Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Immunology and Infection

Использование РНК-интерференции по расследованию врожденного иммунного ответа у мышей макрофагов

doi: 10.3791/51306 Published: November 3, 2014

Introduction

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

В этом протоколе, мы опишем эффективные методы для подавления генов в линиях мыши макрофагов клеток, используя миРНК и мониторинга последствий такого лечения на врожденного иммунного ответа. Эти процедуры выполняются в формате 96-луночного, что позволяет РНК-интерференции экраны в средне- или высокой пропускной моды.

В ответ на инфекцию, люди монтировать немедленного врожденный иммунный ответ и более медленный, но более конкретные адаптивного иммунного ответа. Этот быстрый врожденного иммунного ответа включает вербовку и активацию фагоцитирующих врожденных иммунных клеток, включая макрофаги 1. Классически активированные макрофаги участвуют в острых воспалительных реакций и производить антибактериальных белков и соединений, цитокинов и хемокинов, и представить антигены 2,3. Кроме того, активированные макрофаги играют роль в регуляции иммунитета, поддержания толерантности, восстановление тканей и заживление ран 4-8. Из-за их широкого спектра функций, Макрофаги могут играть определенную роль в многочисленных заболеваний, включая атеросклероз, артрит, рак и 9. Таким образом, изучение макрофагов является ключевым направлением исследований в течение некоторого времени в самых разнообразных областях заболевания.

Несмотря на их важность в врожденного иммунного ответа, макрофаги могут быть сложные клетки, чтобы работать с. В частности, трудно получить эффективную трансфекцию с использованием липидных реактивов в макрофагах без ассоциированного токсичности 10,11. Более того, даже когда миРНК эффективно доставлены в макрофагах, надежность RNAi-индуцированного гена нокдаун часто может быть довольно умеренными и могут варьироваться в зависимости от гена к гену.

Чтобы преодолеть эти технические проблемы, мы оптимизировали трансфекции и нокдаун методы 12-16 в двух клеточных линий мыши макрофагов, RAW264.7 17 и J774A.1 18. Этот подход использует Amaxa Nucleofector Shuttle System 96-а для трансфекции; эта системаиспользует комбинацию специализированных реагентов и электропорации для трансфекции клеток в формате 96-луночного 19. После трансфекции мы опишем методы, чтобы максимизировать восстановление и жизнеспособность клеток и для максимального последующее миРНК вызванной генной нокдаун. Чтобы проиллюстрировать полезность этого подхода, мы опишем протокол для миРНК доставки этих макрофагов клеточных линий, стимулируют эти клетки с липополисахарида (ЛПС), и следить за врожденный иммунный ответ на уровне производства нескольких провоспалительных цитокинов. Мы предоставляем образцы данных, в которой мы нацелены на Toll-подобный рецептор (TLR) семья, члены которой чувствуют LPS и другие патогенные ассоциированные молекулярные паттерны (PAMPs), регулировать врожденный иммунитет.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

1. Поддержание макрофагов клеточных линий

  1. Выращивают RAW264.7 и J774A.1 клеточные линии в среде DMEM, дополненной 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS) при 37 ° С в присутствии 5% СО 2. Для поддержания стерильности, добавить 1% пенициллина / стрептомицина (ручка / острый) в средствах массовой информации (хотя это не является строго необходимым).
  2. Критический шаг: Убедитесь, что для эффективной трансфекции и миРНК-индуцированного гена нокдаун макрофаги растут в здоровом состоянии. Используйте ячейки между проходами 3 и 10 после свежего оттаивания, так как эти макрофаги линии демонстрируют лучшую эффективность трансфекции и поддерживать надежную выживание после трансфекции на данном этапе; не используйте более высокую проход количество (> 20), а эффективность трансфекции и гена нокдаун и уменьшаться значительно.
  3. Для оптимизации миРНК трансфекции, пластинчатые клетки на 20% слияния и расти один или два дня, пока клетки не достигают не более 80% слияния. Заросли клетки не будут трансфекции efficровать.

2. Программирование Shuttle System 96-а для трансфекции

  1. Запустите программу трансфер 96-а на компьютере, подключенном к челноку. Выберите новый файл параметров в верхнем меню левой файла.
  2. Выделить скважин, которые будут трансфицированные на отображаемом пластины схеме 96-луночного. Зеленый ящик будет указать, какие скважины выбираются.
  3. Выберите программу, соответствующую клеточную линию макрофагов используется (DS-136 для RAW264.7 или DS-130 для J774A.1) и выберите Применить, расположенной ниже схематически 96-луночного планшета. Обратите внимание, что после выбора программы, колодцы на схематическом пластины будут окрашены темно-синий. Пустые кружки скважин, которые не были назначены программу и не будут шокированы.

3. Подготовка реагентов для трансфекции

  1. Подготовка рабочего раствора Nucleofector ™ путем смешивания SF клеточной линии 96-а решение Nucleofector ™со всем содержимым закрытом дополнения трубки. Разрешить смешанные реагенты для уравновешивания при комнатной температуре перед использованием. Хранить лишний полное решение Nucleofector ™ на 4 ° С на срок до 3 месяцев для использования в будущем.
  2. Предварительно теплой DMEM, RPMI-1640, 0,25% трипсин / ЭДТА, и забуференный фосфатом физиологический раствор (PBS) при 37 ° С до получения макрофаги для трансфекции.
  3. Подготовьте миРНК для трансфекции оттаивания на льду. Для того чтобы минимизировать количество замораживания оттепели в миРНК, заморозить новых миРНК в виде аликвот в первый раз, когда они используются.
  4. В начальных экспериментах, использовать миРНК при относительно высокой дозе 2 мкМ (разбавленных 1:10 от 20 мкМ запасов). Впоследствии титруют киРНК, которые вызывают устойчивый ген нокдаун до более низких дозах, хотя, как правило, более высокие дозы необходимы для эффективного гена нокдауна в макрофагах по сравнению с другими типами клеток.
    ПРИМЕЧАНИЕ: миРНК доступны из многих источников; довольно прочная ген нокдаун можно получитьиспользуя siGenome SMARTPOOLs, которые бассейны четырех миРНК, ориентированных каждый ген. В качестве отрицательного контроля, использовать любой из различных ненацеливании бассейнов миРНК или миРНК.
  5. Чтобы контролировать эффективность трансфекции, трансфекции либо контрольную плазмиду pmaxGFP (представленную в наборах Amaxa) или флуоресцентно меченные киРНК параллельно экспериментальным киРНК. Ожидайте 30-50% трансфекции в GFP плазмиды (анализировали с помощью микроскопии или проточной цитометрии дня после трансфекции) и> 99% трансфекции флуоресцентно меченных миРНК (анализировали с помощью проточной цитометрии сразу после трансфекции и восстановления).

4. Подготовка макрофагах для трансфекции

  1. Снять прилипшие макрофаги из чашки для культивирования клеток трипсинизацией. Аспирируйте СМИ и промыть клетки дважды 10 мл PBS. После удаления PBS, инкубировать клетки с предварительно нагревают 0,25% трипсин / ЭДТА (1 мл / 10 см пластина) в течение 1-2 мин, пока клетки начинают отделяться. Аккуратно постучите по планшету и переместить Солуции во время инкубации, чтобы максимизировать трипсинизации.
  2. После инкубации добавляют 9 мл DMEM + FBS СМИ, аккуратно перемешать вверх и вниз, и сбора клеток с помощью пипетки в стерильную пробирку.
  3. Подсчитайте количество выделенных макрофагах использованием гемоцитометра. Ожидать около 10 млн макрофаги на 10 см тарелку. Рассчитать общее количество макрофагов, необходимых; каждую лунку на трансфер 96-а требуется 200 000 клеток. Не забудьте добавить ценность несколько дополнительных скважин клеток для обеспечения потерь пипеток.
  4. Внесите расчетное число клеток в центрифужную пробирку. Центрифуга клетки в течение 10 мин при 150 х г при комнатной температуре. Не центрифугировать слишком быстро, как это будет уменьшаться макрофагов здоровье и эффективность трансфекции.

5. Nucleofection макрофагов с миРНК

  1. Используя стерильный 96-а вокруг нижнюю пластину (что облегчает смешивания при минимизации потери реагента), добавить 2 мкл каждого миРНК в каждую лунку, чтобы быть Transfected.
    Примечание: В зависимости от количества миРНК, это может быть достигнуто в ходе стадии центрифугирования макрофагов.
  2. Аспирируйте носитель из центрифугированных клеток. Аккуратно ресуспендирования клеток в растворе Nucleofector ™ SF (содержащие добавки решение), с использованием 20 мкл на 200 000 клеток гранулированных. После ресуспендировали, использовать клетки сразу для оптимальной трансфекции.
  3. Трансфер ресуспендировали клетки в стерильный корыта; с помощью многоканальной пипетки, передача 20 мкл ресуспендированных смеси клеток в каждую лунку 96-луночного планшета, содержащего киРНК. Аккуратно перемешать с помощью пипетки вверх и вниз.
  4. Передача 20 мкл клеток / миРНК смеси в 96-луночный планшет Nucleocuvette ™ важным шагом:. Избежать образования пузырьков в процессе стадии передачи, поскольку это может вызвать ошибки при Nucleofection.
  5. После размещения всех экспериментальных образцов в трансфекции пластины, покрывают 96-луночный планшет с крышкой и предоставленной Verу слегка постучите по твердой поверхности, чтобы удалить пузырьки из образцов.
  6. Поместите 96-луночного планшета с крышкой в ​​96-луночного трансфер Nucleofector и выберите "загрузить и запустить" в правом нижнем углу экрана программы. До Nucleofection, следовать строки программы, чтобы сохранить результаты.
    Примечание: Во время процесса Nucleofection, колодцы успешно tranfected будет изображен на 96-и принципиальная на экране зеленым кругом со знаком плюс. Красный круг с минусами указывает на ошибку, скорее всего, из-за пузырьков или неправильно пипетки правильный объем реагентов.

6. Восстановление и покрытие из макрофагов

  1. Сразу же после Nucleofection, используя многоканальную пипетку, добавьте 80 мкл подогретого (37 ° С) RMP1-1640 носитель в каждую лунку. Добавить СМИ в сторону друг хорошо, позволяя СМИ медленно перемешать с трансфекции клеток, которые очень нежный на данном этапе. Не добавляйте носитель слишком быстро, так как это будетзначительно уменьшить жизнеспособность.
  2. Поместите 96-луночных планшетах с трансфицированных образцов и RPMI-1640 в инкубаторе 37 ºC с 5% CO 2 в течение 2 мин; это имеет решающее значение, чтобы позволить клетки, чтобы восстановить до дальнейшей обработки.
  3. Извлеките 96-луночного планшета из инкубатора и тщательно переноса смеси из каждой лунки в культуре ткани 96-луночного планшета с использованием многоканальной пипетки.
  4. Используя многоканальную пипетку, добавьте 100 мкл подогретого (37 ° С) DMEM + FBS среды в каждую лунку.
  5. Инкубируйте тканевой культуре 96-луночного планшета с образцами в инкубаторе 37 ºC с 5% CO 2 в течение 24-36 ч (оптимизации точную синхронизацию для отдельных киРНК, но на этот раз диапазон, как правило хорошо работает).

7. Стимулирование макрофагов с ЛПС

  1. После 24-36 ч после Nucleofection инкубации подготовить LPS (или другой PAMPs) в свежем СМИ. Подготовьте достаточно свежую среду для всех скважин (200 мкл мEdia / лунку 96-луночного планшета плюс немного за пипетки). Развести LPS в конечной концентрации 20 нг / мл в DMEM + FBS.
  2. Тщательно аспирата средств массовой информации из 96-луночного планшета и добавить свежий СМИ содержащий LPS в клетках.
  3. Следить за ответ на ЛПС или других PAMPs в разное время после стимуляции. 6 ч является достаточным, чтобы генерировать надежную воспалительную реакцию цитокинов для цитокинов, таких как IL-6 или ФНО.

8. Контроль за индуцированные врожденного иммунного ответа, Нокдаун гена, и жизнеспособность в макрофагах

  1. Для контроля ЛПС-индуцированную продукцию цитокинов, пипетки супернатант от клеток в тарелку хранения 96-луночного. Продукция цитокинов может быть измерена с помощью ELISA.
  2. После того, как удаляют надосадочную жидкость, контролировать жизнеспособность клеток с использованием флуоресцеина диацетат (при расщеплении с помощью клеточных эстераз в живых клетках, это соединение становится флуоресцентный). Определить миРНК, которые предназначаются гены, которые управляют жизнеспособности клеток с помощью тего подход. Примечание: сам процесс трансфекции должны иметь небольшой эффект на жизнеспособность, если правильно выполнены.
    1. Добавить флуоресцеина диацетат (5 мг / мл в ацетоне акций) в каждую лунку (1: 100 конечном разведении в PBS).
    2. Инкубируют при комнатной температуре в течение 4:59 мин, а затем контролировать флуоресценции в клетках с использованием планшет-ридера (460 нм возбуждение, 515 нм эмиссии).
    3. Дополнительно: Для того, чтобы флуоресценции в лунках однородна, лизируют клетки, использующие буферы, такие как RIPA; это обеспечивает равномерное флуоресцентного сигнала в скважине, так как некоторые читатели пластины выполнен с возможностью отслеживать только небольшую часть скважины; если клетки не равномерно покрытием, флуоресцеин диацетат может дать неточное чтение.
  3. В качестве альтернативы мониторинга жизнеспособности клеток, контролировать ген миРНК-индуцированной нокдаун путем количественной ПЦР с использованием РНК, полученной из адгезивных клеток.
    1. После супернатант удаляют из клеток (шаг 8,1 выше), объявлениеd RLT буфера (который используется для лизиса и сохранения РНК) непосредственно в адгезивных клеток лизировать их.
    2. Изолировать РНК с использованием препарата комплект РНК, таких как мини-комплект RNeasy, и использовать КПЦР с геноспецифических праймеров для контроля Нокдаун гена относительно контроля лечения миРНК. Используйте праймеров к Βactin или GAPDH для нормализации.
  4. В качестве другой альтернативы, чтобы контролировать другие аспекты врожденной иммунной реакции, контролировать фагоцитарную способность макрофагов путем добавления FITC-меченого E. палочки частицы непосредственно на прикрепленных клеток с использованием набора. После протокол производителя, который занимает всего несколько часов, контролировать фагоцитарную поглощение с помощью планшет-ридера или микроскопии.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Чтобы продемонстрировать эффективность трансфекции с использованием этого подхода, мы контролировали поглощение FITC-меченого миРНК используя цитометр потока (рисунок 1).

Чтобы проиллюстрировать полезность нашего подхода к мониторингу врожденный иммунный ответ, мы трансфецировали миРНК направленные известные врожденные иммунные регуляторные гены в RAW264.7 макрофагов клеточной линии, стимулировали клетки с ЛПС, а затем контролировать производство провоспалительных цитокинов IL- 6 и TNF-alpha. Различные TLRs распознавать различные PAMPs, с ЛПС из грамотрицательных бактерий, признанных TLR4 20, липопептиды, такие как PAM3CSK4 признан TLR2 21, и дт РНК из вирусов, таких как мимической поли (I: C), признанной TLR3 22,23. Как показано на рисунке 2, ингибирование TLR4 (но не других TLRs использованием миРНК) сильно уменьшает выработку ЛПС-индуцированной IL-6 и ФНО. Более того, ингибирование IL-6 с миРНК уменьшает также IL-6 производство, не затрагивая ФНО производства (сравните панели A к B на рисунке 2).

Рисунок 1
Рисунок 1: FITC-меченого миРНК эффективно трансфицировали в клеточную линию макрофагов мыши J774A.1 с использованием описанных методов Сразу же после трансфекции клетки промывали несколько раз, фиксируется в параформальдегида и флуоресценции контролировали с помощью проточной цитометрии.. На рисунке сравнивает клетки инкубируют в присутствии FITC-миРНК, которые были либо трансфицированных (синий кривой) или нет (красная кривая).

Рисунок 2
Рисунок 2: Эффективность и специфичность миРНК в макрофагах мышиклеточная линия RAW264.7. RAW264.7 клетки трансфицировали указанными киРНК (либо контролировать не-таргетинга бассейны миРНК # 1 или 2, или siРНК, которые нацелены на TLR4, TLR3, TLR2, или IL-6, как показано). 24 часа в сутки позже, клетки стимулировали 20 нг / мл ЛПС в течение 6 часов и продукции цитокинов (либо IL-6 в панели А или ФНО в панели В дальнейшем контролировали ELISA. Звездочки указывают значение существенно отличается от лечения контрольной (р <0,05 , т-тест).

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Многочисленные исследования были опубликованы в которой отдельные гены были мишенью миРНК в макрофагах мышей. В то время как липидный опосредованной трансфекции был использован для доставки миРНК для макрофагов клеточных линий на индивидуальной основе, эти методы страдают от потенциального воздействия на жизнеспособность, ограниченного генного нокдауна, и изменчивости от гена к гену. Для создания более надежных анализов, которые могут быть использованы для генов-мишеней в средне- или высокой пропускной моды, мы оптимизировали технику, используя Amaxa Nucleofector системы трансфера 96-а, который проявляет большую последовательность в гене нокдаун и ограниченные последствия для жизнеспособности (это более надежный Система является более дорогим, чем липид-опосредованных подходов). Многие переменные были испытаны с целью оптимизации этих процедур. Мы смогли использовать эту систему для эффективной доставки миРНК в различных первичных макрофагов и увековечил линии макрофагов клеток (в некоторых случаях это потребовало использования Amaxa комплект оптимизация 96-а линия клеток). Ян предварительные испытания с этими различными линиями мыши макрофагов клеток (RAW264.7, J774A.1 и MH-S) и первичных клеток (тиогликолята-вызвало и из костного мозга макрофаги), мы обнаружили, что RAW264.7 и J774A.1 клетки выставлены самые надежные миРНК-индуцированного гена нокдаун (с последующим MH-S и первичных клеток, соответственно, данные не показаны). Поскольку эти два иммортализованных клеточных линий макрофагов обычно используются для исследования, мы оптимизировали наши процедуры RNAi далее с помощью этих строк.

Для контроля эффективности трансфекции, мы либо использовать контроль GFP плазмиды в наборах Nucleofector или FITC-меченого миРНК. GFP плазмида проявляет сильную флуоресценцию на следующий день после трансфекции, эффективность трансфекции с 30-50% по анализировали под микроскопом или с помощью проточной цитометрии (данные не показаны). С FITC-меченых Серна, мы наблюдаем> 99% эффективность трансфекции как анализировали с помощью проточной цитометрии (дсРНК transfects лучше, чем ДНК плазмиды). Хотя важно, чтобы ждать флуоресценции кразработать при использовании GFP плазмиды, флуоресцентный миРНК следует контролировать относительно скоро после трансфекции, потому что флуоресцентный сигнал ослабевает с течением времени.

Трансфекция при описанных выше условиях не имеет существенного влияния на жизнеспособность клеток. Мы, как правило, мониторинг жизнеспособности клеток следующий наших миРНК процедур с использованием флуоресцеина диацетат. Это соединение не является флуоресцентной; Однако, когда расщепляется клеточными эстераз в живых клетках, становится флуоресцентный. Кроме того, флуоресцентный форма затем сохраняется в клетках с интактной мембраны плазмы 24. Это флуоресценции основе анализа является относительно простым, быстрым и дешевым анализ для контроля жизнеспособности клеток, хотя есть и другие более сложные анализы, которые, например, контролировать клеточный АТФ уровней.

Как правило, мы анализе наши клетки врожденной иммунной для функции 24-36 ч после трансфекции, который находится на ранней стороне для RNAi по сравнению с другими клеточными линиями. БелыйIle нужно ждать эндогенных белков, чтобы перевернуть, чтобы облегчить гена нокдаун, необходимо сбалансировать это с потерей миРНК потенции, и мы находим более надежную нокдаун в этих лини х макрофагов при слегка прежние времена, чем в типичном 48-72 ч, используемых в других типах клеток. В то время как это является предпочтительным для контроля уровня белка от вестерн, мы, как правило, контролировать уровни мРНК от кПЦР, с целью изучения нескольких генов сразу, для которой множество антител и западные кляксы не может быть практичным. Мы используем LPS в минимальной дозе, которая максимизирует воспалительный продукцию цитокинов.

При ориентации новых генов с миРНК, мы начнем с относительно высокой дозе миРНК описанного в протоколе, а затем титруют вниз миРНК, которые вызывают фенотип. Последующие элементы управления, предназначенные для предотвращения мимо цели эффекты включают в себя использование нескольких дуплексов миРНК, чтобы определить, если более чем один миРНК может вызвать тот же фенотип, проверки ген нокдаун КПЦР или вестерн, и с помощью GEпе избыточная экспрессия исследования в контексте подхода к RNAi. Эти подходы должны учитывать быстрой идентификации генов, которые регулируют врожденный иммунитет в макрофагах мыши.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Авторы заявляют, что они не имеют конкурирующие финансовые интересы. Эта статья была организована Lonza, Inc.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Amaxa nucleofector 96-well shuttle system Lonza AAM-1001S
Amaxa SF cell line 96-well nucleofector kit Lonza V4SC-2096
RAW264.7 mouse macrophage cell line ATCC TIB-71
J774A.1 mouse macrophage cell line ATCC TIB-67
siGenome smartpool siRNA Dharmacon varies depending on gene
Non-targeting control siRNA pool Dharmacon D-001206-13-20
Block-iT fluorescent oligo for electroporation Invitrogen 13750062
Ultrapure E. coli O111:B4 LPS List Biological Laboratories 421
DMEM, high glucose Invitrogen 11995-065
RPMI-1640 Invitrogen 11875-093
Penicillin-streptomycin solution (Pen/Strep) Fisher SV30010
0.25% Trypsin-EDTA Invitrogen 25200072
96-well tissue culture plates Fisher 07-200-89  
96-well round bottom sterile plates (not coated) Fisher 07-200-745
Mouse IL-6 Duoset ELISA kit R&D Biosystems DY406
Mouse TNFα Duoset ELISA kit R&D Biosystems DY410
Fluorescein diacetate Sigma-Aldrich F7378
RLT buffer Qiagen 79216
RNeasy mini kit Qiagen 74134
Vybrant Phagocytosis Assay Kit Invitrogen V-6694

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Kaufmann, S. H. E., Medzhitov, R., Gordon, S. The innate immune response to infection. ASM Press. (2004).
  2. Adams, D. O., Hamilton, T. A. The cell biology of macrophage activation. Annual review of immunology. 2, 283-318 (1984).
  3. Fujiwara, N., Kobayashi, K. Macrophages in inflammation. Current drug targets. Inflammation and allergy. 4, 281-286 (2005).
  4. Gordon, S., Martinez, F. O. Alternative activation of macrophages: mechanism and functions. Immunity. 32, 593-604 (2010).
  5. Martinez, F. O., Helming, L., Gordon, S. Alternative activation of macrophages: an immunologic functional perspective. Annual review of immunology. 27, 451-483 (2009).
  6. Fairweather, D., Cihakova, D. Alternatively activated macrophages in infection and autoimmunity. Journal of autoimmunity. 33, 222-230 (2009).
  7. Benoit, M., Desnues, B., Mege, J. L. Macrophage polarization in bacterial infections. Journal of immunology. 181, 3733-3739 (2008).
  8. Mantovani, A., Sica, A., Locati, M. Macrophage polarization comes of age. Immunity. 23, 344-346 (2005).
  9. Burke, B., Lewis, C. E. The macrophage. 2nd edn, Oxford University Press. (2002).
  10. Lee, G., Santat, L. A., Chang, M. S., Choi, S. RNAi methodologies for the functional study of signaling molecules. PloS one. 4, (2009).
  11. Carralot, J. P., et al. Automated high-throughput siRNA transfection in raw 264.7 macrophages: a case study for optimization procedure. Journal of biomolecular screening. 14, 151-160 (2009).
  12. Alper, S., et al. Identification of innate immunity genes and pathways using a comparative genomics approach. ProcNatl Acad Sci USA. 105, 7016-7021 (2008).
  13. De Arras, L., et al. An evolutionarily conserved innate immunity protein interaction network. J. Bio. Chem. 1967-1978 (2013).
  14. Yang, I. V., et al. Novel regulators of the systemic response to lipopolysaccharide. Am J Respir Cell Mol Biol. 45, 393-402 (2011).
  15. Yang, I. V., et al. Identification of novel innate immune genes by transcriptional profiling of macrophages stimulated with TLR ligands. Molecular immunology. 48, 1886-1895 (2011).
  16. Yang, I. V., et al. Identification of novel genes that mediate innate immunity using inbred mice. Genetics. 183, 1535-1544 (2009).
  17. Raschke, W. C., Baird, S., Ralph, P., Nakoinz, I. Functional macrophage cell lines transformed by Abelson leukemia virus. Cell. 15, 261-267 (1978).
  18. Ralph, P., Moore, M. A., Nilsson, K. Lysozyme synthesis by established human and murine histiocytic lymphoma cell lines. The Journal of experimental medicine. 1528-1533 (1976).
  19. Zumbansen, M., et al. First siRNA library screening in hard-to-transfect HUVEC cells. Journal of RNAi and gene silencing. 6, 354-360 (2010).
  20. Lu, Y. C., Yeh, W. C., Ohashi, P. S. LPS/TLR4 signal transduction pathway. Cytokine. 42, 145-151 (2008).
  21. Aliprantis, A. O., et al. Cell activation and apoptosis by bacterial lipoproteins through toll-like receptor-2. Science. 285, 736-739 (1999).
  22. Alexopoulou, L., Holt, A. C., Medzhitov, R., Flavell, R. A. Recognition of double-stranded RNA and activation of NF-kappaB by Toll-like receptor 3. Nature. 413, 732 (2001).
  23. Conforti, R., et al. Opposing effects of toll-like receptor (TLR3) signaling in tumors can be therapeutically uncoupled to optimize the anticancer efficacy of TLR3 ligands. Cancer Res. 70, 490-500 (2010).
  24. Fernandez-Botran, R., Větvička, V. Methods in Cellular Immunology. 8, CRC Press. 8 (2001).
Использование РНК-интерференции по расследованию врожденного иммунного ответа у мышей макрофагов
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

De Arras, L., Guthrie, B. S., Alper, S. Using RNA-interference to Investigate the Innate Immune Response in Mouse Macrophages. J. Vis. Exp. (93), e51306, doi:10.3791/51306 (2014).More

De Arras, L., Guthrie, B. S., Alper, S. Using RNA-interference to Investigate the Innate Immune Response in Mouse Macrophages. J. Vis. Exp. (93), e51306, doi:10.3791/51306 (2014).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
simple hit counter