Tomoauto kullanma: Bir Protokol Yüksek verim Otomatik Cryo-elektron Tomografi için

Bu prosedürün genel amacı, kullanıcıların kriyo-elektron tomografisinin yüksek verimli bir toplama ve işleme boru hattı oluşturmasına yardımcı olmaktır. Bu yöntem, kriyo-elektron tomografisi alanındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir, örneğin: yeni nesil dedektörlerle toplanan verileri nasıl işleyebilirim ve otomatik eğim serisi toplama yazılımı tarafından üretilen büyük miktarda veriyi nasıl işleyebilirim? Bu tekniğin ana avantajı, kullanıcının otomatik eğim serisi işleme için verimli bir boru hattı bulmak için birden fazla yazılım paketini birleştirici bir şekilde yapılandırabilmesi ve tomogram analizine daha fazla zaman harcanmasına olanak sağlamasıdır.

Genel olarak, cryo-ET'ye yeni başlayan bireyler mücadele edecektir çünkü elektron mikroskobundan üretilen büyük verileri işlemek için birçok sıkıcı adım gereklidir. Bu gelişme fikri ilk olarak beş yıl önce, bir bakterinin 3D rekonstrüksiyonunu elde etmek için yüzlerce adımı manuel olarak geçmek zorunda kaldığımızda aklımıza geldi. Önceden, Shigella flexneri mini hücrelerinin hazırlanmasına ilişkin metin protokolüne bakın.