Name: Fare derisi yara iyileşmesinin tek hücreli transkriptomik veri kümesini analiz etmek için R, Seurat ve CellChati kullanma (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-01T13:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 58 s
Description: Keşfedin fare derisi yara iyileşmesinin tek hücreli transkriptomik veri kümesini R, Seurat ve CellChat kullanarak analiz etme yöntemini. Bu protokol biyoinformatik deneyimi olmayan araştırmacılar için tasarlanmıştır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Eming, S. A., Martin, P., Tomic-Canic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Wound+repair+and+regeneration%3A+mechanisms%2C+signaling%2C+and+translation%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">Wound repair and regeneration: mechanisms, signaling, and translation.</a> Sci Transl Med. 6 (265), 265sr6(2014).</li>
<li>Wietecha, M. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phase-specific+signatures+of+wound+fibroblasts+and+matrix+patterns+define+cancer-associated+fibroblast+subtypes%5BTitle%5D)+AND+%22Matrix+Biol%22%5BJournal%5D)">Phase-specific signatures of wound fibroblasts and matrix patterns define cancer-associated fibroblast subtypes.</a> Matrix Biol. 119, 19-56 (2023).</li>
<li>Rodrigues, M., Kosaric, N., Bonham, C. A., Gurtner, G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Wound+healing%3A+a+cellular+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol+Rev%22%5BJournal%5D)">Wound healing: a cellular perspective.</a> Physiol Rev. 99 (1), 665-706 (2019).</li>
<li>Chen, L., Mirza, R., Kwon, Y., DiPietro, L. A., Koh, T. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+murine+excisional+wound+model%3A+contraction+revisited%5BTitle%5D)+AND+%22Wound+Repair+Regen%22%5BJournal%5D)">The murine excisional wound model: contraction revisited.</a> Wound Repair Regen. 23 (6), 874-877 (2015).</li>
<li>Rhea, L., Dunnwald, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Murine+excisional+wound+healing+model+and+histological+morphometric+wound+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Murine excisional wound healing model and histological morphometric wound analysis.</a> J Vis Exp. (162), e61616(2020).</li>
<li>Fischer, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+the+splinted%2C+human-like+excisional+wound+model+in+mice%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-Protocol%22%5BJournal%5D)">Protocol for the splinted, human-like excisional wound model in mice.</a> Bio-Protocol. 13 (3), e4606(2023).</li>
<li>Iglesias-Bartolome, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+signature+primes+human+oral+mucosa+for+rapid+wound+healing%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">Transcriptional signature primes human oral mucosa for rapid wound healing.</a> Sci Transl Med. 10 (451), aap8798(2018).</li>
<li>Chen, L., Arbieva, Z. H., Guo, S., Marucha, P. T., Mustoe, T. A., DiPietro, L. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Positional+differences+in+the+wound+transcriptome+of+skin+and+oral+mucosa%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Positional differences in the wound transcriptome of skin and oral mucosa.</a> BMC Genomics. 11, 471(2010).</li>
<li>Leonardo, T. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+changes+in+human+palate+and+skin+healing%5BTitle%5D)+AND+%22Wound+Repair%22%5BJournal%5D)">Transcriptional changes in human palate and skin healing.</a> Wound Repair. 31 (2), 156-170 (2023).</li>
<li>Rognoni, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fibroblast+state+switching+orchestrates+dermal+maturation+and+wound+healing%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Syst+Biol%22%5BJournal%5D)">Fibroblast state switching orchestrates dermal maturation and wound healing.</a> Mol Syst Biol. 14 (8), e8174(2018).</li>
<li>Bergmeier, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+a+myofibroblast-specific+expression+signature+in+skin+wounds%5BTitle%5D)+AND+%22Matrix+Biol%22%5BJournal%5D)">Identification of a myofibroblast-specific expression signature in skin wounds.</a> Matrix Biol. 65, 59-74 (2018).</li>
<li>Plikus, M. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regeneration+of+fat+cells+from+myofibroblasts+during+wound+healing%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Regeneration of fat cells from myofibroblasts during wound healing.</a> Science. 355 (6326), 748-752 (2017).</li>
<li>Shook, B. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Myofibroblast+proliferation+and+heterogeneity+are+supported+by+macrophages+during+skin+repair%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Myofibroblast proliferation and heterogeneity are supported by macrophages during skin repair.</a> Science. 362 (6417), aar2971(2018).</li>
<li>Rinkevich, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Skin+fibrosis.+Identification+and+isolation+of+a+dermal+lineage+with+intrinsic+fibrogenic+potential%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Skin fibrosis. Identification and isolation of a dermal lineage with intrinsic fibrogenic potential.</a> Science. 348 (6232), aaa2151(2015).</li>
<li>Guerrero-Juarez, C. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+analysis+reveals+fibroblast+heterogeneity+and+myeloid-derived+adipocyte+progenitors+in+murine+skin+wounds%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Single-cell analysis reveals fibroblast heterogeneity and myeloid-derived adipocyte progenitors in murine skin wounds.</a> Nat Commun. 10 (1), 650(2019).</li>
<li>Gay, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phagocytosis+of+Wnt+inhibitor+SFRP4+by+late+wound+macrophages+drives+chronic+Wnt+activity+for+fibrotic+skin+healing%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Adv%22%5BJournal%5D)">Phagocytosis of Wnt inhibitor SFRP4 by late wound macrophages drives chronic Wnt activity for fibrotic skin healing.</a> Sci Adv. 6 (12), eaay3704(2020).</li>
<li>Haensel, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Defining+epidermal+basal+cell+states+during+skin+homeostasis+and+wound+healing+using+single-cell+transcriptomics%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">Defining epidermal basal cell states during skin homeostasis and wound healing using single-cell transcriptomics.</a> Cell Rep. 30 (11), 3932-3947.e6 (2020).</li>
<li>Phan, Q. M., Sinha, S., Biernaskie, J., Driskell, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+transcriptomic+analysis+of+small+and+large+wounds+reveals+the+distinct+spatial+organization+of+regenerative+fibroblasts%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Dermatol%22%5BJournal%5D)">Single-cell transcriptomic analysis of small and large wounds reveals the distinct spatial organization of regenerative fibroblasts.</a> Exp Dermatol. 30 (1), 92-101 (2021).</li>
<li>Foster, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrated+spatial+multiomics+reveals+fibroblast+fate+during+tissue+repair%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Integrated spatial multiomics reveals fibroblast fate during tissue repair.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 118 (41), e2110025118(2021).</li>
<li>Hu, K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+space-time+mapping+identifies+concerted+immune+and+stromal+cell+patterns+and+gene+programs+in+wound+healing+and+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Stem+Cell%22%5BJournal%5D)">Transcriptional space-time mapping identifies concerted immune and stromal cell patterns and gene programs in wound healing and cancer.</a> Cell Stem Cell. 30 (6), 885-903.e10 (2023).</li>
<li>Hao, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dictionary+learning+for+integrative%2C+multimodal+and+scalable+single-cell+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis.</a> Nat Biotechnol. 42 (2), 293-304 (2024).</li>
<li>Jin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inference+and+analysis+of+cell-cell+communication+using+CellChat%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat.</a> Nat Commun. 12 (1), 1088(2021).</li>
<li>Germain, P. -L., Lun, A., Garcia Meixide, C., Macnair, W., Robinson, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Doublet+identification+in+single-cell+sequencing+data+using+scDblFinder%5BTitle%5D)+AND+%22F1000Research%22%5BJournal%5D)">Doublet identification in single-cell sequencing data using scDblFinder.</a> F1000Research. 10, 979(2021).</li>
<li>Jin, S., Plikus, M. V., Nie, Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CellChat+for+systematic+analysis+of+cell-cell+communication+from+single-cell+transcriptomics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell transcriptomics.</a> Nat Protoc. 20 (1), 180-219 (2024).</li>
<li>Luecken, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Benchmarking+atlas-level+data+integration+in+single-cell+genomics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Benchmarking atlas-level data integration in single-cell genomics.</a> Nat Methods. 19 (1), 41-50 (2022).</li>
<li>Hao, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrated+analysis+of+multimodal+single-cell+data%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Integrated analysis of multimodal single-cell data.</a> Cell. 184 (13), 3573-3587.e29 (2021).</li>
<li>Lun, A. T. L., McCarthy, D. J., Marioni, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+step-by-step+workflow+for+low-level+analysis+of+single-cell+RNA-seq+data+with+Bioconductor%5BTitle%5D)+AND+%22F1000Research%22%5BJournal%5D)">A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor.</a> F1000Research. 5, 2122(2016).</li>
<li>McCarthy, D. J., Campbell, K. R., Lun, A. T. L., Wills, Q. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scater%3A+pre-processing%2C+quality+control%2C+normalization+and+visualization+of+single-cell+RNA-seq+data+in+R%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics+%28Oxford%2C+England%29%22%5BJournal%5D)">Scater: pre-processing, quality control, normalization and visualization of single-cell RNA-seq data in R.</a> Bioinformatics (Oxford, England). 33 (8), 1179-1186 (2017).</li>
<li>Wolf, F. A., Angerer, P., Theis, F. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((SCANPY%3A+large-scale+single-cell+gene+expression+data+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Biol%22%5BJournal%5D)">SCANPY: large-scale single-cell gene expression data analysis.</a> Genome Biol. 19 (1), 15(2018).</li>
<li>Aran, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reference-based+analysis+of+lung+single-cell+sequencing+reveals+a+transitional+profibrotic+macrophage%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Immunol%22%5BJournal%5D)">Reference-based analysis of lung single-cell sequencing reveals a transitional profibrotic macrophage.</a> Nat Immunol. 20 (2), 163-172 (2019).</li>
<li>Andreatta, M., Berenstein, A. J., Carmona, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((scGate%3A+marker-based+purification+of+cell+types+from+heterogeneous+single-cell+RNA-seq+datasets%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">scGate: marker-based purification of cell types from heterogeneous single-cell RNA-seq datasets.</a> Bioinformatics. 38 (9), 2642-2644 (2022).</li>
<li>Efremova, M., Vento-Tormo, M., Teichmann, S. A., Vento-Tormo, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CellPhoneDB%3A+inferring+cell-cell+communication+from+combined+expression+of+multi-subunit+ligand-receptor+complexes%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">CellPhoneDB: inferring cell-cell communication from combined expression of multi-subunit ligand-receptor complexes.</a> Nat Protoc. 15 (4), 1484-1506 (2020).</li>
<li>Hu, Y., Peng, T., Gao, L., Tan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CytoTalk%3A+de+novo+construction+of+signal+transduction+networks+using+single-cell+transcriptomic+data%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Adv%22%5BJournal%5D)">CytoTalk: de novo construction of signal transduction networks using single-cell transcriptomic data.</a> Sci Adv. 7 (16), eabf1356(2021).</li>
<li>Dimitrov, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+methods+and+resources+for+cell-cell+communication+inference+from+single-cell+RNA-Seq+data%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Comparison of methods and resources for cell-cell communication inference from single-cell RNA-Seq data.</a> Nat Commun. 13 (1), 3224(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Dizüstü veya masaüstü bilgisayar</td><td>YOK</td><td>YOK</td><td>Windows veya MacOS çalıştırıyor&nbsp;</td></tr><tr><td>R</td><td>YOK</td><td>Sürüm 4.4.1</td><td>https://cran.rstudio.com/'dan indirmek ücretsiz</td></tr><tr><td>Rstüdyo</td><td>Posit Yazılımı, PBC</td><td>Sürüm 2024.09.0</td><td>https://posit.co/download/rstudio-desktop/'dan indirmek ücretsiz</td></tr><tr><td>Ofis Excel</td><td>Microsoft</td><td>Herhangi bir sürüm</td><td>Tablo verilerinin analizi için</td></tr><tr><td>İnternet tarayıcısı</td><td>YOK</td><td>YOK</td><td>Web sitelerinde gezinmek için</td></tr><tr><td><güçlü>R Paketleri</güçlü></td><td>Repository</td><td><güçlü>Sürüm</güçlü></td><td></td></tr><tr><td>Geliştirici araçları</td><td>CRAN</td><td>2.4.5</td><td></td></tr><tr><td>xl'yi oku</td><td>CRAN</td><td>1.4.3</td><td></td></tr><tr><td>OpenXLSX</td><td>CRAN</td><td>4.2.7.1</td><td></td></tr><tr><td>Düzenli Evren</td><td>CRAN</td><td>2.0.0</td><td></td></tr><tr><td>scÖzelleştirmek</td><td>CRAN</td><td>2.1.2</td><td></td></tr><tr><td>Biyok Yöneticisi</td><td>Biyoiletken</td><td>1.30.25</td><td></td></tr><tr><td>NMF</td><td>Biyoiletken</td><td>0.28</td><td></td></tr><tr><td>Karmaşık Isı Haritası</td><td>Biyoiletken</td><td>2.20.0</td><td></td></tr><tr><td>Biyoc Komşuları</td><td>Biyoiletken</td><td>1.22.0</td><td></td></tr><tr><td>Tek Hücre Deneyi</td><td>Biyoiletken</td><td>1.26.0</td><td></td></tr><tr><td>daire içine almak</td><td>Biyoiletken</td><td>0.4.16</td><td></td></tr><tr><td>kenar R</td><td>Biyoiletken</td><td>4.2.1</td><td></td></tr><tr><td>scDbl Bulucu</td><td>Biyoiletken</td><td>1.18.0</td><td></td></tr><tr><td>Seurat</td><td>CRAN</td><td>5.1.0</td><td></td></tr><tr><td>Hücre Sohbeti</td><td>Github</td><td>2.1.2</td><td></td></tr></tbody></table>

fare derisi yara iyileşmesinin tek hücreli transkriptomik veri kümesini analiz etmek için r, seurat ve cellchat'i kullanma

Using R, Seurat, and CellChat to Analyze a Single-Cell Transcriptomics Dataset of Mouse Skin Wound Healing

Fare derisi yara iyileşmesinin tek hücreli transkriptomik veri kümesini analiz etmek için R, Seurat ve CellChat'i kullanma

The process of wound healing is regulated by complex interactions between different cell types across space and time. Through the profiling of individual ...

using-r-seurat-cellchat-to-analyze-single-cell-transcriptomics

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

Karsinojenez kanser hücrelerinin ve kanser mikro arasındaki etkileşimi içeren bir süreçtir. Moleküler olayları incelemek için, bir kanser gelişimi boyunca farklı aşamalarda farklı hücre popülasyonu izole etmek gerekmektedir. Bazal hücreli karsinom için bir fare modeli kullanarak, kanser sırasında hücre analizleri için bir protokol açıklar.

Hücre Nüfus Analizler Cilt Karsinojenez sırasında

Bu iletişim kuralı genel işlemlerini açıklar ve kalite kontrol sağlıklı yetişkin memeli tek hücreleri damlacık-esaslı, yüksek üretilen iş tek hücre RNA-Seq hazırlıkları hazırlanması için gerekli denetler. Sıralama parametreleri, okuma hizalama ve aşağı akım tek hücreli bioinformatic analiz da sağlanır.

Damlacık tek hücre barkodlama tabanlı Transcriptomics yetişkin memeli dokuların

Burada, primer fibroblastlar kullanarak in vitro çizik testve farelerde in vivo deri yara iyileşmesi test için bir protokol salıyoruz. Her iki tahliller in vitro ve in vivo yara iyileşmesini değerlendirmek için basit yöntemlerdir.

In Vitro ve In Vivo In Vivo Analizi Yara İyileşmesi için Scratch Migration Tahlil ve Dorsal Skinfold Odası

Burada, fare karotis arterlerinin tek hücreli bir süspansiyonunu hazırlamak için iki aşamalı bir hücre sindirim protokolünü açıklıyoruz.

Tek Hücreli Dizileme için Fare Karotis Arterlerinden Tek Hücreli Süspansiyonun Hazırlanması

Bu çalışma iki önemli deneysel teknik sunmaktadır: yara kapanmasını değerlendirmek için bir murin yara modelinin oluşturulması ve hücresel canlılığı korumak için murin derisinden tek hücreli süspansiyonların hazırlanması.

Fare Yara Modelleri ve Tek Hücre Süspansiyonlarının Hazırlanması

Yinelemeli ağartma-uzatma-çoğullama (IBEX) ve ticari bir nükleotid etiketleme testinin (Click-iT EdU) kombinasyonu, sabit donmuş murin dokusu kesitlerinde oldukça dinamik süreçlerde bölünen hücre tiplerinin saptanmasını ve sınıflandırılmasını sağlar. Ayrıca, yeni bir açık kaynaklı görüntü işleme hattı, yüksek verimli görüntü elde etme ve analiz sağlar.

Doku Örneklerinde Cilt Hücresi Fenotiplerini ve Proliferasyon Durumlarını Değerlendirmek için Yüksek Verimli Görüntüleme ve Analiz İş Akışı

Bu protokol, erken doğum sonrası fare beyinlerinin beyinciklerindeki mikroglial hücre durumlarını izole etmek ve karakterize etmek için akış sitometrisi ve tek hücreli RNA dizilimini birleştirir. Mikroglia heterojenliğini ortaya çıkarmak ve serebellar gelişim ve hastalıktaki rollerinin anlaşılmasını geliştirmek için enzimatik ayrışma, Percoll santrifüjleme ve immün boyama kullanır.

Erken Doğum Sonrası Fare Beyin Gelişiminde Mikroglia Aktivasyonunu Karakterize Etmek için Akış Sitometrisi ve Tek Hücre Analizi

Bu çalışma, bir doku kesitinin doğrudan uzamsal barkodlamasını tek hücreli çoklu analiz ile birleştiren bir uzamsal Trekker–CUT&amp;Tag çoklu protokolü sunmaktadır. Bu yaklaşım, gen ekspresyonunun ve histon H3K27ac modifikasyonunun aynı anda mekansal olarak çözülen tek hücreli profillenmesini sağlar ve doku mikroanatomisi bağlamında gen düzenlemesine mekanik içgörüler sunar.

Donmuş doku kesitlerinde transkriptom ve epigenomik hedeflerin mekansal çözülmüş, entegre tek hücreli multiomik profillenmesi

Burada, kornea epitel yara iyileşmesi sırasında HSP27'nin işlevini değerlendirmek için ısı şoku proteini 27'ye (HSP27) özgü küçük enterferans yapan RNA'yı kullanmak için bir protokol sunuyoruz. RNA interferansı, çeşitli hücre tiplerinde protein fonksiyonunu araştırmak için gen ekspresyonunu etkili bir şekilde yıkmak için en iyi yöntemdir.

Kornea Epitel Yara İyileşmesi sırasında Isı Şoku Protein 27 Fonksiyon RNA Girişim tabanlı İncelenmesi

Bu makale, yani terroir kavramının, içgörü kazanmak için üzüm berry transkript ve metabolitleri hedefsiz metabolomik, transkriptomik ve çok değişkenli istatistiksel analiz uygulamasını açıklar, dut kalite özellikleri çevrenin etkisi.

Üzüm Berry metabolomik ve transkriptomik aracılığıyla yorumlanır Terroir Kavramı

Keşfedin fare derisi yara iyileşmesinin tek hücreli transkriptomik veri kümesini R, Seurat ve CellChat kullanarak analiz etme yöntemini. Bu protokol biyoinformatik deneyimi olmayan araştırmacılar için tasarlanmıştır.

Fare derisi yara iyileşmesinin tek hücreli transkriptomik veri kümesini analiz etmek için R, Seurat ve CellChat'i kullanma

Daha fazla video keşfet