Мы разработали Полуавтоматическая Оптический метод анализа Heartbeat (Соха) для анализа высокоскоростных оптических записи с<em> Drosophila</em>, Данио и сердца эмбриональных мыши. Мы демонстрируем применения нашей методологии анализа функции сердца в плодовой мухи и эмбрионального сердца мыши.
Abstract
Мы разработали метод анализа высокоскоростных оптических записи с<em> Drosophila</em>, Данио и эмбриональных мыши сердца (Fink, и. Др.., 2009). Наши Полуавтоматическая оптического анализа Heartbeat (Соха) использует новый алгоритм обнаружения движения, которое в состоянии обнаружить сердечные движения, связанные с отдельными сократительной и релаксации событий. Программа предоставляет множество физиологически соответствующих показаний в том числе систолического и диастолического интервалами, частота сердечных сокращений, а также качественные и количественные показатели сердцебиения arrhythmicity. Кроме того, программа вычисляет измерения диаметра сердца во время обеих диастолу и систолу, из которых фракции укорочения и дробные изменения области рассчитываются. Выходной предоставляется в качестве цифровой файл, совместимый с большинством программ электронной таблицы. Измерения производятся для каждого сердцебиения в записи увеличения статистической мощности на выходе. Мы показываем, каждый из шагов, где пользователя не требуется и показать применение нашей методологии анализа сердечной деятельности во всех трех генетически послушный модели сердца.
Protocol
Нажмите здесь, чтобы посмотреть обзор полу автоматизированной сердцебиение анализа (Соха) процедуры. Полуавтоматическая оптического анализа сердцебиение 1. Предварительная обработка – Этот шаг дае?…
Discussion
Модель Drosophila оказался мощный генетический инструмент, который был использован для решения различных научных вопросов, начиная от эмбрионального развития к обучению и память. В последнее время этот универсальный организм модели был использован для исследования генетики функции серд?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
КО и переменного тока, поддерживаются грантов и стипендий, начиная с Американской ассоциации сердца. SIB и РБ, поддерживаются грантами NIH.
Materials
Material Name
Type
Company
Catalogue Number
Comment
MatLab software
Math Works, Inc
Required environment for the analysis software.
EM-CCD digital camera
Hamamatsu Corp.
9100 or 9300
Other high speed digital cameras will also work.
HC image data capture software
Hamamatsu Corp.
Other image capture software that produces movies in avi format will also work.
Light Microscope with 10x objective
Leica
A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution
Ocorr, K., Fink, M., Cammarato, A., Bernstein, S. I., Bodmer, R. Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts. J. Vis. Exp. (31), e1435, doi:10.3791/1435 (2009).