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DOI: 10.3791/55701-v
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Die Entwicklung der mikrobiellen Gemeinschaften hängt von einer Kombination von Faktoren ab, einschließlich Umweltarchitektur, Mitgliedshäufigkeit, Züge und Wechselwirkungen. Dieses Protokoll beschreibt eine synthetische, mikrogefertigte Umgebung für die gleichzeitige Verfolgung von Tausenden von Gemeinschaften, die in Femtoliter-Vertiefungen enthalten sind, wo Schlüsselfaktoren wie Nischengröße und Einschluss angenähert werden können.
Das übergeordnete Ziel dieser Methode ist die parallele Hochdurchsatzanalyse von mikrobiellen Gemeinschaften mit mehreren Mitgliedern in geschlossenen Umgebungen unter Verwendung von Silizium-Mikrotiter-Arrays. Der Hauptvorteil dieser Technik besteht darin, dass sie ein hochparalleles Screening von fein lokalisierten mikrobiellen Wechselwirkungen mit hohem Durchsatz ermöglicht, die für Industrie, Medizin und Umwelt von Bedeutung sind. Diese Methode kann dazu beitragen, Schlüsselfragen in den Bereichen Biomedizin und mikrobielle Ökologie zu beantworten, wie z.B. wie räumliche Einschränkungen, die auf feinen Skalen angelegt sind, deterministische und stochastische Parameter der Gemeinschaftsentwicklung beeinflussen und welche Auswirkungen dies auf die Häufigkeit und Organisation mikrobieller Mitglieder hat.
Beginnen Sie mit der Vorbereitung der Micro-Well-Arrays. Schneiden Sie zunächst einzelne Micro-Well-Array-Chips aus Siliziumwafern, die mit mehreren Arrays gedruckt wurden, mit einem Diamantritzer. Jeder einzelne Chip enthält Sub-Arrays von Wells mit Durchmessern von fünf bis 100 Mikrometern in drei verschiedenen Abstandsdichten.
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