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L’analyse du réseau a été appliquée pour évaluer l’association de diverses communautés microbiennes écologiques, telles que le sol, l’eau et la rhizosphère. Présenté ici est un protocole sur la façon d’utiliser l’algorithme WGCNA pour analyser différents réseaux de co-occurrence qui peuvent se produire dans les communautés microbiennes en raison de différents environnements écologiques.