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Divergência de Microbiota Raiz em Diferentes Habitats baseados em Redes de Correlação Ponderada
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Biology
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JoVE Journal Biology
Divergence of Root Microbiota in Different Habitats based on Weighted Correlation Networks
DOI:

09:49 min

September 25, 2021

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Chapters

  • 00:06Introduction
  • 00:46I. Data Download
  • 01:05II. Optimal Power Value Determination
  • 02:38III. Construction of a Co-Expression Network and Module Identification
  • 04:25IV. Preservation Test
  • 05:44V. Correlation Analysis of the Module Membership
  • 06:55VI. Analysis of the Microbial Flora in the Microbial Differential Network Module
  • 07:43Resuts: Analysis of Differences in Rice delavayi Root Microbial Communities Based on Weighted Co‐Expression Network
  • 09:18Conclusion

Summary

Automatic Translation

A análise de rede foi aplicada para avaliar a associação de diversas comunidades microbianas ecológicas, como solo, água e rizosfera. Apresentado aqui é um protocolo sobre como usar o algoritmo WGCNA para analisar diferentes redes de co-ocorrência que podem ocorrer nas comunidades microbianas devido a diferentes ambientes ecológicos.

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