חצי אוטומטיות Heartbeat ניתוח אופטי של לבבות קטנים
Summary
פיתחנו חצי אוטומטיות Heartbeat אופטי ניתוח בשיטה (סוהא) לניתוח הקלטות מהירות גבוהה אופטי מ<em> תסיסנית</em>, דג הזברה ולבבות עובריים בעכבר. אנו להדגים את היישום של המתודולוגיה שלנו לניתוח של תפקוד הלב זבוב הפירות ולבבות עכבר עובריים.
Abstract
פיתחנו שיטה לניתוח הקלטות מהירות גבוהה אופטי מ<em> תסיסנית</em>, דג הזברה ולבבות עובריים בעכבר (פינק, et. Al. 2009). ניתוח חצי אוטומטי שלנו Heartbeat אופטי (סוהא) משתמשת התנועה רומן איתור אלגוריתם זה מסוגל לזהות תנועות הלב הקשורים כויץ בודדים ואירועים הרפיה. התוכנית מספקת מגוון רחב של פיזיולוגית readouts הרלוונטיים כולל סיסטולי ודיאסטולי במרווחים, קצב הלב, כמו גם צעדים איכותי וכמותי של arrhythmicity דופק. התוכנית גם מחשבת קוטר מדידות לב במהלך תרויח וגם התכווצות שממנו קיצור השבר ושינויים אזור השבר מחושבים. פלט מסופק כקובץ דיגיטלי תואם תוכניות גיליון אלקטרוני ביותר. המדידות נעשות עבור כל פעימת לב ברשומה הגדלת כוח סטטיסטיות של התפוקה. אנו מדגימים כל הצעדים שבהם קלט משתמש נדרש להראות את היישום של המתודולוגיה שלנו כדי ניתוח של תפקוד הלב בכל שלושת הדגמים לב ממושמע מבחינה גנטית.
Protocol
Discussion
המודל תסיסנית הוכיחה להיות כלי רב עוצמה גנטי, שבו נעשה שימוש כדי לענות על מגוון שאלות מדעיות החל ההתפתחות העוברית על למידה וזיכרון. לאחרונה אורגניזם מודל זה צדדי נעשה שימוש כדי לחקור את הגנטיקה של תפקוד הלב. מספר נסיונות לכמת הפיזיולוגיה הלב המבוגר תסיסנית הסתמכו על …
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
ק.א. ו-AC נתמכים על ידי מענק ו מלגה מאיגוד הלב האמריקני. SIB ו RB הם נתמך על ידי מענקים NIH.
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| MatLab software | Math Works, Inc | Required environment for the analysis software. | ||
| EM-CCD digital camera | Hamamatsu Corp. | 9100 or 9300 | Other high speed digital cameras will also work. | |
| HC image data capture software | Hamamatsu Corp. | Other image capture software that produces movies in avi format will also work. | ||
| Light Microscope with 10x objective | Leica | A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution |
References
- Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles. Mol Biol Cell. 19 (2), 553-562 (2008).
- Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging. Proc Natl Acad Sci U S A. 104, 3943-3948 (2007).
- Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts. Biotechniques. 46, 101-113 (2009).
