April 3rd, 2026
这里,我们展示了一种标准方案,结合了多级质谱树和基于火相正奇口服液体的碎片过程。
开发了多阶段质谱断片方法,用于鉴定和表征火香正奇口腔液体中的复杂成分。传统的串联质谱法无法分辨未知的化合物结构。多级质谱技术提供更深的碎片,以实现全面的结构解析。
对于超高性能液相色谱制备,请双击Xcalibur软件打开。点击“准备下载”,然后点击“直接控制”。在弹窗中,点击泵模块列,将百分比B设置为50,百分比C为零,百分比D为零。
点击电机按钮切换到开启状态。点击更多选项,在弹窗中将流量设置为每分钟5毫升,时间设置为180秒。点击“清除”,然后点击“执行”,尽管弹窗里有警告。
返回主软件窗口,点击“序列设置视图”。点击“打开”以导入编辑后的模板。右键点击方法名称,点击打开文件即可打开方法文件。
在软件主窗口中,将第一个质量与电荷比设置为100,最后一个将质量与电荷比设置为1200。点击保存以保存方法。点击“运行序列”,在后续序列系统中选择“待机”,然后在弹出窗口点击“确定”。
等待样品注射完成。点击“路线图视图”,然后点击“Qual 浏览器”图标打开“Qual 浏览器窗口。点击打开,选择RAW格式的数据文件,双击打开。
右键点击色谱图窗口,点击“范围”。在扫描滤波器部分,选择ESI完整MS。在剧情类型部分,选择TIC,然后点击“确定”。观察显示的总离子色谱图。
点击质谱窗口中的按销按钮。在色谱图窗口中,点击并滑动,选择相对丰度最强的时间区。观察相应的质谱离子,并记录质量与电荷比值。
打开仪器设置窗口。找到N的母质量列,等于两行,输入之前记录的质量与电荷比值。点击保存以保存方法。
回到软件窗口的序列设置视图,修改文件名,点击保存以保存序列。点击“运行序列”,然后在弹窗中点击“确定”。等待样品注射完成。
进入Qual浏览器窗口,点击“打开”,选择RAW数据文件,双击打开。右键点击色谱图窗口,点击“范围”。在扫描滤波器部分,选择 ESI 完整,MS.In 图类型部分,选择 TIC,点击“好”显示色谱图。
在质谱窗口中,点击按钮。选择相对丰度最强的时间区域,观察质量谱离子。记录下一级质谱的质量与电荷比值。
在仪器设置窗口中,找到N的母质量列,等于三行,输入之前记录的质量与电荷比值。点击保存以保存方法。如前所述,重复数据查看程序以完成样品注入和分析。
打开原始数据文件后,点击质谱窗口中的按钮,观察片段离子峰的变化。在仪器设置窗口,进入行为类型栏,点击CID。然后选择PQD或ETD来更改碰撞模式。
在“归一化碰撞能量”栏中,点击35并改为50以调整碰撞能量。在绘图软件中绘制母离子和碎裂离子,包括母离子结构、化合物名称和质量电荷比值。例如,识别质量电荷比为461.15的碎片,并在串联质谱谱中观察质量电荷比为623.21的前驱离子。
计算质量差异。分析中间离子的进一步碎裂,质量与电荷比为461.15。要生成质量与电荷比为315.09的产物离子,需基于所有碎片的键位和连接分析计算质量差。
推断未知化合物的最终结构,质量与电荷比为623.21。未知化合物质量电荷比为623.21,损失了一个己糖单位,产生了质量电荷比为461.15的碎片离子。中间体的三级质谱断裂产生新白天使鸡,质量电荷比为315.09,且损失一个鼠梨酶单元。
新白天使石的四重质谱仪产生了质荷比为135.09的碎片离子。未知化合物的结构是通过多阶段断裂图样推断出来的。质量电荷比为545.41和365.12的未知化合物均采用相同的破碎方法推导。
该方案能够对药用草药和中药中专利药中更多未知化合物进行详细分析和结构表征。清晰理解主要组件的核心结构对于使用该协议进行准确的碎片化和分析至关重要。该程序使得开发多阶段质谱断片数据库为基础,以提升化合物鉴定和比较分析。
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This article presents a comprehensive technique for the structural exploration of unknown compounds in Chinese herbal compounds (CHCs), with a focus on Huoxiang Zhengqi oral liquid. The method leverages advanced mass spectrometry, particularly linear ion trap technology, to achieve deeper fragmentation and more detailed molecular characterization than traditional approaches. The developed workflow is applicable to the analysis of bioactive small molecules in traditional Chinese medicine.
Comprehensive structural elucidation of unknown small molecules in complex herbal mixtures is critical for advancing discovery-stage confidence in traditional medicine-derived therapeutics. The use of linear ion trap mass spectrometry enables deeper fragmentation and more detailed molecular characterization, directly supporting target validation and mechanistic de-risking in early R&D. This approach enhances the ability to link bioactive constituents to pharmacological mechanisms, informing portfolio decisions and translational research continuity.
This structural analysis technique fits at the interface of early discovery and lead identification, providing foundational molecular data for subsequent screening and translational studies.