Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Medicine

Sammenligning af Bibliometrisk analyse ved hjælp af PubMed, Scopus og Web of Science-databaser

doi: 10.3791/58494 Published: October 24, 2019

Summary

Litteratur databaser er almindeligt anvendt til at vurdere publikationer i et bestemt emne, disciplin, land eller region i verden, en praksis kendt som Bibliometrisk analyse. Den nuværende protokol beskriver, hvordan du bruger PubMed, Scopus, og Web of Science databaser til at gøre Bibliometrisk analyse.

Abstract

Litteratur databaser (dvs., PubMed, Scopus, og Web of Science) adskiller sig med hensyn til deres dækning, fokus, og det værktøj, de leverer. PubMed fokuserer primært på biovidenskab og biomedicinsk discipliner, hvorimod Scopus og Web of Science er tværfaglige. Den protokol, der er beskrevet i den aktuelle undersøgelse, blev brugt til at søge efter publikationer fra jordanske forfattere i årene 2013-2017. I denne protokol, hvordan man bruger hver database til at udføre denne type søgning forklares i detaljer. En Scopus-søgning resulterede i det højeste antal dokumenter (11.444 dokumenter) efterfulgt af et Web of Science Search (10.943 dokumenter). PubMed resulterede i et mindre antal dokumenter på grund af dens snævrere omfang og dækning (4.363 dokumenter). Resultaterne viser også en årlig tendens i: (1) antallet af publikationer, (2) de discipliner, der har flest publikationer, (3) de samarbejdslande, og (4) antallet af Open Access publikationer. I modsætning hertil har PubMed en sofistikeret søgeords optimeringstjeneste (dvs.medicinsk emneoverskrift eller MeSH), mens både Scopus og Web of Science giver søgeanalyse værktøjer, der kan producere repræsentative tal. Endelig forklares funktionerne i hver database i detaljer, og flere indekser, der kan udvindes ved hjælp af søgeresultaterne, leveres. Denne undersøgelse danner grundlag for brug af litteratur databaser til Bibliometrisk analyse.

Introduction

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Klassisk, forskere har brugt litteratur databaser til at udføre litteraturgennemgang for deres studier1. En anden brug af disse litteratur databaser opstod i slutningen afdet 19 århundrede , hvor forskerne analyserede kroppen af litteratur, en brug, der langsomt er vokset siden2. I de sidste par årtier, digitaliserede litteratur og dannelsen af online litteratur databaser givet mulighed for at forskerne til at analysere kroppen af litteratur og forskning ydeevne nemt og effektivt. Et eksempel ville være at analysere forskningsresultater for et dokument3, et emne4, en disciplin5, et land6, eller endda en region i verden7. Denne type analyse er kendt som Bibliometrisk analyse. Heartsill unge defineret Bibliometrisk analyse som brugen af statistiske metoder til at analysere et organ af litteratur til at afsløre historiske udvikling8. Med andre ord, bibliometri er den kvantitative undersøgelse af offentliggjorte enheder på grundlag af citat og tekstanalyse9.

Forskellige databaser bruges til at gøre Bibliometrisk analyse og hver database har forskellige karakteristika og kan give forskellige tjenester10. I øjeblikket er de mest almindeligt anvendte litteratur databaser Web of Science og Scopus for næsten alle discipliner, både kun tilgængelige på abonnementsbasis11, og PubMed for biomedicinsk og biovidenskab, en frit tilgængelig database10. Der er også Google Scholar, som kan være et nemt værktøj til at håndtere, men det bør ikke bruges som en Bibliometrisk analyseværktøj i øjeblikket på grund af nogle mangler såsom dens uklare omfang og dækning, dens mangel på citation analyseværktøjer, og dens inddragelse af ikke-peer revideret ikke-videnskabeligt indhold12,13. Desuden, Google Scholar mangler værktøjer til at udføre avanceret søgning og søgeordsoptimering14.

Flere tidligere undersøgelser har sammenlignet funktionerne i de tidligere nævnte litteratur databaser med henblik på litteraturgennemgang3,5,10,12,13,15 ,16,17. Men i denne undersøgelse, de midler, hvormed PubMed, Scopus, og Web of Science databaser bruges til at udføre en Bibliometrisk analyse vil blive leveret, og fordele og ulemper for hver af dem vil blive sammenlignet. Bibliometrisk analyse kan bruges til at analysere forskning output i næsten enhver disciplin, så målgruppen ville være enhver forsker, der har til hensigt at analysere offentliggørelse tendenser. Et eksempel på at analysere en publikation trend i Jordan som et land vil blive præsenteret ved hjælp af hver database. Jordan blev valgt, fordi at gøre en Bibliometrisk analyse for et land (i modsætning til et emne) er ikke meget ligetil. Desuden, Jordan, specifikt, er dårligt undersøgt i en Bibliometrisk måde, da det kan være både en forfatternavn og et land navn. Vi forklarer, hvordan man overvinder en sådan udfordring i søgningen.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Bemærk: følgende er søge metoder og et eksempel søgning for hver metode er forudsat. Bemærk, at den del, der specifikt er relateret til Bibliometrisk analyse, også leveres.

1. PubMed

  1. Vælg Avanceret søgning fra PubMed hjemmeside (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
  2. Indtast det ønskede søgeudtryk i søgefeltet. Vælg søgeordene i databasen med den medicinske emneoverskrift (MeSH). Følgende eksempel beskriver, hvordan man vurderer forskning i "kræft".
    1. Åbn MeSH-databasen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh.
    2. Indtast ordet "cancer" i søgefeltet.
    3. Sørg for, at resultaterne viser ordet "neoplasmer" øverst i søgningen, hvor det konstateres, at brugen af ordet "neoplasmer" er mere velegnet, da "neoplasmer" er det ord, der bruges til at indeksere relevante emner.
    4. Yderligere kontrollere andre vilkår, der er anført under udtrykket "neoplasmer" ved at klikke på det. Resultaterne vil vise andre termer, der anvendes til at beskrive lignende emner (f. eks. tumor), og vil også nævne andre underkategorier (underpositioner) under betegnelsen neoplasma.
    5. Brug rullelisterne i afsnittet Builder til at angive feltet i den artikel, som PubMed søger efter udtrykket i. Bemærk, at følgende søgefelter er tilgængelige: alle felter, titel, abstrakt, forfattere, tilhørsforhold, interessekonflikter, sprog, Journal, udgiver, publikationstype, tilskudsnummer, ISBN og maske termer.
    6. Tilføj så mange felter som nødvendigt, og vælg relationen mellem disse felter (og, eller, eller ikke). Se tabel 1 for yderligere oplysninger.
  3. Klik på Søg.
  4. Afgræns søgeresultaterne yderligere i resultaterne ved hjælp af forskellige filtre, der er tilgængelige som beskrevet i tabel 2. Kommentar at fra nu af, den afgørende ransage gennemstegt vil være oplagt i den historie i den fremskreden ransage, hvilke var tilgået i den først skridt. Det betyder, at søgningen kan afbrydes midlertidigt på dette trin og genoptages senere.
  5. Sørg for, at hver ny søgning gemmes på skærmbilledet avanceret søgehistorik, hvor den vil blive tildelt et nummer (f. eks.#2). Brug dette nummer i søgefeltet ovenfor til at fratrække søgte forespørgsler (f. eks. "#1 ikke #2" for at trække resultater fra søge #2 fra resultaterne af søge #1).
  6. Eksporter resultaterne for at analysere dem yderligere.
    1. Brug værktøjet FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi) til at eksportere resultaterne i et kommasepareret format (CSV), og vælg PubMed på rullelisten Vælg en database, der skal startes.
    2. Vælg input fra Entrez History fra indtastnings skærmen, og en avanceret PubMed søgehistorik vises på rullelisten.
    3. Vælg den søgning, der blev udført i de forrige trin på PubMed Advanced Search, og klik på Submit.
    4. Få vist den resulterende rapport, da den giver mulighed for at eksportere søgeresultaterne i en CSV-formatfil.
  7. Udfør følgende trin for at analysere jordansk forskningsoutput i en 5-årig periode mellem 1/1/2013 og 31/12/2017 ved hjælp af PubMed.
    1. Åbn formularen til avanceret søgning i dokument søgnings formularen på PubMed-webstedet (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
    2. Brug Jordan som søgeterm, og Angiv tilhørsforhold som søgefelt. Bemærk, at PubMed fortolker tilhørsforhold som alle oplysninger relateret til forfatteren (dvs. forfatterens navn, adresse, tilhørsforhold), så udelukke ethvert dokument forfattet af en forfatter ved navn "Jordan", hvor tilhørsforhold land er ikke Jordan. Følg nedenstående trin for at undgå at medtage sådanne irrelevante resultater.
    3. Skriv Jordan i et andet felt, og vælg felttypen forfatter.
    4. Vælg operatoren ikke som relationen mellem de to felter, og klik på Søg.
    5. Angiv publikations datoer fra 1/1/2013 til 31/12/2017 i resultatvinduet, og vælg Journal artikel og gennemse fra artikel typer.
    6. Åbn FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi), og vælg PubMed som databasen.
    7. Vælg input fra Entrez History fra indtastnings skærmen, og vælg søgningen på rullelisten.
    8. Klik på download CSV.
      Bemærk: figur 1 beskriver PubMed-søge rapporten med anmærkning for hvert afsnit i rapporten.

2. Scopus

  1. Tilmeld dig for at få adgang til de komplette søgemuligheder i Scopus-databasen. Kontroller, om den lokale institution allerede er registreret og har adgang til databasen, da akademiske institutioner normalt er registreret i Scopus.
  2. Gå til webstedet (www.scopus.com) og som standard åbner Scopus skærmbilledet dokument søgnings formular.
  3. Indtast det ønskede søgeudtryk i søgefeltet.
  4. Angiv de felter i artiklen, der skal søges efter. Bemærk, at følgende søgefelter er tilgængelige: alle felter, titel, abstrakt, nøgleord, forfattere, tilhørsforhold, finansieringsoplysninger, sprog, referencer, konference, ISSN, CODEN, DOI, ORCID og CAS-nummer.
  5. Tilføj andre felter for at søge efter og angive relationen mellem det nyligt tilføjede felt og det andet felt, der allerede er indtastet (og, eller eller eller ikke). Se (tabel 1) for yderligere oplysninger.
  6. Brug indstillingen Limit til at begrænse søgningen ud fra de indstillinger, der er angivet i Scopus, som beskrevet i tabel 2. efter at have udført søgningen, gemme søgningen og fortsætte senere, hvis det er nødvendigt.
    1. I dette tilfælde skal du indstille en påmindelse ved hjælp af advarslen option set, hvor der sendes en e-mail, når en artikel, der opfylder søgekriterierne, tilføjes.
  7. Afgræns søgeresultaterne yderligere fra resultaterne direkte ved at vælge mellem indstillingerne fra Scopus (tabel 2), hvor Scopus viser antallet af dokumenter, der er inkluderet for hver indstilling.
  8. Vælg enten at analysere resultaterne direkte på webstedet Scopus (Klik på Analysér søgeresultater) eller for at eksportere resultaterne i enten zip-eller CSV-format, når du har udfyldt søgekriterierne.
  9. Udfør følgende trin for at analysere jordansk forskningsoutput i en 5-årig periode mellem 1/1/2013 og 31/12/2017 ved hjælp af Scopus.
    1. Gå til webstedet (www.scopus.com) og som standard åbner Scopus skærmbilledet dokument søgnings formular.
    2. Skriv Jordan som søgeterm i formularen til dokumentsøgning.
    3. Angiv tilhørsland som søgefelt.
    4. Begræns søge varigheden fra 2013 til 2017. Bemærk, at fra 2013 betyder fra 1/1/2013, og til 2017 betyder til 31/12/2017.
    5. Begræns dokumenttypen til artikel eller korrektur, og klik derefter på Søg.
      Bemærk: figur 2 beskriver Scopus-søge rapporten med anmærkning for hvert afsnit i rapporten.

3. Web of Science

  1. Tilmeld dig for at få adgang til de komplette søgemuligheder i Web of Science database. Kontroller, om den lokale institution allerede er registreret og har adgang til databasen som akademiske institutioner er normalt registreret i Web of Science.
  2. Gå til webstedet for videnskabens hjemmeside (www.webofknowledge.com). Hjemmesiden åbner den grundlæggende søgning og omfatter Web of Science Core Collection som den valgte database til søgning.
  3. Søg efter felterne som beskrevet i tabel 2.
  4. Tilføj et andet felt (hvis det er nødvendigt) for at forbinde begge felter med enten AND, OR eller NOT. Se tabel 1.
  5. Definer den varighed, der søges ned til 1945. Når søgningen er gennemført, gemmes resultaterne i historikken og kan til enhver tid returneres. Hvis det er nødvendigt, skal du angive en påmindelse, hvis et nyt dokument føjes til søge rapporten.
  6. Sortér resultaterne i henhold til enten data, tidspunkter citeret, anvendelses antal eller til andre kategorier fra den medfølgende rulleliste.
  7. Forfine søgeresultaterne yderligere fra resultaterne direkte ved at vælge mellem de muligheder, som Web of Science (tabel 2), hvor Web of Science viser antallet af dokumenter, der er inkluderet for hver mulighed.
  8. Se resultaterne, og analysér dem via et trækort eller søjlediagram. Bemærk, at der er en tabel, som viser antallet i hver kategori.
  9. Download resultaterne. Bemærk, at i modsætning Scopus og PubMed, Web of Science kun tillader downloading af 5.000 poster på et tidspunkt (f. eks, en 10.000 resultatsøgning er hentet i to batches, den første batch for de første 5.000 poster, og en anden batch for de næste 5.000 Records).
  10. Udfør følgende trin for at analysere jordansk forskning output i en 5-årig periode mellem 1/1/2013 og 31/12/2017 ved hjælp af Web of Science.
    1. Skriv Jordan i søgefeltet, og Angiv adresse som søgefelt.
    2. Identificer varigheden af søgningen mellem 2013 og 2017, og klik på Søg.
    3. Begræns søgningen ved hjælp af artikel-og korrektur filtre.
    4. Vælg at analysere de resultater, der er gemt i søgehistorikken nu eller senere.
    5. Vælg at analysere resultaterne i form af tabeller eller visuelle trækort og søjler.
      Bemærk: figur 3 beskriver Web of Science Search Report med annotation for hvert afsnit i rapporten.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Resultater fra PubMed Search

I alt 4.363 dokumenter blev hentet baseret på søgningen foretaget i denne undersøgelse. Gratis fuld tekst var tilgængelig for 1.767 dokumenter (40,5%). I 2013, i alt 532 dokumenter blev offentliggjort, 663 dokumenter i 2014, 811 dokumenter i 2015, 952 dokumenter i 2016, og 1.405 dokumenter i 2017.

Resultaterne viser, at 1.008 (23,8%) dokumenter drøftede spørgsmål i forbindelse med kræft, mens kun 53 (1,2%) dokumenter diskuterede AIDS-relaterede emner. Resultaterne viser også, at 150 (3,5%) dokumenter blev offentliggjort i Tandpleje relaterede tidsskrifter, mens 275 (6,5%) dokumenterne blev offentliggjort i sygejournaler.

Resultater fra Scopus Search

I alt 11.444 dokumenter var resultatet af den søgning, der blev foretaget i den aktuelle undersøgelse, herunder 10.974 (95,9%) artikler og 470 (4,1%) Gæstevurderingerne. Kun 652 (5,7%) af dokumenterne var åben adgang.

Figur 4 viser den årlige trend i jordanske udgivelser i løbet af 5-års intervallet. Ifølge det land i samarbejde i Scopus Search (figur 5), USA (USA) er den mest almindeligt land jordanske forskere samarbejder med (1.553 publikationer), efterfulgt af Saudi-arabien med 1.176 publikationer, og Forenede Kongerige med 723 publikationer.

Figur 6 detaljer de 10 mest almindelige discipliner jordanere har udgivet i. Baseret på den Scopus søgning, medicin er den mest almindeligt disciplin offentliggjort i (2.441 publikationer), efterfulgt af ingeniørvidenskab (1.837 publikationer), og samfundsvidenskab (1.468 publikationer). Universitetet i Jordan har bidraget til 3.346 (29,3%) publikationer af de samlede fem års publikationer, efterfulgt af Jordan University of Science and Technology med 2.396 publikationer (21,0%), og Hashemite University af 1.347 publikationer (11,8%).

Resultater fra Web of Science Search

I alt 10.943 dokumenter blev offentliggjort i Jordan. 87 er meget citerede papirer og 14 anses for at være varme papirer. Resultaterne viser, at 2.879 dokumenter var åben adgang, 2.547 dokumenter var guld åben adgang, 170 dokumenter var grøn offentliggjort, og 162 dokumenter var grøn accepteret (manuskript deponeret i depoter efter accept før offentliggørelse).

Figur 7 viser den årlige trend i jordanske udgivelser i løbet af 5-års intervallet. Figur 8 beskriver samarbejdslandet. Ifølge Web of Science Search, USA er den mest almindeligt land jordanere samarbejde med (929 publikationer), efterfulgt af Frankrig med 860 publikationer, og Østrig med 429 publikationer. Figur 9 detaljer de 10 mest almindelige discipliner jordanere offentliggjort i. Ifølge Web of Science Search, ingeniørvidenskab er den mest almindeligt disciplin offentliggjort i (1.315 publikationer), efterfulgt af matematik (1.263 publikationer), og datalogi (828 publikationer).

Figure 1
Figur 1: rapporten for PubMed-søgningen med farve anmærkning for hver sektion i rapporten. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 2
Figur 2: rapporten for Scopus-søgningen med farve anmærkning for hver sektion i rapporten. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 3
Figur 3: rapporten til Web of Science Søg med farve annotation for hver sektion i rapporten. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 4
Figur 4: den årlige tendens i publikationer i Jordan i løbet af 5-årig periode, som ekstraheret fra Scopus. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 5
Figur 5: landene jordanere har tendens til at forfatte publikationer med, som udvundet fra Scopus. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 6
Figur 6: discipliner jordanske publikationer er generelt om, som udvundet fra Scopus. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 7
Figur 7: et søjlediagram, der viser den årlige publikations trend i årene 2013-2017 i Jordan, som udvindes fra Web of Science. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 8
Figur 8: et søjlediagram, der viser de lande, jordanere har tendens til at samarbejde med i årene 2013-2017, som udvindes fra Web of Science. Klik her for at se en større version af dette tal.

Figure 9
Figur 9: et træ kort, der viser de 10 discipliner, som de fleste jordanske offentliggøre i løbet af årene 2013-2017, som udvindes fra Web of Science. Klik her for at se en større version af dette tal.

Operatør funktion Pubmed Scopus Web of Science Eksempel
Begge udtryk skal vises Og Og Og
Mindst et af betingelserne skal fremgå Eller Eller Eller
Udtrykket efter det må ikke vises Ikke OG IKKE Ikke
Du ønsker at finde to ord inden for en "n" afstand fra hinanden, uanset deres rækkefølge X W/n I nærheden af/n Jordan W/2 Cancer → at finde et resultat med ordene "Jordan" og "cancer" inden for 2 ord fra hinanden
Du ønsker at finde et ord inden for en "n" afstand før det andet ord (Order respekteret) X Pre/n X Jordan pre/2 Cancer → at finde et resultat med ordene "Jordan" er før "kræft" med 2 ord
Du ønsker at finde ordene med den angivne stilk, uanset den anden del af ordet X eller? * Jordan * eller Jordan? → vil også returnere resultaterne for "jordansk"
Du ønsker at finde et ord med den angivne stilk og med et maksimum på blot et bogstav mere efter det X X $ eller? Jordan $ eller Jordan? → vil give resultater for "Jordans", men ikke for "jordansk"
Søger efter den nøjagtige sætning inden for anførselstegnene, vil respektere betydningen af de operatorer, som er nævnt i tilbuddene X "" "" "Kræft i Jordan?" → vil søge efter "kræft i Jordan" eller "kræft i Jordans"
Søger efter den nøjagtige sætning i anførselstegnene uden at respektere betydningen af de operatorer, som er nævnt i tilbuddene X {} X {Kræft i Jordan?} → vil søge efter "kræft i Jordan?" kun, det er det vil fortolke spørgsmålstegnet som et spørgsmålstegn

Tabel 1: operatorer til at udføre de angivne funktioner for hver database. Operatører i PubMed skal være i store tilfælde, i modsætning til dem for Scopus og Web of Science. X = ikke til stede.

Resultat foranstaltninger Pubmed Scopus Web of Science
Dokumenter hvert år
Publikationer i bestemte tidsskrifter
Publikationer pr. forfatter
Institutionel tilknytning
Land af forfattere
Antal publikationer med åben adgang (Golden OA)
Antal publikationer med åben adgang (grøn OA) X X
Publikationer pr. dokumenttype
Emneområde
Publikationer i bestemte udgivere X X
Publikationer for specifikke maske termer X
Web of Science kategorier X X
Finansierings agentur X X
Publikationer om specifikke køns X X
Publikationer om specifik aldersgruppe X X
Publikationer af en unik PubMed ID X
Publikationer, som styres af en bestemt redaktør X X
Meget citerede papirer: papirer i top 1% i hvert emneområde i form af højeste citater i de sidste 10 år. X X
Hot Papers i marken: papirer, der er blevet stærkt citeret i de seneste to måneder i forhold til normen (gennemsnitlige citater i peer Papers). X X

Tabel 2: resultatmålinger og søgefiltre, der er tilgængelige for hver litteratur database. Forskerne kan henvise til hver database instruktioner for yderligere oplysninger om brug af hvert filter.

Pubmed Scopus Web of Science
Dækkede discipliner Biovidenskab og biomedicinsk discipliner Alle discipliner Alle discipliner
Fokus Biovidenskab og biomedicinsk discipliner Fysiske, sundhedsmæssige, livs-og samfundsvidenskaber Videnskab, teknologi, samfundsvidenskab, kunst og humaniora.
Dækkede periode 1966 1970 1900 *
Gratis/betalt Gratis Betalt Betalt
Ejerskab National Institute of Health Elsevier Clarivate
Professionel term indeksering Ja Nej Nej
Tilknyttede datasøgning Nej Nej Ja
Gammel datadækning Nej Nej Ja
Figur produktion Nej Ja Ja
Vurdering af åben adgang Guld åben adgang Guld åben adgang Grøn og guld åben adgang
Venlig grænseflade + ++ +++
Operatørernes tilgængelighed + +++ ++
* Dækning afhænger af institutionelt abonnement

Tabel 3: sammenligning af egenskaberne for PubMed, Scopus og Web of Science. Oplysningerne i denne tabel er baseret på undersøgelsens data og oplysningerne fra hver database10,22,23,24.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

I denne undersøgelse, de skridt, hvorigennem PubMed, Scopus, og Web of Science databaser bruges til at udføre en Bibliometrisk analyse blev leveret. Det blev angivet, at den hyggeligste og nemmeste værktøj til at bruge til bibliometriske analysetjenester er Web of Science; Men, dens ulempe er, at dens tjenester ikke er tilgængelige gratis. PubMed er afsat til biomedicinske videnskaber og er tilknyttet flere andre National Library of Medicine (NLM) værktøjer, der kan bidrage til at optimere analysen af biomedicinske. Medicinsk emneoverskrift (MeSH) er en professionel indeksering værktøj, hvor ved at tilføje en ny artikel til PubMed database, artiklen vil blive gennemsøgt af eksperter for de vigtigste emner, det diskuterer, og en liste over MeSH vil blive tildelt for hver artikel. På den anden side, dens største ulempe er, at det kræver god viden om, hvordan man bruger det. Søgning på Web of Science Core Collection vil give alle artikler, der er offentliggjort i tidsskrifter indekseret i Science Citation Index udvidet (SCIE), social science Citation Index (SSCI), kunst og humaniora Citation Index (AHCI), og den nyligt tilføjede Fremspirende kilde citat Index (ESCI), hvor forfattere kan vælge databasen i Web of Science for at søge i18. Desuden er to andre databaser for bøger og konferencer også inkluderet19. Scopus er generelt let at bruge og har en database, der dækker flere tidsskrifter end de to andre tjenester20, men det er stadig en betalt service. Tabel 3 yderligere detaljer og sammenligner de særlige kendetegn ved PubMed, Scopus, og Web of Science.

Som vist i resultaterne, hver af Scopus og Web of Science database Search leverede forskellige discipliner som de mest almindeligt discipliner jordanere udgive i. Årsagerne til disse uoverensstemmelser blev undersøgt ved at analysere klassificeringen af forskningsområdet (disciplin) for hver database. Det konstateredes, at Scopus Search gav 27 forskningsområder, hvor publikationer klassificeres i en eller flere af dem. På den anden side, Web of Science Search gav 140 forskningsområder. Men, Web of Science publikationer er klassificeret i kun én af dem (ingen publikation er klassificeret i mere end ét forskningsområde). For eksempel, det fælles forskningsområde "medicin" i Scopus svarer til 27 forskningsområder i Web of Science, som er (tal svarer til bidraget fra hvert forskningsområde i de samlede 10.936 publikationer, som resulterede fra Web of Science Search):

Intern medicin (2,5%), neurologi (2,2%), onkologi (2,2%), kirurgi (1,4%), endokrinologi (1,1%), Pediatrics (1,1%), psykiatri (1%), eksperimentel medicin (1%), hjerte-kar-system (0,9%), infektionssygdomme (0,9%), radiologi (0,9%), Orthopedics ( 0,7%), Obstetrik og Gynækologi (0,7%), immunologi (0,6%), rehabilitering (0,6%), Hematologi (0,6%), Urologi (0,5%), respiratorisk (0,4%), oftalmologi (0,3%), gastroenterologi (0,3%), komplementær medicin (0,3%), dermatologi (0,2%), morfologi ( 0,2%), reumatologi (0,2%), anæstesiologi (0,2%), Akutmedicin (0,1%), allergi (0,1%).

Som forklaret tidligere i protokollen, forskere kan downloade søgeresultater i en CSV eller XLSX format, hvor flere værktøjer er tilgængelige til yderligere at analysere og kort resultaterne. Disse værktøjer anvende begrebet videnskab kortlægning eller Bibliometrisk kortlægning, som er en rumlig repræsentation af, hvordan discipliner, felter, dokumenter, eller forfattere er relateret24,25:

  • Den Sci2 Tool (https://sci2.cns.iu.edu/user/index.php): et frit tilgængeligt værktøj til at udføre analyse af data udvundet fra Scopus, Web of Science, eller endda PubMed.
  • BibExcel (http://homepage.univie.ac.at/juan.gorraiz/bibexcel/): et frit tilgængeligt værktøj, der administrerer og opbygger kort til data, som udvindes fra forskellige bibliometriske programmer.
  • CiteSpace (http://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace/): et frit tilgængeligt værktøj til visualisering og analyse af tendenser og mønstre i den videnskabelige litteratur.
  • UCINET (https://sites.google.com/site/ucinetsoftware/home): en s ubscription-baseret værktøj til analyse af sociale netværk data og tegning visualiseret kort.
  • Pajek (http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/): et frit tilgængeligt værktøj til analyse og visualisering af store netværk.
  • Leydesdorff ' s software (https://www.leydesdorff.net/software.htm): et frit tilgængeligt værktøj til at analze output fra bibliometriske databaser og til at tegne tilknytninger af resultaterne.
  • Netværk Workbench Tool (http://nwb.cns.iu.edu): et frit tilgængeligt værktøj, der giver specifikke algoritmer til at håndtere publikationer data til at konstruere og analysere bibliometriske netværk og kort.
  • VintagePoint (https://www.thevantagepoint.com): et abonnement-baseret værktøj til at analysere og videnskab kort store mængder af struktureret tekst for at opdage mønstre og relationer
  • VOSviewer (http://www.vosviewer.com/download): et frit tilgængeligt værktøj specielt designet til at konstruere og visualisere bibliometriske kort, idet der lægges særlig vægt på den grafiske gengivelse af sådanne kort.

Derudover kan forskerne bruge data indhentet fra de tre databaser (PubMed, Scopus og Web of Science) og beregne flere andre værdifulde indekser ved hjælp af data fra andre kilder, herunder Verdensbanken og organisationen for økonomisk samarbejde og Udvikling (OECD). Da årspublikationer og forfatterens tilhørsland er tilgængelige som resultatmålinger i de tre databaser, kan følgende indekser således måles:

  • Befolknings indeks
  • Antal publikationer pr. million indbyggere, hvor populationer kan hentes fra World Bank database26.
  • Publikationer pr. bruttonationalprodukt (BNP)
  • Antal publikationer pr. milliard-dollar BNP, hvor BNP kan opnås fra "verdens udviklingsindikatorer" fra World Bank database26.
  • Årlig videnskabelig vækstrate (forsknings produktivitet)
  • (Publikationer i året (n) – publikationer i året (n-1))/publikationer i året (n-1)
  • Publikationer pr. region

Da verden er inddelt i 9 regioner i henhold til Fn's statistiske årbog af de Forenede Nationer27, er disse divisioner baseret på geografiske, videnskabelige og økonomiske overvejelser. Disse regioner er: Vesteuropa, Østeuropa, Amerikas Forenede Stater (USA), Canada, Latin Amerika og Caribien, Afrika, Japan, Asien (ekskl. Japan) og Oceanien.

Forskere, der har til formål at gøre Bibliometrisk analyse ved hjælp af ovennævnte databaser bør være opmærksomme på deres begrænsninger; Journal dækning af Scopus og Web of Science i næsten alle discipliner ikke når halvdelen af kladderne i Ulrich's tidsskrifter ordbog28. Det betyder, at selvom Scopus og Web of Science indekserede tidsskrifter er baseret på kvalitet, dækker de ikke alle tidsskrifter i nogen disciplin. Desuden er ikke-engelsksprogede tidsskrifter underrepræsenterede, da fokus for disse databaser er engelsksprogede tidsskrifter28. En af de begrænsninger, man kan støde på i løbet af analysen er den manglende adgang til komplette oplysninger om en artikel (f. eksmangler forfatterens land tilhørsforhold), hvilket kan føre til en form for fejl i resultaterne. Dette kan undgås ved at udføre en manuel søgning efter forfatteren. Dette spørgsmål blev imidlertid ikke drøftet i den analyse, der blev gennemført i denne undersøgelse, da tidligere undersøgelser har anslået, at de manglende oplysninger, der er forårsaget af dette problem, er ubetydelige (mindre end 5%)6.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Alle forfattere afslører ingen potentielle interessekonflikter.

Acknowledgments

Forfatterne vil gerne takke Deanship for videnskabelig forskning for sin fond til støtte for video produktion til denne undersøgelse. Forfatterne vil også gerne takke Dr. Aseel Zabin, Department of English Language and Literature, University of Jordan for engelsk sprog gennemgang af denne undersøgelse.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
clarivate N/A Web of Science provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.
Elsevier N/A Scopus provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. McGowan, J. PRESS peer review of electronic search strategies: 2015 guideline statement. Journal of Clinical Epidemiology. 75, 40-46 (2016).
  2. Hood, W., Wilson, C. The literature of bibliometrics, scientometrics, and informetrics. Scientometrics. 52, (2), 291-314 (2001).
  3. Bar-Ilan, J. Citations to the Introduction to infometrics indexed by WOS, Scopus and Google Scholar. Scientometrics. 82, (3), 495-506 (2010).
  4. Boudry, C., Baudouin, C., Mouriaux, F. International publication trends in dry eye disease research: A bibliometric analysis. The Ocular Surface. 16, (1), 173-179 (2018).
  5. Kulkarni, A. V. Comparisons of citations in Web of Science, Scopus, and Google Scholar for articles published in general medical journals. Journal of the American Medical Association. 302, (10), 1092-1096 (2009).
  6. AlRyalat, S. A., Malkawi, L. International Collaboration and Openness in Jordanian Research Output: A 10-year Publications Feedback. Publishing Research Quarterly. 34, (2), 265-274 (2018).
  7. Falagas, M. E., Karavasiou, A. I., Bliziotis, I. A. Estimates of global research productivity in virology. Journal of Medical Virology. 76, (2), 223-229 (2005).
  8. Young, H. The ALA glossary of library and information science. Ediciones Díaz de Santos. (1983).
  9. Broadus, R. Toward a definition of bibliometrics. Scientometrics. 12, (5-6), 373-379 (1987).
  10. Falagas, M. E. Comparison of PubMed, Scopus, web of science, and Google scholar: strengths and weaknesses. The FASEB Journal. 22, (2), 338-342 (2008).
  11. Guz, A. N., Rushchitsky, J. J. Scopus: A system for the evaluation of scientific journals. International Applied Mechanics. 45, (4), 351 (2009).
  12. Jacso, P. As we may search-comparison of major features of the Web of Science, Scopus, and Google Scholar citation-based and citation-enhanced databases. CurrentScience. 89, (9), 1537-1547 (2005).
  13. Li, J. Citation analysis: Comparison of Web of Science, Scopus, Scifinder, And Google Scholar. Journal of Electronic Resources in Medical Libraries. 7, (3), 196-217 (2010).
  14. Levine-Clark, M., Kraus, J. Finding chemistry information using Google Scholar: a comparison with Chemical Abstracts Service. Science & Technology Libraries. 27, (4), 3-17 (2007).
  15. Gavel, Y., Iselid, L. Web of Science and Scopus: a journal title overlap study. Online Information Review. 32, (1), 8-21 (2008).
  16. Harzing, A. W., Alakangas, S. Google Scholar, Scopus and the Web of Science: a longitudinal and cross-disciplinary comparison. Scientometrics. 106, (2), 787-804 (2016).
  17. Aghaei Chadegani, A., et al. A comparison between two main academic literature collections: Web of Science and Scopus databases. (2013).
  18. Testa, J. The Thomson Reuters journal selection process. Transnational Corporations Review. 1, (4), 59-66 (2009).
  19. Web of Science Core Collection: Web of Science: Summary of Coverage. http://clarivate.libguides.com/woscc/coverage (2018).
  20. Burnham, J. F. Scopus database: a review. 3, (1), Biomedical Digital Libraries. 1 (2006).
  21. Pubmed. www.ncbi.nlm.nih.gov/ (2018).
  22. Scopus. www.scopus.com (2018).
  23. Web of Science. www.webofknowledge.com (2018).
  24. Small, H. Visualizing science by citation mapping. Journal of the American society for Information Science and Technology. 50, (9), 799-813 (1999).
  25. Cobo, M. J. Science mapping software tools: Review, analysis, and cooperative study among tools. Journal of the American Society for Information Science and Technology. 62, (7), 1382-1402 (2011).
  26. World bank. http://www.worldbank.org (2018).
  27. Statistical Yearbook – 60th issue. https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/ (2018).
  28. Mongeon, P., Paul-Hus, A. The journal coverage of Web of Science and Scopus: a comparative analysis. Scientometrics. 106, (1), 213-228 (2016).
Sammenligning af Bibliometrisk analyse ved hjælp af PubMed, Scopus og Web of Science-databaser
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

AlRyalat, S. A. S., Malkawi, L. W., Momani, S. M. Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases. J. Vis. Exp. (152), e58494, doi:10.3791/58494 (2019).More

AlRyalat, S. A. S., Malkawi, L. W., Momani, S. M. Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases. J. Vis. Exp. (152), e58494, doi:10.3791/58494 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
simple hit counter