Preparazione del campione all'analisi bioinformatica della metilazione del DNA: strategia di associazione per l'obesità e studi sui tratti correlati

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6 maggio 2022

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6 maggio 2022

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Natália Yumi Noronha^*¹ , Guilherme da Silva Rodrigues^*¹ , Marcela Augusta de Souza Pinhel¹ , Jean-Baptiste Cazier²^,³ , Lígia Moriguchi Watanabe¹ , Albert Nobre Menezes⁴ , Carlos Roberto Bueno⁵ , Carolina Ferreira Nicoletti¹ , Bruno Affonso Parenti de Oliveira¹ , Isabelle Mello Schineider⁶ , Isabella Harumi Yonehara Noma⁷ , Igor Caetano Dias Alcarás⁸ , Fernando Barbosa⁹ , Carla Barbosa Nonino⁶

¹Department of Internal Medicine, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, ²Centre for Computational Biology, University of Birmingham, ³Institute of Cancer and Genomic Sciences, College of Medical and Dental Sciences, University of Birmingham, ⁴Cancer Genetics and Evolution Laboratory, Cancer Research UK, Institute of Genetics & Molecular Medicine, The University of Edinburgh, ⁵Ribeirão Preto School of Physical Education and Sport, University of São Paulo, ⁶Health Sciences Department, Ribeirao Preto Medical School, University of Sao Paulo, ⁷Faculty of Pharmaceutical Sciences, University of São Paulo, ⁸Department of Genetics, Ribeirão Preto Medical School, University of São Paulo, ⁹Department of Clinical, Bromatological and Toxicological Analysis, Faculty of Pharmaceutical Sciences of Ribeirao Preto, University of São Paulo

^* These authors contributed equally

Il presente studio descrive il flusso di lavoro per gestire i dati di metilazione del DNA ottenuti dalle tecnologie microarray. Il protocollo illustra i passaggi dalla preparazione del campione all'analisi dei dati. Tutte le procedure sono descritte in dettaglio e il video mostra i passaggi significativi.