Journal
/
Genetics
/
पौधों में माइक्रोआरएनए ट्रांसक्रिप्टोम का सटीक और कुशलता पूर्वक विश्लेषण करने के लिए एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
A Bioinformatics Pipeline to Accurately and Efficiently Analyze the MicroRNA Transcriptomes in Plants
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

पौधों में माइक्रोआरएनए ट्रांसक्रिप्टोम का सटीक और कुशलता पूर्वक विश्लेषण करने के लिए एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन

DOI:
10.3791/59864-v

•

06:34 min

•

January 21, 2020

•

, , ,
1Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, 2State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences,Peking University

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:15Installation and Testing
  • 02:56Identifying Novel MicroRNAs (miRNAs)
  • 03:33Reference Index Building
  • 04:42Results: Representative miRDP2 Performance
  • 05:45Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

अद्यतन संयंत्र मिरना मानदंड और एक ओवरहाल ्ड एल्गोरिदम के साथ एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन, अर्थात् एमआईआरदीप-पी 2 (एमआईआरपी2), पौधों में माइक्रोआरएनए ट्रांसक्रिप्टोम का सही और कुशलता से विश्लेषण कर सकती है, विशेष रूप से जटिल और बड़े जीनोम वाली प्रजातियों के लिए।

Tags

Bioinformatics PipelineMicroRNA TranscriptomesPlantsMiRDeep2Plant MicroRNAsTranscriptional RegulatorsPlant DevelopmentEnvironmental ChallengesFalse PositivesProcessing TimeHigh Confidence MicroRNA AnnotationGenome FunctionMiRDeep2 PipelineArabidopsis ThalianaGenome Reference IndexNoncoding RNA Reference IndexDeep Sequencing ReadsAdaptersFASTA Identifiers

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

पेप्टाइड व्युत्पन्न विधि पौधों में सेलुलर के उस पार जीन और प्रोटीन और Organellar बाधाओं को परिवहन करने के लिए

नकल संख्या बदलाव की जांच सिंगल सेल अनुक्रमण का उपयोग

रिकॉमबिनेंट Adeno-एसोसिएटेड वायरस सीरोटाइप 9 का उपयोग कर MicroRNA की प्रणालीगत डिलिवरी कुतर में Neuromuscular रोगों का इलाज

एक Optogenetic विधि को नियंत्रित करने और सेल में जीन अभिव्यक्ति पैटर्न का विश्लेषण करने वाली सेल बातचीत

संवैधानिक रोग के आनुवंशिक निर्धारकों का मूल्यांकन करने के लिए लक्षित अगली पीढ़ी के अनुक्रमण और Bioinformatics पाइपलाइन

C. एलिगेंस में जीनोमिक पॉइंट म्यूटेंट पैदा करने के लिए एक रैपिड और सतही पाइपलाइन का उपयोग CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

अलगाव, लक्षण वर्णन और मानव दंत कूप स्टेम सेल के MicroRNA आधारित आनुवंशिक संशोधन

इन विट्रो और में-सेल आकार छोटे अणु प्रेरित पूर्व mRNA संरचनात्मक परिवर्तन की जांच करने के लिए का उपयोग करना

विशेषता हिस्one पोस्ट-translational में संशोधन परिवर्तन खमीर न्यूरोडेजेनेरेटिव प्रोटिनोपैथी मॉडल

बढ़ाया खमीर एक संकर स्क्रीन मानव डीएनए दृश्यों के लिए प्रतिलेखन कारक की पहचान करने के लिए

Read Article