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Genetics

Enquête basée sur l'interférence ARN de la fonction de la protéine de choc thermique 27 pendant la cicatrisation cornéenne épithéliale Wound

Published: September 27, 2016 doi: 10.3791/54280
Automatic Translation
*1, *2, 2, 2, 2, 2
1Department of Ophthalmology, Saevit Eye Hospital, 2Department of Ophthalmology, University of Ulsan College of Medicine, Asan Medical Center
* These authors contributed equally

Introduction

Les cellules épithéliales de la cornée (CECS) tombent en continu dans le film lacrymal, alors qu'ils sont simultanément remplacées par des cellules du limbe et des couches basales épithéliales de la cornée. 1 Divers facteurs de stress extrinsèques peuvent induire l'apoptose et la desquamation de CECs. 2 Les protéines de choc thermique (HSP) sont hautement conservée et peut être divisé en deux familles selon la taille moléculaire. 3 la plus grande famille HSP comprend HSP90, HSP70 et HSP60, et la plus petite famille comprend HSP27. 4 la phosphorylation de HSP27 est connue pour jouer un rôle important dans la survie des cellules et est nécessaire pour la migration cellulaire en raison du rôle de cette protéine dans l' actine remodelage. 5-7 par conséquent, nous avons tenté de tester le rôle potentiel de HSP27 phosphorylation dans la migration de la CCE et de l' apoptose dans un modèle in vitro de cicatrisation épithéliale.

L'interférence ARN (ARNi) en utilisant soit des petites ou courtes ARN interférents (siRNA) a gel' intérêt à la fois la biologie également exonéré fondamentale et appliquée, car elle permet potentiellement l'expression d'un gène d'intérêt à être renversé vers le bas. 8 Ici, nous avons utilisé siRNA spécifiques HSP27 pour évaluer la contribution des HSP27 à la guérison de la plaie de la CCE et de l' apoptose. Les méthodes traditionnelles d'ARNi pour le gene knock-down dans les cellules utilisent des duplexes d'ARN synthétiques, comprenant deux oligonucléotides 21-mères non modifiés qui peuvent être assemblés pour créer des ARNsi. L'ARNi siRNA que nous avons utilisé dans cette étude est une méthode simple et très efficace pour transfecter des cellules, et ce réactif travaille avec diverses lignées cellulaires immortalisées. Dans la présente étude, nous démontrons les méthodes utilisées pour cette analyse, y compris un essai induit scratch-plaie directionnelle, western blot, siRNA essai de transfection, immunofluorescence et cytométrie en flux.

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Protocol

1. Cell Line

  1. Culture 10 6 cellules télomérase immortalisées humaines de cornée épithéliale (HCECs) dans une plaque à 6 puits (densité: 1039,9 cellules / mm 2) dans un incubateur à 37 ° C avec une atmosphère de CO2 à 5% en utilisant un milieu de croissance de l' épithélium bronchique (BEGM) jusqu'à ce que ils atteignent 95% de confluence.

2. Analyse par Western Blot après Création épithéliales Wounds Scratch

  1. Streak une pointe stérile de 200 pi de pipette sur la surface d'un puits d'confluentes HCECs cultivées quatre fois par boîte dans une enceinte de sécurité biologique (classe II, type A2) et incuber HCECs séparément dans un incubateur à 37 ° avec une atmosphère de CO 2 de 5% pendant 1, 5, 10, 30, 60 et 120 min.
  2. Utiliser une plaque de 6 puits pour six échantillons différents en fonction de la durée d'incubation après la lésion de l'épithélium de la cornée.
  3. Laver les monocouches HCEC blessés trois fois avec PBS 1x, puis ajouter 2,0 ml BEGM à chaque puits.
  4. Détachez HCECs utilisant 2ml de 0,25% de trypsine-acide éthylènediaminetétra-acétique (EDTA) par puits pendant 5 minutes, centrifuger à 900 g pendant 5 min dans un tube de 15 ml et aspirât de trypsine-EDTA à l'aide d'une pipette de 1 ml.
  5. Suspendre HCECs avec 1 ml 1x PBS et les transférer dans un tube de 1,5 ml.
  6. Centrifugeuse HCECs à 10.000 xg pendant 15 sec et aspirée 1x PBS en utilisant une pipette de 1 ml.
  7. Remettre en suspension HCECs dans 100 de tampon de lyse glacé pl (Tris 10 mM, NaCl 10 mM, EDTA 2 mM mM , NaF 25, 2 mM de Na 3 VO 4, le fluorure de phénylméthanesulfonyle 1 mM [PMSF], les inhibiteurs de la protéase [1 pM de pepstatine A, 1 pM de leupeptine et 0,1 uM d'aprotinine] et 0,5% de Triton X-100 [pH 7]) et mélangez-les bien.
  8. Incuber les cellules pendant 30 min sur de la glace pour induire la lyse des cellules.
  9. lysats Centrifugeuse à 4 ° C à 10000 xg pendant 15 min, puis transférer surnageants frais tubes de 1,5 ml (90 aliquotes) et les stocker à -80 ° C.
  10. Déterminer la concentration totale en protéines des lysats cellulaires en utilisant la pr Bradfordtest otein. 9
  11. Charge de 30 ug de protéines cellulaires totales dans un gel d'acrylamide à 10% ou 12% pour le sodium dodécyl électrophorèse sur gel de polyacrylamide (SDS-PAGE), puis par électrophorèse transfert séparés des bandes de protéines sur des filtres de nitrocellulose avec un courant de 200 mA pendant 1 heure à 4 ° C C à utiliser dans des essais western blot.
  12. Bloc nitrocellulose filtres membranes avec 5% de lait écrémé dans une solution saline tamponnée au Tris avec du Tween 20 (TBST) pendant 1 heure, ajouter des anticorps polyclonaux de lapin primaire contre HSP27 non-phosphorylée (1: 1000 dilution) ou primaire d'anticorps polyclonaux de lapin contre phosphorylée HSP27 (1 : 1000 dilution) dans 5% d'albumine de sérum bovin (BSA), et on incube les membranes pendant une nuit à 4 ° C sur un agitateur.
  13. Détecter les bandes immunoréactives en utilisant des anticorps de chèvre anti-lapin conjugués à la peroxydase de raifort (dilution 1: 10000) dans 5% de BSA après lavage pendant 10 minutes, 3 fois avec du TBST.
  14. Incuber la membrane dans les réactifs de luminol Western Blot (6-7 ml par 10 cm x 5 cm de la membrane) pendant 1 min à température ambiante.
  15. Retirer la membrane de la solution de réactif, éliminer le liquide en excès avec une serviette absorbante, et placer dans un protecteur de feuille de plastique.
  16. Travailler dans une pièce sombre avec une lumière sûre, placer la membrane recouverte d'une cassette de film avec le côté de la protéine vers le haut.
  17. Placez le film X-ray sur le dessus de la membrane et exposer pendant 1 min.

3. Dosage de transfection de siRNA 10

  1. HCECs de culture à 5 x 10 5 cellules / puits dans une plaque à 6 puits dans un incubateur à 37 ° C avec une atmosphère de CO2 à 5% en utilisant BEGM jusqu'à ce qu'elles atteignent 95% de confluence.
  2. On dilue le réactif de transfection (2,5 ou 7,5 pi) avec 100 pi de réduction milieu sérique pour la transfection (le facteur de dilution est de 41 ou 14,3) et on dissout le HSP27 spécifique et brouillée siRNA contrôle dans 100 ul de milieu sérique réduit pour créer 10 ou 50 nM de spécifiques HSP27 et embrouillé siRNA contrôle.
  3. Mélanger 100 μ; La solution de siRNA l avec 100 ul de réactif de transfection dilué (1: 1 ratio) et on incube le mélange pendant 15 min à température ambiante.
  4. Ajouter les complexes ARNsi-lipide aux cellules. Puis, après 4 médias de changement h pour terminer BEGM et incuber les cellules pendant 2 jours à 37 ° C.
  5. Analyser les cellules transfectées par western blot, comme décrit des sections 4.1 à 4.7.

4. Analyse par transfert de Western pour les cellules transfectées 11 siARN

  1. Extrait spécifiques HSP27 et brouillés HCECs siRNA-transfectées contrôle dans une enceinte de sécurité biologique en utilisant 100 pi de tampon de lyse glacé (Tris 10 mM, NaCl 10 mM, acide éthylènediaminetétraacétique 2 mM (EDTA), mM NaF 25, 2 mM Na 3 VO 4, 1 mM de fluorure de phénylméthanesulfonyle (PMSF), les inhibiteurs de protéase, et 0,5% de Triton X-100, pH 7).
  2. Incuber les cellules pendant 30 min sur de la glace pour induire la lyse des cellules.
  3. lysats Pellet à 10.000 xg pendant 15 minutes, puis transférer surnageants frais 1,5 ml baignoirees (90 ul aliquotes) et les stocker à -80 ° C.
  4. Déterminer les concentrations protéiques des lysats cellulaires en utilisant le dosage des protéines de Bradford. 9
  5. Charger les échantillons avec des quantités égales de protéines cellulaires totales sur un gel d'acrylamide 10% ou 12%, sous réserve du gel à SDS-PAGE, et le transfert électrophorétique les bandes de protéines séparées à des filtres de nitrocellulose avec un courant de 200 mA pendant 1 h à 4 ° C à utiliser dans des essais western blot.
  6. Bloc filtre de nitrocellulose membranes avec 5% de lait écrémé dans une solution saline tamponnée au Tris avec du Tween 20 (TBST) pendant 1 heure, ajouter des anticorps primaires contre phosphorylée et non phosphorylée HSP27 (1: 1000 dilution), phosphorylée Akt (1: 1000 dilution), non phosphorylée Akt (1: 1000 dilution, utilisée comme marqueur de la survie cellulaire), Bcl-2-protéine associée à X (1: 1000 dilution utilisée comme une protéine pro-apoptotique), et glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase (GAPDH; 1 : 200 dilution utilisée comme témoin de charge) dans 5% d'albumine de sérum bovin (BSA), etincuber les membranes pendant une nuit à 4 ° C sur un agitateur.
  7. Détecter les bandes immunoréactives en utilisant des anticorps de chèvre anti-lapin conjugués à la peroxydase de raifort (dilution 1: 10000) dans 5% de BSA après lavage 3 fois avec du TBST, 10 min chaque lavage.
  8. Incuber la membrane dans les réactifs de luminol Western Blot (6-7 ml par 10 cm x 5 cm de la membrane) pendant 1 min à température ambiante.
  9. Retirer la membrane de la solution de réactif, éliminer le liquide en excès avec une serviette absorbante, et placer dans un protecteur de feuille de plastique.
  10. En travaillant dans une chambre noire avec une lumière inactinique, placer la membrane recouverte d'une cassette de film avec le côté de la protéine vers le haut.
  11. Placez le film X-ray sur le dessus de la membrane et exposer pendant 1 min.

5. Scratch induite Directional Blessant évaluation Dosage de migration cellulaire 12

  1. Dans une enceinte de sécurité biologique, faire une blessure en faisant glisser une pointe de pipette stérile sur la surface d'un puits de cultures confluentes despécifiques à l'HSP27 ARNsi-transfectée ou HCECs ARNsi transfectée contrôle brouillé.
  2. Immédiatement après la blessure, se laver les cellules deux fois avec du phosphate de 1x solution saline tamponnée (PBS) et les maintenir dans les cultures BEGM dans un incubateur à 37 ° C avec une atmosphère de CO2 à 5% pendant 24 heures après la blessure.
  3. Photographie images HCEC utilisant un microscope droit à grossissement 100X 24 heures après la blessure et d'effectuer l'aplatissement de fond en utilisant le filtre commande dans le logiciel d'analyse d'image.
  4. Utilisation de la commande Sélectionner des mesures, définir la zone d'intérêt (AOI) avec la même forme polygonale taille qui peut couvrir perpendiculairement de bout en bout de la blessure initiale, et de déterminer trois AOI différent dans la zone blessée de chaque échantillon.
  5. compter automatiquement le nombre de cellules dans chaque champ en utilisant les Count / Taille des options de menu Mesure.

6. cytométrie de flux Analyse de l'apoptose

  1. Culture siRNA-transfectées et HSP27 spécifique de contrôle sHCECs chacun contenant 10nM de siRNA ARNi transfecté à une concentration de 5 x 10 5 cellules / puits dans des plaques à 6 puits jusqu'à ce que les cellules atteignent 95% de confluence dans un incubateur à 37 ° C avec une atmosphère de CO2 à 5% dans BEGM.
  2. Détacher HCECs en utilisant 2 ml de 0,25% de trypsine-EDTA par puits pendant 5 minutes, centrifuger à 900 g pendant 5 min dans un tube de 15 ml et aspirât de trypsine-EDTA à l'aide d'une pipette de 1 ml.
  3. Laver les cellules deux fois avec du PBS froid puis remettre en suspension les cellules dans 1 x tampon (0,1 M HEPES / NaOH [pH 7,4], 1,4 M de NaCl et 25 mM de CaCl2) se liant à une concentration de 10 6 cellules / ml.
  4. Transférer 100 pl de suspension de cellules (1 x 10 5 cellules) dans un tube de culture de 5 ml.
  5. Ajouter 5 ul d'isothiocyanate de fluorescéine conjugué à l'annexine V et 5 pi d'iodure de propidium.
  6. vortexer doucement les cellules et les incuber pendant 15 min à température ambiante dans l'obscurité.
  7. Ajouter 200 pi de tampon de liaison 1x à chaque tube et on analyse les cellules par un flux cytometer à 1 h.

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Representative Results

L'expression de HSP27 phosphorylée significativement augmentée à 5, 10, et 30 minutes après zéro blessant comparé à HCECs 13 non blessés. L' analyse par transfert de Western a révélé que l'expression de HSP27 phosphorylée et la protéine Akt phosphorylée ont tous deux été significativement réduite, alors que l'expression de Bax était significativement augmentée dans HCECs d'ARNsi spécifique à une transfection HSP27 (figure 1A-E). L'expression de HSP27 phosphorylée a été réduite de 30% et 40% en 10 nM et 50 nM de HSP27-spécifique des cellules siARN transfectées, respectivement, par rapport aux cellules de siARN transfectées contrôle, mais l'expression de HSP27 phosphorylée n'a pas été réduite (figure 1A-B ). En outre, l'expression de HSP27 non phosphorylé a été réduite de 20% et 30% en 10 nM et 50 nM de HSP27 spécifique des cellules transfectées de siARN, respectivement, mais l'expression de HSP27 non phosphorylée n'a pas été réduite (figure 1A et C </ Strong>).

Le dosage de la blessure directionnelle induite aux rayures a indiqué que 24 h après blessantes cellules siARN transfectées HSP27-spécifiques, à 10 et 50 nM présentait une réduction des migrations (Figure 2). En outre, HCECs ARNsi transfectée HSP27 spécifiques ont subi une mort cellulaire apoptotique et nécrotique plus , comparé aux cellules transfectées siRNA contrôle brouillé par cytométrie de flux (Figure 3).

Figure 1
Figure 1. Analyse par transfert de Western en utilisant des anticorps contre HSP27 phosphorylée (p-HSP27), HSP27 non phosphorylée (non-p-HSP27), Akt phosphorylée (p-Akt) comme marqueur de survie cellulaire, non-Akt phosphorylée (non p-Akt), la protéine Bcl-2eassociated X (Bax) sous forme d' une protéine pro-apoptotique et de la GAPDH (a). L'expression de HSP27 phosphorylée et non phosphorylée et protéine Akt phosphorylée a diminué significativement (B - D), toutefois, l'expression de Bax significativement augmenté dans les HCECs ARNsi transfectée spécifiques à HSP27 (E), par rapport à celle observée dans les cellules siARN transfectées témoins (p <0,05). L'expression de HSP27 phosphorylée a été réduite de 30% et 40% en 10 nM et 50 nM de HSP27-spécifique des cellules siARN transfectées par rapport à un contrôle simulé, respectivement, mais l'expression de HSP27 phosphorylée n'a pas été réduite à 10 nM et 50 nM de siRNA contrôle les cellules transfectées (B). **, *; †, ††; ‡, ‡‡; §, §§: une différence statistiquement significative entre les groupes (p <0,05). Les barres d'erreur représentent l' écart - type (SD). S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

"> Figure 2
Figure 2. Scratch induite par dosage de blessure directionnelle pour évaluer la migration cellulaire après la blessure dans HCECs siRNA-transfectées. Une blessure à la rayure a été créée dans le contrôle et les cellules siARN transfectées HSP27 spécifiques (A). Les cellules ont été retirées des zones «traînés». À 24 h après la lésion, 10 et 50 nM d'ARNsi de cellules transfectées spécifiques à HSP27 présentait un nombre plus faible de cellules migrant par rapport aux cellules transfectées d'ARNsi 10 et 50 nM de commande (B). ** Et * indiquent une différence statistiquement significative entre les groupes (p <0,05). Les données sont présentées en moyenne ± écart - type. S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 3 <br /> Figure 3. cytométrie de flux de 50 nM de contrôle brouillé siRNA et les cellules HSP27 spécifiques siARN transfectées humaines cornéennes épithéliales (HCECs) marquées avec de l' annexine V et PI (A et B). Le pourcentage des cellules totales dans les quadrants correspond aux cellules précoces apoptotiques (cellules annexine V-positives et PI-négatives, Q4, en bas à droite), les cellules fin apoptotiques (annexine V-positif et PI-positifs cellules, Q2, en haut à droite), et les cellules nécrotiques (cellules V-négatives et PI-positif annexine, Q1, en haut à gauche). HCECs siRNA-transfecter spécifiques HSP27 avaient la mort cellulaire plus apoptotique et nécrotique que des cellules de contrôle de siARN transfectées. S'il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de cette figure.

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Disclosures

Les auteurs ont aucun intérêt financier ou de propriété dans tous les matériaux ou procédés mentionnés dans cette étude.

Acknowledgments

Cette étude a été soutenue par la subvention de recherche pour étudiants (13-14) de l'Université d'Ulsan College of Medicine, Seoul, Corée et une subvention (2014-464) de l'Institut Asan for Life Sciences, Séoul, Corée.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Biological safety cabinet CHC LAB Co.Ltd,  Daejeon, Republic of Korea  CHC-777A2-06 Class II, Type A2 
Stealth RNAi™ siRNA Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA RNAi siRNA; scrambled control-siRNA and HSP27-specific siRNA
BEGMTM Lonza, Inc., Walkersville, MD CC-3171, CC4175 Bronchial epithelium growth medium 
Protease inhibitor  Sigma-Aldrich, Inc., St. Louis, MO P8340 ,P7626 1 μM Pepstatin A, 1 μM Leupeptin, 0.1 μM Aprotinin
Bradford protein assay  Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA #500-0001 Bradford protein assay 
Nitrocellulose filters  Amersham, Little Chalfont, UK RPN3032D Western blotting membrane
Non-phosphorylated HSP27  Abcam Inc., Cambridge, MA ab12351 1:1,000 dilution (Total HSP27)
Phosphorylated HSP27 (Ser85) Abcam Inc., Cambridge, MA ab5594 1:1,000 dilution HSP27 was phosphorylated at Ser85
Lipofectamine® RNAiMAX reagent  Invitrogen, Carlsbad, CA 13-778-075 Transfection reagent
Phosphorylated Akt (Ser473) Cell Signaling Technology, Danvers, MA No. 4060 1:1,000 dilution Akt was phosphorylated at Ser473 (cell survival marker)
Non-phosphorylated Akt  Cell Signaling Technology, Danvers, MA No. 4061 1:1,000 dilution (Total Akt)
Bcl-2-associated X protein  Cell Signaling Technology, Danvers, MA No. 4062 1:1,000 (anti-apoptotic protein marker)
GAPDH Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA No. 4063 1:1,000 loading control marker (house keeping gene)
Horseradish peroxidase-conjugated goat anti-rabbit antibodies Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA NCI1460KR 1:10,000 dilution
OPTI-MEM Invitrogen, Carlsbad, CA 31985 reduced serum medium for transfection
Image analysis software Olympus, Inc., Tokyo, Japan Image-Pro Plus 5.0
Skimed milk powder  Carl Roth GmbH + Co. KG, Karlstruhe, Germany T145.2
Tris  Amresco LCC, Inc. Solon, OH No-0497
Sodium Chloride  Amresco LCC, Inc. Solon, OH No-0241
Six well culture plate Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA 140675 35.00 mm diameter / well
24-well culuture dish Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA 142475
Orbital shaker N-Bioteck, Inc., Seoul, South Korea NB1015
Bovine serum albumin Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA sc-2323 
BDFACSCantoTM II BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ Flow cytometry
X-Ray Film Kodak, Rochester, NY Medical X-Ray Cassette with Green 400 Screen 
western blotting luminol reagent Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA sc-2048 
FITC Annexin V Apoptosis Detection Kit I BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ 556547

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References

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