Abbiamo sviluppato un semi-automatico ottica Metodo di analisi Heartbeat (SoHa) per analizzare le registrazioni ottico ad alta velocità da<em> Drosophila</em>, Zebrafish e cuori embrionali di topo. Dimostriamo l'applicazione della nostra metodologia per l'analisi della funzione cardiaca nel moscerino della frutta e cuori embrionali di topo.
Abstract
Abbiamo sviluppato un metodo per analizzare le registrazioni ottico ad alta velocità da<em> Drosophila</em>, Zebrafish e cuori embrionali di topo (Fink, et. Al., 2009). Il nostro semi-automatico Analisi Heartbeat (Optical SoHa) utilizza un nuovo algoritmo di rilevamento di movimento che è in grado di rilevare movimenti di contrazione cardiaca associata a singoli eventi e relax. Il programma prevede una serie di letture fisiologicamente rilevanti tra pressione sistolica e diastolica intervalli, frequenza cardiaca, come pure le misure qualitative e quantitative di arrhythmicity battito cardiaco. Il programma calcola anche le misure di diametro cuore sia durante la diastole e sistole dal quale sono calcolati frazione di accorciamento e cambia zona frazionaria. L'uscita è fornito sotto forma di file digitale compatibile con la maggior parte dei programmi di foglio elettronico. Le misure sono fatte per ogni battito cardiaco in un record aumentando la potenza statistica del risultato. Dimostriamo ciascuna delle fasi in cui è richiesto l'input dell'utente e mostra l'applicazione della nostra metodologia per l'analisi della funzione cardiaca in tutti e tre i modelli cuore geneticamente trattabili.
Protocol
Clicca qui per visualizzare una panoramica dei semi automatizzati di analisi battito cardiaco (SoHa) procedura. Semi-automatici di analisi battito cardiaco ottico 1. Pre-elaborazione – Questa operazione fornisce informazioni sulla diametri cuore diastolica e sistolica. Bordi cuore sono identificati e contrassegnati massimo durante la …
Discussion
Il modello Drosophila ha dimostrato di essere un potente strumento genetico che è stato usato per affrontare una serie di quesiti scientifici che spaziano dallo sviluppo embrionale all'apprendimento e alla memoria. Di recente questo organismo modello versatile è stato utilizzato per studiare la genetica della funzione cardiaca. Un certo numero di tentativi di quantificare fisiologia cardiaca in adulti Drosophila si sono basati sulle osservazioni fatte nei moscerini intatta attraverso la cuticola addominale. La mag…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
KO e AC sono supportati da una borsa e una borsa di studio della American Heart Association. SIB e RB sono sostenuti da sovvenzioni NIH.
Materials
Material Name
Type
Company
Catalogue Number
Comment
MatLab software
Math Works, Inc
Required environment for the analysis software.
EM-CCD digital camera
Hamamatsu Corp.
9100 or 9300
Other high speed digital cameras will also work.
HC image data capture software
Hamamatsu Corp.
Other image capture software that produces movies in avi format will also work.
Light Microscope with 10x objective
Leica
A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution
Ocorr, K., Fink, M., Cammarato, A., Bernstein, S. I., Bodmer, R. Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts. J. Vis. Exp. (31), e1435, doi:10.3791/1435 (2009).