הסיבוב הראשון של הדמיה, להוסיף 40 μl של חיץ חישול 1X אחרי 1 μl של streptavidin ב 10 מ"ג / מיליליטר למדגם. אפשר התערובת להסתפק בכ 2 דקות לפני reimaging (3C דמויות ו4C).
_כותרת "> 6. המרת מלבן לתוך צינור

  1. כדי לעצב צינור מבוסס על המלבן, לשמור את כל הטמפרטורות פני הרכיב במקום מלבד השורות העליונה ותחתונים. להציג את השורה חדשה שטמפרטורת פני ים מתוכננים על ידי שרשור חצי אריחים העליונים ותחתונים של הטורים שלהם לcyclize המלבן המקורי לקונפורמציה צינור (איור 5 א ').
  2. מערבבים את השורה החדשה של גדילים (14 גדילים) עם גדילי הרכיב של 24H × מלבן 28T לא כולל שורות העליונים ותחתונים (336 גדילים) כדי להשיג פתרון מניות ננומטר 200.
  3. בצע את טיהור ג'ל צעדים 2.2-2.7 (איור 5).

7. הילוכים אלקטרונים מיקרוסקופים הדמיה

  1. שוקל 0.06 גרם של formate uranyl ב 3 מיליליטר של מים מזוקקים להכין פתרון כתם formate uranyl המימי 2%. סנן את פתרון כתם formate uranyl המימי 2% באמצעות 0.2 מיקרומטר מסנן מצורף מזרק.
    1. הוסף 5 μl של5 N NaOH למ"ל 1 של פתרון כתם מסונן. בקצרה מערבולת הפתרון צנטריפוגות ב 20,000 x ז.
  2. זוהר לפרוק את הרשתות מצופים פחמן (צד מצופה כלפי מעלה) עם ההגדרות הבאות: 25 מילי-אמפר, 45 של, 0.1 mbar, וקוטביות מתח גבוה שלילית.
  3. שימוש במלקחיים סגירה עצמית כדי לתפוס את רשת טופלה פורק לזוהר מהקצה.
  4. פיפטה 3.5 μl של מדגם על הרשת למשך 4 דקות. השתמש פיסת נייר סינון לפתיל את המדגם על ידי הבאת נייר הסינון במגע עם הרשת מהצד.
  5. מייד להוסיף 3.5 μl של פתרון הכתם על הרשת 1 דקות.
  6. פתיל את הכתם כמו ב7.4 ולהחזיק את נייר הסינון נגד הרשת 1 - 2 דקות.
  7. העבר את הרשת לבעל דגימת TEM ותמונה באמצעות JEM-1400 JEOL מופעלים ב 80 kV עם הגדלה נעה בין 10 K 80 K (איור 5 ג).

8. בניית צורות שרירותיות שימוש Molecular בד

  1. לזהות צורה ובחר את הגדילים שמתאימים לצורה על הבד המולקולרי. לצורה משולש לדוגמא, בחר 206 מתוך 362 גדילים לבד המולקולרי.
  2. החלף את תחום החשוף (כלומר, לאורך האלכסון של המשולש) עם קטע פולי-T 10-11 נוקלאוטידים ארוך (עיצוב 1 באיור 6 א), או להוסיף מגן קצה שהוא משלים לתחום החשוף ולסיים אותו עם 10 - קטע 11 נוקליאוטידים פולי-T הארוך (עיצוב 2 באיור 6 א) כדי למנוע צבירה.
    הערה: כל שעליך לעשות צריפת טמפרטורת פני הים שמתאימה לפיקסלים של המשולש (ללא שימוש בחוטי מגן) תוביל לצבירה ולא היווצרות להקת המוצר ייחודית על ג'ל. השתמש בעיצוב מגן קצה לצורות שונות כפי שהוא יעיל יותר במשאבים; זה דורש רק ארבע קבוצות נוספות של גדילים (איור 6 ג) בהשוואה ל -14 קבוצות נוספות בעיצוב החלפה (Figurדואר 6B).
  3. יצירת ספריית גדיל לבד המולקולרי 310 פיקסלים הכולל סט הליבה (בד 362 SST), 1 * סט (מגיני קצה אשר נקלטים על תחום 1 של SST), סט 2 * (מגיני קצה אשר נקלטים על תחום 2 של SST), הגדר 3 * (מגיני קצה אשר נקלטים על תחום 3 של SST), וקבעת 4 * (מגיני קצה אשר נקלטים על תחום של 4 SST) לתת כולל של 1,344 מגיני קצה.
  4. צנטריפוגה הצלחות גם 96 לקבוצות השונות לבערך 10 שניות. Pipet את הגדילים הרצויים מהצלחות על מנת להפוך את פתרון מניות לצורה מסוימת.
    1. לצורה משולש עם מגיני קצה, פיפטה 1 μl של 206 גדילים מקבוצת הליבה, 0 מ * 1 סט, 0 מסט * 2, 0 מסט 3 * 24 וגדילים מקבוצה 4 * לצנטריפוגות 2 מיליליטר צינור. הוסף 20 μl מים ללא יונים מזוקקים לצינור כדי להפוך את פתרון מניות ננומטר 400 של גדילי דנ"א.
  5. הוסף 50 μl של פתרון 400 מניות ננומטר של stra DNA NDS, 10 μl של חיץ חישול B 10X (50 מ"מ טריס, pH 7.9, 10 מ"מ EDTA, 125 מ"מ MgCl 2) פתרון מניות ו -40 μl H deionized מזוקק 2 O לצינור PCR 0.2 מיליליטר. זה עושה את מדגם 100 μl של המשולש במאגר חישול B 1X (5 מ"מ טריס, pH 7.9, 1 mM EDTA, 12.5 מ"מ MgCl 2) עם גדילים בריכוז של כ -200 ננומטר לכל גדיל.
  6. לחשל את התערובת בCycler תרמית במשך 17 שעות כמתואר בשלב 2.3.
  7. הכן 2% agarose ג'ל ילידים כמתואר בשלב 2.4.
  8. לטהר את המדגם כמתואר בשלב 2.5.
  9. למדוד את הריכוז של ה- DNA כמתואר בשלב 2.6.
  10. תמונת המדגם תחת AFM כמתואר בשלב 3 (איור 7C ו7D).
  11. פיק ולערבב גדילים לצורות שונות תוך שימוש באותה ספריית גדיל. לחשל את הפתרונות השונים ולשלב דגימות מטוהרת של צורות שונות כדי לחסוך זמן במהלך ההדמיה AFM.
jove_title "> 9 אופציונאלי:. אוטומציה רובוט של עיצוב צורה וערבוב נוזלים

  1. השתמש בתכנית MATLAB המותאם אישית כדי לסייע לעיצוב של צורות מורכבות.
  2. להשתמש בתוכנה כדי לספק הוראות בצורה של רצף pipetting למטפל נוזלי רובוט. השתמש במטפל הנוזלי הרובוט כדי לבחור ולערבב את הגדילים המהווים את צורת היעד.
    הערה: ערבוב עיצוב צורה וגדיל היה אוטומטי כדי לצמצם טעויות אנוש ולהפוך את הבנייה פחות עבודה אינטנסיבית.

10. מלבנים וצינורות מעבר סולמות שונים

  1. לבנות מלבנים בגדלים שונים (איור 10), פשוט על ידי שינוי מספר הסלילים מקבילים (H) ומספר סיבובי סליל (T).
  2. בצע שלב 3 למלבן בגודל מסוים.
  3. בצע שלב 6 לצינור גודל מסוים.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

ההרכבה העצמית של טמפרטורת פני הים (איור 1) תניב 24H × מלבן 28T, כפי שמודגם באיור 2. רצפי DNA לטמפרטורת פני הים השונים יכולים להיות שונה / מותאם כדי לאפשר תיוג streptavidin (איור 3 ו -4), את הפיכתו של מלבן לתוך צינור (איור 5), הרכבה העצמית הניתנת לתכנות של טמפרטורת פני הים כדי ליצור צינורות ומלבנים בגדלים שונים (איור 10), והבנייה של צורות שרירותיות 2D באמצעות הבד המולקולרי (איור 8). שני עיצובים (עיצוב תחלופה תחום ועיצוב מגן קצה) נבדקו כפתרונות להצטברות לאורך תחומים חשופים של צורות שרירותיות (איור 7). לשניהם יש עיצובי תשואת ג'ל דומה ושלמות מבנית, אך עיצוב מגן הקצה הוא יותר חסכוני מאז שהיא דורשת פחות מיני עזר (איור 6).קטיף גדיל וערבוב יכולים להיות אוטומטי, כפי שמוצגים איורים 9 להפחית טעויות אנוש ולחסוך זמן.

איור 1
איור 1. עצמי הרכבה של צורות מולקולריות באמצעות אריחים חד-גדילים. מוטיב SST הקנונית, מותאם מ -12 (א) (ב) שמאל ואמצע:. שני תיאורים של טמפרטורת פני הים התאסף. יש לי טמפרטורת פני הים פנימי באורך מלא של 42 בסיסים ומסומנים "U" בזמן שיש לי טמפרטורות פני גבול 21 בסיסים ומסומנים "L". בתרשים משמאל, צבעים להבחין תחומים שונים. בתרשים האמצע, צבעים להבחין גדילים שונים. מימין: סכמטי של הקיר הלבנים נוף מבני SST. לבנים עבים הם טמפרטורת פני הים מלאה ודקים לבנים הם טמפרטורת פני הים גבול. קצוות מעוגלים מצביעים לא זיווג משלים. כמו בדמות האמצע, צבעים להבחין אריחים בודדים. בכל תרשיםאילים, יש כל אריח רצף ייחודי. (ג) מניעת בחירה מתאימה של גדילים מאוסף SST המרכיבים את עיצוב המלבן בתוצאות דמות ב ביצירת צורה רצויה שונה כגון משולש (משמאל) או טבעת מלבנית (מימין). (ד) העיצוב של צינור עם רוחב ואורך שנקבע מראש. (E) בהתחשב בריכה-מסונתז מראש של רצפי SST (למעלה), צורות שרירותיות (למטה) יכול להיות מתוכנן על ידי בחירת קבוצת משנה של גדילים ל להשתמש בתערובת הגדיל (פיקסלים כחולים כהים) ומבטלים את כל השאר (פיקסלים בצבע תכלת). נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 2
עיצוב ותמונת AFM של 24H × 28T המלבן. ציור סכמטי של 24H × מלבן 28T (). תצוגה מוגדלת-במוצגת גם למבנה המקומי מפורט. הסדר קטע SST הפרט הוא גם 10 NT - 11 NT - 11 NT - 10 NT (למשל, a2.13-b2.13-a1.13 * -b1.12 *) או 11 NT - 10 nt- 10 NT - 11 NT (למשל, a3.12-b3.12-a2.13 * -b2.12 *). משולשים בצד השמאלי של המלבן מצביעים שורות בהסדר SST 10nt-11nt-11nt-10nt; טמפרטורת פני הים הפנימי האחרות יש 11 NT - 10 NT -10 nt- 11 NT במקום (NT הוא ראשי תיבות של נוקלאוטיד). מאז 24H × מלבן SST 28T יש ממדים דומים למבנה ה- DNA אוריגמי, הקריטריון הציג בעבודת אוריגמי DNA ולשקול SST המלבן "בנוי היטב" אם אין לו פגם במתווה הצפויה יותר מ -15 ננומטר בקוטר היה אימץ. בנוסף, "בנוי היטב" חה מבנה מלבןשום חורים בפנים שלה גדול יותר מ -10 ננומטר בקוטר נדרשו. בעקבות הקריטריונים לעיל, יחס "גם היווצרות" של 55% (N = 163) הושג. כוכבית אדומה (*) מציינת את הפינה השמאלית התחתונה של המלבן כאן. 2% אלקטרופורזה agarose ילידים (ב) ג'ל. U, קנה בלתי; P, מטוהר (על ידי מיצוי ג'ל מנתיב U) (ג) AFM תמונה של מבנה הסריג. (גודל סריקה: 2 × 2 מיקרומטר מיקרומטר). נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 3
איור 3. גבול תיוג של 24H × 28T המלבן. (א) ציור סכמטי של דו הספציפייםotin כותרת 24H × מלבן 28T. הגדילים מודגשים בכחול הם גדילי הידית. הגדילים מסומנים באדום הם הגדילים אנטי-ידית שכותרתו עם ביוטין '3 (נקודות שחורות). Streptavidin מתואר ככדור כתום תמונת AFM (ב ') לפני הוספה (גודל סריקה: 1 מיקרומטר × 1 מיקרומטר) streptavidin.. (ג) AFM תמונה לאחר הוספת streptavidin (גודל סריקה: 1 מיקרומטר מיקרומטר × 1). הבלעה, נוף המוגדל-במראה תיוג מוצלח. הערה streptavidin שהופיע כשתי נקודות או פסים לבנים בשל גבהים העלו. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 4
איור 4. ב שלהן פנימי תיוג של 24H × 28T המלבן. ציור סכמטי של 24H ביוטין הספציפי שכותרתו × מלבן 28T (). הגדילים מודגשים בכחול הם גדילי הידית. הגדילים מסומנים באדום הם הגדילים אנטי-ידית שכותרתו עם ביוטין '3 (נקודות שחורות). Streptavidin מתואר ככדור כתום תמונת AFM (ב ') לפני הוספה (גודל סריקה: 1 מיקרומטר × 1 מיקרומטר) streptavidin.. (ג) AFM תמונה לאחר הוספת streptavidin (גודל סריקה: 1 מיקרומטר מיקרומטר × 1). הבלעה, נוף המוגדל-במראה תיוג מוצלח. הערה streptavidin שהופיע גם כנקודות או פסים לבנים בשל הגבהים העלו. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

בתוך עמודים = "תמיד"> איור 5
איור 5. עיצוב ותמונת TEM של 24H × Tube 28T. ציור סכמטי של 24H × חבית 28T (). שתי תצוגות מוגדלת-בראש והזהויות קטע מפורטת מופע התחתון. שים לב שקטעים a24.x * (למשל, a24.13 *) וb24.x * (למשל, b24.12 *) של השורה העליונה משלימים למגזרי a24.x (למשל, a24.13) וb24.x (למשל, b24.12) של השורה התחתונה; השלמה כזו צפויה לגרום להיווצרות של המבנה צינורי. 2% אלקטרופורזה agarose ילידים (ב) ג'ל. U, קנה בלתי; P, מטוהר (על ידי מיצוי ג'ל מנתיב U) (C) תמונת TEM של מבנה החבית (סרגל קנה מידה: 100 ננומטר).. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26."Target =" _ ighres.jpg blank "> לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 6
איור 6. שני עיצובים למניעת הצבירה נגרם על ידי תחומים דביקים חשופים. () הפגנת צד-ידי הצד של שתי שיטות כדי לכסות תחומים חשופים. תחום הדביק מזווג (תחום 4) מצויינים עם תיבה אדומה, מקווקו. עיצוב 1 הוא עיצוב התחלופה תחום, שבתחום מזווג מוחלף על ידי תחום פולי-T (מוצג באדום ושכותרתו "T"). עיצוב 2 הוא עיצוב מגן קצה, הכולל כיסוי תחום מזווג עם גדיל מגן קצה (מוצג באדום ושכותרתו "T-4 *"). גדיל מגן הקצה מורכב מסעיף פולי-T והשלמה לתחום החשוף. התצורות (ב) השונות אפשריות הגבול קשור עם החלפת תחום (עיצוב 1).ישנם 14 דרכים שונות SST הפנימי (מוצג בכחול) יכול להשאיר תחום או תחומים חשופים. החלפות הגדיל המתאימות מוצגות באדום לכל מצב. עיצוב מגן הקצה (ג) (2 עיצוב). SST הפנימי אחד (כחול) דורש רק ארבעה גדילי מגן קצה (אדום) כדי לכסות תחומים נחשפו באמצעות עיצוב זה. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 7
איור 7. שני עיצובים למשולש SST. (א) ו- (ב) מתארים שרטוטים המבוססים על עיצוב 1 (החלפת תחום) ועיצוב 2 (מגן קצה) באיור 8, בהתאמה. אזור פולי-T (T10 או T11 באיור) מתואר כפינה מעוגלת בתרשים בלוקים. הבלעה מראה תצוגה מוגדלת של המבנה מצויינים עם התיבה המקווקו. ברים סולם, 100 ננומטר. (ג) ו- (ד) הם תמונות AFM. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26.

איור 8
איור 8. תמונות תרשימים וAFM של 100 צורות שונות. עיצובי מבנה מוצגים בלוחות העליונים. צביעה בצבע תכלת מציינת את גדילי הבד יישארו מחוץ לתערובת תוך צביעה בצבע כחולה כהה מציינת את הגדילים כלולים. לשם בהירות, גדילי מגן קצה מושמטים. תמונת AFM מקבילה של כל מבנה מוצגת להלן העיצוב שלה. כל תמונה היא 150 ננומטר × 150 ננומטר באזור. ישנם 100 צורות ייחודיות. נכללים 10 בספרות ערבית, אותיות 26 האותיות לטיניות, 23 סימני פיסוק וkeyboaסימנים שלישיים, 10 סמלי הבעה, 9 סימנים האסטרולוגים, 6 תווים סיניים, וכמה סימנים שונים. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 9
איור 9. רובוט האוטומציה תרשים זרימה. תרשים זה מתאר את זרימת העבודה המשמשת כדי להפוך את תהליך הערבוב. ראשית, תכנית MATLAB מותאמת אישית משמשת לעיצוב הצורה הרצויה. שוב, מלבנים כחולים כהים מצביעים הגדילים להיכלל בתערובת. לאחר העיצוב הושלם, תכנית פלטי סט של הוראות pipetting עבור המטפל הנוזלי רובוטית. רובוט טפטפות הריכוזים הנכונים של הגדילים המתאימים לצורה מסוימת לפלאטדואר גם. התערובת אז עוברת חישול סיר אחד, ואחריו ההדמיה AFM של צורות וכתוצאה מכך. (נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26). אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 10
איור 10. עצמי עצרת של מלבנים וצינורות מעבר סולמות שונים. () תמונות AFM של מלבנים SST עם הממדים הבאים נועד (משמאל לימין):. 4H × 4T, 6H × 7T, 10H × 10T, 12H × 14T, ה -18 × 20T, 24H × 28T, ו× 36 ח 34T ( B) המשקל המולקולרי של המבנים בקנה מידת לוגריתמים. הכוכבית מציינת את המשקל של מבנה אוריגמי M13 DNA אופייני כנקודת התייחסות. תמונות (C) TEMשל צינורות SST עם הממדים שתוכננו הבאים (משמאל לימין): 8H × 28T, 8H × 55T, 8H × 84T, 24H × 28T, ו12H × 177T. כל הברים בקנה מידה להראות 100 ננומטר. נתון זה שונה מדמות שפורסמה בעבר 26. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

בשלב היווצרות מבנה, חשוב לשמור על ריכוז מתאים של קטיונים מגנזיום (למשל., 15 מ"מ) בתערובת גדיל DNA לDNA ננו העצמי להרכיב. כמו כן, בשלב אפיון agarose ג'ל / טיהור, חשוב לשמור על ריכוז קטיון מגנזיום מתאים (למשל., 10 מ"מ) בג'ל וחיץ ריצת ג'ל לשמור DNA ננו במהלך אלקטרופורזה. ל24H × מבנה מלבן 28T, בדקנו חישול בריכוזים שונים Mg ++ ומצאתי כי המבנה שנוצר בדרך כלל בטווח של 10-30 מ"מ Mg ++ (עם התשואה הטובה ביותר עם ​​ההיווצרות סביב 20 מ"מ Mg ++).

בניגוד למבנה אוריגמי פיגומים, יש מבנה SST ארכיטקטורה מודולרית. יכולות להיות מתוכננות מאותו הבד צורות שונות על ידי בחירת משנה המתאים של אריחי SST. בנוסף, מבנה SST מורכב הלוך ושובמ 'גדילי דנ"א סינטטיים קצרים בלבד ואינו כרוכים בפיגום ארוך המשמש בגישת אוריגמי. לכן, בגודל של מבנה SST אינו מוגבל על ידי האורך של הפיגום זמין. עם זאת, בעוד שגישת אוריגמי DNA יכול לעתים קרובות להיות מותאמת כדי לייצר שני מבנים מקופלים או מונומרים פרש, SST עלול לגרום למבנים שהוקמו באופן חלקי ובכך עשוי לדרוש טיהור ג'ל לשימוש מאוחר יותר. בנוסף, בשל חוסר גדיל פיגום, מבנה SST יכול להיות "שביר" יותר מעמיתו אוריגמי DNA שלה. שתי גישת SST וגישת אוריגמי DNA מתפתחת מהר, ומומלץ למשתמש לבחור את הגישה המתאימה ביותר לצורכים הפונקציונליים מסוימים שלו או שלה.

מה שמדהים הוא מאות מונומרים קטנים תיווך רק על ידי אינטראקציות מחייבות מקומיות יכולים עצמי להרכיב לצורה גלובלית שנקבעה, כפי שהודגמו על ידי גישת SST. עקרונות היסוד שמוצגים בsho גישת SSTuld ניתן להכליל לחומרים ליד גדילי דנ"א, והשיטה הבסיסית המתוארת במאמר זה, לאחר שינוי מתאים, צריך לאפשר למבנים של מבנים מורכבים התאספו עצמית מחומרים מגוונים.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Acknowledgments

עבודה זו מומנה על ידי משרד הצי צעיר מחקר תכנית פרס חוקר N000141110914, משרד המחקר של צי גרנט N000141010827, NSF פרס קריירת CCF1054898, פרס ממציא ניו 1DP2OD007292 של מנהל ה- NIH ומכון Wyss לפקולטה להנדסת הפעלת קרן בהשראה ביולוגית (לPY) ו צינג-פקינג מרכז למדעי חיים הפעלת קרן (לBW).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
DNA Strands  Integrated DNA Technology Section 3.1
SYBR Safe DNA gel stain Invitrogen S33102 Section 3.4.2
Freeze'N Squeeze DNA Gel Extraction Spin Columns BIO-RAD 731-6166 Section 3.6
Bruker's Sharp Nitride Lever Probes Bruker AFM Probes SNL10 Section 4.3
Safe Imager 2.0 Blue Light Transilluminator Invitrogen G6600 Section 3.6
Centrifuge 5430R Eppendorf 5428 000.414 Section 3.6
Transmission Electron Microscope  Jeol Jem 1400 Section 7.4
Multimode 8 Veeco Section 4
Typhoon FLA 9000 Laser Scanner GE Heathcare Life Sciences 28-9558-08 Section 3.5
Ultrapure Distilled water Invitrogen 10977-023 Section 3.7.1
Mica disk SPI Supplies 12001-26-2 Section 4.1
Steel mounting disk Ted Pella, Inc. 16218 Section 4.1
carbon coated copper grid for TEM Electron Microscopy Sciences FCF400-Cu Section 7.2
tweezers Dumont 0203-N5AC-PO Section 7.31
glow discharge system Quorum Technologies K100X Section 7.2
DNA Engine Tetrad 2 Peltier Thermal Cycler BIO-RAD PTC–0240G Section 3.3
Owl Easycast B2 Mini Gel Electrophoresis Systems ThermoScientific B2 Section 3.4.3
Seekam LE Agarose 500G Lonza 50004 Section 3.4.1
GeneRuler 1kb Plus DNA Ladder, Ready-To-Use 75-20000bp ThermoScientific SM1333 Section 3.4.4
Nanodrop 2000c UV-vis Spectrophotometer ThermoScientific Section 3.7
0.2 um filter Corning Inc. 431219 Section 7.1.2

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Seeman, N. C. Nucleic acid junctions and lattices. J. Theor. Biol. 99 (2), 237-247 (1982).
  2. Fu, T. J., Seeman, N. C. DNA double-crossover molecules. Biochemistry. 32 (13), 3211-3220 (1993).
  3. Winfree, E., Liu, F., Wenzler, L. A., Seeman, N. C. Design and self-assembly of two-dimensional DNA crystals. Nature. 394 (6693), 539-544 (1998).
  4. Yan, H., Park, S. H., Finkelstein, G., Reif, J. H., LaBean, T. H. DNA-templated self-assembly of protein arrays and highly conductive nanowires. Science. 301 (5641), 1882-1884 (2003).
  5. Rothemund, P. W. K., Papadakis, N., Winfree, E. Algorithmic self-assembly of DNA Sierpinski triangles. PLoS Biol. 2 (12), e424 (2004).
  6. Shih, W., Quispe, J., Joyce, G. A 1.7-kilobase single-stranded DNA that folds into a nanoscale octahedron. Nature. 427 (6975), 618-621 (2004).
  7. Chworos, A., et al. Building programmable jigsaw puzzles with RNA. Science. 306 (5704), 2068-2072 (2004).
  8. Park, S. H., et al. Finite-size, fully-addressable DNA tile lattices formed by hierarchical assembly procedures. Angew. Chem. Int. Ed. 45 (5), 735-739 (2006).
  9. Rothemund, P. W. K. Folding DNA to create nanoscale shapes and patterns. Nature. 440 (7082), 297-302 (2006).
  10. Schulman, R., Winfree, E. Synthesis of crystals with a programmable kinetic barrier to nucleation. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 104 (39), 15236-15241 (2007).
  11. He, Y., et al. Hierarchical self-assembly of DNA into symmetric supramolecular polyhedra. Nature. 452 (7184), 198-201 (2008).
  12. Yin, P., et al. Programming DNA tube circumferences. Science. 321 (5890), 824-826 (2008).
  13. Sharma, J., et al. Control of self-assembly of DNA tubules through integration of gold nanoparticles. Science. 323 (5910), 112-116 (2009).
  14. Douglas, S. M., Dietz, H., Liedl, T., Högberg, B., Graf, F., Shih, W. M. Self-assembly of DNA into nanoscale three-dimensional shapes. Nature. 459 (7245), 414-418 (2009).
  15. Andersen, E. S., et al. Self-assembly of a nanoscale DNA box with a controllable lid. Nature. 459 (7243), 73-76 (2009).
  16. Dietz, H., Douglas, S. M., Shih, W. M. Folding DNA into twisted and curved nanoscale shapes. Science. 325 (5941), 725-730 (2009).
  17. Zheng, J. P., et al. From molecular to macroscopic via the rational design of self-assembled 3D. DNA crystal. Nature. 461 (7260), 74-77 (2009).
  18. Han, D., et al. DNA origami with complex curvatures in three-dimensional space. Science. 332 (6024), 342-346 (2011).
  19. Liu, W., Zhong, H., Wang, R., Seeman, N. C. Crystalline two-dimensional DNA origami arrays. Angew. Chem. Int. Ed. 50 (1), 264-267 (2011).
  20. Zhao, Z., Liu, Y., Yan, H. Organizing DNA origami tiles into larger structures using preformed scaffold frames. Nano Lett. 11 (7), 2997-3002 (2011).
  21. Woo, S., Rothemund, P. Programmable molecular recognition based on the geometry of DNA nanostructures. Nat. Chem. 3 (8), 620-627 (2011).
  22. Delebecque, C. J., Lindner, A. B., Silver, P. A., Aldaye, F. A. Organization of intracellular reactions with rationally designed RNA assemblies. Science. 333 (6041), 470-474 (2011).
  23. Lin, C., Liu, Y., Rinker, S., Yan, H. DNA tile based self-assembly: building complex nanoarchitectures. ChemPhysChem. 7 (8), 1641-1647 (2006).
  24. Seeman, N. C. Nanomaterials based on DNA. Annu. Rev. Biochem. 79 (1), 65-87 (2010).
  25. Voigt, N. V., Nangreave, J., Yan, H., Gothelf, K. V. DNA origami: a quantum leap for self-assembly of complex structures. Chem. Soc. Rev. 40 (12), 5636-5646 (2011).
  26. Wei, B., Dai, M., Yin, P. Complex Shapes self-assembled from single stranded DNA tiles. Nature. 485 (7400), 623-626 (2012).
  27. Wei, B., Wang, Z., Mi, Y. Uniquimer: software of de novo DNA sequence generation for DNA self-assembly: an introduction and the related applications in DNA self-assembly. J. Comput. Theor. Nanosci. 4 (1), 133-141 (2007).
  28. Seeman, N. C. De novo design of sequences for nucleic acid structural engineering. J. Biomol. Struct. Dyn. 8 (3), 573-581 (1990).
  29. Hansma, H. G., Laney, D. E. DNA binding to mica correlates with cationic radius: assay by atomic force microscopy. Biophys. J. 70 (4), 1933-1939 (1996).
  30. Seelig, G., Soloveichik, D., Zhang, D. Y., Winfree, E. Enzyme-free nucleic acid logic circuits. Science. 314 (5805), 1585-1588 (2006).
  31. Yin, P., Choi, H. M. T., Calvert, C. R., Pierce, N. A. Programming biomolecular self-assembly pathways. Nature. 451 (7176), 318-322 (2008).

Tags

כימיה גיליון 99 הרכבה עצמית אריחי ה- DNA אריחים חד-גדילים בד מולקולרי פיקסל מולקולרי ננו לתכנות DNA ננוטכנולוגיה
עצמי הרכבה של צורות דו-ממדיות מורכבות מחד-גדילי דנ&quot;א אריחים
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Wei, B., Vhudzijena, M. K.,… More

Wei, B., Vhudzijena, M. K., Robaszewski, J., Yin, P. Self-assembly of Complex Two-dimensional Shapes from Single-stranded DNA Tiles. J. Vis. Exp. (99), e52486, doi:10.3791/52486 (2015).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter