スモールハーツの半自動光ビート解析
Summary
我々は、より高速の光記録を分析するための半自動化された光ビートの分析法（SOHA）を開発しました<em>ショウジョウバエ</em>、ゼブラフィッシュとマウス胎児の心臓。我々は、ショウジョウバエとマウス胎児の心臓の心機能の分析に私たちの方法論の適用を示しています。
Abstract
我々から高速光記録を分析するための方法を開発した<em>ショウジョウバエ</em>、ゼブラフィッシュとマウス胎児の心臓（フィンク、ら、2009）。私たちの半自動光ビート解析（SOHAは）個々の収縮と弛緩のイベントに関連付けられている心臓の動きを検出することができる新たな動き検出アルゴリズムを使用しています。プログラムは、収縮期および拡張期の間隔、心拍数だけでなく、ハートビートarrhythmicityの定性的および定量的措置を含む生理学的に適切な読み出しのホストを提供します。プログラムはまた、短縮率と小数面積の変化が計算された拡張期と収縮期の両方の間に心臓の直径の測定値を計算します。出力はほとんどのスプレッドシートプログラムと互換性のあるデジタルファイルとして提供されています。測定は、出力の統計的検出力を増加させる、レコード内のすべてのハートビートのために作られています。我々は、ユーザー入力が必要な各ステップを示し、すべての3つの遺伝的に扱いやすい心モデルにおける心機能の分析に私たちの方法論の適用を示す。
Protocol
Discussion
ショウジョウバエモデルでは、胎生発育から学習や記憶に至るまで、科学的なさまざまな質問に対処するために使用されている強力な遺伝学的ツールであることが証明されている。最近この多目的なモデル生物は、心臓機能の遺伝学を調査するために使用されています。成体ショウジョウバエで心臓生理学を定量化するための試行回数は、腹部のクチクラを通してそのままハエで行った観測?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
KOとACは、米国心臓協会からの助成金やフェローシップでサポートされています。 SIBとRBは、NIHからの補助金によってサポートされています。
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| MatLab software | Math Works, Inc | Required environment for the analysis software. | ||
| EM-CCD digital camera | Hamamatsu Corp. | 9100 or 9300 | Other high speed digital cameras will also work. | |
| HC image data capture software | Hamamatsu Corp. | Other image capture software that produces movies in avi format will also work. | ||
| Light Microscope with 10x objective | Leica | A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution |
References
- Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles. Mol Biol Cell. 19 (2), 553-562 (2008).
- Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging. Proc Natl Acad Sci U S A. 104, 3943-3948 (2007).
- Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts. Biotechniques. 46, 101-113 (2009).
