Drosophila melanogaster es un sistema experimental clave en el estudio de la regulación de la grasa. Actualmente existen numerosas técnicas para medir los niveles de grasa almacenada en Drosophila, pero la mayoría son costosas y/o laboriosas y tienen claras limitaciones. Aquí, presentamos un método para determinar de manera rápida y económica los niveles de grasa del organismo en larvas de Drosophila L3. La técnica se basa en las diferencias de densidad entre los tejidos magros y grasos y permite la detección rápida de fenotipos magros y grasos. Hemos verificado la precisión de este método mediante la comparación con el porcentaje de grasa corporal determinado por extracción de lípidos neutros y cromatografía de gases junto con espectrometría de masas (GCMS). Además, describimos protocolos detallados para la recolección y sincronización de larvas, así como recetas experimentales relevantes. La técnica que se presenta a continuación supera las principales deficiencias de los métodos de cuantificación de lípidos más utilizados y proporciona una forma eficaz de cribar de forma rápida y sensible las larvas L3 para detectar fenotipos de regulación de la grasa, manteniendo al mismo tiempo la integridad de las larvas. Este ensayo tiene amplias aplicaciones para el estudio del metabolismo y la regulación de la grasa utilizando Drosophila.