Mikrobielle DNA-Isolierung im Stuhl: Untersuchung des Effekts der Umweltanreicherung auf die Mikrobiomdiversität im Maustumormodell

- Environmental Enrichment (EE) bezieht sich auf die Modifikationen der Haltungsparameter, um positive Auswirkungen auf verschiedene Krankheiten wie Krebs zu erzielen. Bei einer tumortragenden Maus aktiviert EE das Immunsystem und reduziert Entzündungen, was letztendlich die Darmmikrobiota verbessert und die Überlebensrate verbessert. Um die Veränderungen der Darmmikrobiota zu untersuchen, geben Sie die gewünschte Menge Stuhllysepuffer in ein Röhrchen, das den Mausstuhl enthält.

Die Probe zentrifugieren und den Überstand in ein frisches Mikrozentrifugenröhrchen überführen. Fügen Sie Guanidiniumchlorid-Lysepuffer hinzu, der DNase und RNase denaturiert. Fügen Sie als nächstes Ethanol hinzu und geben Sie die Probe in eine Siliziumdioxid-Spin-Säule.

Ethanol hilft der DNA, sich an Siliziumdioxid zu binden. Zentrifugieren Sie die Probe. Übertragen Sie nun die Säule in ein frisches Mikrozentrifugenröhrchen und fügen Sie der Säule einen Elutionspuffer hinzu, um die DNA zu eluieren.

Zentrifugieren Sie die Probe und entsorgen Sie die Säule. Übertragen Sie die Probe in ein PCR-Röhrchen und führen Sie eine PCR durch, um die DNA zu amplifizieren. Laden Sie die DNA auf Agarosegel und führen Sie