Análisis cuantitativo de empalmes alternativos del Pre-mRNA en secciones de cerebro de ratón usando análisis de ARN In Situ hibridación

Este método puede ayudar a responder preguntas clave en el campo del empalme alternativo de pre-ARNm. En concreto, proporciona un sistema de ensayo robusto y sensible para examinar patrones de empalme alternativos in situ en cortes de tejido. Con este método, el empalme alternativo se puede analizar simultáneamente en muchos subtipos que están contenidos en estructuras biológicas complejas, como el cerebro de un ratón.

La principal ventaja de esta técnica es que utiliza sondas de unión de exones antiestáticas de choque en la hibridación in situ de ARNm para producir señales de hibridación específicas de isoformas. La tecnología de amplificación de señal de construcción aumenta la sensibilidad de la detección para proporcionar señales de hibridación robustas. La señal detectada fue la inclusión de exones que escapó de sondas específicas que se utilizan para calcular el porcentaje de empalme en los signos vitales en diferentes áreas anatómicas del cerebro de un ratón.