-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Bir Fourier Matrix Yardımlı Lazer Dezorpsivon / İyonizasyon Görüntüleme için bir Matrix olarak di...
Bir Fourier Matrix Yardımlı Lazer Dezorpsivon / İyonizasyon Görüntüleme için bir Matrix olarak di...
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Dithranol as a Matrix for Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Imaging on a Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometer

Bir Fourier Matrix Yardımlı Lazer Dezorpsivon / İyonizasyon Görüntüleme için bir Matrix olarak ditranol İyon Cyclotron Rezonans Kütle Spektrometresi Dönüşümü

Full Text
14,600 Views
09:38 min
November 26, 2013

DOI: 10.3791/50733-v

Cuong H. Le1,2, Jun Han1, Christoph H. Borchers1,2

1University of Victoria-Genome BC Proteomics Centre,University of Victoria, 2Department of Biochemistry and Microbiology,University of Victoria

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Ditranol (DT, 1,8-dihidroksi-9 ,10-dihydroanthracen-9-on) daha küçük moleküllerin doku görüntüleme için bir MALDI matris olarak bildirilmiştir; üzerinde endojen lipidlerin MALDI görüntüleme için DT kullanımı için protokoller Bir ultra çözünürlüklü kuadrupol-FTICR alet üzerinde pozitif iyon MALDI-MS tarafından doku kesitlerinin yüzey burada verilmektedir.

Bu prosedür, bir sığır lensi içinde çoklu endojen lipidleri mekansal olarak lokalize eder. Matris destekli lazer DESORPSIYON iyonizasyonu tekniğini kullanarak, kütle spektrometrik görüntüleme. İlk olarak, ince bir sığır lens dokusu kesiti hazırlayın ve bir çoklu matris uygulayın, ardından bir maldi kütle spektral veri seti elde edin.

Veri setini, lens dokusu bölümünde tespit edilen lipitlerin görsel bir temsiline dönüştürün. Bu sonuçlar birlikte, bir sığır merceği içindeki lipitlerin konumunu ve nispi bolluğunu belirleyebilir ve bu dağılımın görsel bir temsilini üretebilir Lipid ekstraksiyonu ve ardından LCMS analizi gibi diğer yöntemlerle karşılaştırıldığında, maldi kütle spektrometresi görüntüleme, uzamsal lokalizasyonlarını kaybetmeden aynı anda birden fazla lipitin görselleştirilmesine izin verir. Flaş donmuş doku örneklerini eksi 80 santigrat derece saklama alanından çıkarın.

Bütün bir sığır buzağı lens bölümünü sabitlemek için kapsülü lensin yüzeyinden çıkarın. Bir kriyostatın doku kesme aşamasına bir veya iki damla su koyun. Kriyostat optimum sıcaklığa dengelendiğinde lensi katılaşmadan önce hızlı bir şekilde suya yerleştirin.

Dokuyu ekvatoral olarak 20 mikron kalınlığında bölümler halinde kesin. İlk doku kesitlerini atın ve oküler lens dokusunu görüntülemek için yalnızca ekvator düzlemine yakın veya ekvator düzlemine ek dilimler kullanın. ITO kaplı bir cam slaytın yüzeyini önceden ıslatmak için 1,5 mikrolitre formik asit ekleyin.

Daha sonra doku bölümlerini dikkatlice kriyostatın içindeki slayta aktarın. Ardından, maldi matris uygulamasından önce slaytları 15 dakika liyofilize edin. Bir düzeltme sıvısı kalemi kullanarak, ITO kaplı cam sürgünün iletken olmayan yüzeyine üç öğretme işareti ekleyin.

Şimdi düz yataklı bir tarayıcı kullanarak doku slaytının optik bir görüntüsünü alın ve TIFF veya jpeg gibi uygun bir formatta kaydedin. İlk olarak, ITO kaplı cam slaytların ön yüzeyindeki kenarları, matrisin sürgünün kenarlarını kaplamaması için bantla örtün. Kullanılacak matrisi uygun bir çözücü içinde hazırlayın.

Daha sonra doku bölümlerinin yüzeylerine matris çözeltileri uygulayın. 20 döngü matris kaplama kullanarak cam sürgüyü kaplayın. Alternatif olarak, bir çözücünün elektronik matris püskürtücü ile uyumlu olmaması durumunda matrisleri uygulamak için pnömatik destekli bir airbrush püskürtücü kullanılabilir.

Kütle kalibrasyon çözeltisi için, ES ayar karışımı standart çözeltisini %60'ta bir ila 200 kat oranında seyreltin İzopropanol, seyreltilmiş ES ayar karışımı çözeltisinin dakikada iki mikrolitresini, dört A dönüşüm iyon siklotron rezonansı MS için cihaz üzerindeki çift modlu elektro sprey iyonizasyon iyon kaynağına sokun. F-T-I-C-R cihazını, geniş bant algılama ve 1024 kilobaytlık bir veri toplama boyutu ile pozitif iyon ESI modunda çalıştırın Saniye. Tipik olarak 3.900 volt kılcal elektro püskürtme voltajının ESI parametrelerini ayarlayın.

3.600 voltluk bir sprey kalkanı voltajı nebulizatör azot gazı dakikada iki litre akar. Kuru nitrojen gazı dakikada dört litre ve 200 santigrat derece sıcaklıkta akar. Ayrıca skimmer bir voltajı 15 volta ayarlayın.

Uçuş süresi 0.01 saniye, çarpışma argon gazı akışı saniyede 0.4 litre, kaynak iyon biriktirme süresi 0.1 saniye ve çarpışma hücresi iyon biriktirme süresi 0.2 saniye. Şimdi, kütle ile yük oranı 200 ila 1400 arasındaki kütle aralığında analitik hassasiyeti en üst düzeye çıkarmak için F-T-I-C-R çalışma parametrelerini ayarlayın ve aynı zamanda iyi zaman alanı içermeyen indüksiyon bozunma sinyallerini koruyun. Ardından ESI kütle spektrumlarını edinin ve E es tuning mix solüsyonundaki standart bileşiklerin referans kütlelerini kullanarak cihazı kalibre edin.

Cihazı MALDI işlemi için ayarlamak için, karışık bir turin ve INE standart çözeltisinin birkaç mikrolitrelik alikotunu matris çözeltisi içinde her biri bir Mikromolar konsantrasyonda çözün ve bu çözeltileri doğrudan numune dokusu bölümlerinden birine yerleştirin. Sürgüyü bir doku sürgü adaptörüne yerleştirin ve adaptörü MALDI tarafından çift ESI maldi iyon kaynağına yükleyin. Ardından, lazer gücü için uygun MALDI çalışma parametrelerini ve her toplu tarama için MALDI sinyal birikimi için lazer atışlarının sayısını optimize edin.

Cihazı maldi MSI deneyleri için ayarladıktan, kalibre ettikten ve optimize ettikten sonra, görüntülenecek bir doku bölümünün fiziksel konumunu, görüntüleme yazılımında kaydedilen optik görüntüsüyle hizalayın. Üç noktalı üçgenleme yöntemi kullanarak üç düzeltme sıvısı işaretini hizalayın. Ardından, her bir kütle spektrumunun, edinim sonrası dahili kütle kalibrasyonu için E ES ayar karışımı çözeltisinin referans kütle tepe noktalarını içermesi için eşzamanlı bir ESI MALDI işlemine başlayın.

İlk olarak, MALDI sinyalleri spektrumlara hakim olana kadar kılcal voltajı azaltarak ESI sinyalini zayıflatın, ESI kalibre sinyalleri dahili kütle kalibrasyonu için hala yeterince yüksekken. Ardından, radyasyon lazeri için otomatik bir rasing yöntemi ayarlayın. Rastgele nokta analizi kullanma.

Görüntülenecek doku bölgelerini tanımlayın ve uygun lazer RA adım boyutunu ayarlayın. İlk karşılaştırma için dahili kalibrasyonu kullanarak MALDI kütle spektrumlarını kalibre edin ve MSMS de izotopu için tepe noktalarını seçin ve özelleştirilmiş bir VBA komut dosyası kullanarak mono izotopik tepe noktalarını seçin ve elde edilen mono izotopik tepe listelerini dışa aktarın. Kütüphane girişleriyle kütle eşleştirmesi için ölçülen kütle / yük oranı değerlerini Melin nine ve/veya HMDB metabolom veritabanlarına girin.

Daha sonra, tepe tepesinde milyonda bir parça kütle filtresi genişliğine sahip bir görüntüleme yazılımı kullanarak tüm doku bölümü boyunca tespit edilen tüm lipid varlıkları için maldi görüntüleri oluşturun. Veritabanı girişleriyle eşleşen tüm kütle / yük oranı değerleri için görüntüler oluşturulduktan sonra, sığır lensi gibi bazı belirli dokular için daha sonra araştırılabilecek benzersiz dağılım modellerini aramak için diğer tüm tepe noktaları için de görüntüler oluşturur. Doğrudan çözülme montajı kullanıldığında dokunun geniş yırtılması sıklıkla gözlenir.

IT OAS slaytının etanol veya formik asit içeren preco'su, doku montajı sırasında doku bölümlerinin bütünlüğünün korunmasına yardımcı olur. Hem matris seçimi hem de çözücü seçimi, MALDI spektrumlarının kalitesini etkileyen önemli faktörlerdir. Bu örnekler, verimli bir matris çözücü ile üretilen bir spektrumu, diol için zayıf bir matris çözücü seçimi ile karşılaştırır.

Bir Maldi MSI deneyinden elde edilen kütle spektrumları seti elde edildikten sonra, tespit edilen iyonların her biri için görüntü oluşturulabilir. Her piksel, bir doku bölümünün yüzeyinden bir lazer ışınlama noktasını temsil eder. Analitlerin nispi konsantrasyonları, doku bölümünün farklı bölümlerinde detaylandırılabilir.

Çoğu deneyde, veriler her spektrumdaki toplam iyon akımını normalleştirir. Daha iyi analit matrisine sahip bu normalleşme alanları olmadan, COC kristalleşmesi analitler için daha güçlü sinyallere neden olabilir ve bu da verileri çarpıtabilir. Doku hazırlığı, oluşturulan görüntüyü de önemli ölçüde değiştirebilir.

Numune çok ıslaksa, analitler doku üzerinde delokalize olacak ve uzamsal bilgilerin çoğu kaybolacaktır. Oküler lens üzerinde bir doku görüntüleme deneyinin bu gösterimi, lipitlerin F-T-I-C-R-M-S ile uzamsal dağılımını belirlemek için çoklu Matrixx olarak diol kullandı. Farklı doku tiplerindeki lipitlerin görüntülenmesi, benzer şekilde diol veya başka bir matris kullanılarak gerçekleştirilebilir.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Temel Protokol Sayı 81 göz moleküler görüntüleme kimya teknikleri analitik kütle spektrometrisi matris destekli lazer desorpsiyon / iyonizasyon (MALDI) tandem kütle spektrometresi yağ doku görüntüleme sığır lens ditranol matris FTICR (Fourier Dönüşümü iyon Cyclotron Rezonans)

Related Videos

Uçuş lazer desorpsiyon / iyonizasyon zaman sağlam proteinler (MALDI-TOF) kütle spektrometrik analizi Matris destekli daha büyük 100 kDa

07:49

Uçuş lazer desorpsiyon / iyonizasyon zaman sağlam proteinler (MALDI-TOF) kütle spektrometrik analizi Matris destekli daha büyük 100 kDa

Related Videos

81.8K Views

MALDI Görüntüleme Kütle Spektrometre Rat Beyin Dokusu içinde gangliositler Saptanmasında ve Görselleştirme DAN Matrix Sublime

08:36

MALDI Görüntüleme Kütle Spektrometre Rat Beyin Dokusu içinde gangliositler Saptanmasında ve Görselleştirme DAN Matrix Sublime

Related Videos

11.4K Views

Matris ile sentetik polimerler karakterizasyonu Lazer Desorpsiyon iyonlaşma zaman uçuş (MALDI-TOF) kütle spektrometresi destekli

06:56

Matris ile sentetik polimerler karakterizasyonu Lazer Desorpsiyon iyonlaşma zaman uçuş (MALDI-TOF) kütle spektrometresi destekli

Related Videos

26.2K Views

Amiloid β mevduat matris yardımlı lazer desorpsiyon/iyonlaşma kütle spektrometresi Imaging ile insan beynindeki görselleştirme

09:31

Amiloid β mevduat matris yardımlı lazer desorpsiyon/iyonlaşma kütle spektrometresi Imaging ile insan beynindeki görselleştirme

Related Videos

11.1K Views

Matris yardımlı Lazer Desorpsiyon/iyonlaşma kütle spektrometresi karbonhidrat iyon sinyalleri geliştirmek için bir verimli örnek hazırlama yöntemi

07:12

Matris yardımlı Lazer Desorpsiyon/iyonlaşma kütle spektrometresi karbonhidrat iyon sinyalleri geliştirmek için bir verimli örnek hazırlama yöntemi

Related Videos

7.5K Views

Matris Destekli Lazer Desorpsiyon/İyonizasyon Kütle Spektrometrisi Görüntüleme Kullanarak Drosophila Beyinde Hızlı Lipid Analizi için Örnek Hazırlama

09:00

Matris Destekli Lazer Desorpsiyon/İyonizasyon Kütle Spektrometrisi Görüntüleme Kullanarak Drosophila Beyinde Hızlı Lipid Analizi için Örnek Hazırlama

Related Videos

3.7K Views

Enfeksiyon Sırasında Agar ve Dokuda Yetişen Bakteri Kolonilerinin Görüntüleme Kütle Spektrometrisi Analizi Yoluyla Mikrobiyal İşbirliğinin İncelenmesi

09:49

Enfeksiyon Sırasında Agar ve Dokuda Yetişen Bakteri Kolonilerinin Görüntüleme Kütle Spektrometrisi Analizi Yoluyla Mikrobiyal İşbirliğinin İncelenmesi

Related Videos

2.7K Views

Değişen Dispersite ve Uç Gruplara Sahip Sentetik Polimerlerin Karakterizasyonu için MALDI-ToF MS Yöntemi

06:16

Değişen Dispersite ve Uç Gruplara Sahip Sentetik Polimerlerin Karakterizasyonu için MALDI-ToF MS Yöntemi

Related Videos

1.6K Views

MALDI Numune Hazırlama: Ultra İnce Tabaka Yöntemi

05:28

MALDI Numune Hazırlama: Ultra İnce Tabaka Yöntemi

Related Videos

20K Views

İnsan DNA Onarım Proteinler Genetik Araştırmalar Maya Model Sistemi olarak kullanma

14:09

İnsan DNA Onarım Proteinler Genetik Araştırmalar Maya Model Sistemi olarak kullanma

Related Videos

18.5K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code