Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Anthony A. High; Haiyan Tan; Vishwajeeth R. Pagala; Mingming Niu; Ji-Hoon Cho; Xusheng Wang; Bing Bai; Junmin Peng

doi:10.3791/56474

定圧ラベリング、豊富な液体クロマトグラフィー、質量分析法、およびソフトウェアによる定量化して深い...

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Biochemistry

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Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

定圧ラベリング、豊富な液体クロマトグラフィー、質量分析法、およびソフトウェアによる定量化して深いプロテオームをプロファイリング

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10:37 min

November 15, 2017

DOI: 10.3791/56474-v

Anthony A. High¹, Haiyan Tan¹, Vishwajeeth R. Pagala¹, Mingming Niu^2,3, Ji-Hoon Cho¹, Xusheng Wang¹, Bing Bai², Junmin Peng^1,2

¹St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children's Research Hospital, ²Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children's Research Hospital, ³Heilongjiang University of Chinese Medicine

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

正確に高分解能質量分析計を接続した液体クロマトグラフィーによる定圧ラベリング、広範な分別、バイオインフォマティクスツールの組み合わせで品質管理手順と蛋白質を量的にプロトコルを提案します。

この実験の全体的な目標は、さまざまな薬物治療、時間経過、または生物学的条件にわたって、細胞または組織溶解物から10, 000を超えるタンパク質を特定し、正確に定量することです。この方法は、薬物やその他の生物学的刺激に反応してどのタンパク質が変化しているかなど、医学や生物学の分野における重要な質問に答えるのに役立ちます。この手法の主な利点は、10の異なる実験条件で発現したプロテオームの70%以上を正確に定量する能力があることです。

この技術の意味は、潜在的なバイオマーカーの発見を通じて、ヒトの疾患の診断にまで拡張することができます。最適な細胞溶解と体液推定が下流の消化、標識、および分離手順において重要な役割を果たすため、この方法の視覚的なデモンストレーションは非常に重要です。このプロトコールを開始するには、目的の培養細胞を入手してください。

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