यहाँ, हम एक प्रोटोकॉल का वर्णन करने के लिए Trypanosoma cruzi के extracellular amastigote में एक जीन नॉकआउट परिचय, CRISPR / विकास phenotype या तो axenic amastigote संस्कृति की सेल गिनती द्वारा या मेजबान सेल आक्रमण के बाद intracellular amastigotes के प्रसार के द्वारा पीछा किया जा सकता है.