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要使用双分子互补亲和纯化检测和分离一对特定的相互作用蛋白,请将一对双分子荧光互补质粒-转染剂混合物加入含有哺乳动物细胞的培养板中。
一个质粒编码一种相互作用的蛋白质——诱饵蛋白——与报告荧光蛋白片段融合。另一个质粒编码另一种结合蛋白——猎物蛋白——与荧光蛋白的互补片段融合。
孵化。转染剂促进质粒细胞摄取。成功转染的细胞表达细胞膜定位蛋白。
诱饵-猎物蛋白的相互作用使荧光蛋白片段更接近。这导致片段融合和重新折叠,形成功能性荧光蛋白,其荧光可以在荧光显微镜下可视化。
用
含有非离子去污剂的裂解缓冲液代替培养基,以破坏细胞膜,释放融合蛋白。将细胞裂解物收集在管中。离心机。
将
含有融合蛋白的上清液转移到新鲜的管中。添加与荧光蛋白靶向单域抗体纳米抗体偶联的琼脂糖珠,纳米抗体识别折叠荧光蛋白上的三维表位并结合。
离心机。将融合蛋白结合的琼脂糖珠重悬于缓冲液中。加热以将融合蛋白与琼脂糖珠解离。执行 SDS-PAGE 以分离单个蛋白质,然后使用荧光蛋白片段特异性抗体进行蛋白质印迹。
仅检测到带有荧光片段标记的相互作用蛋白质,从而确认它们的分离。
首先,将HEK293T细胞接种在含有 10 毫升 DMEM 的 10 厘米培养皿中。然后,在 500 微升转染缓冲液中稀释 2.5 微克每种双分子荧光互补载体。
加入 10 微升转染试剂,并将混合物涡旋 10 秒钟。然后,短暂离心样品,并在室温下孵育 10 分钟。接下来,将 DNA 转染混合物滴加到培养皿中。然后,将样品孵育 8 至 24 小时。
按照文本方案中所述制备细胞裂解缓冲液和补充的细胞裂解缓冲液。然后,用冰冷的PBS洗涤细胞两次。吸出PBS,并加入1毫升冰冷补充的细胞裂解缓冲液。
接下来,将盘子放在冰上,孵育五分钟。然后,使用细胞刮刀取出细胞并将它们转移到冷冻的微量离心管中。在 4 摄氏度下以 18,000 倍重力离心管 5 分钟,以去除细胞碎片。然后,将透明上清液转移到新鲜的微量离心管中。
在
1 毫升 PBS 中洗涤适量的琼脂糖珠。然后,以 300 倍重力离心珠子,并小心地除去上清液。接下来,向每个样品中加入20微升琼脂糖珠,并在4摄氏度下孵育两小时,端到端旋转。
以
300倍重力离心珠子,并在细胞裂解缓冲液中洗涤3次。然后,将洗涤的珠子重悬于 50 微升稀释的样品缓冲液中。最后,将样品在 95 摄氏度下加热两到三分钟。