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DOI: 10.3791/62008-v
Kelly Veerasammy*1,2, Yuki X. Chen*1,2, Sami Sauma*1, Mathilde Pruvost1, David K. Dansu1, Tenzin Choetso1,2, Tiffany Zhong3, Damien Marechal1, Patrizia Casaccia1, Rinat Abzalimov4,5, Ye He1,5
1The Graduate Center - Advanced Science Research Center, Neuroscience Initiative,The City University of New York, 2The City College of New York, CUNY, 3The Bronx High School of Science, 4The Graduate Center - Advanced Science Research Center, Structural Biology Initiative,The City University of New York, 5The Graduate Center - Advanced Science Research Center, MALDI MS Imaging Joint Core Facility,The City University of New York
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
本协议的目标是在规划使用 MALDI MSI 进行实验时,为样品制备提供详细的指导,以最大限度地提高生物样品中的代谢和分子检测。
MALDI 成像质谱法是代谢组学领域的一项独特进步,它使我们能够测量和可视化相对代谢物丰度和分布,这些都表明了生物体、生理和病理状况。MALDI 成像的主要优点是它能够检测 C2 中的代谢物,而无需标记。为了演示该程序,我们有来自 Patricia Casita 博士实验室的研究生 Sami Sauma。
Yuki Chen 和 Kelly Veerasammy,我实验室的学生研究人员。收获后,立即将组织放入液氮、冷却的铝箔船和聚苯乙烯盒中。根据组织的大小,盖上聚苯乙烯盒的盖子,将组织冷冻 2 到 10 分钟。
当组织充分冷冻后,使用镊子取出舟,并将固定在干冰箔内的组织运输到低温恒温器。在切片组织之前,请注意不要在载玻片上呼吸。使用手套和设置为电阻的电压表来测试适当数量的 MALDI 兼容氧化铟锡涂层载玻片的电导率以进行分析。
标记后,将载玻片放在干净的纸巾上,并将 70% 乙醇清洁的低温恒温器设置为零下 20 摄氏度。将组织样品放入低温恒温器中,并根据组织的类型设置低温恒温器室和标本头的温度。让组织平衡 30 分钟后,使用冷冻组织包埋化合物将组织安装到卡盘上。
并将干净的刀片放入载物台中并锁定,调整载物台的位置和试样的角度,以达到所需的切割角度。并切片组织,直到露出感兴趣的区域。当达到所需区域时,使用预冷的刷子小心地获得 10 到 12 微米厚的切片,但在采集时迅速将每个切片收集到每张载玻片的标记面上。
将手指放在载玻片下方以加热切片,以确保牢固地安装到载玻片上。切片将在 5 到 10 秒内变得透明,并在大约 30 到 60 秒后变得不透明。收集完所有切片后,将载玻片放入载玻片架中,然后用干冰带到亵渎者那里。
或者,玻片可以在真空箱中携带。将载玻片放入装有干燥剂的亵渎器中,将载玻片真空干燥 45 至 60 分钟。干燥后,如果不立即使用,请将载玻片放入载玻片转运车中,并在转运车中注入氮气。
用封口膜密封支架,然后将支架放入拉链袋中。然后将第一个拉链袋放入第二个贴有标签的拉链袋中,里面装有干燥剂,可在零下 80 摄氏度下存放长达六个月。脱水后,使用粗体银色标记在组织切片外的载玻片空白处放置 X 标记,并使用黑色细点标记在每个银色 X 的顶部放置第二个黑色 X。
在塑料盖上勾勒出样品位置,并将载玻片和 MALDI 目标放在平板扫描仪的表面上。然后预览幻灯片并选择所需的区域。以 16 位灰度扫描幻灯片,每英寸 2, 400 点,并保存图像以备后用。
要将基质涂抹到载玻片上,请打开自动基质喷涂装置,确保阀门位于负载处,然后启动喷涂软件。检查排气扇是否正常运行,并在 comms 选项卡下确认系统通信正确。以每分钟 100 微升的速度启动溶剂泵,背压约为 500 磅/平方英寸。
并将氮气罐设置为每平方英寸 30 磅,以启动压缩空气流向矩阵喷雾器。将喷雾器前部的压力调节器调整为每平方英寸 10 磅,并根据需要设置喷雾器喷嘴温度。在阀和负载位置,使用注射器用 7 毫升 70% 甲醇冲洗定量环,然后用 6 毫升基质填充定量环。
将空白载玻片放入支架和喷雾器中,用胶带固定两端以防止移动,并检查流速和温度是否稳定。按 start(开始)设置喷嘴温度并调整泵流速,以匹配所选方法。将阀门从加载切换到喷涂,然后单击继续。
允许系统运行完成。沉积完成后,将阀门从喷涂切换到加载,然后单击继续。在显微镜下检查矩阵编码的模式。
如果观察到均匀的细基质晶体层,则将基质沉积在适当的样品玻片上,如刚才所示。处理完所有载玻片后,按照制造商的说明清洁系统,以防止喷雾器喷嘴堵塞。在这里,从每 100 道尔顿区间中选择的质量放电谱图的 MALDI MS 成像数据分析的输出图像,清楚地显示了从小分子代谢物到高分子量脂质的谱图的识别效用。
每条道路都描绘了相应的离子热图,其中包含在出生后第 1 天、第 21 天和第 60 天收集的三个组织中特定代谢物物种的空间和光谱信息。MALDI MSI 方法的一个优势是能够辨别某些物种的特异性,这些物种是通过质荷比与发育里程碑或特定解剖结构的比来确定的。在该分析中,观察到一些代谢物在出生后第 1 天的新生儿或出生后第 60 天的成人中富集,或者在测试年龄中均匀分布。
观察到其他分子种类特别富含灰质、白质或脑脊髓液和脑室。还分析了代表性代谢物的空间分布,包括次黄嘌呤、谷氨酸、N-乙酰天冬氨酸、花生四烯酸和几种脂质。为了保持代谢统计物的保真度,适当的样品解剖、储存和 cyro 切片对于防止人工代谢变化至关重要。
进行 MALDI 实验后,您可能需要验证您发现的代谢物的身份。这可以通过微萃取和液相色谱串联 MS 来实现。MALDI MS 成像技术通过空间分辨率促进了基于代谢组学的调查,并为研究人员提供了在定量和视觉介质中确定代谢数据的机会。最近,人们对饮食对神经退行性疾病的影响、肠道微生物组与大脑之间的关系非常感兴趣。
因此,从神经发育到神经退行性变,神经科学中的代谢研究具有巨大的重要性。肠脑相互作用的主要事实。正是在这种背景下,MALDI 成像设施的想法才能真正提供出色的技术,以可视化特定作可能对大脑产生的影响。
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