2011年7月3日
描述一个简单,快速的方法确定了大量的植物生物量的样品糖化潜力。这种分析的自动化平台,涉及植物生物量在96孔板和随后的表现预处理,水解和释放糖的定量分析的准备。
你好,我是 Kara Ted,我是 Leo。支持我。我是 Simon McQueen Mason。
植物生物质的可消化性是当前备受关注的研究课题。这是因为在构成生物质的植物细胞壁多糖中蕴藏着大量糖类物质,如果我们能够以可利用的形式将这些糖类释放出来,就可以通过发酵生产各种产品,例如燃料和化学品。然而,这些材料极难消化,因此深入理解调控其可消化性的因素已成为一项紧迫的任务。
为了能够利用植物材料生产可再生资源,我们需要能够测定这些植物的糖化潜力。因此,在约克大学,我们正在对大量植物材料进行筛选,以确定它们的糖化潜力。糖化是指将复杂碳水化合物分解为其单糖组分,进而通过不同的工业过程生产有价值化学品的过程。
为了测定糖化潜力,我们在微尺度水平上模拟工业过程,对生物质进行预处理和酶水解,以测定所释放的糖含量。该方法可鉴定出具有优良性状的基因型品种。该高通量系统采用 IG 六孔板格式运行。
采用温和的水解条件以揭示不同基因型之间的细微差异,该方法还具有足够的灵活性,可支持不同的底物材料,并可用于评估不同的酶。我们使用的方法包括将植物材料制成粉末,然后在90摄氏度下用稀释的酸或碱预处理20分钟。接着,在50摄氏度下使用商业化的纤维素酶混合物进行酶解消化,持续八小时。
最后,采用MBTH法测定还原糖的释放量。植物材料以干燥茎秆形式收获,并切割成4毫米长的片段。将这些片段与三颗直径5毫米的金属球一同放入2毫升的样品瓶中。
每个小瓶均单独贴有条形码,通过扫描条形码以确保样本的可追溯性。将样本装入机器人中的研磨与分装设备。样本将被自动研磨并混合,以便将生物材料分装至96孔板中。
将小瓶穿刺后,再重新定位到机械臂中,使其置于一个振动的漏斗内,以分配粉末。漏斗的振动由天平调控,以确保每孔分配的粉末质量达到目标量。将生物量分配至板的10列中,预留两列为标准品孔。
每个样品进行四次重复,每块板加载20个样品。该板的水解产物将被分装到三块PCR板中,从而得到三块光学检测板。通过这种方法,每孔生物质中的还原糖均有三次测定。
制备完成后,使用硅胶垫密封板以防止蒸发。待准备就绪后,将其转移至液体处理机器人。在液体处理过程中,机器人可自动完成预处理、酶解以及释放糖类的测定。
两张两米长的实验台配备了盛放各种所需试剂的容器,以及用于存放塑料器皿的存储空间。实验室内设有用于预处理和水解的培养箱,以及用于糖分测定的热循环仪。预处理步骤在深孔板中进行。
通过向生物质粉末中加入稀酸或稀碱溶液。将平板转移至加热块中,在90摄氏度下孵育20分钟。孵育结束后,用500微升醋酸缓冲液冲洗五次以去除预处理试剂。
预处理步骤冲洗完毕后,加入酶混合液。这是一种标准混合物,包含纤维素酶和Novozyme 188,两者按4:1的比例混合,浓度为每孔7 FPU。
将平板在50摄氏度下振荡孵育8小时。取75 µL水解产物转移至PCR板中。在PCR板的第11和第12列中加入葡萄糖标准品。
随后向所有孔中加入25微升1摩尔的氢氧化钠。最后,将50微升MBTH试剂移液至PCR板中。在将水解物转移至第三块PCR板后,深孔板被储存保存。
将PCR板转移至热循环仪中,在60摄氏度下孵育15分钟。该过程的最后一步是将反应混合液转移至光学板以进行显色反应。孵育结束后,从热循环仪中取出PCR板。
向转移后的反应混合物中加入100 µL氧化试剂。为促进显色反应,液体处理程序在24小时内运行四次,其中预处理冲洗和酶的添加过程约需两小时。酶解反应持续八小时,糖的测定则需要另外两小时。
在第一块平板孵育八小时的同时,下一块平板开始进行处理。通过这种机器人资源分配方式,每天可完成三轮实验,每轮处理80个样品,以测定释放的还原糖量。光学平板的测定波长为620纳米。
所获得的结果经过分析,以量化反应每小时每毫克释放的糖量(单位为纳摩尔)。感谢观看,希望本视频能为您的生物燃料研究带来启发。
本文介绍了一种利用自动化平台快速评估不同植物生物质样品糖化潜力的方法。该过程以高通量形式进行,包括预处理、水解以及对释放糖分的定量分析。
高通量糖化分析能够快速、定量地评估木质纤维素生物质的可消化性,这是生物炼制原料优化中的关键瓶颈。该平台通过揭示基因型依赖性的糖释放差异,支持早期阶段的筛选和机制层面的风险评估。该方法可提高在工业生物技术流程中原料选择与工艺开发的预测可靠性。
这种高通量检测方法可整合到可再生原料从发现到开发的连续流程中,连接早期基因型筛选与临床前工艺验证。