Name: Detectie van doelgerichte veranderingen bij niet-kleincellige longkanker met behulp van sequencing van de volgende generatie (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-10-10T14:25:00.000+00:00
Duration: 5 min 17 s
Description: Leer een geautomatiseerde next-generation sequencing workflow voor niet-kleincellige longkanker. Dit ISO15189-geaccrediteerde protocol detecteert doelgerichte genomische veranderingen in formol-gefixeerde paraffine-ingebakken weefsels voor nauwkeurige diagnostiek.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Feng, R. M., Zong, Y. N., Cao, S. M., Xu, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+cancer+situation+in+China%3A+Good+or+bad+news+from+the+2018+global+cancer+statistics%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Commun+%28Lond%29%22%5BJournal%5D)">Current cancer situation in China: Good or bad news from the 2018 global cancer statistics.</a> Cancer Commun (Lond). 39 (1), 22(2019).</li>
<li>Siegel, R. L., Kratzer, T. B., Giaquinto, A. N., Sung, H., Jemal, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cancer+statistics%2C+2025%5BTitle%5D)+AND+%22CA+Cancer+J+Clin%22%5BJournal%5D)">Cancer statistics, 2025.</a> CA Cancer J Clin. 75 (1), 10-45 (2025).</li>
<li>Sung, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Global+cancer+statistics+2020%3A+Globocan+estimates+of+incidence+and+mortality+worldwide+for+36+cancers+in+185+countries%5BTitle%5D)+AND+%22CA+Cancer+J+Clin%22%5BJournal%5D)">Global cancer statistics 2020: Globocan estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries.</a> CA Cancer J Clin. 71 (3), 209-249 (2021).</li>
<li>Fukuoka, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-institutional+randomized+phase+II+trial+of+gefitinib+for+previously+treated+patients+with+advanced+non-small-cell+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">Multi-institutional randomized phase II trial of gefitinib for previously treated patients with advanced non-small-cell lung cancer.</a> J Clin Oncol. 41 (6), 1162-1171 (2023).</li>
<li>Kris, M. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficacy+of+gefitinib%2C+an+inhibitor+of+the+epidermal+growth+factor+receptor+tyrosine+kinase%2C+in+symptomatic+patients+with+non-small+cell+lung+cancer%3A+A+randomized+trial%5BTitle%5D)+AND+%22JAMA%22%5BJournal%5D)">Efficacy of gefitinib, an inhibitor of the epidermal growth factor receptor tyrosine kinase, in symptomatic patients with non-small cell lung cancer: A randomized trial.</a> JAMA. 290 (16), 2149-2158 (2003).</li>
<li>Zhou, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Erlotinib+versus+chemotherapy+as+first-line+treatment+for+patients+with+advanced+EGFR+mutation-positive+non-small-cell+lung+cancer+%28OPTIMAL%2C+CTONG-0802%29%3A+A+multicentre%2C+open-label%2C+randomised%2C+phase+3+study%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet+Oncol%22%5BJournal%5D)">Erlotinib versus chemotherapy as first-line treatment for patients with advanced EGFR mutation-positive non-small-cell lung cancer (OPTIMAL, CTONG-0802): A multicentre, open-label, randomised, phase 3 study.</a> Lancet Oncol. 12 (8), 735-742 (2011).</li>
<li>Wu, K., House, L., Liu, W., Cho, W. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+targeted+therapy+for+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Zhongguo+Fei+Ai+Za+Zhi%22%5BJournal%5D)">Personalized targeted therapy for lung cancer.</a> Zhongguo Fei Ai Za Zhi. 16 (8), C21-C34 (2013).</li>
<li>Sharma, S. V., Settleman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oncogenic+shock%3A+Turning+an+activated+kinase+against+the+tumor+cell%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Cycle%22%5BJournal%5D)">Oncogenic shock: Turning an activated kinase against the tumor cell.</a> Cell Cycle. 5 (24), 2878-2880 (2006).</li>
<li>Kumar, S. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+early+growth+response+1+%28EGR1%29+expression+correlates+with+resistance+to+anti-EGFR+treatment+in+vitro+and+with+poorer+outcome+in+metastatic+colorectal+cancer+patients+treated+with+cetuximab%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Transl+Oncol%22%5BJournal%5D)">High early growth response 1 (EGR1) expression correlates with resistance to anti-EGFR treatment in vitro and with poorer outcome in metastatic colorectal cancer patients treated with cetuximab.</a> Clin Transl Oncol. 19 (6), 718-726 (2017).</li>
<li>Li, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Status+of+10+targeted+genes+of+non-small+cell+lung+cancer+in+Eastern+China%3A+A+study+of+884+patients+based+on+NGS+in+a+single+institution%5BTitle%5D)+AND+%22Thorac+Cancer%22%5BJournal%5D)">Status of 10 targeted genes of non-small cell lung cancer in Eastern China: A study of 884 patients based on NGS in a single institution.</a> Thorac Cancer. 11 (9), 2580-2589 (2020).</li>
<li>Wen, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+signature+of+driver+genes+identified+by+target+next-generation+sequencing+in+Chinese+non-small+cell+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Oncologist%22%5BJournal%5D)">Genomic signature of driver genes identified by target next-generation sequencing in Chinese non-small cell lung cancer.</a> Oncologist. 24 (11), e1070-e1081 (2019).</li>
<li>Tan, N., Li, Y., Ying, J., Chen, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histological+transformation+in+lung+adenocarcinoma%3A+Insights+of+mechanisms+and+therapeutic+windows%5BTitle%5D)+AND+%22J+Transl+Int+Med%22%5BJournal%5D)">Histological transformation in lung adenocarcinoma: Insights of mechanisms and therapeutic windows.</a> J Transl Int Med. 12 (5), 452-465 (2024).</li>
<li>Coco, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next+generation+sequencing+in+non-small+cell+lung+cancer%3A+New+avenues+toward+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Drug+Targets%22%5BJournal%5D)">Next generation sequencing in non-small cell lung cancer: New avenues toward personalized medicine.</a> Curr Drug Targets. 16 (1), 47-59 (2015).</li>
<li>Yang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+molecular+and+cellular+choreography+of+early+mammalian+lung+development%5BTitle%5D)+AND+%22Med+Rev%22%5BJournal%5D)">The molecular and cellular choreography of early mammalian lung development.</a> Med Rev. 4 (3), 192-206 (2024).</li>
<li>Wang, R., Wang, G., Zhang, N., Li, X., Liu, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+evaluation+and+cost-effectiveness+analysis+of+serum+tumor+markers+in+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Res+Int%22%5BJournal%5D)">Clinical evaluation and cost-effectiveness analysis of serum tumor markers in lung cancer.</a> Biomed Res Int. 2013, 195692(2013).</li>
<li>McGinn, S., Gut, I. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+sequencing-spanning+the+generations%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">DNA sequencing-spanning the generations.</a> Nat Biotechnol. 30 (4), 366-372 (2013).</li>
<li>Larson, N. B., Oberg, A. L., Adjei, A. A., Wang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+clinician%27s+guide+to+bioinformatics+for+next-generation+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22J+Thorac+Oncol%22%5BJournal%5D)">A clinician's guide to bioinformatics for next-generation sequencing.</a> J Thorac Oncol. 18 (2), 143-157 (2023).</li>
<li>McCombie, W. R., McPherson, J. D., Mardis, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-generation+sequencing+technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb+Perspect+Med%22%5BJournal%5D)">Next-generation sequencing technologies.</a> Cold Spring Harb Perspect Med. 9 (11), a036798(2019).</li>
<li>Van Dijk, E. L., Jaszczyszyn, Y., Thermes, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Library+preparation+methods+for+next-generation+sequencing%3A+Tone+down+the+bias%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Cell+Res%22%5BJournal%5D)">Library preparation methods for next-generation sequencing: Tone down the bias.</a> Exp Cell Res. 322 (1), 12-20 (2014).</li>
<li>Rao, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Potential+unreliability+of+ALK+variant+allele+frequency+in+the+efficacy+prediction+of+targeted+therapy+in+NSCLC%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Med%22%5BJournal%5D)">Potential unreliability of ALK variant allele frequency in the efficacy prediction of targeted therapy in NSCLC.</a> Front Med. 17 (3), 493-502 (2023).</li>
<li>Koontz, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agarose+gel+electrophoresis%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">Agarose gel electrophoresis.</a> Methods Enzymol. 529, 35-45 (2013).</li>
<li>Holmes, D. L., Stellwagen, N. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Electrophoresis+of+DNA+in+oriented+agarose+gels%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomol+Struct+Dyn%22%5BJournal%5D)">Electrophoresis of DNA in oriented agarose gels.</a> J Biomol Struct Dyn. 7 (2), 311-327 (1989).</li>
<li>Liu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quality+control+of+next-generation+sequencing-based+in+vitro+diagnostic+test+for+onco-relevant+mutations+using+multiplex+reference+materials+in+plasma%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cancer%22%5BJournal%5D)">Quality control of next-generation sequencing-based in vitro diagnostic test for onco-relevant mutations using multiplex reference materials in plasma.</a> J Cancer. 9 (9), 1680-1688 (2018).</li>
<li>Zhang, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+improved+NGS+library+construction+approach+using+DNA+isolated+from+human+cancer+formalin-fixed+paraffin-embedded+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Anat+Rec+%28Hoboken%29%22%5BJournal%5D)">An improved NGS library construction approach using DNA isolated from human cancer formalin-fixed paraffin-embedded samples.</a> Anat Rec (Hoboken). 302 (6), 941-946 (2019).</li>
<li>Wood, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((National+comprehensive+cancer+network+%28NCCN%29+clinical+practice+guidelines+for+lung+cancer+screening%5BTitle%5D)+AND+%22Thorac+Surg+Clin%22%5BJournal%5D)">National comprehensive cancer network (NCCN) clinical practice guidelines for lung cancer screening.</a> Thorac Surg Clin. 25 (2), 185-197 (2015).</li>
<li>Chinese Society of Pathology Quality Control, Chinese Medical Association Chinese Society of Oncology, China Anti-Cancer Association Chinese Society of Lung Cancer, Chinese Thoracic Oncology Group. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Guidelines+on+clinical+practice+of+molecular+tests+in+non-small+cell+lung+cancer+in+China%5BTitle%5D)+AND+%22Zhonghua+Bing+Li+Xue+Za+Zhi%22%5BJournal%5D)">Guidelines on clinical practice of molecular tests in non-small cell lung cancer in China.</a> Zhonghua Bing Li Xue Za Zhi. 50 (4), 323-332 (2021).</li>
<li>Rao, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developing+an+effective+quality+evaluation+strategy+of+next-generation+sequencing+for+accurate+detecting+non-small+cell+lung+cancer+samples+with+variable+characteristics%3A+A+real-world+clinical+practice%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cancer+Res+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">Developing an effective quality evaluation strategy of next-generation sequencing for accurate detecting non-small cell lung cancer samples with variable characteristics: A real-world clinical practice.</a> J Cancer Res Clin Oncol. 149 (8), 4889-4897 (2023).</li>
<li>Hutchins, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Practical+guidance+to+implementing+quality+management+systems+in+public+health+laboratories+performing+next-generation+sequencing%3A+Personnel%2C+equipment%2C+and+process+management+%28Phase+1%29%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Practical guidance to implementing quality management systems in public health laboratories performing next-generation sequencing: Personnel, equipment, and process management (Phase 1).</a> J Clin Microbiol. 57 (8), e00261-e00319 (2019).</li>
<li>Haile, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+high+throughput+nucleic+acid+purification+from+formalin-fixed+paraffin-embedded+tissue+samples+for+next+generation+sequence+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Automated high throughput nucleic acid purification from formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples for next generation sequence analysis.</a> PLoS One. 12 (6), e0178706(2017).</li>
<li>Larguinho, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+fast+and+efficient+ultrasonic-based+strategy+for+DNA+fragmentation%5BTitle%5D)+AND+%22Talanta%22%5BJournal%5D)">Development of a fast and efficient ultrasonic-based strategy for DNA fragmentation.</a> Talanta. 81 (3), 881-886 (2010).</li>
<li>Xuan, J., Yu, Y., Qing, T., Guo, L., Shi, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Next-generation+sequencing+in+the+clinic%3A+Promises+and+challenges%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Lett%22%5BJournal%5D)">Next-generation sequencing in the clinic: Promises and challenges.</a> Cancer Lett. 340 (2), 284-295 (2013).</li>
<li>Senst, A., Bonsiepe, H., Kron, S., Schulz, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+the+Agilent+2100+bioanalyzer+instrument+as+quality+control+for+next-generation+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22J+Forensic+Sci%22%5BJournal%5D)">Application of the Agilent 2100 bioanalyzer instrument as quality control for next-generation sequencing.</a> J Forensic Sci. 69 (6), 2192-2196 (2024).</li>
<li>Li, W., Qiu, T., Ling, Y., Gao, S., Ying, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Subjecting+appropriate+lung+adenocarcinoma+samples+to+next-generation+sequencing-based+molecular+testing%3A+Challenges+and+possible+solutions%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Oncol%22%5BJournal%5D)">Subjecting appropriate lung adenocarcinoma samples to next-generation sequencing-based molecular testing: Challenges and possible solutions.</a> Mol Oncol. 12 (5), 677-689 (2018).</li>
<li>Li, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Potential+unreliability+of+uncommon+ALK%2C+ROS1%2C+and+RET+genomic+breakpoints+in+predicting+the+efficacy+of+targeted+therapy+in+NSCLC%5BTitle%5D)+AND+%22J+Thorac+Oncol%22%5BJournal%5D)">Potential unreliability of uncommon ALK, ROS1, and RET genomic breakpoints in predicting the efficacy of targeted therapy in NSCLC.</a> J Thorac Oncol. 16 (3), 404-418 (2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>&nbsp;Agilent&nbsp; High Sensitivity DNA Kit</td><td>&nbsp;Agilent</td><td>5067-4626</td><td>Voor gebruik met het&nbsp; Agilent 2100 Bioanalyzer System</td></tr><tr><td>&nbsp;Agilent DNA 1000 Reagents Kit</td><td>&nbsp;Agilent</td><td>5067-1504</td><td>Voor gebruik met het&nbsp; Agilent 2100 Bioanalyzer System</td></tr><tr><td>Agilent 2100 Bioanalyzer</td><td>Agilent</td><td>G2939A</td><td>Beoordeel de fragmentgrootte van de bibliotheek en de aanwezigheid van adapters.&nbsp;</td></tr><tr><td>Concert Volledig automatisch nucleïnezuur zuiveringsinstrument</td><td>CONCERT</td><td>MC1002</td><td>Gebaat voor DNA-extractie</td></tr><tr><td>Equalbit 1&times;dsDNA HS Assay Kit</td><td>Vazyme</td><td>EQ121-02-AA</td><td>Voor gebruik met de&nbsp; Qubit 3.0 Fluorometer</td></tr><tr><td>Human EGRR/KRAS/BRAF/ALK genmutatie gecombineerde detectiekit</td><td>Burning Rock</td><td>BR-LC00102</td><td>bibliotheekconstructie</td></tr><tr><td>Magnis BR</td><td>Agilent Technologies</td><td>G7595AA</td><td>Automatische NGS bibliotheekvoorbereiding</td></tr><tr><td>ME220 Focused-ultrasonicator</td><td>Covaris</td><td>500396</td><td>ultrasone behandeling</td></tr><tr><td>NanoDrop One/OneC</td><td>Thermo Fisher</td><td>ND-ONE-W</td><td>Volle golflengte UV zichtbare spectrofotometrische detectie</td></tr><tr><td>NextSeq 550Dx</td><td>Illumina</td><td>20005715</td><td>sequence</td></tr><tr><td>NSQ 500/550 Hi Output KT v2.5(300CYS)</td><td>Illumina</td><td>20024908</td><td>Voor gebruik met de NextSeq 550Dx</td></tr><tr><td>Nucleïnezuur extractiereagens</td><td>CONCERT</td><td>RC1102</td><td>Gebaat voor DNA-extractie</td></tr><tr><td>Qubit 3.0 Fluorometer</td><td>Life</td><td>Q33216</td><td>Gebaat voor nucleïnezuur of bibliotheekconcentratie detectie</td></tr><tr><td>Qubit dsDNA HS Assay Kit</td><td>Life</td><td>Q32851</td><td>Voor gebruik met de&nbsp; Qubit 3.0 Fluorometer</td></tr></tbody></table>

detectie van doelgerichte veranderingen bij niet-kleincellige longkanker met behulp van sequencing van de volgende generatie

Detection of Targetable Alterations in Non-small Cell Lung Cancer using Next-generation Sequencing

Detectie van doelgerichte veranderingen bij niet-kleincellige longkanker met behulp van sequencing van de volgende generatie

The success of targeted therapy in non-small cell lung cancer (NSCLC) hinges on the precise identification of driver alterations, including mutations, ...

detection-targetable-alterations-non-small-cell-lung-cancer-using

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Kankeronderzoek

We beschrijven de bereiding van barcode DNA-bibliotheken en daaropvolgende hybridisatie gebaseerde exon vastleggen voor de detectie van de belangrijkste kanker-geassocieerde mutaties in klinische monsters tumor door massaal parallelle "next generation" sequencing. Gerichte exon sequentie biedt de voordelen van hoge doorvoer, lage kosten en diepe sequentie dekking, hetgeen aldus hoge gevoeligheid voor het detecteren van lage frequentie mutaties.

Detecteren Somatische genetische veranderingen in tumorspecimens door Exon Capture en Massively Parallel Sequencing

Dit manuscript beschrijft klinische protocollen voor twee next-generation sequencing panelen. Het ene paneel onderzoekt hematologische maligniteiten, terwijl het andere paneel zich richt op genen die vaak gemutaeerd zijn in solide tumoren. Moleculaire classificatie van drivermutaties in humane maligniteiten biedt waardevolle prognostische en voorspellende informatie.

Next Generation Sequencing voor de detectie van beroep Mutaties in vaste en vloeibare Tumoren

Er wordt een geïntegreerd systeem beschreven voor gerichte next-generation sequencing van oncologische monsters. Dit cross-platform systeem is geoptimaliseerd voor tumorbiopsies van lage kwaliteit en lage hoeveelheid, past zich aan lage DNA-inputs aan, omvat goed gekarakteriseerde multi-variant controles en beschikt over een nieuwe variant caller die wordt geïnformeerd door kwantitatieve pre-analytische kwaliteitscontrolemaatregelen.

Integratie van Nat en droog Bench Processen Optimaliseert Gerichte next-generation sequencing van lage kwaliteit en lage hoeveelheid tumorbiopten

Dit manuscript beschrijft een techniek voor het opsporen van mutaties van lage frequentie in ctDNA, ER-Seq. Deze methode is onderscheiden zich door het unieke gebruik van twee-directionele foutcorrectie, een speciale achtergrond filter en efficiënte moleculaire verwerving.

Detectie van zeldzame mutaties in CtDNA met behulp van de volgende generatie Sequencing

Het verkrijgen van kwalitatief hoogwaardige genomic DNA van tumor weefsels is een essentiële eerste stap voor het analyseren van de genetische veranderingen met behulp van de volgende generatie sequencing. In dit artikel presenteren we een eenvoudige en snelle methode om tumorcellen te verrijken en te verkrijgen intact DNA touch Impressum cytologie specimens.

Eenvoudige en snelle methode om kwalitatief hoogwaardige Tumor DNA uit klinisch-pathologische monsters met behulp van Touch Impressum cytologie

Dit artikel beschrijft een methode voor het identificeren van klonale en subclonale veranderingen tussen verschillende specimens van een bepaalde patiënt. Hoewel de hier beschreven experimenten gericht zijn op een specifiek tumor type, is de aanpak algemeen toepasbaar op andere vaste tumoren.

Vergelijkende laesies analyse door middel van een gerichte sequentie benadering

Hier presenteren we een protocol om de werkzaamheid van gerichte therapieën geselecteerd op basis van de genomische samenstelling van een tumor te testen. Het protocol beschrijft identificatie en validatie van structurele DNA-herschikkingen, engraftmentatie van tumoren van patiënten in muizen en het testen van reacties op overeenkomstige geneesmiddelen.

Testen gerichte therapieën bij kanker met behulp van structurele DNA-wijzigingsanalyse en patiënt-afgeleide Xenografts

De toename van moleculaire biomarkers die moeten worden getest voor niet-plaveiselcelcarcinoom niet-kleincellige longkanker (NS-NSCLC) zorgmanagement heeft geleid tot de ontwikkeling van snelle en betrouwbare moleculaire detectiemethoden. We beschrijven een workflow voor de beoordeling van genomische veranderingen voor NS-NSCLC-patiënten met behulp van een ultrasnelle next generation sequencing (NGS)-benadering.

Ultrasnelle amplicon-gebaseerde sequencing van de volgende generatie bij niet-plaveiselcelkanker

Dit manuscript beschrijft een methode om te kwantificeren tumor cel accumulatie in de longen in een diermodel van uitzaaiing van de tumor.

Long Tumor cel aanwerving Assay

Het doel van dit artikel is bedoeld als een gedetailleerde beschrijving van het protocol voor de pulmonaire metastase assay (PuMA). Dit model staat onderzoekers bestuderen metastatische Osteosarcoom (OS) celgroei in longweefsel met behulp van een widefield fluorescentie- of confocale laser scanning microscoop.

Praktische overwegingen bij het bestuderen van uitgezaaide longkanker kolonisatie in met behulp van de pulmonaire metastase Assay Osteosarcoom

Leer een geautomatiseerde next-generation sequencing workflow voor niet-kleincellige longkanker. Dit ISO15189-geaccrediteerde protocol detecteert doelgerichte genomische veranderingen in formol-gefixeerde paraffine-ingebakken weefsels voor nauwkeurige diagnostiek.

Detectie van doelgerichte veranderingen bij niet-kleincellige longkanker met behulp van sequencing van de volgende generatie

Meer video's verkennen