שיטה להערכת הזיקה המתמדת של אגוניסט למדינה פעיל (<em> K<subB></sub</em>) של קולטני G-חלבון בשילוב מתואר. הניתוח מספק אמצעים מוחלט או יחסי של<em> K<subB></sub</em> תלוי אם הפעלת קולטן המכונן הוא מדיד. השיטה שלנו חל במורד התגובות השונות של הפעלת הקולטן.
כאשר אגוניסט מפעיל אוכלוסייה של G-חלבון בשילוב קולטנים (GPCRs), זה מעורר מסלול איתות זה מגיע לשיאו בתגובה של התא או הרקמה. תהליך זה יכול להיות מנותח ברמה של קולטן יחיד, אוכלוסייה של קולטנים, או תגובה במורד הזרם. כאן אנו מתארים כיצד לנתח את התגובה במורד הזרם כדי לקבל אומדן של הזיקה אגוניסט מתמדת המדינה הפעילה של קולטנים יחיד.
רצפטורים להתנהג כמו מתגים quantal כי חלופי בין מדינות פעיל פעיל (איור 1). המצב הפעיל אינטראקציה עם חלבונים ספציפיים G או שותפים איתות אחרים. בהעדר ligands, המדינה לא פעיל השולט. הכריכה של אגוניסט מעלה את ההסתברות כי קולטן יעבור למצב פעיל בגלל זיקה מתמדת למדינת פעיל (K ב) שלו הוא גדול בהרבה מזה של מדינת פעיל (K). סיכום שליציאות אקראיות של כל הקולטנים באוכלוסייה התשואות על רמה קבועה של הפעלת קולטן בזמן. הגומלין של ריכוז של אגוניסט לעורר חצי מקסימלי הפעלת קולטן שווה מתמיד את הזיקה שנצפו (K obs), וכן את החלק היחסי של אגוניסט קולטן מתחמי במצב פעיל מוגדר יעילות (ε) (איור 2).
שיטות לניתוח התגובות במורד הזרם של GPCRs פותחו המאפשרים הערכה של K obs ואת היעילות היחסית של 1,2 אגוניסט. בדו"ח זה, אנו מראים כיצד לשנות את הניתוח הזה כדי להעריך את ערך K אגוניסט b ביחס לזה של אגוניסט אחר. עבור מבחני כי התערוכה פעילות המכונן, אנו מראים כיצד להעריך K b ביחידות המוחלט של M -1.
השיטה שלנו לניתוח ריכוז בתגובה אגוניסט עקומות 3,4 מורכברגרסיה ליניארית הגלובלית באמצעות מודל מבצעי 5. אנו מתארים הליך באמצעות יישום תוכנה, פריזמה (GraphPad תוכנה, Inc, סן דייגו, קליפורניה). ניתוח התשואות אומדן של המכפלה של K ו obs פרמטר יחסי היעילות (τ). אומדן τK obs של אגוניסט אחד, מחולק כי אחרת, היא מדד יחסי של K b (ע"ר i) 6. במשך כל קולטן מפגין פעילות מכוננת, אפשר להעריך פרמטר יחסי היעילות של קומפלקס הקולטן חינם (τ sys). במקרה זה, הערך של K b אגוניסט שווה τK obs / τ sys 3.
השיטה שלנו הוא שימושי לקביעת הסלקטיביות של אגוניסט עבור תת קולטן לכימות אגוניסט קולטן חלבוני איתות דרך שונה G.
בגלל השיטה שלנו להערכת RA אני (יחסית לערך K ב) רק דורש מדידת ריכוז בתגובה עקומות אגוניסט, הניתוח שלנו ניתן לעשות זאת בכל עת עקומות אלה נמדדים.
אם יום יומית וריאציה בתגובה של הכנת הניסוי (למשל, תאים או רקמות) הוא גדול, ?…
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכה על ידי מכוני הבריאות הלאומיים גרנט GM 69829.