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植物におけるマイクロRNA転写物を正確かつ効率的に分析するバイオインフォマティクスパイプライン
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
A Bioinformatics Pipeline to Accurately and Efficiently Analyze the MicroRNA Transcriptomes in Plants
DOI:

06:34 min

January 21, 2020

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Chapters

  • 00:04Title
  • 01:15Installation and Testing
  • 02:56Identifying Novel MicroRNAs (miRNAs)
  • 03:33Reference Index Building
  • 04:42Results: Representative miRDP2 Performance
  • 05:45Conclusion

Summary

Automatic Translation

バイオインフォマティクスパイプライン、すなわちmiRDeep-P2(略してmiRDP2)は、植物miRNA基準とオーバーホールされたアルゴリズムを備えており、特に複雑で大きなゲノムを持つ種に対して、植物のマイクロRNA転写物を正確かつ効率的に分析することができました。

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