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使用 MALDI 质谱成像进行代谢分析的示例准备
使用 MALDI 质谱成像进行代谢分析的示例准备
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JoVE Journal Biology
Sample Preparation for Metabolic Profiling using MALDI Mass Spectrometry Imaging

使用 MALDI 质谱成像进行代谢分析的示例准备

Full Text
6,852 Views
09:08 min
December 22, 2020

DOI: 10.3791/62008-v

Kelly Veerasammy*1,2, Yuki X. Chen*1,2, Sami Sauma*1, Mathilde Pruvost1, David K. Dansu1, Tenzin Choetso1,2, Tiffany Zhong3, Damien Marechal1, Patrizia Casaccia1, Rinat Abzalimov4,5, Ye He1,5

1The Graduate Center - Advanced Science Research Center, Neuroscience Initiative,The City University of New York, 2The City College of New York, CUNY, 3The Bronx High School of Science, 4The Graduate Center - Advanced Science Research Center, Structural Biology Initiative,The City University of New York, 5The Graduate Center - Advanced Science Research Center, MALDI MS Imaging Joint Core Facility,The City University of New York

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

本协议的目标是在规划使用 MALDI MSI 进行实验时,为样品制备提供详细的指导,以最大限度地提高生物样品中的代谢和分子检测。

MALDI 成像质谱法是代谢组学领域的一项独特进步,它使我们能够测量和可视化相对代谢物丰度和分布,这些都表明了生物体、生理和病理状况。MALDI 成像的主要优点是它能够检测 C2 中的代谢物,而无需标记。为了演示该程序,我们有来自 Patricia Casita 博士实验室的研究生 Sami Sauma。

Yuki Chen 和 Kelly Veerasammy,我实验室的学生研究人员。收获后,立即将组织放入液氮、冷却的铝箔船和聚苯乙烯盒中。根据组织的大小,盖上聚苯乙烯盒的盖子,将组织冷冻 2 到 10 分钟。

当组织充分冷冻后,使用镊子取出舟,并将固定在干冰箔内的组织运输到低温恒温器。在切片组织之前,请注意不要在载玻片上呼吸。使用手套和设置为电阻的电压表来测试适当数量的 MALDI 兼容氧化铟锡涂层载玻片的电导率以进行分析。

标记后,将载玻片放在干净的纸巾上,并将 70% 乙醇清洁的低温恒温器设置为零下 20 摄氏度。将组织样品放入低温恒温器中,并根据组织的类型设置低温恒温器室和标本头的温度。让组织平衡 30 分钟后,使用冷冻组织包埋化合物将组织安装到卡盘上。

并将干净的刀片放入载物台中并锁定,调整载物台的位置和试样的角度,以达到所需的切割角度。并切片组织,直到露出感兴趣的区域。当达到所需区域时,使用预冷的刷子小心地获得 10 到 12 微米厚的切片,但在采集时迅速将每个切片收集到每张载玻片的标记面上。

将手指放在载玻片下方以加热切片,以确保牢固地安装到载玻片上。切片将在 5 到 10 秒内变得透明,并在大约 30 到 60 秒后变得不透明。收集完所有切片后,将载玻片放入载玻片架中,然后用干冰带到亵渎者那里。

或者,玻片可以在真空箱中携带。将载玻片放入装有干燥剂的亵渎器中,将载玻片真空干燥 45 至 60 分钟。干燥后,如果不立即使用,请将载玻片放入载玻片转运车中,并在转运车中注入氮气。

用封口膜密封支架,然后将支架放入拉链袋中。然后将第一个拉链袋放入第二个贴有标签的拉链袋中,里面装有干燥剂,可在零下 80 摄氏度下存放长达六个月。脱水后,使用粗体银色标记在组织切片外的载玻片空白处放置 X 标记,并使用黑色细点标记在每个银色 X 的顶部放置第二个黑色 X。

在塑料盖上勾勒出样品位置,并将载玻片和 MALDI 目标放在平板扫描仪的表面上。然后预览幻灯片并选择所需的区域。以 16 位灰度扫描幻灯片,每英寸 2, 400 点,并保存图像以备后用。

要将基质涂抹到载玻片上,请打开自动基质喷涂装置,确保阀门位于负载处,然后启动喷涂软件。检查排气扇是否正常运行,并在 comms 选项卡下确认系统通信正确。以每分钟 100 微升的速度启动溶剂泵,背压约为 500 磅/平方英寸。

并将氮气罐设置为每平方英寸 30 磅,以启动压缩空气流向矩阵喷雾器。将喷雾器前部的压力调节器调整为每平方英寸 10 磅,并根据需要设置喷雾器喷嘴温度。在阀和负载位置,使用注射器用 7 毫升 70% 甲醇冲洗定量环,然后用 6 毫升基质填充定量环。

将空白载玻片放入支架和喷雾器中,用胶带固定两端以防止移动,并检查流速和温度是否稳定。按 start(开始)设置喷嘴温度并调整泵流速,以匹配所选方法。将阀门从加载切换到喷涂,然后单击继续。

允许系统运行完成。沉积完成后,将阀门从喷涂切换到加载,然后单击继续。在显微镜下检查矩阵编码的模式。

如果观察到均匀的细基质晶体层,则将基质沉积在适当的样品玻片上,如刚才所示。处理完所有载玻片后,按照制造商的说明清洁系统,以防止喷雾器喷嘴堵塞。在这里,从每 100 道尔顿区间中选择的质量放电谱图的 MALDI MS 成像数据分析的输出图像,清楚地显示了从小分子代谢物到高分子量脂质的谱图的识别效用。

每条道路都描绘了相应的离子热图,其中包含在出生后第 1 天、第 21 天和第 60 天收集的三个组织中特定代谢物物种的空间和光谱信息。MALDI MSI 方法的一个优势是能够辨别某些物种的特异性,这些物种是通过质荷比与发育里程碑或特定解剖结构的比来确定的。在该分析中,观察到一些代谢物在出生后第 1 天的新生儿或出生后第 60 天的成人中富集,或者在测试年龄中均匀分布。

观察到其他分子种类特别富含灰质、白质或脑脊髓液和脑室。还分析了代表性代谢物的空间分布,包括次黄嘌呤、谷氨酸、N-乙酰天冬氨酸、花生四烯酸和几种脂质。为了保持代谢统计物的保真度,适当的样品解剖、储存和 cyro 切片对于防止人工代谢变化至关重要。

进行 MALDI 实验后,您可能需要验证您发现的代谢物的身份。这可以通过微萃取和液相色谱串联 MS 来实现。MALDI MS 成像技术通过空间分辨率促进了基于代谢组学的调查,并为研究人员提供了在定量和视觉介质中确定代谢数据的机会。最近,人们对饮食对神经退行性疾病的影响、肠道微生物组与大脑之间的关系非常感兴趣。

因此,从神经发育到神经退行性变,神经科学中的代谢研究具有巨大的重要性。肠脑相互作用的主要事实。正是在这种背景下,MALDI 成像设施的想法才能真正提供出色的技术,以可视化特定作可能对大脑产生的影响。

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