Name: Morfogenetik dinamiklerini analiz ve hücre iskeleti düzenleyiciler ciro sağlayan Embriyolardan teknikleri (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-05-12T15:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 52 s
Description: Öğrenin hücre göçünde protein dinamiklerini incelemek için FRAP ve fotoaktivasyon tekniklerini kullanarak sitoskelet düzenleyicilerinin davranışlarını B16-F1 ve NIH 3T3 hücrelerinde gerçek zamanlı izleme yöntemlerini.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Alman Araştırma Vakfı (DFG) için mali destek (grant Nr. RO2414/5-1 KR olarak) için sana şükrediyoruz.

<ol><li>Day, R. N., Davidson, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+fluorescent+protein+palette%3A+tools+for+cellular+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Chem+Soc+Rev%22%5BJournal%5D)">The fluorescent protein palette: tools for cellular imaging.</a> Chem Soc Rev. 38 (10), 2887-2921 (2009).</li>
<li>Ishikawa-Ankerhold, H. C., Ankerhold, R., Drummen, G. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advanced+fluorescence+microscopy+techniques--FRAP%2C+FLIP%2C+FLAP%2C+FRET+and+FLIM%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Advanced fluorescence microscopy techniques--FRAP, FLIP, FLAP, FRET and FLIM.</a> Molecules. 17 (4), 4047-4132 (2012).</li>
<li>Koestler, S. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Arp2%2F3+complex+is+essential+for+actin+network+treadmilling+as+well+as+for+targeting+of+capping+protein+and+cofilin%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Arp2/3 complex is essential for actin network treadmilling as well as for targeting of capping protein and cofilin.</a> Mol Biol Cell. 24 (18), 2861-2875 (2013).</li>
<li>Steffen, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rac+function+is+crucial+for+cell+migration+but+is+not+required+for+spreading+and+focal+adhesion+formation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Rac function is crucial for cell migration but is not required for spreading and focal adhesion formation.</a> J Cell Sci. 126, Pt 20 4572-4588 (2013).</li>
<li>Lai, F. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Arp2%2F3+complex+interactions+and+actin+network+turnover+in+lamellipodia%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Arp2/3 complex interactions and actin network turnover in lamellipodia.</a> EMBO J. 27 (7), 982-992 (2008).</li>
<li>Dimchev, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficiency+of+lamellipodia+protrusion+is+determined+by+the+extent+of+cytosolic+actin+assembly%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Efficiency of lamellipodia protrusion is determined by the extent of cytosolic actin assembly.</a> Mol Biol Cell. 28 (10), 1311-1325 (2017).</li>
<li>Koppel, D. E., Axelrod, D., Schlessinger, J., Elson, E. L., Webb, W. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamics+of+fluorescence+marker+concentration+as+a+probe+of+mobility%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Dynamics of fluorescence marker concentration as a probe of mobility.</a> Biophys J. 16 (11), 1315-1329 (1976).</li>
<li>Patterson, G. H., Lippincott-Schwartz, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+photoactivatable+GFP+for+selective+photolabeling+of+proteins+and+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">A photoactivatable GFP for selective photolabeling of proteins and cells.</a> Science. 297 (5588), 1873-1877 (2002).</li>
<li>McKinney, S. A., Murphy, C. S., Hazelwood, K. L., Davidson, M. W., Looger, L. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+bright+and+photostable+photoconvertible+fluorescent+protein%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">A bright and photostable photoconvertible fluorescent protein.</a> Nat Methods. 6 (2), 131-133 (2009).</li>
<li>Gurskaya, N. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Engineering+of+a+monomeric+green-to-red+photoactivatable+fluorescent+protein+induced+by+blue+light%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Engineering of a monomeric green-to-red photoactivatable fluorescent protein induced by blue light.</a> Nat Biotechnol. 24 (4), 461-465 (2006).</li>
<li>Lippincott-Schwartz, J., Patterson, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Photoactivatable+fluorescent+proteins+for+diffraction-limited+and+super-resolution+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Photoactivatable fluorescent proteins for diffraction-limited and super-resolution imaging.</a> Trends Cell Biol. 19 (11), 555-565 (2009).</li>
<li>Kremers, G. J., Piston, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Photoconversion+of+purified+fluorescent+proteins+and+dual-probe+optical+highlighting+in+live+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Photoconversion of purified fluorescent proteins and dual-probe optical highlighting in live cells.</a> J Vis Exp. (40), (2010).</li>
<li>Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21356831">Preparation of slides and coverslips for microscopy.</a> CSH Protoc. 2008, 4988(2008).</li>
<li>Small, J. V., Rottner, K. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/book/10.1007/978-90-481-9301-1">Actin-based Motility</a>. Carlier, M. F. , Springer. Dordrecht. (2010).</li>
<li>Kaverina, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Enforced+polarisation+and+locomotion+of+fibroblasts+lacking+microtubules%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Enforced polarisation and locomotion of fibroblasts lacking microtubules.</a> Curr Biol. 10 (12), 739-742 (2000).</li>
<li>Small, J., Rottner, K., Hahne, P., Anderson, K. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualising+the+actin+cytoskeleton%5BTitle%5D)+AND+%22Microsc+Res+Tech%22%5BJournal%5D)">Visualising the actin cytoskeleton.</a> Microsc Res Tech. 47 (1), 3-17 (1999).</li>
<li>Mikhailov, A. V., Gundersen, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Centripetal+transport+of+microtubules+in+motile+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Motil+Cytoskeleton%22%5BJournal%5D)">Centripetal transport of microtubules in motile cells.</a> Cell Motil Cytoskeleton. 32 (3), 173-186 (1995).</li>
<li>Rottner, K., Behrendt, B., Small, J. V., Wehland, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((VASP+dynamics+during+lamellipodia+protrusion%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">VASP dynamics during lamellipodia protrusion.</a> Nat Cell Biol. 1 (5), 321-322 (1999).</li>
<li>Svitkina, T. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanism+of+filopodia+initiation+by+reorganization+of+a+dendritic+network%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Mechanism of filopodia initiation by reorganization of a dendritic network.</a> J Cell Biol. 160 (3), 409-421 (2003).</li>
<li>Small, J. V., Isenberg, G., Celis, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Polarity+of+actin+at+the+leading+edge+of+cultured+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Polarity of actin at the leading edge of cultured cells.</a> Nature. 272 (5654), 638-639 (1978).</li>
<li>Dang, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inhibitory+signalling+to+the+Arp2%2F3+complex+steers+cell+migration%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Inhibitory signalling to the Arp2/3 complex steers cell migration.</a> Nature. 503 (7475), 281-284 (2013).</li>
<li>Anderson, K. I., Cross, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Contact+dynamics+during+keratocyte+motility%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Contact dynamics during keratocyte motility.</a> Curr Biol. 10 (5), 253-260 (2000).</li>
<li>Burnette, D. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+role+for+actin+arcs+in+the+leading-edge+advance+of+migrating+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">A role for actin arcs in the leading-edge advance of migrating cells.</a> Nat Cell Biol. 13 (4), 371-381 (2011).</li>
<li>Humphries, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clathrin+potentiates+vaccinia-induced+actin+polymerization+to+facilitate+viral+spread%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Host+Microbe%22%5BJournal%5D)">Clathrin potentiates vaccinia-induced actin polymerization to facilitate viral spread.</a> Cell Host Microbe. 12 (3), 346-359 (2012).</li>
<li>Riedl, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lifeact%3A+a+versatile+marker+to+visualize+F-actin%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Lifeact: a versatile marker to visualize F-actin.</a> Nat Methods. 5 (7), 605-607 (2008).</li>
<li>Kage, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FMNL+formins+boost+lamellipodial+force+generation%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">FMNL formins boost lamellipodial force generation.</a> Nat Commun. 8, 14832(2017).</li>
<li>Peckham, M., Miller, G., Wells, C., Zicha, D., Dunn, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Specific+changes+to+the+mechanism+of+cell+locomotion+induced+by+overexpression+of+beta-actin%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Specific changes to the mechanism of cell locomotion induced by overexpression of beta-actin.</a> J Cell Sci. 114, Pt 7 1367-1377 (2001).</li>
<li>Salmon, E. D., Waterman, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+we+discovered+fluorescent+speckle+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">How we discovered fluorescent speckle microscopy.</a> Mol Biol Cell. 22 (21), 3940-3942 (2011).</li>
<li>Machan, R., Wohland, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+applications+of+fluorescence+correlation+spectroscopy+in+live+systems%5BTitle%5D)+AND+%22FEBS+Lett%22%5BJournal%5D)">Recent applications of fluorescence correlation spectroscopy in live systems.</a> FEBS Lett. 588 (19), 3571-3584 (2014).</li>
<li>Becker, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+lifetime+imaging--techniques+and+applications%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microsc%22%5BJournal%5D)">Fluorescence lifetime imaging--techniques and applications.</a> J Microsc. 247 (2), 119-136 (2012).</li>
</ol>

Yazarlar ifşa gerek yok.

Burada bu makale ve nasıl onlar farklı deneysel koşullarda uygulama için optimize açıklanan teknikleri kritik adımları tartışmak.
Mikroenjeksiyon hücrelerde tanıtan eksojen proteinler, inhibitörleri veya uyuşturucu üzerinden anlık etkilerini izlemek için uygulanan bir yöntemdir. Proteinler arasında zor işlevlerini belirlemek için özellikle yararlı olabilir hücre tipleri transfect için ya da uzun vadeli ifade değil istendiğinde durumlarda. Hayatta kalma belirli hücre tiplerinin üzerinde seribaşı hücre dışı matriks bağlı olarak değişir dikkat edilmelidir. En endotel, epitelyal veya fibroblast benzeri hücre tipleri, hatta küçük olanlar (bkz: Dang vd. balık keratocytes gibi. 21 ve Anderson ve çapraz22) başarılı bir şekilde enjekte edilebilir. Ancak, hücre göç bir mükemmel model sistemi oluşturur, ancak bilinmeyen bir nedenle bu tür terkedilemeyen bir enjeksiyon ile uyumsuz laminin üzerinde seribaşı B16-F1 hücreleri gibi özel durumları vardır. NIH3T3 fibroblast hücreler için düzenli olarak enjeksiyonları fibronektin terkedilemeyen ve ek photomanipulation teknikleri sıkı BAĞLAMAK (hatta photoactivation ile; B16-F1 hücrelerin burada gösterilen) gibi eşit derecede iyi bu fibroblastlar (bkz: gerçekleştirilebilir gerçekleştiriyoruz Örneğin, Köstler vd. 3). aynı zamanda işlevsel özellikleri ve deney hedeflerine göre farklı proteinler zaman saniye arasında değişen saat için değişiklikler neden farklı miktarda sürebilir kabul gerekir. Bir teknik eksojen Ajan dozaj/konsantrasyonu daha doğru daha örneğin, tek hücre düzeyinde plazmid transfection kullanırken denetlenebilir avantajdır. Buna ek olarak, bir protein flüoresan etiketleme eşzamanlı çok kanallı görselleştirme fluorescently öğesini diğer proteinlerin gerekliyse esneklik artırabilir hücrenin varlığını güvence altına almak için bir zorunluluk değil. Mikroenjeksiyon anlık etkileri spesifik proteinlerin veya protein karışımları hücre morfolojisi veya (Örneğin, Dang ve ark. sitoiskeleti dinamik değişiklikler üzerinde analiz etmek için özellikle yararlı olabilir 21 Arp2/3 karmaşık inhibitörü Arpin tarafından geçiş anında efektleri bir örneğin). Teknik hücre hasarı çıkarabilir veya hücre morfolojisi etkilemek onun invasiveness dezavantajdır. Bu nedenle, önemli bir göz microinjections işlemi sırasında hücre canlılığı izlemektedir. Burada tanıtılan yöntem üzerinde el ile işleme dayanıyor. Fibroblastlar fibronektin terkedilemeyen üzerinde büyüyen gibi başarılı enjeksiyonları ile uyumlu olacak şekilde test koşullarında bir çevre % 100 başarı oranı burada açıklanan el ile enjeksiyon Protokolü sağlar; Bu yaklaşım video mikroskobu veya sıkı BAĞLAMAK, daha önce yayımlanmış3olarak da dahil olmak üzere karmaşık ve zaman alıcı izleme denemeleri ile birleştirirken esastır. Bu arada sırada dışlamaz, tek tek hücreler güvenli bir şekilde ani değişiklikler, kontrast çekirdeği ve sitoplazma hücre kenar retraksiyon tarafından takip, kabul edilebilir bir mikroenjeksiyon olay muzdarip. Bu tür deneysel nadiren hariç ve böylece daha fazla analizler için kabul edilmez.
Ancak, bir yarı-otomatik yaklaşım da yaygın, örneğin hızlı istihdam kullanılır (< 300 ms) iğne sadece ilgili önce her hücrenin üstündeki konumlandırılmış olması böylece makine kontrollü iğne enjeksiyon basınç artışı ile çakışık düşürücü enjeksiyon. Tanımı sadece yukarıda açıklanan el ile bir yaklaşım daha alt tarafından yarı-otomatik enjeksiyon başarı oranı olduğunu hız için optimize edilmiştir çünkü başarıyla bu tedavi; hayatta birden çok hücre analizi tarafından takip Böylece tek bir hücre başarılı enjeksiyon dayanmaz. Bu nedenle, tek hücre analizi aksine, yarı-otomatik enjeksiyon daha birkaç yüz hücreleri, Örneğin, video mikroskobu düşük büyütmede veya hücre fiksasyon ve boyama üzerine tarafından enjeksiyon etkilerini çözümlemek için uygundur. İstihdam detaylı yaklaşım ne olursa olsun mikroenjeksiyon bir son nokta tahlil anlamına gelmez, ama teknikleri sıkı BAĞLAMAK veya photoactivation3de dahil olmak üzere, çeşitli ile kombine edilebilir.
Sıkı BAĞLAMAK tarafından protein Ciro oranı belirlerken, lazer yoğunluğunu, mikroskop kurulum ve görüntüleme koşullarına bağlı olarak optimize edilmiş olması gerekir (büyütme, hedefleri, vb, yanı sıra hücre tipi, yapısı ve floresan protein photobleaching). En iyi lazer güç, etkili beyazlatma ile en olası duyarlilik, büzülme önlemek veya geri çekme analizi (Örneğin, lamellipodia veya filopodia) veya hücresel düzeyde bile zarar altında yapısının tamamlamak için birleştirilmiştir olduğunu unutmayın. Tam beyazlatma göre hangi durumda, % 50 üstünde bir şey de kabul edilebilir olabilir protein, son derece hızlı cirosu engel, ancak ideal olarak, en az 70-%80 verimliliği ağartma, elde edilmelidir. En iyi beyazlatma güç verilen yapısı ve floresan boya için deneysel olarak test edilmelidir, bir düşük lazer güç başlayan tarafından aşamalı onun artış izledi. Tabii ki, herhangi bir floresan boya tanımı gereği ile lazer ışığı uyarma zirveye yakın ağartılmış (488 nm FITC veya EGFP gibi sık kullanılan yeşil boyalar için). Ancak, lazerler ile UV yakınındaki lazerler gibi daha kısa dalga boyları daha büyük güce teslim ve böylece aynı zamanda verimli yaygın olarak kullanılan Boyar maddeler beyazlatma için kullanılabilir. Biz rutin bir 405 nm diode lazer istihdam (120 mW) (ikinci veri gösterilmez) halinde de olsa biraz daha düşük verimlilik ile EGFP ve kırmızı floresan boyalar (örneğin mCherry), beyazlatma için. 405 nm diyot PA-GFP (aşağıya bakın) photoactivation için de kullanılabilir gibi maksimum esneklik ile bu sistem endows.
B16-F1 hücre yapıları ve floresan proteinler photobleached burada için 65-100 mW arasındaki 405 nm lazer güçler uygulandı. Photobleached bölge analiz ederken verilen yapı özgün şekli zaman dilimi üzerinde analiz korunup korunmayacağını dikkate almak önemlidir. Lamellipodia eğimi önemli ölçüde zaman içinde değişmiş olup olmadığını analiz bölgesi/kontur yoksa eğriliği değişimler yanlış sonuçlara neden Örneğin, ciro lamellipodia ucunda proteinlerin analiz ederken bakım alınmalıdır tam olarak ölçülen her çerçeve yapısında tamamını kapsayacak. Buna ek olarak, lamellipodia, microspikes gibi içine gömülü demetleri floresan yoğunluğu sapmalar neden olabilir unutulmamalıdır. Şekil 2b (9 s süre içinde beyaz ok) gösterildiği gibi microspike benzeri yapıda ölçülen photobleached bölgesi yanındaki yer almaktadır ama kişiliğiniz dışarıdaki kişiliğinizden ölçüm süresi kalır ve böylece herhangi bir neden olmaz yanlışlık. Protein ciro analizi için onların Floresans zaman içinde önemli ölçüde hücre morfolojisi veya faktörler değişiklikleri diğer--dan sert önlemek için akıttıkları ki konumunu ve boyutunu seçme bölgeleri analiz zaman önemli konusu önem taşır satın alma photobleaching. Örneğin, çözümlenen yapısı önemli kantitatif katkı sağlayan yapıları çözümlemesi sırasında dışarı ölçülen bölge taşımamalısınız; Ayrıca, ilgisiz, floresan varlıklar protein çekmek veziküler yapıları gibi ilgilendiğiniz alanı Çözümleme sırasında girmeniz gerekir değil. Bu güçlü sonuçlarının doğruluğunu etkileyecek gibi lamellipodial aktin polimerizasyon hızı belirlemek için hiçbir geri veya karıştırmaktan (yukarı katlanırYani ) lamellipodia olduğunu analiz, özen gösterilmelidir. Buna ek olarak, lamellipodial bölgelerin retraksiyon hızlı arkadaki translocation görünebilir potansiyel olarak lamellipodial aktin polimerizasyon oranları tahmindi için lider. Bir ek dikkate (edinme photobleaching düzeltilmesi için başvuru pozisyon olarak alınan) hücre içi normalleştirme bölgeler photobleaching, gerçek konumdan hangi-meli var olmak doğrudan önlemek için büyük mesafesindedir photobleached alanına göre etkiler.
PA GFP öğesini yapıları photoactivation için optimal koşullar kadar ayarlarken, anlık photoactivation sırasında ağartma önlemek için özen gösterilmelidir. Çalışmamızda, lazer güçlerle en iyi sonuçlar elde 5 - 10 kat daha normalde EGFP beyazlatma için istihdam düşük. İçin resim alma photoactivated moleküllerin çekim hızı ve çerçeveler arasındaki zaman aralığını olmalı bölgeler ve photoactivated olmak için yapıları boyutunu göz önünde bulundurarak en iyi duruma getirilmiş ve analiz, photoactivated potansiyel hareketliliğini yanı sıra proteinler hücre altı başka konumlara. Floresans görüntüleme her türlü gelince, bakım hücre canlılık fizyolojik alakalı sonuçları elde etmek için önemlidir.
Prensip olarak, yeşil kırmızı photoconversion mEos veya Dronpa modelleri12 gibi floresan proteinlerin eşit derecede güçlü bir yöntem aşağıdaki dinamikler ve ciro lamellipodium gibi hücre altı yapıları kabul ettiğiniz anlamına gelir ( Örneğin, bkz: Burnette vd. 23). PA-GFP aksine ikinci yöntemin avantajı önce ve sonra dönüştürme, ortak bir ek kırmızı floresan protein hızlı gerek kalmadan iki ayrı renk ile protein dynamics takip imkanı olacaktır. Ancak, bizim ön deneyler, kontrast değişim ölçüde ve PA-GFP photoactivation elde floresan sinyal şiddeti belki yeşil kırmızı karşı üstün spektral özellikleri nedeniyle photoconverted probları ile karşılaştırıldığında daha büyük Floresan problar (veri gösterilmez). Her durumda, aktin filaman devir oranı, lamellipodia veya vaksinia virüs kaynaklı aktin kuyrukları gibi hücre kenar çıkıntılar ayrıntılı çalışmalar defa sadece PA-GFP türevleri5,6,24kullanarak yayınlanmıştır.
Photoactivation analiz etmek için hangi hücre bölge dikkate alınarak, çeşitli faktörler dikkate, hangi (aktin monomerleri sitozol etkinleştirme üzerine cep kenarında birleşme), burada gösterilen belirli örnekte kullanarak ele alınmıştır alınması gereken ama Kesinlikle benzer çeşitli bilimsel sorunlara yaygınlaştırılması. İlk olarak, ne zaman cytosolically photoactivated proteinler, örneğin, lamellipodial birleşme oranı ayrı deneysel koşullarda (Dimchev ve ark. içinde gösterildiği gibi ölçülür 6), sitozolik bölgeler ve uzaklıkları lamellipodial kenarlarına boyutları deneysel grupları arasında yakın olabilir. Photoactivating sitozolik bölgeler, hücre kalınlığı çekirdeğine yakın konumlarda büyük olduğunda bu dikkate almak önemlidir. Verilen bu proteinin aktif olması için dağıtım rastlanılmaması sitozol içinde dağıtılır daha kalın hücresel bölgeler aktive aktive protein, yüksek miktarda neden olabilir. Son olarak, ifade düzeyleri proteinin aktif olması için kesinlikle tek tek hücreleri son derece değişken olabilir. Konuları değişkenlik nedeniyle birleşme seviyeleri hücre etkinleştirme belirli bölgelerde üzerine elde edilen toplam Floresans göre başka bir yerindeki cytosolically aktif proteinlerin karşılaştırmak önemlidir.
Biz nasıl mikroenjeksiyon proteinler hücre morfolojisi üzerindeki etkilerini araştıran için bir araç olarak kullanılabilir ve bu güçlü indüksiyon fibroblast hücreleri microinjected ile NIH3T3 lamellipodial yapıların göstererek örneği tarif var küçük GTPazlar Rac1. Hücrelerdeki yara/WAVE3C-terminal WCA etki alanı ile microinjected Arp2/3 fonksiyonlu müdahale için bu tekniği daha önce başvurdum. Microinjected hücrelerdeki çeşitli parametreler sıkı BAĞLAMAK veya photoactivation gibi diğer deneyleri tarafından çözümlenebilir. Nasıl sıkı BAĞLAMAK ve photoactivation hücre altı dinamikleri ve aktin monomerleri hareketliliğini soruşturma için istihdam edilebilir anlatmıştık. Sıkı BAĞLAMAK grubumuz tarafından kullanılan gibi VASP, Abi, cortactin, cofilin, lamellipodia için yerelleştirme ve protein kapatma proteinlerin veya Fokal yapışıklıklar huzurunda bileşenlerinde ciro elucidating için ciro araştırmak için daha önce5 ve4sinyal Rac yokluğu. Ayrıca, aktin polimerizasyon oranları ölçme photobleaching EGFP öğesini β-aktin5tarafından yapılabilir ama alternatif yöntemler adlı biri yok. Lifeact25gibi hücresel aktin filamentleri etiketleme canlı hücre görüntüleme uyumlu probları tarafından görüldüğü gibi floresan inhomogeneities izlemek de istihdam6,26olabilir. Burada β-aktin overexpression, hangi artan hücre kenar çıkıntı ve geçiş yapabilir ve böylece potansiyel olarak özel tahlil veya deneysel soru ile müdahale önlenebilir olduğunu avantajdır (bkz: Örneğin, Kage vd. 26; Peckham vd. 27). Lifeact hücrelerdeki tarafından etiketli aktin filaman yapıların ağartma bilgiler sadece sonda ciro, böylece Ancak, Lifeact sonda ayrı bir dezavantajı onun hızlı açık/kapalı Kinetik aktin filamentleri için Binding kabul ettiğiniz anlamına gelir değil için bu25bağlar aktin filamentleri ciro ama. Floresan inhomogeneities izleme önce6,istihdam26 pratik bir uzlaşma sağlamak, Floresans speckles yaygın olarak kullanılan izleme çok benzer ipliksi içine hücre iskeleti dahil (bkz: Örneğin, somon ve Waterman28) yapıları, ama kullanmak için olabildiğince düz ön ve sıkı BAĞLAMAK EGFP öğesini F-aktin yapıları olarak kesin olmayabilir. Photoactivation tarafımızdan lamellipodia yanı sıra deneysel olarak ayarlanmış sitozolik F-aktin düzeyleri6bağlamında sitozol boyunca kabiliyeti çıkıntılı içine monomeric aktin birleşme oranlarının tahmin etmek için uygulanmıştır. Hareketlilik ve dağıtım proteinlerin incelenmesi sitozolik bölgeleri gibi nispeten geniş alanlardan elde edilen teknik yararlıdır. Ancak, dağıtım proteinlerin incelenmesi nispeten küçük photoactivated yapılardan türetilmiş; Örneğin, büyüme koniler aktif floresan moleküllerinin düşük sayılar, zayıf sinyaller ve duyarlılık eksikliği nedeniyle böylece zor olabilir. Photoactivation veya photoconversion floresan (yukarı bakın), potansiyel alternatif teknikleri ters photobleaching üzerinde uzak floresan moleküllerinin hareketliliği takip ederek takip yatırım Getirisi dışında tüm hücre dayanır sıkı BAĞLAMAK içerebilir Bu bölge. Teknik photoactivatable sürümleri proteinlerin overexpressing gerektirmez, ama her zaman potansiyel olarak istenmeyen yan etkileri duyarlilik gibi neden lazer gücünün normalden daha yüksek bir doza maruz içerecektir.
Açıkça, photoactivation ve sıkı BAĞLAMAK proteinler monomerleri, dimer veya hatta küçük reaksiyonlar hareket ediyor ve ek bağlama ortakları ile birlikte hareket ayırt edemez. Bu tür bilgileri yerine Floresans korelasyon spektroskopi teknikleri29 veya FLIM-perde30, alternatif olarak, elde edilebilir. Yine de, sıkı BAĞLAMAK ve photoactivation doğrudan yerel ve küresel protein dynamics hücrelerdeki protein faiz, hücre altı konumu veya okudu hücre tipi ne olursa olsun değerlendirmek için basit yaklaşım oluşturmaktadır.

Proteinler ve canlı hücreler diğer molekülleri kronolojik zamanmekansal dinamiklerini izleme hücre ve Moleküler Biyoloji alanında pek çok gerekli bir araç haline gelmiştir. Floresans mikroskobu teknikleri Floresans rezonans enerji transferi (FRET) ve (FRET-FLIM) görüntüleme FRET-floresan ömür boyu da dahil olmak üzere Gelişmiş veya sıkı BAĞLAMAK, Floresans kaybına photobleaching (fiske VURMAK) ve photoactivation gibi diğerleri izin zamansal ve mekansal protein-protein etkileşimler, konformasyon değişiklikleri izleme gibi Difüzyon kinetik ve yerelleştirme hücre1,2farklı proteinlerin belirlenmesi için. Sıkı BAĞLAMAK ve photoactivation teknikleri, özellikle, aktin sitoiskeleti ve hücre göç düzenleyiciler incelenmesi için yaygın olarak uygulanabilir. Bu teknikler tek başına veya mikroenjeksiyon3gibi ek Embriyolardan teknikleri ile birlikte uygulanabilir ve proteinlerin fluorescently etiketli ifade içerir. Onlar protein Derneği aktin zengini yapılarına Kinetik tahminine yer filopodia veya lamellipodia, Fokal yapışıklıklar4, proteinlerin ciro gibi hücre geçiş izin veya aktin ağlar5dallı. Ayrıca lamellipodial aktin polimerizasyon fiyatlar, sitozol, aktin filamentleri çıkıntılı olarak polymerizing için hücre altı aktin monomer translocation oranı içinde monomeric aktin dağılım değerlendirilmesi belirlenmesi olanağı lamellipodia6ve diğer parametreleri.
Sıkı BAĞLAMAK görselleştirme ve proteinler ilk olarak 1970'lerde Axelrod7tarafından geliştirilen canlı hücrede hareketliliğini miktarının bir yöntemdir. Faiz (ROI) fluorescently etiketli proteinler ile doldurulan bir hücrede bulunan bir bölge geçici bir lazer yüksek yoğunluk, bu bölgede mevcut bir verilen kısa dönemde fluorophore moleküllerinin ağartma neden yeterli maruz kalmaktadır. Fluorescently beyazlatma sırasında yatırım Getirisi dışında bulunan protein etiketli Ryslampa diffüz ve ağartılmış bölgeye bağlı olarak photobleached moleküller öteleme zamanla neden onların kronolojik zamanmekansal dynamics sızmak. Tabii onun devir hızı içinde sözde ağartılmış yapısı ilişkili ve ağartılmış bölgelerde Floresans kurtarma oranı boyutu ve belirli bir molekül Difüzyon oranı da dahil olmak üzere çeşitli faktörlere bağlıdır. Böylece, çözünür proteinler Floresans sıkıca odak yapışıklıklar gibi yapıları ile ilişkili proteinler ise Difüzyon yoluyla hızla ağartılmış ROI içinde kurtarma aracılık, onların Floresans kurtarma gibi-ecek-si olmak uzun ciro süreleri, hem yapısı ilişkili kesir protein ve ayrılma-dernek Kinetik çözünür kısmını Difüzyon üzerinde bağlıdır. Floresans kurtarma genellikle satın aldı ve floresan yoğunluğu öncesi çamaşır suyu başlangıç düzeyi ulaşılana kadar sayılabilir. Difüzyon tarafından doldurulan değiştiremiyor sözde hareketsiz kesir ait olduğu veya mobil oluşan moleküller çoğunluğu ile karşılaştırıldığında çok yavaş hesaplı Yenileyici ilk floresan yoğunluğu bir parçası, ancak, bu oluşmaz kesir. Protein Ciro oranı belirlemek için sıkı BAĞLAMAK eğrileri, Floresans kurtarma ölçüde zaman içinde temsil eden oluşturulur. Bu kurtarma eğrileri ortalama buçuk kat protein kurtarma hesaplanabilir. Eğri uygun ortalama sıkı BAĞLAMAK veri ve dolayısıyla matematiksel analizler oluşturarak, mobil kesir ortalama Ciro oranı bileşik moleküllerinin homojen bir nüfusun oluşturan veya bu oluşur anlamak mümkündür iki veya daha fazla altgrupları diferansiyel oranları teslim molekülleri. Kantitatif yaklaşımlar tarafından protein ciro oranları tahmin ek olarak lamellipodia bölgelerde photobleached kurtarma izleme da retrograd akışı, çıkıntı gibi lamellipodial motilite parametreleri doğru miktar için izin verebilirsiniz, ve aktin polimerizasyon oranları. Bu nedenle, sıkı BAĞLAMAK yaşam hücre yapıları içinde çeşitli parametreleri değerlendirmek için uygulanacak çok yönlü bir araç teşkil etmektedir.
Photoactivation Difüzyon ve proteinler veya belirlenmiş bir hücresel konumundan kaynaklanan molekül hareketliliğini izlemek için kullanılan bir yöntemdir. Tekniği kullanır, örneğin, bir değişken başlangıçta son derece maruz kalma üzerine arttırılması onun Floresans sağlar bir şekilde mutasyona Patterson ve Lippincott-Schwartz8tarafından geliştirilen vahşi tipi yeşil flüoresan protein (GFP), ultraviyole (UV) ışık (yaklaşık 400 nm; burada, 405 nm). Patterson ve arktarafından açıklandığı gibi., vahşi tipi GFP kromofor mevcut nüfus tarafsız fenoller ve yaklaşık 397 büyük Absorbans zirvesinde üretmek Anyonik phenolates olarak nm ve küçük bir 475, nm, anılan sıraya göre. Işınlama UV ışığıyla proteinin nüfus photoconversion, iyonik formu doğru kayması uğrar. 488 tarafından heyecanlı zaman nm, photoconverted/photoactivated protein Floresan, ayrım arasında aktif ve sigara-harekete geçirmek GFP yüksek iç arka plan Floresans nedeniyle uygulamada yetersiz içinde 3 kat artış gösteriyor. Ancak, arka plan yoğunluğu azalmasına GFP sıra (203 konumundaki histidin ikame) içine bir tek amino asit mutasyon getirerek elde edilmiştir. Elde edilen T203H mutant, photoactivatable-GFP (PA-GFP) bunun üzerine ışınlama UV ışığı ile neredeyse 100-fold 488 nm ışık tarafından daha sonra heyecanlı zaman artar küçük tepe Absorbans önemli bir azalma ile karakterize olarak da bilinir. Bu nedenle, overexpression PA GFP öğesini proteinlerin Difüzyon belirlenmesi ve motilite moleküllerin hücrenin sağlar yaygın olarak kullanılan bir yaklaşım olacaktır. Daha önce sadece keşif çıkıntılı içine onların hareketlilik sitozol, aynı zamanda onların birleşme oranı içinde izin PA GFP öğesini aktin aktin monomerleri sitozolik bölgeler, uzak dağılım oranını belirlemek için uyguladığınız lamellipodial aktin ağ6. Daha yeni edebiyat da prensip olarak benzer bir biçimde kullanılabilmesi için roman, fotoğraf-Cabrio proteinler açıklar ama zaten fotoğraf-dönüştürmeden önce görünür olmasını olası avantajı yataklık. Bu grubun floresan proteinlerin örnekler9,10,11,12Dendra2 ve mEos2.
Bu makalede, biz proteinlerin microinjecting hücrelerle metodolojisi açıklar. Daha ne kadar bu teknik ile sıkı BAĞLAMAK, photobleaching proteinlerin aktin sitoiskeleti yönetmelik ve hareketliliği, dahil tarafından birleştirilebilir ve nasıl sıkı BAĞLAMAK eğrileri ve yarı zamanlı mobil kesirler kurtarma elde edilebilir açıklamak. Buna ek olarak, biz ne kadar sıkı BAĞLAMAK teknik aktin polimerizasyon hızı lamellipodial ağlar için kullanılabilir bir örnek sağlar. Ayrıca yönergeleri ve monomeric aktin sitozolik hareketliliğini ve lamellipodia içine aktin şirketleşme oranları belirlemek için kullanılan photoactivation deneyler gerçekleştirmek ipuçları sağlar. Tabii ki, bu teknikleri değildir sadece sınırlı aktin sitoiskeleti bileşenleri izleme, ama potansiyel olarak gerekli orta adaptasyon veya en iyi duruma getirme üzerine, yaygın olarak diğer hücre tipleri için veya farklı proteinler, yapıları, araştırmak için uygulanabilir ve parametreleri.

<table><tbody><tr><td>B16-F1 fare derisi melanom hücreleri&nbsp;</td><td>Amerikan Tipi Kültür Koleksiyonu, Manassas, VA</td><td>CRL-6323</td><td></td></tr><tr><td>NIH-3T3 hücreleri</td><td>Amerikan Tipi Kültür Koleksiyonu, Manassas, VA</td><td>CRL-1658</td><td></td></tr><tr><td>DMEM 4.5g/L glikoz ve nbsp;</td><td>Yaşam Teknolojileri, Thermno Fisher Scientific, Almanya</td><td>41965-039</td><td></td></tr><tr><td>Jambon' s F-12 orta</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>N8641</td><td></td></tr><tr><td>Fetal baldır serumu&nbsp; (FCS)</td><td>PAA Laboratuvarları, Linz, Avusturya</td><td>A15-102</td><td></td></tr><tr><td>Fetal sığır serumu (FBS)</td> <td>Sigma-Aldrich, Almanya</td><td>F7524</td><td>Lot054M3396</td></tr><tr><td>MEM Esansiyel olmayan amino asitler ve nbsp;</td><td>Gibco, ThermoFisher Scientific, Almanya</td><td>11140035</td><td></td></tr><tr><td>L-Glumatin 200mM (100x)</td><td>Life Technolgies</td><td>25030-024</td><td></td></tr><tr><td>Pen-Strep 5000 U/mL</td><td>Yaşam teknolojileri</td><td>15070063</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum Piruvat (100 mM)</td><td>Gibco, ThermoFisher Scientific, Almanya</td><td>11360-039</td><td></td></tr><tr><td>Laminin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>L-2020</td><td></td></tr><tr><td>Laminin Kaplama Tamponu&nbsp;</td><td></td><td></td><td>Kendi kendine yapılan: 50mM Tris ph7.4, insan plazmasından 150mM NaCl</td></tr><tr><td>Fibronektin&nbsp;</td><td>Roche Diagnostik, Mannheim, Almanya</td><td>11 051 407 001</td><td></td></tr><tr><td>Jetpei</td><td>Polyplus Transfeksiyon, Illkirch, Fransa</td><td>101-10N</td><td></td></tr><tr><td>JetPei tampon</td><td>Polyplus Transfeksiyon, Illkirch, Fransa</td><td>702-50</td><td>150mM NaCl</td></tr><tr><td>PA-GFP-aktin plazmid DNA&nbsp;</td><td></td><td></td><td>Koestler ve ark.2008'de tanımlanmıştır</td></tr><tr><td>pEGFP-aktin plazmid DNA</td><td>Clontech, Mountain View, CA, ABD</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mikroenjeksiyon</td><td></td><td></td> için Rac1 proteini <td>GST etiketli versiyon olarak saflaştırılır ve enjeksiyondan önce GST'den ayrılır</td></tr><tr><td>Mikroenjeksiyon tamponu</td><td></td><td></td><td>Kendi kendine yapılan: 100mM NaCl, 50mM Tris-HCl ph7.5, 5mM MgCl2, 1mM DTT</td></tr><tr><td>Dekstran, Teksas Kırmızısı, 70.000 MW, Lizin Sabitlenebilir</td><td>Moleküler Problar, Thermno Fisher Scientific, Almanya</td><td>D1864</td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop dairesel kapak camları 15mm, No.1&nbsp;</td><td>Karl Hecht, Aisstent, Sondheim, Almanya</td><td>1001/15</td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf Femtotips Mikro Yükleyici</td><td>Uçları Eppendorf, Hamburg, Almanya</td><td>5242 956 003</td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf Femtotip Mikroenjeksiyon Kılcal Uçlar</td><td>Eppendorf, Hamburg, Almanya</td><td>930000035</td><td></td></tr><tr><td>Silikon Gres&nbsp;</td><td>ACC Silikonlar, Bridgewater, İngiltere</td><td>SGM494</td><td></td></tr><tr><td>Alüminyum Açık Elmas Banyosu Görüntüleme Odası</td><td>Warner instruments</td><td>RC-26</td><td></td></tr><tr><td>Otomatik sıcaklık kontrolörü</td><td>Warner Instruments</td><td>TC-324B</td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop: Axio Observer&nbsp;</td><td>Carl Zeiss, Jena, Almanya</td><td></td><td></td></tr><tr><td>CoolSnap-HQ2 fotoğraf makinesi&nbsp;</td><td>Fotometri, Tucson, AZ</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Lambda DG4 ışık kaynağı&nbsp;</td><td>Sutter Instrucment, Novato, CA</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Lazer kaynağı&nbsp;</td><td>Visitron Systems</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf FemtoJet mikroenjektör&nbsp;</td><td>Eppendorf, Hamburg, Almanya</td><td></td><td>Basınç beslemesi için dahili kompresör ile</td></tr><tr><td>Nikon Narishige Mikromanipülatör sistemi</td><td>Nikon Instruments, Japonya</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Visiview yazılımı v2.1.4</td><td>Visitron Systems, Puchheim, Almanya</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Metamorph yazılımı v7.8.10</td><td>Moleküler Cihazlar, Sunnyvale, CA</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sigma Plot v.12</td><td>Systat Yazılım A.Ş.</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

morfogenetik dinamiklerini analiz ve hücre iskeleti düzenleyiciler ciro sağlayan embriyolardan teknikleri

Micromanipulation Techniques Allowing Analysis of Morphogenetic Dynamics and Turnover of Cytoskeletal Regulators

Zamanmekansal dynamics proteinlerin incelenmesi çeşitli bağlamlarda fonksiyonel önemi ortaya çıkarabilir. Bu makalede, öyle sonra photobleaching (sıkı BAĞLAMAK) ve photoactivation teknikleri ele nasıl flüoresan kurtarma proteinler hücre altı yerlerde kronolojik zamanmekansal dinamiklerini incelemek için kullanılabilir. Biz de nasıl bu teknikler çeşitli parametreler aktin hücre iskeleti yönetmelik ve hücre hareketliliği için bağlı basit belirlenmesi olanaklı kılmak göstermek. Ayrıca, hücre mikroenjeksiyon Ayrıca (potansiyel olarak önceki veya söz konusu photomanipulation teknikleri tamamlayan) alternatif tedavi tetikleyici anlık etkileri translocated proteinler hücre için anlatılan morfoloji ve işlev. Embriyolardan protein enjeksiyon veya yerel uygulama plazma membran geçirgen uyuşturucu veya hücre iskeleti inhibitörleri gibi tedavisinde belirli bir hücre davranış tek hücre ve hücre altı üzerine hemen sonuçları kaydetmek için güçlü bir araç olarak hizmet verebilir düzeyi. Bu burada lamellipodial hücre kenar çıkıntı hemen indüksiyon tarafından rekombinant Rac1 protein, iğne ile bir çeyrek yüzyıl önce belirlenen örneklenir. Ayrıca, Gelişmiş yeşil flüoresan protein (EGFP) ciro belirlemek için bir protokol sağlar-VASP, belirgin B16-F1 hücrelerinin lamellipodial ipuçları biriken bir aktin filaman polimeraz sıkı BAĞLAMAK istihdam ve dahil olmak üzere ilgili veri analiz ve eğri uydurma. Ayrıca lamellipodial aktin ağ polimerizasyonu, oranları tahmin etmek için yönergeleri EGFP öğesini β-aktin ifade hücreleri tarafından olarak mevcut. Son olarak, nasıl aktin monomer hareketlilik photoactivation kullanılarak hızlı filaman derleme, lamellipodia, çıkıntılı ipuçları gibi sitelerde aktin birleşme tarafından takip hücre sitoplazma içinde oranları araştırmak talimatlar verilmiştir yaklaşıyor. Bu protokoller hiçbiri bileşenleri veya aktin sitoiskeleti düzenleyiciler için sınırlı, ama kolayca benzer moda kronolojik zamanmekansal dynamics ve çeşitli farklı hücre altı yapıları veya fonksiyonel proteinlerin işlevi keşfetmek için uzatılabilir bağlamlarda.

Şekil 1 g h faz kontrast görüntüleri önceden NIH3T3 fibroblast hücre ve bir küçük Rho-aile GTPazlar lamellipodia oluşumu karmaşık dalga ile etkileşimi yoluyla ikna yeteneğine sahip olan Rac1, 10 dk sonrası mikroenjeksiyon gösterir. Hücre ilk onun canlılığı ve Morfoloji, Örneğin, lamellipodia eksikliği onaylamak için mikroenjeksiyon (şekil 1g), daha önce görüntülenir. 10 dk sonrası mikroenjeksiyon, hücre açıkça bu tedaviden beklenen ve başarılı enjeksiyon (şekil 1h) gösterir morfolojisi, değişti.
Basitlik ve netlik için biz sonraki değil Ayrıca microinjected hücre analizi sıkı BAĞLAMAK ve photoactivation örnek sonuçları sağlar.
EGFP öğesini VASP lamellipodium ucundaki ciro analizi Şekil 2a-fiçinde gösterilir. VASP Ayrıca doğmakta olan ve odak yapışıklıklar, hücre iç18,19küçük ve uzatılmış noktalar hedefleyen unutmayın. Lamellipodial bölge, ucu açık bir VASP birikmesi ile floresan yoğunluğu ağartılmış ve öncesinde, sırasında ve lamellipodium ileri çıkıntı olarak beyazlatma sonra YG kontur takip ederek her zaman dilimi için ölçülen. Ağartılmış EGFP-VASP proteinler Kastarlamasız molekülleri bu sitelerdeki tarafından dönüştürülüyor gibi Floresans kademeli kurtarma (Şekil 2b) görülmektedir. Bu şekilde elde edilen ve (1 ifade edilir) öncesi çamaşır suyu yoğunluğu için normalleştirilmiş sıkı BAĞLAMAK kurtarma eğrisi Şekil 2cgörülebilir. Photobleaching verimliliği değişebilir ve değeri yaklaşık % 20, t0 değerinden belirlenen bu örnekte, beyazlatma daha önce yapıldı (photobleaching sonra ilk kare). Floresans artış ağartma önce Floresans kabaca % 80 gösterilen örnek bir plato ulaşır. Kurtarma hareketsiz kesir (Eğer, Şekil 2 ' deki kırmızı ok olarak tanımlandıktan sonra bir statik yapısı gibi Fokal adezyon deney saat süresince ön çamaşır suyu yoğunluğu ve Plato Floresans arasındaki farkı ulaştı c, e), Floresans miktarı arasında ağartma ve tam kurtarma zaman kurtarıldı, ancak olarak tanımlanır mobil kesir (yeşil çift başlı ok Şekil 2c, e). EGFP-VASP yoğunluğu buna bağlı Bilindiği gibi burada analiz lamellipodium ucu gibi bir dinamik olarak değişen yapısı, IF ölçüde sadece hareketsiz molekülleri temsil, ancak Ayrıca çıkıntı hızında azalma türetme yapıp yapmayacağınızı unutmayın parametre18. Yarı kurtarma hesaplamak için uygun bir eğri Sigma Arsa (Şekil 2d) üzerinde oluşturuldu. Bu durumda, Denklem 2 çözme çıkarılan "b" parametresinin değeri eşittir 0.0754 için hangi ne zaman Logaritmik fonksiyonu (Denklem 4) tahmini bir yarı-zamanlı sonuçlarını 9,19 kurtarılması uygulanan s (Şekil 2d , sağ paneli), hangi nispeten hızlı bu hücredeki belirli ortalama ile karşılaştırıldığında daha önce5yayımlanır. Kurtarma yarı-kez bazen önemli ölçüde hücre hücre aynı nüfus içinde değişebileceğini belirtmek gerekir. Bu nedenle, temsilci sonuçları elde etmek için en az 15-20 hücrelerden ortalama olarak bu parametre belirleme öneririz. Derece sapma aritmetik ortalamaları EGFP-VASP kurtarma için 15 hücrelerden ortalama olarak göstermek için her zaman-nokta vardı oluşturulan (Şekil 2e) ve oluşturulan ve benzer bir şekilde (Şekil 2 görüntülenen ortalama eğrisi uyuyor f).
Polimerizasyon hızı lamellipodial aktin ağının ileriye doğru ağ çıkıntı ve retrograd akışı toplamı oluşmaktadır. Sıkı BAĞLAMAK aktin polimerizasyon hızı EGFP öğesini β-aktin ve photobleaching çıkıntılı bir lamellipodial bölgesi (Şekil 2g) ile (Bu durumda B16-F1) transfecting hücreleri tarafından ölçmek için uygulanır. Lamellipodial aktin ağ polimerizasyon analiz için EGFP öğesini β-aktin ağartma üzerine Floresans kurtarma zaman içinde değerlendirilir. Aktin monomerleri ilerler (tüm hangi doğru açık20nokta) lamellipodial aktin filamentleri dikenli ucunda polimerizasyon ağ sürekli translocated rearwards ve ileri, ilerliyor hangi oranda kolayca olabilir mi Floresan photobleaching üzerine polarize kurtarılması sırasında elde edilen. En kısa zamanda ağartılmış bölge lamellipodium arka kısmı ve alt yoğunluğu daha fazla yatay düzenlenmiş filaman demetleri tarafından karakterize lamel arasındaki geçiş bölgesi ulaştı lamellipodium floresan Kurtarma tamamlandıktan Ne lamellipodium görülmektedir göre çok daha yavaş teslim. Şekil 2giçinde gösterildiği, Floresans kurtarma kenarı ve geriye doğru çıkıntı ve retrograd akışının (ayrı ayrı temsil edilen mesafeler ölçüm sağlar lamel doğru akan yatay bir çizgi olarak görüntülenmeyecektir Şekil 2g portakal ve kırmızı çift başlı ok olarak sağ panelinde sırasıyla).
Biz de photoactivation aktin monomerleri sitozol içinde hareketliliğini ve lamellipodia çıkıntılı içinde onların birleşme oranı izlemek için PA-GFP-aktin ile transfected B16-F1 hücrelerdeki başvurdum. Şekil 3a, bgösterildiği, sitozolik bir bölge 405 nm lazere maruz photoactivated, görüntüleri üzerinde GFP elde iken her 1.5 kanal s photoactivated aktin GFP Tagged with, dağıtım görüntülenmesi için. Photoactivated GFP-aktin şekil 3bsitozolik bölgede dışarı Difüzyon görülebilir. Floresan yoğunluğu photoactivated sitozolik bölge azalma oranı t0 ilk yoğunlukta yüzdesi olarak gösterilir (ilk çerçeve photoactivation sonra; Şekil 3 c). Photoactivated aktin aynı zamanda entegre lamellipodia, nerede yeni aktin monomerleri aktin filamentleri çıkıntı sırasında elongating büyüyen dikenli uçlarına eklenir ucunda. Lamellipodial birleşme oranını tahmin etmek için iki boyutlu bir kontur/bölgenin yaklaşık 5 mikron genişliği ve yüksekliği 1 µm zamanla floresan yoğunluğu şiddetindeydi; Bölge lamellipodium fırlamıştı olarak ipucu, sürekli yeniden konumlandırılmış. Aktin birleşme floresan yoğunluğu, t0 photoactivated sitozolik bölgesinin yüzdesi olarak temsil edilen (şekil 3d). Aktin filamentleri uzama ilerledikçe yeni aktin monomer lamellipodial ön tarafta dahil edilmiştir. Bu aktin monomerleri bir kısmını stochastically monomer photoactivated neredeydin sitozolik havuzdan elde edildi. Floresan lamellipodia ilk 20 içinde hızlı artış sonuçlanır s photoactivation sonra. Gibi yeni monomer lamellipodial ön, daha önce eklenen aktin monomerleri akışına filamentler lamel doğru retrograd akımını eklenmektedir. Zaman içinde yatırım Getirisini tamamen floresan monomerleri ile doldurulur ve floresan bir plato (şekil 3d) ulaşılır. Floresans kademeli bir düşüş sonra Difüzyon photoactivated monomerleri hücre boyunca ve takip zaman görülmektedir, photoactivated aktin monomerleri giderek lamellipodial önüne yeniden eklenmektedir. Bu azalma Floresans hücrenin tamamını photoactivated ve sigara photoactivated monomerleri arasında bir denge (veri gösterilmez) ulaşıldığında en kısa zamanda ulaşmak mümkün bir yeni Platosu, bulacaksınız.
Aktin monomerleri sitozol boyunca hareketliliğini Floresans yoğunluklarda klemple ( şekil 3bir renk kodlu bölgelerde etiketli tarafından üzerinde örneği photoactivated bölgesinden konumlandırılmış eşit büyüklükte bölgelerde ölçerek elde edildi R1-R5). Şekil 3egösterildiği, floresan yoğunluğu her bu bölgede uzak yavaş yavaş azalıyor cytosolically photoactivated bölgesi, photoactivated aktin monomerleri kesir olarak olur giderek seyreltilmiş ile aktif olmayan (Yani, sigara floresan) monomerleri. Ayrıca, daha sonra Floresans zirvesine ulaştı: daha uzak ölçülen photoactivated bölgesinden gelen bu bölgelere yaygın aktin monomer için gerekli uzun zaman bulunduğu bölgedir. Her bölge içine aktin monomer infiltrasyon derecesi için temsil edici bir değer yarı Floresans Yaylası ulaşma miktarının tarafından elde edilebilir. Daha uzak bölge, uzun içine yaygın photoactivated aktin geçen ve böylece daha fazla zaman sonuçta daha yüksek bir t1/2 değeri (şekil 3e) önde gelen ulaşmak, floresan Yaylası için gereklidir.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57643/57643fig1.jpg"> Resim 1 : Odası derleme ve mikroenjeksiyon yordamı Imaging. (bir) görüntüleme odası bileşenleri. (b) silikon gres dikkatle plastik mühürleyen açılış etrafında sürülür. (c) coverslip hücre-yüzü yukarı bakacak şekilde açılış görüntüleme odasının ortasına yerleştirilir. (d) güvenli bir mühür coverslip üstüne plastik mühürleyen konumlandırma ve yan kelepçeler sıkma belirlenir. (e) mikroskopi orta odası yuvasına pipetted. (f) görüntüleme odası mikroskop Sahne Alanı'nda yer alıyor, sıcaklık dedektörü ve elektrotlar 37 ° C için önceden ayarlanmış bir Isıtma birimine bağlı ve hücreleri mikroskobu başlatılan önce en az 30 dk için adapte izin verilir. Bu örnekte, mikroskop sahne microinjections gerçekleştirmek için bir micromanipulator ile de donatılmıştır ve mikroenjeksiyon iğne hücre katmanı görüntüleme odasında kapsayan orta içine daldırma. (g) bir NIH3T3 fibroblast hücre mikroenjeksiyon önce faz kontrast mikroskobu tarafından görüntülenmiştir. Kızıl Haç perinükleer yerde hantal çekirdeği yakınlığı nedeniyle yüksek bir sitoplazmik bölgesine karşılık gelen gelecekteki mikroenjeksiyon konumunu gösterir. (h) 10 dk takip mikroenjeksiyon ile Rac1 hücre lamellipodia (yeşil oklarla gösterilen) tüm hücre çevre etrafında belirgin oluşumu tarafından tepki verir. <a href="/files/ftp_upload/57643/57643fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57643/57643fig2.jpg"> Resim 2: Sıkı BAĞLAMAK sağlar protein ciro veya lamellipodial aktin polimerizasyon oranlarının belirlenmesi. (bir) temsilcisi örnek B16-F1 hücre EGFP-VASP lamellipodial bölgesinin photobleaching daha önce belirtildiği gibi ifade etme. Farklı renkli kontür/şekiller hangi bölgelerine Floresans yoğunluk ölçümleri için zaman içinde kabul edildi belirtmek için etiketlenir. Not kırmızı kontur çoklu veziküller ve hücre yüzey katlar içeren bir alanda yer alan bir sitozolik bölgesi etiketleri bir ünlem işareti ile işaretlenmiş. Floresan, potansiyel olarak yanlış sonuçlara neden güçlü kısa süreli dalgalanmalar tarafından karakterize edilmektedir Bu gibi dinamik alanlarda Floresans başvuru, bölgelerinde seçmek için kaçınılmalıdır. EGFP-VASP ifade hücre önce ve photobleaching sonra (b) Lamellipodial bölgesi. Photobleaching mor olarak işaretlenmiş bölge zaman içinde görüntülenir sonra floresan sinyal kurtarma. Ok gösterir VASP için büyük olasılıkla aktin filamentleri yüksek yoğunluk nedeniyle zenginleştirilmiş bir microspike ucu polymerizing orada19. b kırmızı photobleached lamellipodium (mor kontur) floresan yoğunluğu miktarının (c) bir sıkı BAĞLAMAK örneği kurtarma eğri olarak türetilen ve sağdaki yeşil çizgiler, sırasıyla, hareketsiz ve mobil kesirler gösterir. (d) A sıkı BAĞLAMAK kurtarma eğri c (sol paneli) ve kurtarma yarım saat (doğru kapı aynası) türetmek için kullanılan hesaplama yöntemi örneği uygun. (e) bir sıkı BAĞLAMAK kurtarma örneği eğrisi SEM çubuklarla örnek nüfus içinde arasındaki değişkenlik derecesini gösteren Floresans kurtarma eğrileri 15 hücrelerin ortalama türetilmiş. (f) bir eğri uyum sıkı BAĞLAMAK kurtarma eğrisi uyan 15 hücrelerin (sol paneli) ve kurtarma yarım saat (doğru kapı aynası) türetmek için kullanılan hesaplama yöntemi örneği ortalama türetilmiş. lamellipodium önce ve sonra bir lamellipodial bölgesinin beyazlatma belirtildiği gibi Floresans kurtarma lamellipodium içinde zamanla ardından EGFP öğesini β-aktin ifade B16-F1 hücrenin çıkıntılı, hızlandırılmış panelleri (g). Sağ panelde değerleri ölçülen için çıkıntı ve retrograd mesafeler sağlanmaktadır (turuncu ve kırmızı, sırasıyla). Hesaplamalar görüntü panelleri altında ortaya çıkarmak nasıl çıkıntı ve retrograd mesafeleri toplamı polimerizasyon hızı lamellipodial aktin ağının türetmek için kullanılır. <a href="/files/ftp_upload/57643/57643fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57643/57643fig3.jpg"> Şekil 3: PA-GFP-aktin hücre izleme monomer için Photoactivation. (bir) A temsilcisi örnek PA-GFP-aktin photoactivation sitozolik bölge kırmızı daire (PA) tarafından belirtildiği şekilde uyarının harekete geçirilmesine karşılık önce ifade B16-F1 hücre. Farklı renkli kontür hangi bölgelerine Floresans yoğunluk ölçümleri için zaman içinde kabul edildi belirtmek için etiketlenir. (b) zamansal dağıtım PA-GFP-aktin uyamayan bir örnek photoactivation. Photoactivated aktin ondan dağılır floresan photoactivated, sitozolik bölge (kırmızı daire), içinde yavaş yavaş azalma not edin. Açık ve ağ derlemeye kendi Difüzyon nedeniyle photoactivated aktin monomerleri yavaş yavaş lamellipodia (camgöbeği bölgesi) ve bir mesafe ve zaman bağımlı moda sitozol (farklı renk kodlu bölgelerde) boyunca geliştirilmiştir. Floresan photoactivated sitozolik bölgedeki (kırmızı kontur b) (c) temsilcisi, zamansal düşüş. lamellipodial bölge (camgöbeği kontur b) floresan yoğunluğu (d) Temporal değişiklikler. (e) eğrileri floresan yoğunluğu nedeniyle photoactivation alanından değişken mesafelerde konumlandırma sitozolik bölgeler (b renk kodlu) zamansal değişimler temsilcisi. Nasıl floresan ulaşma yarı-kez Plato Not (sağdaki göstergede gösterilen) ile uzaklığı artırmak photoactivation alanına bölge göz önüne alındığında büyük olasılıkla artış ile korele aktin monomerleri Difüzyon için gerekli kez ilgili bölge. <a href="/files/ftp_upload/57643/57643fig3large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>

Biz nasıl sıkı BAĞLAMAK ve photoactivation gibi mikro - ve photomanipulation teknikleri hareketliliği parametreleri belirlenmesi etkinleştirmek ve proteinler geçiş içinde kronolojik zamanmekansal dinamikleri hücreleri tanımlamak. Deneysel veriler hücre altı dinamikleri ve ciro hareketliliği düzenleyiciler veya temel aktin sitoiskeleti içerir.

Morfogenetik dinamiklerini analiz ve hücre iskeleti düzenleyiciler ciro sağlayan Embriyolardan teknikleri

Examining the spatiotemporal dynamics of proteins can reveal their functional importance in various contexts. In this article, it is discussed how ...

Mikromanipülasyon ve FRAP ve fotoaktivasyon gibi ışık mikroskobu tekniklerinin bir kombinasyonunu kullanmanın genel amacı, hücre iskeleti regülasyonu ve göçünde yer alan proteinlerin pakiyotemporal dinamiklerini farklı koşullarda veya sinyal yoluna bağlı bir şekilde izlemektir. Burada tartışılan mikromanipülasyon yöntemleri, herhangi bir molekül tipinin hücrelere doğrudan verilmesi ve ayrıca tanımlanmış hücre altı konumlarda protein aktivitesinin ışık kaynaklı manipülasyonu için yararlıdır. Dolayısıyla burada sunulan tekniklerin temel avantajı, proteinlerin hücreler üzerinde uyguladığı anlık etkilerin belirlenmesine ve hücre boyunca hareketliliklerinin izlenmesine izin vermesidir.Bu işleme başlamak için, daha önce yetiştirilmiş B16-F1 hücrelerini bir ila beş oranında üç santimetrelik plastik bir tabağa geçirin. Hücre kültürü ortamını aspire edin. Hücreleri PBS ile yıkayın, PBS'yi aspire edin ve hücreleri ayırmak için Tripsin EDTA ekleyin.Tripsinizlenmiş hücrelere hücre kültürü ortamı ekleyin. Bu santrifüjden sonra 1000 rpm'de üç ila beş dakika boyunca hücreleri yeniden askıya alın ve şahin tüplerine aktarın. B16-F1 hücrelerini üç santimetrelik bir tabağa oturttuktan ve en az altı saat yayılmalarına izin verdikten sonra, 150 milimolar sodyum klorür içeren bir çözelti içinde 500 nanogram DNA yapısı ve bir mikrolitre transfeksiyon reaktifi karışımı ekleyerek B16-F1 hücrelerini transfekte edin.B16-F1 hücreleri için, 15 milimetrelik kapak fişlerini 150 mikrolitre laminin çözeltisi ile kaplayın ve oda sıcaklığında bir saat inkübe edin. NIH için, 3T3 hücreleri kapak kızaklarını fibronektin çözeltisi ile kaplar ve oda sıcaklığında bir saat inkübe eder. İnkübasyondan sonra, laminin ve fibronektin inkübe edilmiş örtü fişlerini PBS ile yıkayın ve ardından PBS'yi aspire edin.İki mililitre NIH 3T3 fibroblastını birleşik bir tabaktan fibronektin kaplı örtü fişlerine bir ila 20 oranında tohumlayın. Transfekte edilmiş B16-F1 hücrelerinin iki mililitresini birleşik bir tabaktan bir ila 30 oranında laminin kaplı lamellere pipetleyin. Bunu takiben, hücrelerin mikroskopiden önce 37 santigrat derecede bir doku kültürü inkübatöründe gece boyunca laminin ve fibronektin kaplı örtü kaymaları üzerinde yayılmasına izin verin.Kapak camını, hücreler yukarı bakacak şekilde ısı iletken bir RC-26 alüminyum görüntüleme odasına yerleştirin. Ardından, kapak kızağı ile hazne arasında güvenli bir sızdırmazlık sağlamak için kapak camının üzerine plastik bir sızdırmazlık maddesi yerleştirin, ortamın sızmasını önlemek için plastik sızdırmazlık maddesini haznenin sürgülü kelepçeleriyle vidalayarak sabitleyin. Şimdi, 37 santigrat derece önceden ısıtılmış mikroskopi ortamını merkezi alana pipetleyin.Isı dedektörünü odanın belirlenen yuvasına yerleştirin ve odanın elektrotlarını 37 santigrat derece sabit bir sıcaklık sağlayarak bir TC-324B otomatik sıcaklık kontrol cihazına bağlayın. Mikroenjeksiyon kılcal damarında mevcutsa iğne tıkanmasına yol açabilecek protein agregatlarını çıkarmak için önceden çözülmüş bir protein çözeltisini 10.000G'de en az 30 dakika santrifüjleyin. Esnek bir pipet ucu kullanarak, arka taraftan bir mikrolitre protein çözeltisi içeren bir mikroenjeksiyon iğnesi yükleyin.İğne ucunda hava kabarcıkları varsa, bunları çıkarmak için iğne tabanına hafifçe vurun. Ardından, mikromanipülasyon cihazındaki iğne tutucuyu dikkatlice ayarlayın. Mikroenjeksiyon iğnesini iğne tutucuya vidaladıktan sonra, iğne ucunu hücre kültürü ortamına aktarmadan önce bir mikroenjeksiyon basınç cihazı kullanarak iğneye basınç uygulayın.Ardından, düşük büyütme hedefi kullanarak iğneyi görüş alanına yerleştirin, ardından ilgilendiğiniz bir hücreyi bulun ve iğneyi kademeli olarak hücrenin üzerine indirin. Mikroenjeksiyon için, hücrenin plazma zarına hafifçe dokunun, bu hücreye nüfuz etmek için yeterli olabilir veya mikroskop kurulumuna çok hafif bir dokunuşla geçici zar yırtılmasına yardımcı olabilir. İğne ucunu ortama doğru hareket ettirerek hücreye akış görünür görünmez enjeksiyon işlemini durdurun.Lazeri tetiklemeden önce GFP kanalına geçin ve zaman atlamalı görüntü alımını başlatın. Bunu takiben, ekranı görüntülerken GFP kanalında foto ağartılacak bölgeyi manuel olarak çizin. Görüntü alımının başlamasından en az üç ila dört kare sonra 405 nanometre lazerin manuel tetiklemesiyle foto ağartmayı başlatın.Yazılımdaki GFP 488 nanometre görüntü alımını 500 milisaniye pozlama ve 1500 milisaniye zaman aralığına ayarlayın. Ardından, dalga boyu serisi karesini işaretleyerek ve dalga boyu alma menüsünde istenen kanal sayısını seçerek çift kanallı veya üç kanallı zaman atlamalı filmler almak için yazılım ayarlarını yapın. Lazeri tetiklemeden önce, zaman atlamalı görüntü alımını başlatın ve ekrana bakarken faz kontrast kanalında fotoaktif hale getirilecek bölgeyi manuel olarak çizin.Bunu takiben, görüntü alımının başlamasından en az üç ila dört kare sonra 405 nanometre lazerin manuel tetiği ile fotoaktivasyonu başlatın. FRAP sonuçlarının analizi için, VisiView'dan türetilen zaman atlamalı filmleri MetaMorph yazılımında açın. MetaMorph kullanarak ilgili bölgeleri manuel olarak çizerek floresan geri kazanımının her bir zaman noktası için foto-ağartılmış bölgelerin yoğunluk değerlerini türetin.Lamellipodyumun ucuna, foto ağartılmış alanın tamamını veya bir kısmını kaplayan bir şekil çizin ve ilerleyen ucun yer değiştirmesi sırasında zaman içinde ilgili bölgenin lamellipodial yoğunluklarındaki değişiklikleri izlemek için gerekirse sonraki karelerdeki konumunu manuel olarak ayarlayın. Arka planın düzeltilmesi ve foto ağartma edinimi için sırasıyla hücrelerin dışındaki ve içindeki bölgeleri analiz edin. İlgilenilen bir bölge seçildikten sonra, menü ölçüm bölgesi ölçümlerini kullanarak MetaMorph'ta yoğunluk değerlerini çıkarın.Yapılandır menüsünde geçen süre ve ortalama yoğunluk seçeneklerinin seçili olduğundan emin olun. Günlüğü aç'a tıklayın ve dinamik veri alışverişini seçin. Ardından bir excel elektronik tablosunu açmak için Tamam'ı tıklayın ve MetaMorph değerlerini excel'e yapıştırmak için günlüğü aç düğmesini tekrar tıklayın.Yoğunluk değerlerini uygun formüller içeren bir excel elektronik tablosuna yapıştırarak FRAP floresan geri kazanım eğrilerini hesaplamak için MetaMorph'tan türetilen yoğunluk değerlerini kullanın. Foto-ağartılmış bölgenin floresan geri kazanımı, arka plan ve iç bölgelere normalize edilir. Floresan geri kazanımının yarı süresini hesaplamak için, floresan geri kazanım eğrilerinin değerlerini karşılık gelen sürelerle SigmaPlot'a yapıştırın, ardından en iyi eğri uyumuna bağlı olarak mono veya iki üstel fonksiyonu seçerek dinamik uyum sihirbazı üstel yükseliş aracını kullanarak bir eğri uyumu gerçekleştirin.Seçilen fonksiyonun çözülmesiyle elde edilen parametreler, ilgili kurtarma yarı zamanının saniye cinsinden hesaplanmasına izin veren uygun formülü içeren bir excel elektronik tablosuna yapıştırılabilir. Fotoaktive edilebilir aktinin aktivasyon üzerine difüzyonunun yanı sıra lamellipodium gibi belirli bir bölge içindeki birikimini ölçmek için, normalizasyon için arka plan floresansını belirlemek amacıyla ilgili bölgelerde ve hücre dışında zaman içindeki yoğunlukları belirlemek için MetaMorph kullanın. Fotoaktifleştirilebilir aktinin aktivasyon bölgesinden uzağa doğru yer değiştirme oranını veya lamellipodyum içindeki dahil edilme oranını incelemek için, daha önce MetaMorph'tan türetilen verilerden floresan eğrileri oluşturun.Normalizasyon için kullanılan arka plan bölgesi, fotoaktif sitozolik bölge veya araştırılacak lamellipodial bölge için yoğunluk değerlerini uygun formülleri içeren bir excel elektronik tablosuna yapıştırın. Küçük GTPase Rac1'in mikroenjeksiyonundan önce ve sonra bir NIH 3T3 fibroblast hücresinin yüz kontrast görüntüleri burada gösterilmektedir. Mikroenjeksiyondan yaklaşık 12 dakika sonra, hücre morfolojisini değiştirdi, bu da enjeksiyonun başarılı olduğunu gösteriyor.Ağartılmış EGFP VASP'ın lamellipodium ucunda ağartılmamış moleküller tarafından geri dönüşümü burada gösterilmektedir. Bu özel örnekte, ağartma öncesi floresansın yaklaşık %80'inde geri kazanım floresan platoları. Fotoaktivasyon üzerine, fotoaktif GFP aktini sitozolik bölgeden hızla yayılır.Fotoaktif aktin monomerlerinin bir kısmı, lamellipodia içinde hızlı bir floresan patlaması yaratarak öne doğru yer değiştirir. Fotoaktif aktin monomerlerinin fraksiyonu, sitozol boyunca yolculukları sırasında aktive edilmemiş monomerlerle seyreltildiğinden, fotoaktif bölgeye uzak lamellipodia'da floresanın dahil edilmesi nefis bir şekilde daha düşüktür. Fotoaktif GFP aktin zamanla fotoaktif bölgeden yayıldığında, sürekli olarak fotoaktif olmayan floresan olmayan aktin ile değiştirilir.Sonuç olarak, bu bölgenin floresan yoğunluğunda kademeli bir azalma gözlenir. Zamanla, sitozolik aktivasyon bölgesine yakın lamellipodia hızla floresan aktin içerir. Floresandaki bir sonraki düşüş, basitçe aktin depolimerizasyonu ve lamellipodyumdan uzakta monomer difüzyonundan kaynaklanmaktadır.Bu nedenle, deneyler tek bir mikroskopi sistemi üzerinde gerçekleştirildiğinde, mikroenjeksiyon ve FRAP veya fotoaktivasyon tekniklerinin kombinasyonu, araştırılan proteinlerin doğasına bağlı olarak birkaç dakika içinde gerçekçi bir şekilde gerçekleştirilebilir. Mikromanipülasyon öncesinde, sırasında ve sonrasında veya lazer ışığına maruz kaldıktan sonra kendinizi her zaman mutlu etmeyi unutmayın. FRAP ve fotoaktivasyon için, seçilen bölgenin film süresi boyunca yapısal bütünlüğünü koruması özellikle önemlidir.Mikroenjeksiyon prosedürü, verilen tedavilerin subselüler düzeyde ani sonuçlarını ele almak için plazma zarı geçirgen ilaçların veya hücre iskeleti inhibitörlerinin lokal uygulaması ile tamamlanabilir. Mikromanipülasyon teknikleri, hücre iskeleti bileşenlerinin ve komplekslerinin difüzyon özelliklerini ve hücre altı dinamiklerini keşfetmenin ve hücresel morfogenezi düzenleyen ikinci el yolakları anlamanın yolunu açmıştır. Bu videoyu izledikten sonra, sitozolik proteinlerin, hücre iskeleti içindeki eyleme dahil edilen veya farklı hücre altı organellerde bulunan proteinlerin uzay-zamansal dinamiklerini nasıl izleyeceğinizi ve izleyeceğinizi iyi anlamanız ve sonuçta hücre düzenlemesinin kinetiğini çözmeniz gerekir.

micromanipulation-techniques-allowing-analysis-morphogenetic-dynamics

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Biz, küresel ya da lokalize gerginlik uygulama yanıt tek, yaşayan yapışık hücrelere kaynaklı nükleer ve iskelet deformasyonları ölçmek için, iki bağımsız, mikroskop tabanlı araçlar sunuyoruz. Bu teknikler, nükleer sertliği belirlemek için (yani, deformabilitesi) ve, çekirdek ve hücre iskeletinin arasındaki hücre içi kuvvet iletim prob kullanılır.

Fazlararası Hücre Çekirdek Mekanik Özellikleri Probe Biyofiziksel Tahliller: Yüzey Gerilme Uygulama ve Microneedle Manipülasyon

Işık tarafından küçük GTPaz aktivitesinin yerleşim-zaman kontrolü için bir yöntem tarif edilmiştir. Bu yöntem, rapamisin indüklenen FKBP-FRB heterodimerization ve foto-kafes sistemleri dayanmaktadır. Işık ışınlama Optimizasyonu Subselüler düzeyindeki küçük GTPases bir uzay-zamansal olarak kontrollü aktivasyon sağlar.

Yaşayan hücreler içinde Subselüler Düzeyinde ve Seconds Zaman ölçeği üzerinde Küçük GTPaz Faaliyet uzay-zamansal Manipülasyon

Maya tomurcuklanan nedeniyle güçlü genetik ve mikrotübül hücre iskeletinin basitliği için in vivo olarak mikrotübül dinamiklerinin çalışmak için avantajlı bir modeldir. Aşağıdaki protokol dönüşümü ve kültür maya hücreleri eş odaklı mikroskopi görüntü elde ve kantitatif maya hücrelerini canlı mikrotübül dinamiklerini analiz etmek açıklamaktadır.

Yüksek çözünürlüklü görüntüleme ve Bireysel Astral Mikrotubul Dynamics Analizi Budding Maya

Bu protokol için seçim ve uygun hücreler embriyolardan için hazırlanması ve piezoelektrik micromanipulator kullanımı bu hücrelerde kromozom yeniden konumlandırmak için açıklar.

Embriyolardan kromozomların böcek Spermatocytes

Bu protokol, tek hücrelerde ve kavisli epitelyal dokularda akomyosin davranışlarını nasıl güvenilir bir şekilde analiz ettiğini açıklayan basit yönergelerle birlikte Fiji tabanlı, Kullanıcı dostu bir metodoloji sunar. Öğretici izlemek için hiçbir programlama becerileri gereklidir; tüm adımlar Fiji grafik kullanıcı arayüzü ve ilişkili eklentileri kullanarak yarı interaktif bir şekilde gerçekleştirilir.

Kültür Drosophila Egg Chambers Time-Lapse filmler kullanarak yerel hücresel ve doku ölçeklerde Actomyosin dinamikleri Analizi

Burada canlı hücre dönen disk konfokal mikroskopisi ve MATLAB tabanlı görüntü işleme kullanarak prometafazda senkronize hücrelerde mikrotübül dinamiği analizinin sağlam ve ayrıntılı bir yöntemini sıyoruz.

Monopolar Mitotik İğlerde Dönen Disk Mikroskobu ile Mikrotübül Dinamiğinin Ölçülmesi

Mikroakışkan bir çip üzerinde fare embriyonik dokusunun kültürü ve manipülasyonu için bir protokol sağlanır. Yol modülatörlerinin darbelerini uygulayarak, bu sistem fare somitogenezinin fonksiyonel araştırması için sinyal salınımlarını harici olarak kontrol etmek için kullanılabilir.

Somitogenezi Yöneten Sinyal Salınımlarının Fonksiyonel Olarak İncelenmesi İçin Bir Mikroakışkan Yaklaşımı

Temel ve uygulamalı araştırmalarda yaygın olarak kullanılan tipik mikrotübül inhibitörleri, hücreler üzerinde geniş kapsamlı etkilere sahiptir. Son zamanlarda, fotostatinler, mikrotübüllerin anlık, geri dönüşümlü, mekansal olarak hassas manipülasyonunu yapabilen bir fotodeğiştirilebilir mikrotübül inhibitörleri sınıfı olarak ortaya çıkmıştır. Bu adım adım protokol, fotostatinlerin 3D canlı preimplantasyon fare embriyosunda uygulanmasını detaylandırır.

Fotostatinler Kullanılarak Canlı Preimplantasyon Fare Embriyosundaki Mikrotübül Sitoiskeletinin Spatiotemporal Subcellular Manipülasyonu

Burada, fare dokularının geliştirilmesinde sitomem adı verilen özel sinyal filopodiasını tespit etmek için embriyoların fiksasyonu, immün boyama ve bölümlenmesi için optimize edilmiş bir adım adım protokol sağlanmaktadır.

Sitonem analizi için embriyonik fare dokusunun fiksasyonu

Aktomiyosin kontraktilitesi hücre ve doku morfogenezinde önemli bir rol oynar. Bununla birlikte, aktomiyosin kontraktilitesini in vivo akut olarak manipüle etmek zordur. Bu protokol, Drosophila embriyolarında Rho1 aracılı aktomiyosin kontraktilitesini hızla inhibe eden ve aktomiyozinin in vivo inaktivasyonundan sonra epitel gerginliğinin ani kaybını ortaya çıkaran bir optogenetik sistemi tanımlar.

Drosophila Embriyolarında Epitelyal Gerginliğin Ölçümü ile Birlikte Rho1 Aracılı Aktomiyosin Kontraktilitesinin Optogenetik İnhibisyonu

Öğrenin hücre göçünde protein dinamiklerini incelemek için FRAP ve fotoaktivasyon tekniklerini kullanarak sitoskelet düzenleyicilerinin davranışlarını B16-F1 ve NIH 3T3 hücrelerinde gerçek zamanlı izleme yöntemlerini.

Morfogenetik dinamiklerini analiz ve hücre iskeleti düzenleyiciler ciro sağlayan Embriyolardan teknikleri

Daha fazla video keşfet