Yijun Ruan

Publications

• 系统的评价因素芯片 Seq 保真度。
  Nature Methods. Apr, 2012  |   Pubmed ID: 22522655
• Exome 测序的胃腺癌标识经常体细胞突变的细胞粘附和染色质重塑基因。
  Nature Genetics. Apr, 2012  |   Pubmed ID: 22484628
• 常见的 BIM 缺失多态性介导固有抵抗和酪氨酸激酶抑制剂在癌症的劣质回应。
  Nature Medicine. 2012  |   Pubmed ID: 22426421
• 启动子为中心的广泛染色质相互作用为转录调控提供拓扑的基础。
  Cell. Jan, 2012  |   Pubmed ID: 22265404
• 使用 5' 和 3' 配对结束标记下一代排序 (RNA PET) 基因组广泛全长谈话内容分析。
  Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2012  |   Pubmed ID: 22113299
• 多能干细胞介导 Ctcf 结构域功能的染色质 Interactome。
  Nature Genetics. Jul, 2011  |   Pubmed ID: 21685913
• DNA 病毒多样性病毒性宏基因组学的蚊子通过获得的广泛调查。
  PloS One. 2011  |   Pubmed ID: 21674005
• 真核基因组的高顺序结构和染色质交互网络。
  Journal of Cellular Biochemistry. Sep, 2011  |   Pubmed ID: 21520242
• 全面大跨度配对结束标记映射显示特征模式的上皮癌基因组在结构上的差异。
  Genome Research. May, 2011  |   Pubmed ID: 21467267
• 乳腺癌的基因组结构畸变转录造成的后果。
  Genome Research. May, 2011  |   Pubmed ID: 21467264
• 基因组测序的周年纪念。介绍人类基因组： 现在在 3D ！
  Science (New York, N.Y.). Feb, 2011  |   Pubmed ID: 21350163
• 转录因子结合的测定。
  Nature Genetics. Jan, 2011  |   Pubmed ID: 21217639
• 确定绑定选址的雌激素受体 α 基因组因素综合模型。
  Molecular Systems Biology. Dec, 2010  |   Pubmed ID: 21179027
• 全基因组分析揭示出甲基 CpG 结合蛋白 2 依赖规例的 Microrna Rett 综合征小鼠模型。
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2010  |   Pubmed ID: 20921386
• 系统生物学的多重平行双-结束-ditag 测序方法。
  Wiley Interdisciplinary Reviews. Systems Biology and Medicine. Mar-Apr, 2010  |   Pubmed ID: 20836024
• 癌症基因组项目的国际网络。
  Nature. Apr, 2010  |   Pubmed ID: 20393554
• 疽的积极选择基因组调查洞察了意外致病力的进化。
  PLoS Pathogens. Apr, 2010  |   Pubmed ID: 20368977
• 嘉宠物工具全面染色质相互作用分析与配对结束标记测序法。
  Genome Biology. 2010  |   Pubmed ID: 20181287
• 染色质相互作用分析使用配对结束标记测序。
  Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jan, 2010  |   Pubmed ID: 20069536
• 优惠协会之间共基因揭示系祖细胞的转录 Interactome。
  Nature Genetics. Jan, 2010  |   Pubmed ID: 20010836
• 雌激素受体 α 绑定人类染色质 Interactome。
  Nature. Nov, 2009  |   Pubmed ID: 19890323
• 再生水中病毒的宏基因组分析。
  Environmental Microbiology. Nov, 2009  |   Pubmed ID: 19555373
• 人雄激素受体/汗腺 A2 受体单倍型及对雄性秃的关系最近的积极选择。
  Human Genetics. Aug, 2009  |   Pubmed ID: 19373488
• 下一代 DNA 测序的转录组与基因组分析的配对结束标记 (PET)。
  Genome Research. Apr, 2009  |   Pubmed ID: 19339662
• De Novo 对成脂过程的 PPARgamma/RXR 结合位点和直接目标的识别。
  PloS One. 2009  |   Pubmed ID: 19300518
• 基于芯片的远距离染色质相互作用的鉴定方法。
  Journal of Cellular Biochemistry. May, 2009  |   Pubmed ID: 19247990
• 转座因子通过哺乳动物转录因子绑定汇辑 》 的演变。
  Genome Research. Nov, 2008  |   Pubmed ID: 18682548
• 解决多能干细胞的表观基因组。
  Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. Jul, 2008  |   Pubmed ID: 18640620
• 外部信号传导通路与胚胎干细胞的转录网络核心的集成。
  Cell. Jun, 2008  |   Pubmed ID: 18555785
• 在室内的城市环境中的机载宏基因组。
  PloS One. 2008  |   Pubmed ID: 18382653
• 功能性宏基因组的九个生物群落分析。
  Nature. Apr, 2008  |   Pubmed ID: 18337718
• 生物多样性与生物地理学的噬菌体在现代叠层石和 Thrombolites。
  Nature. Mar, 2008  |   Pubmed ID: 18311127
• 多个位移放大，放大复杂 DNA 库的使用。
  Nucleic Acids Research. Mar, 2008  |   Pubmed ID: 18285362
• 计算的分析与建模的芯片宠物实验中转录因子结合位点的基因组规模亲和力分布。
  Genome Informatics. International Conference on Genome Informatics. 2007  |   Pubmed ID: 18546507
• 组蛋白 H3 Lys4 和 27 Trimethylations 全基因组图谱揭示了人类胚胎干细胞中的不同基因组车厢。
  Cell Stem Cell. Sep, 2007  |   Pubmed ID: 18371363
• 转录组与基因组分析的配对端 DiTagging。
  Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jul, 2007  |   Pubmed ID: 18265396
• 全基因组图谱 RELA(p65) 绑定标识作为招聘的 NF 活化后 TLR4 激活转录激活因子 E2F1。
  Molecular Cell. Aug, 2007  |   Pubmed ID: 17707233
• 通路对黑色素瘤细胞配对端 DiTag Transcriptomes 中观察到的像差。
  BMC Cancer. 2007  |   Pubmed ID: 17594473
• 鉴定和分析 1%人类基因组所编码的试点项目中的功能元件。
  Nature. Jun, 2007  |   Pubmed ID: 17571346
• 在芯片的哺乳动物细胞中转录因子绑定区域的映射： 基于阵列和测序技术的比较。
  Genome Research. Jun, 2007  |   Pubmed ID: 17568005
• 假基因的编码区域： 共识注释、 分析转录，与演变。
  Genome Research. Jun, 2007  |   Pubmed ID: 17568002
• 融合成绩单和转录的 Retrotransposed 通过全面的转录组分析使用配对端 DiTags (宠物) 发现的基因位点。
  Genome Research. Jun, 2007  |   Pubmed ID: 17568001
• 制图学全基因组的雌激素受体 α 结合位点。
  PLoS Genetics. Jun, 2007  |   Pubmed ID: 17542648
• 在登革热感染期间了解主机响应基因组学方法。
  Novartis Foundation Symposium. 2006  |   Pubmed ID: 17319164
• C-Myc 绑定站点和目标 B 细胞中的基因网络的全局映射。
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2006  |   Pubmed ID: 17093053
• 宠物-工具： 综合处理和配对端 DiTag (PET) 序列数据管理软件套件。
  BMC Bioinformatics. 2006  |   Pubmed ID: 16934139
• 多重配对端 Ditags (MS PET) 的先后顺序： 超低高吞吐量分析与基因组策略。
  Nucleic Acids Research. 2006  |   Pubmed ID: 16840528
• Oct4 和 Nanog 转录网络规管在小鼠胚胎干细胞的多潜能。
  Nature Genetics. Apr, 2006  |   Pubmed ID: 16518401
• 在人类基因组中 P53 转录因子结合位点的世界地图。
  Cell. Jan, 2006  |   Pubmed ID: 16413492
• 人类粪便中的 RNA 病毒社区： 植物病原病毒的流行。
  PLoS Biology. Jan, 2006  |   Pubmed ID: 16336043
• 使用芯片的斑马鱼胚胎的转录组分析。
  PLoS Genetics. Aug, 2005  |   Pubmed ID: 16132083
• 转录过程表征及基因组注释的基因鉴定签名 (GIS) 分析。
  Nature Methods. Feb, 2005  |   Pubmed ID: 15782207
• 严重急性呼吸系统综合症病毒序列变异分析重新评估新加坡传输模式。
  PLoS Medicine. Feb, 2005  |   Pubmed ID: 15736999
• 状态、 质量和扩大国家卫生研究院全长 CDNA 项目： 哺乳动物基因集合 (MGC)。
  Genome Research. Oct, 2004  |   Pubmed ID: 15489334
• 在细胞培养和人群隔离在 2003 年的 SARS 冠状病毒的突变动力学。
  BMC Infectious Diseases. Sep, 2004  |   Pubmed ID: 15347429
• 5' 基因表达 （LongSAGE） 和 3' LongSAGE 的转录过程表征及基因组注释的长时间序列分析。
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2004  |   Pubmed ID: 15272081
• 实验室感染严重急性呼吸系统综合症。
  The New England Journal of Medicine. Apr, 2004  |   Pubmed ID: 15103000
• 讯问转录过程。
  Trends in Biotechnology. Jan, 2004  |   Pubmed ID: 14690619